FuNGI

A0A369GG41

Protein Details

Accession

A0A369GG41

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-42	QHLVDQRSRYKPTKRRGPGNLETVV	Hydrophilic
186-207	ELRRANKTKGRRMDRSRYSTRY	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 11.5, cyto_nucl 10.5, nucl 8.5, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010997 HRDC-like_sf IPR020103 PsdUridine_synth_cat_dom_sf IPR001406 PsdUridine_synth_TruA IPR020097 PsdUridine_synth_TruA_a/b_dom IPR020095 PsdUridine_synth_TruA_C IPR041707 Pus3-like IPR006590 RNA_pol_Rpb4/RPC9_core IPR005574 Rpb4/RPC9 IPR038324 Rpb4/RPC9_sf IPR020094 TruA/RsuA/RluB/E/F_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0009982 F:pseudouridine synthase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation GO:0001522 P:pseudouridine synthesis GO:0008033 P:tRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF01416 PseudoU_synth_1 PF03874 RNA_pol_Rpb4
CDD	cd02569 PseudoU_synth_ScPus3

Amino Acid Sequences

MRIVESQSAVLTNYEVFQHLVDQRSRYKPTKRRGPGNLETVVKEVLVYMRERPSPLGQERATYSPECISQLLDRLRPYDLSKGEVIMMFNHRPPDVAHLNTLVEDMSDRFTSDQQQEIVDAVADILGRSDDDNGGGGDGGRPTTDARVFMAAKYESWTRTGLIHRLRTLEAELQLQTAQEDAPQAELRRANKTKGRRMDRSRYSTRYIALKLAYLGKRYGGFEFQAMSNQPTIEEELWTALTKACLVFPDGEEEVVQFDCCEYSKCGRTDRGVSAFGQVVGLRVRSNRPVPCRRDDADERGDEEEEEEEEEKKENQEEKAPPFDDVADELCYPRILNRLLPRDIRVLAWCPSPPDGFSARFSCRERQYRYFFTQPAFAPPPQLARPGTVPPGWLDLAAMRDAAKRFEGEHDFRNFCKVDPSKQITNFRRRIYESDIVEVDKAGSTLPESQDSGCTHAGDGSHHPKVYYFLVRGSAFLWHQIRHMVAVLFLVGQGFENPSVVSQLLDVEAHPCKPTYVMADEVPLVLWDCVFPDGDADATNKLEDSLRWIHVGDEQQGDKFGPFGVIDSMWRLWREHKMDELLAHQLLLQAANRGPATKCGRGEDDKRRVALFEGGNGGRLGGKYVPVMEKSLTQSPEEQNEKYAKRKGYASAEDMRAQKGMGRGRETEQTADDE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.12
3	0.11
4	0.11
5	0.16
6	0.2
7	0.25
8	0.28
9	0.32
10	0.39
11	0.46
12	0.54
13	0.56
14	0.63
15	0.66
16	0.73
17	0.8
18	0.81
19	0.84
20	0.86
21	0.87
22	0.85
23	0.83
24	0.79
25	0.71
26	0.62
27	0.54
28	0.45
29	0.34
30	0.26
31	0.19
32	0.15
33	0.15
34	0.15
35	0.18
36	0.23
37	0.26
38	0.27
39	0.3
40	0.34
41	0.4
42	0.43
43	0.46
44	0.41
45	0.43
46	0.45
47	0.45
48	0.43
49	0.35
50	0.32
51	0.26
52	0.27
53	0.25
54	0.22
55	0.21
56	0.19
57	0.26
58	0.29
59	0.3
60	0.3
61	0.3
62	0.31
63	0.31
64	0.32
65	0.33
66	0.29
67	0.29
68	0.28
69	0.28
70	0.27
71	0.26
72	0.24
73	0.2
74	0.24
75	0.22
76	0.24
77	0.26
78	0.24
79	0.23
80	0.23
81	0.28
82	0.28
83	0.27
84	0.27
85	0.26
86	0.27
87	0.26
88	0.25
89	0.17
90	0.11
91	0.1
92	0.09
93	0.1
94	0.1
95	0.1
96	0.11
97	0.13
98	0.19
99	0.21
100	0.23
101	0.21
102	0.22
103	0.21
104	0.21
105	0.19
106	0.13
107	0.1
108	0.07
