Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D2J3

Protein Details
Accession A1D2J3    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
128-177EDDQQVKRKREGRREKKNRRRDMEEGADEGEDKSRRRDRKKRDATPEDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
120-169RHKRRRTGEDDQQVKRKREGRREKKNRRRDMEEGADEGEDKSRRRDRKKR
185-192RRRALDRA
194-207DEALKKPTKRRFRK
438-451MRARQIAASKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 14, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
KEGG nfi:NFIA_013250  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSDSPEMRPASPTDVVSDHESQTDLPEEPVKAPTPGGDEGHNEEAPEEGAASATPAAESVAETHEDDPADKEDAGVDSDEESILSEVDEAQFEDFDPENVDIEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRRRTGEDDQQVKRKREGRREKKNRRRDMEEGADEGEDKSRRRDRKKRDATPEDEELLDPATRRRRALDRAMDEALKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEGMRKRMTHAAQMDANNRREGRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALGKLPINKETLIASGIGKVIVFYTKSKRPEPGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEYDPRKLTTRTSAQASVAEARSRELLPPRLANRARAEITHTSYTIVPRPTVVQESKFARPLGASGEDRFRRMRARQIAASKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.31
4 0.32
5 0.27
6 0.24
7 0.24
8 0.21
9 0.22
10 0.22
11 0.17
12 0.16
13 0.19
14 0.2
15 0.21
16 0.24
17 0.23
18 0.22
19 0.21
20 0.21
21 0.22
22 0.24
23 0.23
24 0.22
25 0.23
26 0.28
27 0.33
28 0.31
29 0.26
30 0.23
31 0.22
32 0.2
33 0.16
34 0.11
35 0.06
36 0.06
37 0.06
38 0.07
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.05
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.12
50 0.12
51 0.14
52 0.14
53 0.15
54 0.15
55 0.16
56 0.17
57 0.15
58 0.15
59 0.14
60 0.14
61 0.15
62 0.13
63 0.11
64 0.09
65 0.1
66 0.09
67 0.08
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.05
73 0.05
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.07
79 0.07
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.09
89 0.11
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.12
100 0.13
101 0.13
102 0.12
103 0.13
104 0.18
105 0.26
106 0.33
107 0.43
108 0.51
109 0.6
110 0.67
111 0.73
112 0.75
113 0.75
114 0.75
115 0.75
116 0.75
117 0.71
118 0.74
119 0.74
120 0.69
121 0.66
122 0.63
123 0.62
124 0.64
125 0.7
126 0.72
127 0.76
128 0.84
129 0.89
130 0.93
131 0.95
132 0.94
133 0.9
134 0.87
135 0.81
136 0.78
137 0.75
138 0.67
139 0.57
140 0.47
141 0.4
142 0.32
143 0.27
144 0.22
145 0.16
146 0.14
147 0.21
148 0.28
149 0.36
150 0.47
151 0.56
152 0.63
153 0.72
154 0.83
155 0.85
156 0.88
157 0.88
158 0.84
159 0.79
160 0.72
161 0.62
162 0.51
163 0.41
164 0.31
165 0.23
166 0.17
167 0.11
168 0.13
169 0.19
170 0.2
171 0.21
172 0.25
173 0.29
174 0.35
175 0.44
176 0.48
177 0.43
178 0.46
179 0.47
180 0.44
181 0.39
182 0.36
183 0.33
184 0.29
185 0.26
186 0.29
187 0.37
188 0.46
189 0.55
190 0.62
191 0.65
192 0.7
193 0.79
194 0.76
195 0.77
196 0.7
197 0.64
198 0.56
199 0.46
200 0.38
201 0.28
202 0.23
203 0.13
204 0.09
205 0.04
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.07
214 0.12
215 0.13
216 0.18
217 0.19
218 0.21
219 0.25
220 0.28
221 0.32
222 0.34
223 0.34
224 0.31
225 0.3
226 0.28
227 0.27
228 0.25
229 0.24
230 0.27
231 0.34
232 0.37
233 0.4
234 0.41
235 0.4
236 0.43
237 0.43
238 0.35
239 0.26
240 0.21
241 0.19
242 0.18
243 0.18
244 0.15
245 0.12
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.12
250 0.13
251 0.14
252 0.13
253 0.13
254 0.12
255 0.12
256 0.12
257 0.12
258 0.11
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.05
271 0.05
272 0.07
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.1
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.09
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.09
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.11
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.13
300 0.14
301 0.13
302 0.12
303 0.1
304 0.1
305 0.1
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.07
311 0.09
312 0.11
313 0.17
314 0.24
315 0.29
316 0.32
317 0.36
318 0.41
319 0.5
320 0.55
321 0.59
322 0.61
323 0.6
324 0.61
325 0.61
326 0.56
327 0.49
328 0.42
329 0.33
330 0.33
331 0.3
332 0.26
333 0.24
334 0.23
335 0.24
336 0.24
337 0.24
338 0.19
339 0.21
340 0.25
341 0.31
342 0.38
343 0.38
344 0.4
345 0.42
346 0.43
347 0.43
348 0.41
349 0.35
350 0.29
351 0.32
352 0.36
353 0.41
354 0.39
355 0.4
356 0.38
357 0.39
358 0.4
359 0.34
360 0.31
361 0.31
362 0.35
363 0.37
364 0.42
365 0.41
366 0.4
367 0.4
368 0.39
369 0.36
370 0.31
371 0.28
372 0.23
373 0.22
374 0.24
375 0.23
376 0.25
377 0.26
378 0.3
379 0.33
380 0.4
381 0.42
382 0.49
383 0.51
384 0.53
385 0.52
386 0.52
387 0.49
388 0.42
389 0.46
390 0.42
391 0.46
392 0.42
393 0.37
394 0.32
395 0.32
396 0.35
397 0.34
398 0.31
399 0.25
400 0.23
401 0.26
402 0.28
403 0.34
404 0.34
405 0.32
406 0.36
407 0.41
408 0.45
409 0.47
410 0.43
411 0.36
412 0.32
413 0.31
414 0.29
415 0.3
416 0.27
417 0.26
418 0.36
419 0.37
420 0.4
421 0.41
422 0.39
423 0.41
424 0.44
425 0.51
426 0.51
427 0.56
428 0.61
429 0.67
430 0.71
431 0.7