Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DKP5

Protein Details
Accession A1DKP5    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-39TSAHKAPPMRFRRPKVADPLVRPKKRBasic
133-153ESQFTRPVRLQRRDPRAKTQEHydrophilic
418-437RILGKKVRKALKKREKNYDYBasic
518-540GTDTSRKKAKSKHPSSQPTPQPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-40PMRFRRPKVADPLVRPKKRV
410-433EKREREARRILGKKVRKALKKREK
485-508TPSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRL
524-528KKAKS
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG nfi:NFIA_006500  -  
Amino Acid Sequences MTLPASDANSQTHTSAHKAPPMRFRRPKVADPLVRPKKRVIARPAATSASSVGIDTKPTTRPVIPDITPATQAEKAAPGAPQNDFSVNGFSGPLLSETYVDYPIVITKRSLRVGLKHHIARFASKKTIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRAKTQEMNQDKGQTQKLTPQSSHQLGDAEREELEARKAAREKERAENLAQIAPSMGSAPKRANVPKQKTQQVSKTDMTPEEVARARIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFIPENGRMRMIPVEKWYKFGAKSQFRALTIEEAERFMAKKIKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPAGADGLEADEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEETKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKDYEEEELREKREREARRILGKKVRKALKKREKNYDYSSGSDVNPYSDEESSDDSEAERLREEERKAEEEKNKKDSAPSTRGNVTPSGRPKHTEPLKKGPGAASRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKAKSKHPSSQPTPQPTSRALSPTAPPGQVGKKRIRNVAGAGSVSDADGGAASGGEMSESGKIKKLKLNPPAATSQGGTPQGSRAGSPTPIGSKGLAASRASSPESLRGQNRISTPVPSGTLSFPTPAEIHAAIPQTGILSSDLLKIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGVLKDGQR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.32
3 0.34
4 0.38
5 0.43
6 0.49
7 0.57
8 0.63
9 0.69
10 0.71
11 0.74
12 0.77
13 0.78
14 0.8
15 0.8
16 0.82
17 0.79
18 0.78
19 0.82
20 0.82
21 0.8
22 0.74
23 0.69
24 0.68
25 0.68
26 0.68
27 0.66
28 0.66
29 0.65
30 0.7
31 0.68
32 0.62
33 0.54
34 0.45
35 0.37
36 0.28
37 0.23
38 0.17
39 0.15
40 0.13
41 0.15
42 0.16
43 0.19
44 0.2
45 0.23
46 0.27
47 0.26
48 0.29
49 0.32
50 0.37
51 0.34
52 0.38
53 0.39
54 0.37
55 0.37
56 0.34
57 0.33
58 0.28
59 0.27
60 0.22
61 0.2
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.2
67 0.21
68 0.22
69 0.22
70 0.22
71 0.21
72 0.21
73 0.22
74 0.18
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.12
79 0.11
80 0.11
81 0.08
82 0.09
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.15
94 0.2
95 0.26
96 0.28
97 0.33
98 0.32
99 0.37
100 0.44
101 0.5
102 0.53
103 0.53
104 0.53
105 0.54
106 0.51
107 0.52
108 0.52
109 0.49
110 0.47
111 0.43
112 0.47
113 0.5
114 0.58
115 0.54
116 0.53
117 0.53
118 0.55
119 0.57
120 0.54
121 0.51
122 0.48
123 0.46
124 0.47
125 0.45
126 0.46
127 0.52
128 0.57
129 0.62
130 0.65
131 0.75
132 0.79
133 0.81
134 0.82
135 0.8
136 0.79
137 0.72
138 0.7
139 0.7
140 0.65
141 0.65
142 0.57
143 0.54
144 0.49
145 0.51
146 0.47
147 0.39
148 0.34
149 0.37
150 0.42
151 0.41
152 0.4
153 0.4
154 0.43
155 0.44
156 0.44
157 0.37
158 0.32
159 0.27
160 0.31
161 0.27
162 0.2
163 0.16
164 0.16
165 0.16
166 0.14
167 0.16
168 0.14
169 0.13
170 0.18
171 0.22
172 0.26
173 0.34
174 0.4
175 0.43
176 0.49
177 0.55
178 0.52
179 0.5
180 0.49
181 0.42
182 0.38
183 0.33
184 0.24
185 0.18
186 0.15
187 0.13
188 0.1
189 0.1
190 0.08
191 0.11
192 0.12
193 0.14
194 0.2
195 0.24
196 0.33
197 0.42
198 0.49
199 0.56
200 0.63
201 0.69
202 0.7
203 0.72
204 0.7
205 0.66
206 0.64
207 0.57
208 0.52
209 0.47
210 0.41
211 0.37
212 0.31
213 0.25
214 0.23
215 0.23
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.16
223 0.17
224 0.19
225 0.19
226 0.23
227 0.23
228 0.22
229 0.22
230 0.21
231 0.18
232 0.17
233 0.18
234 0.18
235 0.19
236 0.18
237 0.18
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.13
242 0.09
243 0.08
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.07
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.07
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.11
258 0.13
259 0.13
260 0.13
261 0.13
262 0.14
263 0.18
264 0.18
