FuNGI

A0A369H4Y4

Protein Details

Accession

A0A369H4Y4

Localization Confidence

High

Confidence Score

25.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
48-72	QDATKSEPSKRSKPRSPSQGEKLII	Hydrophilic
164-184	FATYKKIPSTRRRVDPRQGTI	Hydrophilic
386-409	AGSPKPPQQPPNRRARNNKAAEKS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-42	SRGAP
46-46	K
51-64	TKSEPSKRSKPRSP
232-278	KEKKANKGKESAKNAKTGPVKGKGSDDAPKKKTRDAKMEKSAKEPVK
552-585	RREKKAPAAGTPAPEKGPGRGRRGRGGGGGGGGK

Subcellular Location(s)

nucl 24, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR039722 Upf3 IPR005120 UPF3_dom
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF03467 Smg4_UPF3
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12455 RRM_like_Smg4_UPF3

Amino Acid Sequences

MSAPAPQVLSRRTHHGPPPSEPPAKGKSNHDIHPQRPSRGAPSGEKAQDATKSEPSKRSKPRSPSQGEKLIIRRLPPGMTEAEFVSILGTDWEVNKGKVDWFSFCPGKTSVDPSKPSRPGRAYLHLVRKDDMMALSQVVRSATWEDAKSTFTSPSLVGPPSLEFATYKKIPSTRRRVDPRQGTIDQDPEFMAFLEALANPVLARENVDADEAQDGPKEDGKITTTPLVEFLKEKKANKGKESAKNAKTGPVKGKGSDDAPKKKTRDAKMEKSAKEPVKILTKKPTTETAPEAAASQASAADGAAKGRRAGIAAAARILQRDLGLSPGSAHRRARHDAAKAEATTSKEPTASPNEAVQSSTTPTTTATTTATTTATTATKTTTEAAAGSPKPPQQPPNRRARNNKAAEKSKTTESQPTATPVILKKRGDEEVPLPTTSVRSPASKQAANGKPSTATSTTNTANKAKPSPGQKKAPAVTTGATRAFVKHVNASQGVTEAVLRQALETFGTVTLVEVDKRKGFAYVDFADHDGLVKAVGAGPVQVAQSAVQVVERREKKAPAAGTPAPEKGPGRGRRGRGGGGGGGGKATNGMANGPAPTLVASTGGSG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.52
2	0.56
3	0.58
4	0.58
5	0.64
6	0.65
7	0.66
8	0.6
9	0.59
10	0.57
11	0.58
12	0.56
13	0.54
14	0.56
15	0.57
16	0.61
17	0.65
18	0.66
19	0.64
20	0.7
21	0.69
22	0.64
23	0.62
24	0.6
25	0.56
26	0.55
27	0.56
28	0.51
29	0.51
30	0.56
31	0.52
32	0.5
33	0.44
34	0.4
35	0.4
36	0.39
37	0.37
38	0.36
39	0.41
40	0.46
41	0.54
42	0.58
43	0.63
44	0.69
45	0.75
46	0.76
47	0.78
48	0.83
49	0.85
50	0.86
51	0.85
52	0.83
53	0.82
54	0.75
55	0.73
56	0.68
57	0.66
58	0.59
59	0.51
60	0.47
61	0.4
62	0.39
63	0.33
64	0.3
65	0.25
66	0.24
67	0.24
68	0.2
69	0.19
70	0.18
71	0.16
72	0.13
73	0.1
74	0.08
75	0.07
76	0.07
77	0.06
78	0.07
79	0.12
80	0.14
81	0.14
82	0.16
83	0.17
84	0.19
85	0.23
86	0.24
87	0.23
88	0.25
89	0.32
90	0.33
91	0.32
92	0.33
93	0.3
94	0.32
95	0.3
96	0.34
97	0.36
98	0.4
99	0.45
100	0.48
101	0.56
102	0.6
103	0.62
104	0.64
105	0.59
106	0.59
107	0.6
108	0.62
109	0.59
110	0.59
111	0.66
112	0.62
113	0.6
114	0.54
115	0.48
116	0.41
117	0.36
118	0.28
119	0.19
120	0.14
121	0.13
122	0.13
123	0.12
124	0.12
125	0.11
126	0.1
127	0.1
128	0.11
129	0.13
130	0.15
131	0.16
132	0.17
133	0.18
134	0.2
135	0.2
136	0.19
137	0.18
138	0.15
139	0.16
140	0.14
141	0.16
142	0.17
143	0.16
144	0.15
145	0.15
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.12
150	0.1
151	0.11
152	0.17
153	0.18
154	0.18
155	0.2
156	0.26
157	0.34
158	0.43
159	0.53
160	0.55
161	0.63
162	0.72
163	0.77
164	0.81
165	0.82
166	0.79
167	0.76
168	0.69
169	0.63
170	0.56
171	0.53
172	0.43
173	0.35
174	0.28
175	0.2
176	0.19
177	0.14
178	0.12
179	0.06
180	0.06
181	0.06
182	0.06
183	0.06
184	0.06
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.06
189	0.05
190	0.07
191	0.07
192	0.08
193	0.09
194	0.1
195	0.09
196	0.09
197	0.1
198	0.09
199	0.08
200	0.08
201	0.09
202	0.09
203	0.11
204	0.12
205	0.11
206	0.12
207	0.14
208	0.14
209	0.15
210	0.18
211	0.16
212	0.15
213	0.18
214	0.17
215	0.16
216	0.17
217	0.18
218	0.24
219	0.28
220	0.29
221	0.36
222	0.43
223	0.48
