Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A369HCK0

Protein Details
Accession A0A369HCK0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
318-339VPSPSSRPWRASRHRDPSPTPLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007275  YTH_domain  
IPR045168  YTH_prot  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
CDD cd21134  YTH  
Amino Acid Sequences MSPPPPPSTADVEAKKQLSSLSNSIHDTEGRLRRLLKDDADLQLWLQHTRYFDLDHRRRVLDNVRKLKLVEEEREKLMLELRIAQASSSPKLSRHLMSASGSATDEASVAADDDVAAVASASSTRPVKAATDTRFFLVKCFNTANIYMSQRDGLWVTQTKNGEVFAQAFKECQSVILFFSINKSRGFQGFARMMSVPDANLPKPDWIQKINLKAATDPFRVEWINTAVTEFDQVGDLKNPLNEFRSVVVGRDGQEYPPECGLKMMALLSQAAIKPSYAAAAAATTTNNSAVTTIPSRLPSTGRCSITSLQNASPGASVPSPSSRPWRASRHRDPSPTPLPAASVPSSSVELSSQKSHPNLIDC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.38
4 0.36
5 0.32
6 0.34
7 0.33
8 0.31
9 0.34
10 0.36
11 0.37
12 0.36
13 0.31
14 0.29
15 0.33
16 0.36
17 0.34
18 0.36
19 0.37
20 0.4
21 0.45
22 0.47
23 0.4
24 0.38
25 0.4
26 0.39
27 0.39
28 0.34
29 0.28
30 0.26
31 0.25
32 0.2
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.19
37 0.2
38 0.2
39 0.25
40 0.36
41 0.42
42 0.48
43 0.51
44 0.51
45 0.5
46 0.53
47 0.57
48 0.55
49 0.58
50 0.59
51 0.58
52 0.57
53 0.56
54 0.53
55 0.51
56 0.48
57 0.45
58 0.43
59 0.44
60 0.44
61 0.45
62 0.42
63 0.34
64 0.32
65 0.26
66 0.18
67 0.19
68 0.18
69 0.19
70 0.18
71 0.18
72 0.17
73 0.19
74 0.2
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.24
79 0.28
80 0.25
81 0.25
82 0.25
83 0.24
84 0.25
85 0.25
86 0.22
87 0.19
88 0.18
89 0.14
90 0.12
91 0.1
92 0.08
93 0.06
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.03
108 0.03
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.08
113 0.09
114 0.11
115 0.16
116 0.23
117 0.25
118 0.28
119 0.29
120 0.29
121 0.31
122 0.3
123 0.26
124 0.25
125 0.21
126 0.2
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.21
132 0.18
133 0.2
134 0.17
135 0.17
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.09
141 0.11
142 0.14
143 0.15
144 0.18
145 0.19
146 0.19
147 0.18
148 0.19
149 0.15
150 0.13
151 0.13
152 0.1
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.1
157 0.1
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.08
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.11
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.16
173 0.19
174 0.16
175 0.19
176 0.2
177 0.2
178 0.2
179 0.19
180 0.18
181 0.16
182 0.16
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.11
187 0.12
188 0.12
189 0.13
190 0.14
191 0.19
192 0.19
193 0.18
194 0.24
195 0.27
196 0.33
197 0.35
198 0.35
199 0.31
200 0.3
201 0.33
202 0.32
203 0.29
204 0.24
205 0.2
206 0.21
207 0.21
208 0.2
209 0.17
210 0.14
211 0.14
212 0.13
213 0.13
214 0.1
215 0.1
216 0.11
217 0.09
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.09
223 0.09
224 0.09
225 0.11
226 0.11
227 0.12
228 0.14
229 0.13
230 0.13
231 0.14
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.17
237 0.18
238 0.2
239 0.2
240 0.15
241 0.2
242 0.21
243 0.21
244 0.23
245 0.22
246 0.18
247 0.18
248 0.18
249 0.13
250 0.12
251 0.1
252 0.07
253 0.07
254 0.08
255 0.07
256 0.09
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.09
264 0.07
265 0.07
266 0.06
267 0.06
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.08
277 0.07
278 0.11
279 0.13
280 0.15
281 0.16
282 0.19
283 0.2
284 0.21
285 0.24
286 0.24
287 0.29
288 0.35
289 0.35
290 0.34
291 0.38
292 0.4
293 0.44
294 0.46
295 0.42
296 0.35
297 0.37
298 0.36
299 0.32
300 0.29
301 0.22
302 0.19
303 0.15
304 0.15
305 0.14
306 0.19
307 0.2
308 0.23
309 0.31
310 0.34
311 0.39
312 0.46
313 0.55
314 0.6
315 0.68
316 0.76
317 0.78
318 0.81
319 0.83
320 0.81
321 0.79
322 0.77
323 0.7
324 0.61
325 0.52
326 0.46
327 0.4
328 0.4
329 0.32
330 0.25
331 0.22
332 0.22
333 0.23
334 0.2
335 0.19
336 0.17
337 0.18
338 0.21
339 0.25
340 0.25
341 0.3
342 0.32
343 0.35