Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D4F3

Protein Details
Accession A1D4F3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-33CKEARAVIIRPKNRHKLCRACFLEVHydrophilic
336-357IKLPVAPKRKSGKANNPRAIKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
343-348KRKSGK
Subcellular Location(s) mito 17.5, mito_nucl 11.833, cyto_nucl 5.333, nucl 5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032442  CTU1_C  
IPR000541  Ncs6/Tuc1/Ctu1  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR011063  TilS/TtcA_N  
Gene Ontology GO:0002144  C:cytosolic tRNA wobble base thiouridylase complex  
GO:0016779  F:nucleotidyltransferase activity  
GO:0000049  F:tRNA binding  
GO:0032447  P:protein urmylation  
GO:0002143  P:tRNA wobble position uridine thiolation  
KEGG nfi:NFIA_020040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01171  ATP_bind_3  
PF16503  zn-ribbon_14  
CDD cd01993  Alpha_ANH_like_II  
Amino Acid Sequences MPPTLCFNCKEARAVIIRPKNRHKLCRACFLEVFETEVHETITSSSLFYPGERVAIGASGGKDSTVLASVLKTLNERYNYGLELCLLSIDEGIKGYRDDSLETVKRNAVQYDMPLEIVGYSELYGWTMDQVVEQVGKKGNCTYCGVFRRQALDRGAARLGIKHVVTGHNADDVAETVMMNLLRGDLPRLSRGTSIVTDSAASDIKRSKPLKYAYEKEIVLYAHHKKLDYFSTECIYSPEAFRGSARTLIKDLEKIRPSSILDIVKSGEDMAALVPLEVSSSGKKCGGTAVATATAEDDESAGGCGSQNGRSSGGEMAEMEKKLAEDDAAQSRETEIKLPVAPKRKSGKANNPRAIKSQTMGKCERCGYISSQKICKACMLLDGLNKNRPKTAIEVGVGIEEEESSSTLMRQMERVQLTTG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.47
3 0.51
4 0.56
5 0.62
6 0.7
7 0.75
8 0.79
9 0.83
10 0.83
11 0.84
12 0.83
13 0.85
14 0.8
15 0.76
16 0.69
17 0.65
18 0.59
19 0.48
20 0.45
21 0.34
22 0.31
23 0.25
24 0.23
25 0.18
26 0.13
27 0.13
28 0.11
29 0.13
30 0.11
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.13
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.1
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.09
51 0.09
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.08
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.15
61 0.21
62 0.23
63 0.24
64 0.25
65 0.26
66 0.26
67 0.25
68 0.23
69 0.17
70 0.15
71 0.14
72 0.1
73 0.08
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.07
79 0.07
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.1
84 0.1
85 0.11
86 0.13
87 0.21
88 0.24
89 0.26
90 0.28
91 0.27
92 0.29
93 0.3
94 0.28
95 0.23
96 0.2
97 0.2
98 0.21
99 0.2
100 0.17
101 0.14
102 0.14
103 0.11
104 0.1
105 0.08
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.05
116 0.05
117 0.06
118 0.06
119 0.08
120 0.09
121 0.11
122 0.15
123 0.15
124 0.16
125 0.21
126 0.22
127 0.22
128 0.26
129 0.25
130 0.29
131 0.34
132 0.37
133 0.35
134 0.35
135 0.38
136 0.36
137 0.4
138 0.34
139 0.35
140 0.32
141 0.32
142 0.3
143 0.27
144 0.24
145 0.2
146 0.19
147 0.15
148 0.14
149 0.12
150 0.14
151 0.14
152 0.15
153 0.15
154 0.14
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.08
161 0.07
162 0.06
163 0.05
164 0.06
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.11
175 0.12
176 0.13
177 0.13
178 0.14
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.11
191 0.13
192 0.21
193 0.22
194 0.23
195 0.29
196 0.34
197 0.4
198 0.44
199 0.47
200 0.43
201 0.47
202 0.45
203 0.38
204 0.35
205 0.27
206 0.21
207 0.22
208 0.22
209 0.2
210 0.21
211 0.21
212 0.19
213 0.22
214 0.24
215 0.23
216 0.21
217 0.19
218 0.2
219 0.2
220 0.2
221 0.18
222 0.17
223 0.13
224 0.12
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.11
229 0.13
230 0.12
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.18
235 0.19
236 0.2
237 0.23
238 0.24
239 0.26
240 0.28
241 0.28
242 0.28
243 0.29
244 0.29
245 0.26
246 0.29
247 0.23
248 0.21
249 0.2
250 0.2
251 0.17
252 0.16
253 0.14
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.05
266 0.07
267 0.08
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.14
273 0.15
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.15
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.11
282 0.09
283 0.08
284 0.06
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.04
289 0.04
290 0.04
291 0.06
292 0.07
293 0.11
294 0.13
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.17
299 0.17
300 0.16
301 0.13
302 0.12
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.14
307 0.13
308 0.12
309 0.12
310 0.12
311 0.1
312 0.07
313 0.12
314 0.19
315 0.2
316 0.2
317 0.19
318 0.21
319 0.23
320 0.22
321 0.21
322 0.15
323 0.17
324 0.2
325 0.24
326 0.29
327 0.36
328 0.37
329 0.44
330 0.5
331 0.55
332 0.61
333 0.67
334 0.72
335 0.72
336 0.82
337 0.82
338 0.81
339 0.77
340 0.73
341 0.68
342 0.59
343 0.51
344 0.49
345 0.46
346 0.47
347 0.5
348 0.47
349 0.48
350 0.48
351 0.48
352 0.4
353 0.37
354 0.37
355 0.4
356 0.45
357 0.46
358 0.5
359 0.53
360 0.52
361 0.51
362 0.47
363 0.39
364 0.31
365 0.3
366 0.28
367 0.27
368 0.32
369 0.38
370 0.4
371 0.46
372 0.49
373 0.46
374 0.44
375 0.42
376 0.39
377 0.37
378 0.39
379 0.38
380 0.36
381 0.36
382 0.33
383 0.32
384 0.29
385 0.23
386 0.16
387 0.09
388 0.08
389 0.07
390 0.07
391 0.07
392 0.07
393 0.08
394 0.11
395 0.14
396 0.15
397 0.18
398 0.22
399 0.3
400 0.33