109	0.06
110	0.06
111	0.05
112	0.05
113	0.04
114	0.05
115	0.05
116	0.07
117	0.06
118	0.07
119	0.08
120	0.08
121	0.08
122	0.07
123	0.07
124	0.07
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.08
130	0.12
131	0.14
132	0.13
133	0.14
134	0.19
135	0.2
136	0.19
137	0.24
138	0.2
139	0.19
140	0.21
141	0.23
142	0.19
143	0.2
144	0.21
145	0.16
146	0.2
147	0.24
148	0.28
149	0.32
150	0.36
151	0.36
152	0.38
153	0.38
154	0.35
155	0.34
156	0.3
157	0.24
158	0.22
159	0.2
160	0.18
161	0.18
162	0.16
163	0.14
164	0.1
165	0.08
166	0.06
167	0.07
168	0.07
169	0.09
170	0.11
171	0.12
172	0.16
173	0.2
174	0.21
175	0.3
176	0.33
177	0.36
178	0.41
179	0.5
180	0.56
181	0.62
182	0.68
183	0.69
184	0.75
185	0.8
186	0.82
187	0.82
188	0.8
189	0.75
190	0.72
191	0.64
192	0.58
193	0.53
194	0.45
195	0.39
196	0.31
197	0.27
198	0.23
199	0.28
200	0.27
201	0.23
202	0.22
203	0.2
204	0.21
205	0.22
206	0.22
207	0.16
208	0.15
209	0.14
210	0.15
211	0.14
212	0.15
213	0.14
214	0.14
215	0.13
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.13
220	0.11
221	0.1
222	0.09
223	0.09
224	0.1
225	0.1
226	0.1
227	0.08
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.07
232	0.07
233	0.08
234	0.09
235	0.08
236	0.12
237	0.12
238	0.12
239	0.11
240	0.11
241	0.11
242	0.1
243	0.09
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.06
248	0.07
249	0.09
250	0.13
251	0.19
252	0.22
253	0.25
254	0.28
255	0.31
256	0.34
257	0.36
258	0.35
259	0.31
260	0.29
261	0.27
262	0.25
263	0.21
264	0.17
265	0.12
266	0.1
267	0.09
268	0.09
269	0.08
270	0.09
271	0.11
272	0.15
273	0.21
274	0.25
275	0.33
276	0.42
277	0.46
278	0.5
279	0.54
280	0.51
281	0.53
282	0.52
283	0.5
284	0.47
285	0.42
286	0.39
287	0.34
288	0.32
289	0.24
290	0.2
291	0.14
292	0.09
293	0.09
294	0.08
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.09
300	0.12
301	0.14
302	0.14
303	0.21
304	0.24
305	0.26
306	0.31
307	0.31
308	0.28
309	0.26
310	0.25
311	0.18
312	0.15
313	0.13
314	0.09
315	0.09
316	0.09
317	0.08
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.1
322	0.09
323	0.13
324	0.19
325	0.25
326	0.28
327	0.29
328	0.3
329	0.29
330	0.29
331	0.26
332	0.21
333	0.18
334	0.16
335	0.17
336	0.15
337	0.14
338	0.15
339	0.15
340	0.13
341	0.14
342	0.15
343	0.16
344	0.18
345	0.2
346	0.21
347	0.26
348	0.28
349	0.31
350	0.35
351	0.42
352	0.46
353	0.49
354	0.54
355	0.55
356	0.58
357	0.57
358	0.51
359	0.44
360	0.42
361	0.35
362	0.35
363	0.32
364	0.27
365	0.23
366	0.22
367	0.25
368	0.21
369	0.24
370	0.19
371	0.16
372	0.19
373	0.19
374	0.22
375	0.18
376	0.18
377	0.15
378	0.17
379	0.15
380	0.13
381	0.11