265 0.16
266 0.2
267 0.29
268 0.29
269 0.31
270 0.31
271 0.3
272 0.29
273 0.34
274 0.37
275 0.35
276 0.38
277 0.41
278 0.43
279 0.4
280 0.4
281 0.35
282 0.28
283 0.23
284 0.23
285 0.17
286 0.14
287 0.14
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.14
292 0.13
293 0.19
294 0.28
295 0.37
296 0.44
297 0.48
298 0.51
299 0.54
300 0.56
301 0.52
302 0.53
303 0.48
304 0.43
305 0.48
306 0.52
307 0.47
308 0.48
309 0.51
310 0.42
311 0.39
312 0.41
313 0.35
314 0.3
315 0.32
316 0.37
317 0.4
318 0.45
319 0.44
320 0.42
321 0.42
322 0.45
323 0.42
324 0.44
325 0.41
326 0.37
327 0.4
328 0.39
329 0.36
330 0.3
331 0.27
332 0.18
333 0.12
334 0.09
335 0.06
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.03
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.07
353 0.09
354 0.09
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.07
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.09
368 0.12
369 0.15
370 0.2
371 0.28
372 0.34
373 0.36
374 0.43
375 0.49
376 0.54
377 0.55
378 0.51
379 0.44
380 0.4
381 0.38
382 0.32
383 0.26
384 0.19
385 0.17
386 0.17
387 0.16
388 0.14
389 0.15
390 0.15
391 0.15
392 0.14
393 0.16
394 0.18
395 0.2
396 0.23
397 0.24
398 0.26
399 0.32
400 0.36
401 0.39
402 0.46
403 0.5
404 0.55
405 0.59
406 0.6
407 0.61
408 0.64
409 0.63
410 0.62
411 0.64
412 0.63
413 0.68
414 0.73
415 0.75
416 0.78
417 0.79
418 0.82
419 0.79
420 0.77
421 0.74
422 0.71
423 0.63
424 0.54
425 0.5
426 0.41
427 0.36
428 0.31
429 0.25
430 0.17
431 0.15
432 0.13
433 0.13
434 0.11
435 0.11
436 0.11
437 0.13
438 0.14
439 0.14
440 0.13
441 0.11
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.1
446 0.09
447 0.11
448 0.17
449 0.18
450 0.21
451 0.24
452 0.28
453 0.31
454 0.37
455 0.43
456 0.47
457 0.52
458 0.53
459 0.51
460 0.48
461 0.49
462 0.48
463 0.48
464 0.46
465 0.43
466 0.41
467 0.42
468 0.43
469 0.41
470 0.39
471 0.33
472 0.32
473 0.37
474 0.39
475 0.37
476 0.39
477 0.4
478 0.46
479 0.53
480 0.55
481 0.54
482 0.59
483 0.64
484 0.62
485 0.6
486 0.55
487 0.54
488 0.54
489 0.54
490 0.51
491 0.48
492 0.49
493 0.5
494 0.5
495 0.45
496 0.44
497 0.42
498 0.41
499 0.39
500 0.37
501 0.34
502 0.3
503 0.31
504 0.25
505 0.21
506 0.2
507 0.21
508 0.24
509 0.31
510 0.34
511 0.34
512 0.42
513 0.52
514 0.58
515 0.65
516 0.72
517 0.76
518 0.83
519 0.83
520 0.84
521 0.82
522 0.79
523 0.75
524 0.68
525 0.61
526 0.54
527 0.52
528 0.45
529 0.4
530 0.33
531 0.3
532 0.29
533 0.33
534 0.33
535 0.29
536 0.27
537 0.28
538 0.34
539 0.37
540 0.42
541 0.44
542 0.49
543 0.54
544 0.6
545 0.59
546 0.54
547 0.51
548 0.51
549 0.44
550 0.36
551 0.31
552 0.26
553 0.22
554 0.18
555 0.15
556 0.08
557 0.05
558 0.05
559 0.04
560 0.03
561 0.03
562 0.03
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.04
568 0.08
569 0.1
570 0.11
571 0.17
572 0.2
573 0.24
574 0.31
575 0.39
576 0.45
577 0.53
578 0.62
579 0.59
580 0.61
581 0.61
582 0.57
583 0.49
584 0.41
585 0.34
586 0.3
587 0.29
588 0.25
589 0.22
590 0.22
591 0.23
592 0.23
593 0.21
594 0.17
595 0.18
596 0.19
597 0.19
598 0.2
599 0.19
600 0.21
601 0.22
602 0.2
603 0.18
604 0.19
605 0.21
606 0.22
607 0.19
608 0.2
609 0.21
610 0.24
611 0.24
612 0.24
613 0.22
614 0.25
615 0.3
616 0.34
617 0.35
618 0.37
619 0.38
620 0.41
621 0.42
622 0.41
623 0.38
624 0.34
625 0.34
626 0.32
627 0.31
628 0.27
629 0.27
630 0.23
631 0.25
632 0.23
633 0.21
634 0.18
635 0.19
636 0.18
637 0.17
638 0.19
639 0.16
640 0.16
641 0.19
642 0.21
643 0.18
644 0.18
645 0.17
646 0.14
647 0.13
648 0.13
649 0.09
650 0.09
651 0.1
652 0.14
653 0.16
654 0.16
655 0.18
656 0.22
657 0.25
658 0.26
659 0.29
660 0.28
661 0.36
662 0.43
663 0.48
664 0.47
665 0.56
666 0.64
667 0.64
668 0.63
669 0.55
670 0.49
671 0.44
672 0.48
673 0.45
674 0.38
675 0.36
676 0.35
677 0.35
678 0.34
679 0.33
680 0.25
681 0.19
682 0.18
683 0.19
684 0.21
685 0.22
686 0.23
687 0.27
688 0.29
689 0.28
690 0.32
691 0.32
692 0.34