Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

H9CNP6

Protein Details
Accession H9CNP6    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-25MLNIIKSKLKNTYKKKSLNSLNVVIHydrophilic
67-98FNSYNWKIEKQLRKERLRRRLRKLSTNRIFVSHydrophilic
123-144YLLKLKKRYTRLFKRVKFVRKLHydrophilic
268-288KALVRKAKIKKIKLNERSKYFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
78-89LRKERLRRRLRK
256-281KLRRKRKLLRYLKALVRKAKIKKIKL
Subcellular Location(s) mito 13, nucl 12.5, cyto_nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007980  Ribosomal_VAR1  
Gene Ontology GO:0005739  C:mitochondrion  
GO:0005840  C:ribosome  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
GO:0006412  P:translation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05316  VAR1  
Amino Acid Sequences MLNIIKSKLKNTYKKKSLNSLNVVIRNKDFVPAVRDWKNSIYLYNKNALSLIPVASRLVMKLIKGYFNSYNWKIEKQLRKERLRRRLRKLSTNRIFVSDGEFKHTNDKVNITLYVYNRQKLNYLLKLKKRYTRLFKRVKFVRKLQLIRNIGLNILKKQQEKSKILTNVLPNYSSKISIIQNFYYKKFIVKSFRRLKYYMFYKQLLYINKAKFENSYLQGLINLIRKIYKKNVEFNIINLKYFYFNSDIFTQPLVLKLRRKRKLLRYLKALVRKAKIKKIKLNERSKYFFELNNLFTVNNLDTTNNLLNNLIEENKTSSKYLKKIVLNNIKYKRVSGVRIEAAGRLTRRYTASRSQHKVRYKGNLVNAYSSIKGYPSSVIRGNYKPNLQYTKLNSKSRIGSFGVKGWVSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.85
3 0.85
4 0.86
5 0.85
6 0.82
7 0.8
8 0.77
9 0.76
10 0.72
11 0.65
12 0.56
13 0.5
14 0.43
15 0.37
16 0.31
17 0.27
18 0.29
19 0.31
20 0.38
21 0.4
22 0.42
23 0.42
24 0.43
25 0.46
26 0.4
27 0.4
28 0.39
29 0.39
30 0.42
31 0.45
32 0.42
33 0.37
34 0.36
35 0.31
36 0.27
37 0.22
38 0.2
39 0.14
40 0.14
41 0.14
42 0.15
43 0.15
44 0.12
45 0.15
46 0.14
47 0.13
48 0.18
49 0.21
50 0.24
51 0.24
52 0.3
53 0.29
54 0.32
55 0.4
56 0.37
57 0.42
58 0.41
59 0.42
60 0.42
61 0.48
62 0.54
63 0.55
64 0.63
65 0.66
66 0.74
67 0.81
68 0.86
69 0.87
70 0.89
71 0.89
72 0.89
73 0.9
74 0.87
75 0.88
76 0.88
77 0.89
78 0.86
79 0.84
80 0.75
81 0.67
82 0.61
83 0.5
84 0.46
85 0.41
86 0.33
87 0.32
88 0.32
89 0.28
90 0.34
91 0.36
92 0.34
93 0.3
94 0.32
95 0.27
96 0.28
97 0.28
98 0.23
99 0.26
100 0.23
101 0.3
102 0.31
103 0.32
104 0.31
105 0.31
106 0.3
107 0.31
108 0.37
109 0.36
110 0.42
111 0.48
112 0.55
113 0.63
114 0.67
115 0.68
116 0.7
117 0.71
118 0.72
119 0.75
120 0.77
121 0.79
122 0.79
123 0.82
124 0.82
125 0.82
126 0.79
127 0.75
128 0.74
129 0.73
130 0.72
131 0.69
132 0.7
133 0.63
134 0.56
135 0.52
136 0.43
137 0.35
138 0.33
139 0.28
140 0.21
141 0.23
142 0.26
143 0.25
144 0.28
145 0.34
146 0.39
147 0.41
148 0.42
149 0.45
150 0.45
151 0.45
152 0.46
153 0.44
154 0.4
155 0.37
156 0.34
157 0.26
158 0.26
159 0.24
160 0.2
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.19
165 0.22
166 0.2
167 0.26
168 0.27
169 0.29
170 0.28
171 0.26
172 0.24
173 0.23
174 0.27
175 0.31
176 0.35
177 0.44
178 0.51
179 0.57
180 0.58
181 0.57
182 0.54
183 0.52
184 0.53
185 0.5
186 0.44
187 0.4
188 0.36
189 0.4
190 0.42
191 0.36
192 0.33
193 0.33
194 0.29
195 0.32
196 0.31
197 0.27
198 0.24
199 0.24
200 0.25
201 0.2
202 0.21
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.16
208 0.15
209 0.13
210 0.12
211 0.14
212 0.16
213 0.19
214 0.25
215 0.31
216 0.31
217 0.38
218 0.41
219 0.45
220 0.44
221 0.43
222 0.46
223 0.39
224 0.35
225 0.28
226 0.25
227 0.2
228 0.2
229 0.2
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.16
236 0.17
237 0.16
238 0.13
239 0.17
240 0.18
241 0.2
242 0.26
243 0.33
244 0.44
245 0.5
246 0.57
247 0.62
248 0.69
249 0.76
250 0.79
251 0.79
252 0.77
253 0.77
254 0.77
255 0.76
256 0.72
257 0.67
258 0.62
259 0.62
260 0.61
261 0.62
262 0.64
263 0.64
264 0.67
265 0.71
266 0.76
267 0.78
268 0.83
269 0.81
270 0.8
271 0.76
272 0.7
273 0.66
274 0.57
275 0.49
276 0.44
277 0.4
278 0.34
279 0.31
280 0.29
281 0.23
282 0.21
283 0.21
284 0.16
285 0.13
286 0.12
287 0.1
288 0.1
289 0.15
290 0.18
291 0.15
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.14
296 0.15
297 0.12
298 0.1
299 0.11
300 0.15
301 0.17
302 0.19
303 0.19
304 0.23
305 0.28
306 0.33
307 0.38
308 0.41
309 0.45
310 0.51
311 0.6
312 0.66
313 0.65
314 0.71
315 0.71
316 0.7
317 0.64
318 0.58
319 0.55
320 0.5
321 0.48
322 0.44
323 0.45
324 0.41
325 0.43
326 0.42
327 0.37
328 0.34
329 0.33
330 0.28
331 0.24
332 0.22
333 0.23
334 0.26
335 0.29
336 0.33
337 0.38
338 0.47
339 0.55
340 0.62
341 0.67
342 0.72
343 0.76
344 0.78
345 0.75
346 0.75
347 0.73
348 0.72
349 0.72
350 0.71
351 0.65
352 0.6
353 0.55
354 0.47
355 0.4
356 0.34
357 0.26
358 0.18
359 0.17
360 0.15
361 0.18
362 0.18
363 0.22
364 0.26
365 0.3
366 0.35
367 0.39
368 0.46
369 0.48
370 0.51
371 0.51
372 0.54
373 0.57
374 0.55
375 0.58
376 0.58
377 0.63
378 0.66
379 0.69
380 0.64
381 0.63
382 0.68
383 0.63
384 0.6
385 0.53
386 0.51
387 0.47
388 0.48
389 0.47
390 0.39