382	0.09
383	0.1
384	0.09
385	0.09
386	0.07
387	0.09
388	0.1
389	0.11
390	0.1
391	0.1
392	0.11
393	0.15
394	0.21
395	0.21
396	0.27
397	0.31
398	0.32
399	0.32
400	0.36
401	0.31
402	0.25
403	0.32
404	0.28
405	0.29
406	0.36
407	0.42
408	0.44
409	0.49
410	0.59
411	0.59
412	0.67
413	0.68
414	0.61
415	0.6
416	0.57
417	0.55
418	0.52
419	0.51
420	0.42
421	0.38
422	0.36
423	0.32
424	0.29
425	0.24
426	0.17
427	0.1
428	0.09
429	0.06
430	0.05
431	0.06
432	0.09
433	0.1
434	0.11
435	0.12
436	0.12
437	0.16
438	0.17
439	0.2
440	0.17
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.14
446	0.19
447	0.22
448	0.24
449	0.24
450	0.24
451	0.23
452	0.25
453	0.27
454	0.25
455	0.2
456	0.18
457	0.23
458	0.23
459	0.23
460	0.21
461	0.2
462	0.16
463	0.21
464	0.21
465	0.17
466	0.18
467	0.19
468	0.19
469	0.17
470	0.18
471	0.12
472	0.1
473	0.1
474	0.09
475	0.07
476	0.07
477	0.06
478	0.04
479	0.04
480	0.05
481	0.06
482	0.05
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.07
488	0.07
489	0.06
490	0.06
491	0.07
492	0.07
493	0.07
494	0.09
495	0.11
496	0.12
497	0.12
498	0.12
499	0.11
500	0.12
501	0.14
502	0.14
503	0.16
504	0.18
505	0.17
506	0.19
507	0.18
508	0.18
509	0.16
510	0.12
511	0.1
512	0.07
513	0.07
514	0.05
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.07
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.1
529	0.1
530	0.09
531	0.15
532	0.18
533	0.19
534	0.2
535	0.2
536	0.2
537	0.24
538	0.27
539	0.24
540	0.24
541	0.23
542	0.23
543	0.24
544	0.23
545	0.19
546	0.16
547	0.13
548	0.09
549	0.08
550	0.09
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.13
555	0.15
556	0.16
557	0.17
558	0.18
559	0.2
560	0.29
561	0.34
562	0.33
563	0.37
564	0.39
565	0.39
566	0.4
567	0.37
568	0.33
569	0.28
570	0.25
571	0.19
572	0.17
573	0.15
574	0.15
575	0.13
576	0.12
577	0.12
578	0.16
579	0.16
580	0.17
581	0.17
582	0.25
583	0.31
584	0.34
585	0.36
586	0.37
587	0.44
588	0.49
589	0.58
590	0.6
591	0.63
592	0.62
593	0.61
594	0.57
595	0.52
596	0.47
597	0.45
598	0.35
599	0.29
600	0.3
601	0.28
602	0.28
603	0.27
604	0.25
605	0.19
606	0.18
607	0.17
608	0.12
609	0.13
610	0.13
611	0.17
612	0.2
613	0.2
614	0.23
615	0.21
616	0.24
617	0.28
618	0.34
619	0.32
620	0.3
621	0.35
622	0.37
623	0.45
624	0.46
625	0.42
626	0.41
627	0.48
628	0.5
629	0.52
630	0.55
631	0.51
632	0.5
633	0.53
634	0.55
635	0.56
636	0.58
637	0.57
638	0.57
639	0.57
640	0.58
641	0.56
642	0.5
643	0.41
644	0.34
645	0.31
646	0.3
647	0.33
648	0.34
649	0.36
650	0.38
651	0.41
652	0.49
653	0.48
654	0.45

A0A369GG41

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer