Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367JJC6

Protein Details
Accession A0A367JJC6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
468-500KSPTTKQERTQNKPESKRENRRSDKKKLASINAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
482-494ESKRENRRSDKKK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 13.5, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR007275  YTH_domain  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF04146  YTH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50882  YTH  
Amino Acid Sequences MPKENHSNQCFMSVETNDDCNENTNHLFQYTSTNNVVALDDEYNSEENDSERKRSYIDDSGMFHCDEDLKEEEYQQESNSKEELYQKGLDLPPLKSFLKSAIESKNTLSQDKNDASIYTQLMSSLDMTTRKLHNEYSISCFEDHRSEHKLSSSAPSGYDYLDEYRELQMLEMQKYFQLSASAPASQMANEDIIDEEHEPISDMNDFCNNELVVTANESQTCSITMQGQQTVQSDENEYDYQETTAAKDDNRELVDDHNLSWKELADKCYGQTEDKLSLSTVDPNNPFLEVYFERMRQREYPFSSGGPPYIYINPYYMPYQSCYTAMSTDYTPMEQPRNHESFIMEVTNIAGAVKLKHLYELFFDPNVLYHRDDYTAFVCYQSLDSLTAAVGQYYGRRFMGKKLHCCAHMRENFTTWTSLGTQTTECTMEPSSSTSSYVGNRSDAEKKNSKAHDGKQKKHFSFTIHDEKSPTTKQERTQNKPESKRENRRSDKKKLASINADCFWRPLRSSEYILATSNTTEDLIFAKATGYWSVDDFHVDFINTLFTSCKNVYLIFIPQQADYISGFGKITSKAQPIHSMNLKNTPFAIKKSEFQIVKEGRNWRNILKIRWINK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.3
3 0.31
4 0.26
5 0.26
6 0.25
7 0.22
8 0.23
9 0.22
10 0.22
11 0.23
12 0.23
13 0.23
14 0.23
15 0.19
16 0.26
17 0.24
18 0.27
19 0.26
20 0.25
21 0.24
22 0.25
23 0.25
24 0.17
25 0.17
26 0.13
27 0.12
28 0.13
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.14
33 0.12
34 0.12
35 0.2
36 0.22
37 0.25
38 0.27
39 0.28
40 0.29
41 0.32
42 0.37
43 0.37
44 0.38
45 0.38
46 0.39
47 0.41
48 0.42
49 0.38
50 0.31
51 0.24
52 0.21
53 0.17
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.19
58 0.2
59 0.23
60 0.23
61 0.24
62 0.21
63 0.23
64 0.21
65 0.23
66 0.23
67 0.2
68 0.2
69 0.26
70 0.28
71 0.27
72 0.28
73 0.26
74 0.32
75 0.32
76 0.35
77 0.32
78 0.3
79 0.29
80 0.32
81 0.32
82 0.26
83 0.26
84 0.25
85 0.28
86 0.28
87 0.3
88 0.34
89 0.36
90 0.37
91 0.39
92 0.42
93 0.38
94 0.39
95 0.35
96 0.3
97 0.35
98 0.35
99 0.35
100 0.28
101 0.26
102 0.26
103 0.27
104 0.25
105 0.17
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.14
110 0.13
111 0.09
112 0.11
113 0.11
114 0.13
115 0.18
116 0.2
117 0.22
118 0.24
119 0.24
120 0.27
121 0.31
122 0.32
123 0.33
124 0.34
125 0.33
126 0.31
127 0.31
128 0.27
129 0.27
130 0.27
131 0.25
132 0.28
133 0.28
134 0.29
135 0.3
136 0.3
137 0.26
138 0.29
139 0.28
140 0.23
141 0.22
142 0.23
143 0.21
144 0.19
145 0.19
146 0.15
147 0.13
148 0.13
149 0.13
150 0.13
151 0.13
152 0.14
153 0.13
154 0.11
155 0.13
156 0.16
157 0.18
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.14
164 0.12
165 0.1
166 0.13
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.12
173 0.12
174 0.09
175 0.08
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.08
183 0.08
184 0.08
185 0.08
186 0.07
187 0.08
188 0.1
189 0.09
190 0.09
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.16
195 0.15
196 0.12
197 0.12
198 0.12
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.11
208 0.09
209 0.08
210 0.09
211 0.12
212 0.14
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.17
217 0.19
218 0.18
219 0.15
220 0.14
221 0.13
222 0.16
223 0.14
224 0.13
225 0.12
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.08
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.12
235 0.13
236 0.16
237 0.16
238 0.16
239 0.14
240 0.14
241 0.18
242 0.16
243 0.15
244 0.18
245 0.18
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.17
250 0.19
251 0.21
252 0.18
253 0.19
254 0.19
255 0.23
256 0.23
257 0.2
258 0.19
259 0.19
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.14
264 0.14
265 0.14
266 0.17
267 0.16
268 0.17
269 0.18
270 0.19
271 0.19
272 0.18
273 0.17
274 0.11
275 0.15
276 0.11
277 0.16
278 0.17
279 0.19
280 0.21
281 0.22
282 0.25
283 0.24
284 0.28
285 0.29
286 0.31
287 0.32
288 0.31
289 0.31
290 0.31
291 0.27
292 0.24
293 0.17
294 0.14
295 0.12
296 0.13
297 0.12
298 0.1
299 0.11
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.11
304 0.1
305 0.12
306 0.13
307 0.13
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.11
312 0.11
313 0.11
314 0.09
315 0.11
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.15
321 0.15
322 0.18
323 0.23
324 0.25
325 0.25
326 0.25
327 0.23
328 0.2
329 0.21
330 0.18
331 0.11
332 0.08
333 0.08
334 0.07
335 0.07
336 0.05
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.07
343 0.09
344 0.1
345 0.1
346 0.12
347 0.15
348 0.16
349 0.14
350 0.15
351 0.13
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.13
356 0.12
357 0.13
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.12
365 0.11
366 0.1
367 0.1
368 0.09
369 0.08
370 0.07
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.08
380 0.09
381 0.11
382 0.1
383 0.12
384 0.13
385 0.19
386 0.29
387 0.34
388 0.4
389 0.45
390 0.48
391 0.49
392 0.52
393 0.51
394 0.51
395 0.49
396 0.47
397 0.43
398 0.41
399 0.4
400 0.37
401 0.33
402 0.23
403 0.19
404 0.16
405 0.16
406 0.14
407 0.14
408 0.13
409 0.12
410 0.14
411 0.13
412 0.11
413 0.12
414 0.12
415 0.11
416 0.11
417 0.13
418 0.14
419 0.14
420 0.15
421 0.14
422 0.15
423 0.17
424 0.2
425 0.19
426 0.18
427 0.18
428 0.21
429 0.29
430 0.32
431 0.37
432 0.4
433 0.42
434 0.5
435 0.51
436 0.55
437 0.53
438 0.56
439 0.6
440 0.63
441 0.68
442 0.7
443 0.78
444 0.72
445 0.71
446 0.66
447 0.59
448 0.56
449 0.56
450 0.57
451 0.49
452 0.48
453 0.44
454 0.44
455 0.45
456 0.41
457 0.38
458 0.33
459 0.36
460 0.41
461 0.49
462 0.57
463 0.6
464 0.67
465 0.72
466 0.75
467 0.79
468 0.82
469 0.83
470 0.84
471 0.87
472 0.87
473 0.88
474 0.89
475 0.91
476 0.9
477 0.9
478 0.9
479 0.86
480 0.84
481 0.8
482 0.78
483 0.77
484 0.74
485 0.71
486 0.63
487 0.58
488 0.49
489 0.44
490 0.38
491 0.32
492 0.27
493 0.23
494 0.26
495 0.28
496 0.32
497 0.35
498 0.36
499 0.35
500 0.34
501 0.32
502 0.27
503 0.23
504 0.19
505 0.15
506 0.11
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.09
512 0.09
513 0.08
514 0.09
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.11
519 0.12
520 0.14
521 0.14
522 0.15
523 0.14
524 0.15
525 0.14
526 0.13
527 0.13
528 0.11
529 0.14
530 0.11
531 0.12
532 0.11
533 0.11
534 0.17
535 0.17
536 0.2
537 0.18
538 0.18
539 0.2
540 0.22
541 0.26
542 0.25
543 0.29
544 0.27
545 0.26
546 0.26
547 0.24
548 0.23
549 0.18
550 0.16
551 0.11
552 0.11
553 0.11
554 0.11
555 0.14
556 0.14
557 0.17
558 0.22
559 0.27
560 0.29
561 0.33
562 0.42
563 0.42
564 0.49
565 0.53
566 0.52
567 0.5
568 0.56
569 0.54
570 0.46
571 0.44
572 0.44
573 0.4
574 0.38
575 0.43
576 0.37
577 0.41
578 0.44
579 0.51
580 0.45
581 0.44
582 0.5
583 0.48
584 0.51
585 0.53
586 0.57
587 0.54
588 0.61
589 0.62
590 0.55
591 0.59
592 0.6
593 0.59
594 0.6