224	0.49
225	0.56
226	0.54
227	0.59
228	0.67
229	0.67
230	0.62
231	0.62
232	0.59
233	0.56
234	0.52
235	0.47
236	0.44
237	0.41
238	0.4
239	0.36
240	0.38
241	0.33
242	0.32
243	0.34
244	0.36
245	0.38
246	0.41
247	0.47
248	0.46
249	0.5
250	0.56
251	0.55
252	0.58
253	0.58
254	0.63
255	0.66
256	0.73
257	0.68
258	0.64
259	0.66
260	0.57
261	0.5
262	0.42
263	0.35
264	0.37
265	0.38
266	0.37
267	0.38
268	0.4
269	0.39
270	0.4
271	0.41
272	0.34
273	0.34
274	0.34
275	0.26
276	0.23
277	0.22
278	0.2
279	0.15
280	0.12
281	0.09
282	0.06
283	0.04
284	0.04
285	0.03
286	0.03
287	0.03
288	0.03
289	0.04
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.07
295	0.07
296	0.07
297	0.1
298	0.11
299	0.1
300	0.11
301	0.12
302	0.12
303	0.11
304	0.11
305	0.08
306	0.06
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.06
311	0.06
312	0.07
313	0.11
314	0.14
315	0.17
316	0.19
317	0.22
318	0.27
319	0.3
320	0.34
321	0.35
322	0.36
323	0.35
324	0.37
325	0.36
326	0.31
327	0.29
328	0.26
329	0.24
330	0.22
331	0.21
332	0.18
333	0.16
334	0.16
335	0.18
336	0.21
337	0.2
338	0.19
339	0.2
340	0.2
341	0.2
342	0.2
343	0.18
344	0.13
345	0.12
346	0.12
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.09
354	0.1
355	0.1
356	0.11
357	0.11
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.09
366	0.1
367	0.11
368	0.09
369	0.09
370	0.09
371	0.09
372	0.13
373	0.14
374	0.14
375	0.16
376	0.19
377	0.23
378	0.25
379	0.32
380	0.38
381	0.49
382	0.55
383	0.63
384	0.7
385	0.74
386	0.81
387	0.83
388	0.83
389	0.81
390	0.82
391	0.79
392	0.78
393	0.75
394	0.71
395	0.64
396	0.58
397	0.53
398	0.48
399	0.46
400	0.41
401	0.39
402	0.34
403	0.34
404	0.3
405	0.27
406	0.27
407	0.23
408	0.29
409	0.33
410	0.32
411	0.3
412	0.33
413	0.35
414	0.33
415	0.33
416	0.27
417	0.29
418	0.3
419	0.28
420	0.25
421	0.23
422	0.23
423	0.2
424	0.21
425	0.16
426	0.16
427	0.19
428	0.27
429	0.32
430	0.32
431	0.34
432	0.4
433	0.45
434	0.45
435	0.44
436	0.37
437	0.32
438	0.31
439	0.34
440	0.26
441	0.22
442	0.21
443	0.24
444	0.26
445	0.28
446	0.31
447	0.31
448	0.32
449	0.34
450	0.35
451	0.34
452	0.37
453	0.44
454	0.5
455	0.54
456	0.6
457	0.61
458	0.66
459	0.66
460	0.64
461	0.56
462	0.48
463	0.41
464	0.36
465	0.34
466	0.27
467	0.25
468	0.21
469	0.2
470	0.2
471	0.22
472	0.21
473	0.22
474	0.24
475	0.27
476	0.28
477	0.27
478	0.25
479	0.23
480	0.2
481	0.15
482	0.13
483	0.09
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.08
488	0.09
489	0.09
490	0.09
491	0.08
492	0.09
493	0.08
494	0.09
495	0.08
496	0.07
497	0.09
498	0.1
499	0.12
500	0.13
501	0.17
502	0.18
503	0.2
504	0.2
505	0.2
506	0.2
507	0.21
508	0.25
509	0.24
510	0.25
511	0.25
512	0.26
513	0.24
514	0.22
515	0.21
516	0.13
517	0.11
518	0.08
519	0.07
520	0.06
521	0.07
522	0.08
523	0.07
524	0.07
525	0.07
526	0.09
527	0.09
528	0.09
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.09
533	0.09
534	0.1
535	0.13
536	0.16
537	0.25
538	0.28
539	0.32
540	0.36
541	0.39
542	0.4
543	0.45
544	0.46
545	0.42
546	0.46
547	0.45
548	0.46
549	0.47
550	0.45
551	0.39
552	0.4
553	0.36
554	0.34
555	0.4
556	0.43
557	0.48
558	0.54
559	0.58
560	0.62
561	0.66
562	0.63
563	0.57
564	0.53
565	0.45
566	0.4
567	0.36
568	0.27
569	0.23
570	0.19
571	0.15
572	0.12
573	0.11
574	0.09
575	0.07
576	0.08
577	0.09
578	0.1
579	0.11
580	0.11
581	0.11
582	0.1
583	0.1
584	0.1
585	0.09
586	0.09

A0A369H4Y4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer