Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367JTY6

Protein Details
Accession A0A367JTY6    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-139NLLRKKYKLPLLKDPKKPKKPLNAYMLYHydrophilic
333-419VDEAEEKKEKKKKKKKESKGDDEDPMAEYFRKKKKKSKRRRSPSPSSDKHRSRSPSYRRRSPSPSHSRRRSRSPSYDRRRSRSPRRKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-131KKYKLPLLKDPKKPKK
339-352KKEKKKKKKKESKG
362-419FRKKKKKSKRRRSPSPSSDKHRSRSPSYRRRSPSPSHSRRRSRSPSYDRRRSRSPRRK
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR045844  RRM_Ist3-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
PS50102  RRM  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
cd12411  RRM_ist3_like  
Amino Acid Sequences MSFLKQFGHLSIQTRNIGSGKHLNPTKFTSILANVPFRPTSPWQMFAAEKLKGAKNEKMGQRMADISAEWKSMSEQDKKKYFDIYKEKKEVHDAAMEKALNNATSKQFYEENLLRKKYKLPLLKDPKKPKKPLNAYMLYFQAKKDDPSVNGLTIQEKTKKIAQQYAQLPESEKKPFTEKANKLHEEYRKKLAEYNASAEIQRINEREISNGNWSDDASWHAQYKNSAWIFAGGLDYGLTEGDIVCIFSQYGEIMHIILVRDRKTGKSKGYAFLQYEDQRSTILAVDNLNGATVLGRTIRVDHSYGPKKHKKEGEEDSEEEGPLMNVAPEYVEVDEAEEKKEKKKKKKKESKGDDEDPMAEYFRKKKKKSKRRRSPSPSSDKHRSRSPSYRRRSPSPSHSRRRSRSPSYDRRRSRSPRRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.33
4 0.3
5 0.32
6 0.36
7 0.32
8 0.38
9 0.43
10 0.42
11 0.44
12 0.5
13 0.49
14 0.4
15 0.39
16 0.35
17 0.33
18 0.37
19 0.38
20 0.37
21 0.33
22 0.35
23 0.35
24 0.31
25 0.33
26 0.32
27 0.37
28 0.36
29 0.38
30 0.36
31 0.39
32 0.39
33 0.39
34 0.4
35 0.31
36 0.3
37 0.32
38 0.34
39 0.37
40 0.42
41 0.41
42 0.44
43 0.51
44 0.54
45 0.56
46 0.53
47 0.48
48 0.46
49 0.42
50 0.35
51 0.28
52 0.22
53 0.18
54 0.18
55 0.17
56 0.14
57 0.12
58 0.12
59 0.17
60 0.23
61 0.3
62 0.35
63 0.44
64 0.51
65 0.55
66 0.55
67 0.58
68 0.56
69 0.57
70 0.61
71 0.62
72 0.65
73 0.69
74 0.69
75 0.62
76 0.65
77 0.58
78 0.5
79 0.47
80 0.39
81 0.33
82 0.36
83 0.34
84 0.27
85 0.26
86 0.24
87 0.18
88 0.18
89 0.19
90 0.17
91 0.19
92 0.2
93 0.2
94 0.21
95 0.21
96 0.27
97 0.29
98 0.35
99 0.39
100 0.43
101 0.42
102 0.42
103 0.47
104 0.46
105 0.5
106 0.49
107 0.48
108 0.55
109 0.65
110 0.72
111 0.77
112 0.81
113 0.84
114 0.85
115 0.87
116 0.85
117 0.84
118 0.85
119 0.83
120 0.82
121 0.77
122 0.69
123 0.63
124 0.59
125 0.51
126 0.42
127 0.33
128 0.28
129 0.22
130 0.22
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.27
135 0.29
136 0.24
137 0.25
138 0.24
139 0.21
140 0.19
141 0.22
142 0.21
143 0.2
144 0.22
145 0.26
146 0.28
147 0.3
148 0.35
149 0.34
150 0.37
151 0.42
152 0.45
153 0.41
154 0.38
155 0.37
156 0.33
157 0.33
158 0.28
159 0.24
160 0.19
161 0.23
162 0.26
163 0.31
164 0.39
165 0.41
166 0.46
167 0.55
168 0.55
169 0.54
170 0.57
171 0.57
172 0.55
173 0.53
174 0.52
175 0.45
176 0.44
177 0.45
178 0.42
179 0.41
180 0.35
181 0.35
182 0.3
183 0.28
184 0.28
185 0.24
186 0.21
187 0.15
188 0.16
189 0.13
190 0.11
191 0.15
192 0.15
193 0.16
194 0.16
195 0.16
196 0.18
197 0.18
198 0.17
199 0.13
200 0.13
201 0.12
202 0.11
203 0.12
204 0.1
205 0.11
206 0.12
207 0.12
208 0.14
209 0.14
210 0.15
211 0.21
212 0.18
213 0.18
214 0.16
215 0.16
216 0.16
217 0.15
218 0.14
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.04
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.04
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.08
245 0.11
246 0.11
247 0.15
248 0.16
249 0.2
250 0.26
251 0.31
252 0.33
253 0.39
254 0.42
255 0.44
256 0.47
257 0.48
258 0.43
259 0.39
260 0.41
261 0.36
262 0.35
263 0.31
264 0.26
265 0.21
266 0.2
267 0.18
268 0.14
269 0.11
270 0.1
271 0.1
272 0.1
273 0.11
274 0.1
275 0.09
276 0.07
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.08
285 0.11
286 0.12
287 0.14
288 0.17
289 0.26
290 0.35
291 0.41
292 0.49
293 0.55
294 0.57
295 0.64
296 0.67
297 0.62
298 0.62
299 0.65
300 0.64
301 0.62
302 0.6
303 0.56
304 0.51
305 0.46
306 0.37
307 0.28
308 0.18
309 0.12
310 0.1
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.05
315 0.05
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.08
321 0.12
322 0.13
323 0.15
324 0.2
325 0.21
326 0.29
327 0.38
328 0.46
329 0.53
330 0.64
331 0.72
332 0.79
333 0.89
334 0.91
335 0.94
336 0.96
337 0.95
338 0.94
339 0.9
340 0.83
341 0.74
342 0.64
343 0.54
344 0.44
345 0.34
346 0.26
347 0.24
348 0.29
349 0.36
350 0.45
351 0.5
352 0.6
353 0.7
354 0.79
355 0.87
356 0.89
357 0.91
358 0.92
359 0.96
360 0.96
361 0.96
362 0.95
363 0.95
364 0.93
365 0.91
366 0.9
367 0.87
368 0.83
369 0.81
370 0.77
371 0.75
372 0.76
373 0.78
374 0.78
375 0.8
376 0.84
377 0.83
378 0.84
379 0.83
380 0.82
381 0.82
382 0.83
383 0.84
384 0.84
385 0.88
386 0.9
387 0.89
388 0.91
389 0.9
390 0.88
391 0.89
392 0.89
393 0.89
394 0.89
395 0.92
396 0.91
397 0.89
398 0.89
399 0.89