Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DED1

Protein Details
Accession A1DED1    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
495-516VPTGGNRPSRHRHGHHHFWIAAHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) extr 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000743  Glyco_hydro_28  
IPR012334  Pectin_lyas_fold  
IPR011050  Pectin_lyase_fold/virulence  
Gene Ontology GO:0005576  C:extracellular region  
GO:0004650  F:polygalacturonase activity  
GO:0046576  F:rhamnogalacturonan alpha-L-rhamnopyranosyl-(1->4)-alpha-D-galactopyranosyluronide lyase activity  
GO:0071555  P:cell wall organization  
GO:0045490  P:pectin catabolic process  
KEGG nfi:NFIA_076680  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00295  Glyco_hydro_28  
Amino Acid Sequences MRLHAFTLLSLLGLVPSFAAASLSGSVGPLTSASAKAAKKTCNVLDYGAKADKKTDLGPPLAAAFAACKSGGLVYIPAGNYAMSTWVKLANGKAWALQIDGVIYRTGTDGGNMIMIEHTSDFELYSSTSSGAMQGLGYELHAANNWSGPRLLRLWDVSDFSVHDLILVDSPSFHFSIDTCSNGEVYNMAIRGGNHGGLDGVDVWSTNIWIHDVEVTNKDECVTVKSPAKNILVENIYCNLSGGCGMGSLGADTDISDITYKNIYTWNSNQMMMIKSNGGSGTVSNVVLENFIGHGNAYSLDIDSYWSSMSAVSGDGVELSNITIKNWKGTEANGAQRGPIKIICPDKVPCYNILIEDFAMWTETGSKQWYSCQSAYGSGFCLKSGSHHTSYAVTTTTVSSAPSGYSAAKMPLDLSTDFGSTQSIPIPTIPTSFYPGATPYSALMSKQSTKAAKARAVDMSVETPAAASRSEQVVQGASQETSQPAPESAGPVRSVPTGGNRPSRHRHGHHHFWIAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.05
6 0.05
7 0.05
8 0.06
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.07
18 0.09
19 0.09
20 0.11
21 0.18
22 0.19
23 0.26
24 0.32
25 0.35
26 0.38
27 0.44
28 0.47
29 0.43
30 0.44
31 0.41
32 0.41
33 0.39
34 0.4
35 0.39
36 0.36
37 0.33
38 0.34
39 0.33
40 0.3
41 0.3
42 0.31
43 0.3
44 0.3
45 0.31
46 0.29
47 0.27
48 0.24
49 0.21
50 0.14
51 0.11
52 0.09
53 0.1
54 0.08
55 0.07
56 0.08
57 0.08
58 0.09
59 0.09
60 0.09
61 0.08
62 0.12
63 0.12
64 0.12
65 0.12
66 0.11
67 0.1
68 0.09
69 0.13
70 0.1
71 0.11
72 0.11
73 0.13
74 0.14
75 0.16
76 0.17
77 0.17
78 0.2
79 0.2
80 0.2
81 0.2
82 0.19
83 0.18
84 0.17
85 0.13
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.09
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.08
95 0.08
96 0.07
97 0.07
98 0.09
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.07
104 0.06
105 0.07
106 0.06
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.08
117 0.08
118 0.08
119 0.08
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.06
124 0.06
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.11
135 0.11
136 0.13
137 0.14
138 0.16
139 0.15
140 0.17
141 0.18
142 0.19
143 0.21
144 0.19
145 0.18
146 0.17
147 0.16
148 0.15
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.07
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.07
162 0.07
163 0.14
164 0.15
165 0.16
166 0.15
167 0.15
168 0.16
169 0.15
170 0.15
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.11
179 0.12
180 0.12
181 0.1
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.06
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.05
193 0.05
194 0.04
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.08
199 0.09
200 0.1
201 0.13
202 0.15
203 0.14
204 0.14
205 0.14
206 0.13
207 0.12
208 0.16
209 0.15
210 0.17
211 0.22
212 0.24
213 0.25
214 0.3
215 0.31
216 0.27
217 0.25
218 0.26
219 0.22
220 0.21
221 0.2
222 0.17
223 0.16
224 0.14
225 0.14
226 0.09
227 0.07
228 0.07
229 0.06
230 0.04
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.09
250 0.1
251 0.13
252 0.16
253 0.21
254 0.22
255 0.22
256 0.22
257 0.21
258 0.22
259 0.19
260 0.17
261 0.11
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.08
266 0.07
267 0.06
268 0.07
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.05
297 0.05
298 0.05
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.04
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.11
311 0.11
312 0.15
313 0.15
314 0.17
315 0.15
316 0.16
317 0.23
318 0.24
319 0.29
320 0.3
321 0.29
322 0.28
323 0.31
324 0.31
325 0.25
326 0.21
327 0.17
328 0.19
329 0.23
330 0.24
331 0.24
332 0.25
333 0.29
334 0.32
335 0.33
336 0.29
337 0.27
338 0.27
339 0.24
340 0.23
341 0.19
342 0.14
343 0.13
344 0.11
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.11
355 0.16
356 0.22
357 0.26
358 0.26
359 0.27
360 0.26
361 0.29
362 0.3
363 0.27
364 0.23
365 0.2
366 0.2
367 0.17
368 0.17
369 0.13
370 0.15
371 0.21
372 0.25
373 0.25
374 0.25
375 0.27
376 0.28
377 0.29
378 0.27
379 0.21
380 0.15
381 0.13
382 0.12
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.11
394 0.13
395 0.12
396 0.12
397 0.12
398 0.12
399 0.15
400 0.14
401 0.15
402 0.14
403 0.15
404 0.15
405 0.14
406 0.14
407 0.11
408 0.12
409 0.12
410 0.11
411 0.12
412 0.12
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.17
417 0.15
418 0.21
419 0.21
420 0.2
421 0.19
422 0.2
423 0.21
424 0.2
425 0.19
426 0.14
427 0.17
428 0.18
429 0.17
430 0.18
431 0.2
432 0.24
433 0.26
434 0.32
435 0.3
436 0.35
437 0.41
438 0.44
439 0.45
440 0.43
441 0.44
442 0.42
443 0.41
444 0.37
445 0.33
446 0.28
447 0.24
448 0.21
449 0.17
450 0.13
451 0.12
452 0.11
453 0.09
454 0.08
455 0.1
456 0.14
457 0.15
458 0.16
459 0.17
460 0.17
461 0.17
462 0.19
463 0.18
464 0.14
465 0.14
466 0.15
467 0.15
468 0.15
469 0.16
470 0.15
471 0.14
472 0.16
473 0.17
474 0.2
475 0.21
476 0.23
477 0.23
478 0.23
479 0.24
480 0.23
481 0.22
482 0.2
483 0.26
484 0.3
485 0.36
486 0.45
487 0.48
488 0.55
489 0.63
490 0.71
491 0.72
492 0.71
493 0.75
494 0.75
495 0.81
496 0.81