Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367KC55

Protein Details
Accession A0A367KC55    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
166-193VNGFRSIQKSKKKGKKKNMTNNQPQPIVHydrophilic
209-237EQYKEERKGLRERQKRQRDWEKKQAQRSTBasic
253-274TRSYSRSRSRSRSKSRTPSPTPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
174-182KSKKKGKKK
215-235RKGLRERQKRQRDWEKKQAQR
242-248RSRSRSR
258-266RSRSRSRSK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, mito_nucl 12.5, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000467  G_patch_dom  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
IPR034653  SPF45_RRM  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF01585  G-patch  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50174  G_PATCH  
PS50102  RRM  
CDD cd12647  RRM_UHM_SPF45  
Amino Acid Sequences MSFSLYGSLPPSKTEKKGEATKQKQDAPSSSLYSLYSSLPPPETNRSSTSSSAAATTVTAVNTSNTEAPAAPIVPTPVVPVTAHPTPQGWSAINKFRPVLRRPTIQAKPKINRSVIPAGATIVSVETVNKEKTDKALDNAVVQQETKAANTIDLGAIPLLSTPDDVNGFRSIQKSKKKGKKKNMTNNQPQPIVFNMLEDYDPHRPNDYEQYKEERKGLRERQKRQRDWEKKQAQRSTLSLSRSRSRSRSPSYTRSYSRSRSRSRSKSRTPSPTPGSQVPKYHRTNSSVYNQPFVPPPSISPAKIDLNETAEDAYKRRLMLSQQQQQMHKEPQPPIELPQSKSDITRLATVQNIAKKVLAKYGWQEGQGLGKEGEGIKEALQVKPIGHGNGVIIDSSTQKAANIPGKKEMKEKMTRTVLLTNMVGPGEVDDMLQEETAEECSKYGKVERCLIFEVPRGKVPDDKAVRIFVKFTEIEAAKRAVQDLNGRYFDGRIVSATFYDTRRFDKLDLAPSKEELMASLQIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.49
3 0.52
4 0.62
5 0.69
6 0.72
7 0.75
8 0.79
9 0.79
10 0.8
11 0.77
12 0.73
13 0.67
14 0.61
15 0.57
16 0.51
17 0.44
18 0.38
19 0.33
20 0.29
21 0.26
22 0.23
23 0.21
24 0.18
25 0.21
26 0.22
27 0.24
28 0.27
29 0.34
30 0.36
31 0.37
32 0.39
33 0.41
34 0.42
35 0.42
36 0.4
37 0.33
38 0.29
39 0.26
40 0.22
41 0.18
42 0.13
43 0.13
44 0.12
45 0.1
46 0.1
47 0.1
48 0.1
49 0.11
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.13
54 0.13
55 0.13
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.11
60 0.13
61 0.12
62 0.12
63 0.13
64 0.12
65 0.13
66 0.12
67 0.13
68 0.18
69 0.2
70 0.21
71 0.19
72 0.2
73 0.2
74 0.22
75 0.23
76 0.19
77 0.21
78 0.27
79 0.35
80 0.37
81 0.38
82 0.37
83 0.39
84 0.46
85 0.46
86 0.5
87 0.47
88 0.5
89 0.53
90 0.62
91 0.65
92 0.67
93 0.71
94 0.71
95 0.73
96 0.76
97 0.78
98 0.71
99 0.65
100 0.62
101 0.61
102 0.52
103 0.45
104 0.36
105 0.29
106 0.27
107 0.24
108 0.17
109 0.09
110 0.08
111 0.06
112 0.06
113 0.07
114 0.11
115 0.12
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.18
120 0.25
121 0.25
122 0.24
123 0.29
124 0.29
125 0.3
126 0.32
127 0.3
128 0.23
129 0.21
130 0.19
131 0.15
132 0.15
133 0.13
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.11
138 0.12
139 0.09
140 0.08
141 0.08
142 0.06
143 0.06
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.06
151 0.08
152 0.09
153 0.11
154 0.12
155 0.13
156 0.15
157 0.18
158 0.21
159 0.28
160 0.37
161 0.43
162 0.52
163 0.61
164 0.7
165 0.77
166 0.84
167 0.87
168 0.89
169 0.92
170 0.92
171 0.93
172 0.93
173 0.92
174 0.86
175 0.77
176 0.66
177 0.56
178 0.47
179 0.41
180 0.3
181 0.21
182 0.16
183 0.14
184 0.14
185 0.13
186 0.16
187 0.18
188 0.19
189 0.19
190 0.21
191 0.2
192 0.22
193 0.32
194 0.32
195 0.29
196 0.3
197 0.38
198 0.4
199 0.41
200 0.45
201 0.38
202 0.39
203 0.45
204 0.52
205 0.54
206 0.6
207 0.68
208 0.73
209 0.8
210 0.81
211 0.82
212 0.83
213 0.84
214 0.83
215 0.84
216 0.83
217 0.79
218 0.82
219 0.78
220 0.7
221 0.62
222 0.55
223 0.5
224 0.44
225 0.41
226 0.36
227 0.35
228 0.37
229 0.39
230 0.4
231 0.38
232 0.4
233 0.44
234 0.47
235 0.52
236 0.53
237 0.57
238 0.6
239 0.62
240 0.59
241 0.56
242 0.56
243 0.54
244 0.56
245 0.56
246 0.57
247 0.59
248 0.66
249 0.72
250 0.76
251 0.79
252 0.79
253 0.8
254 0.81
255 0.82
256 0.78
257 0.75
258 0.7
259 0.64
260 0.59
261 0.55
262 0.53
263 0.47
264 0.47
265 0.43
266 0.48
267 0.47
268 0.48
269 0.46
270 0.44
271 0.43
272 0.42
273 0.44
274 0.43
275 0.4
276 0.37
277 0.34
278 0.31
279 0.3
280 0.27
281 0.23
282 0.15
283 0.15
284 0.19
285 0.21
286 0.2
287 0.2
288 0.22
289 0.22
290 0.23
291 0.23
292 0.18
293 0.19
294 0.19
295 0.17
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.13
301 0.12
302 0.12
303 0.13
304 0.14
305 0.16
306 0.25
307 0.34
308 0.4
309 0.45
310 0.49
311 0.51
312 0.52
313 0.53
314 0.49
315 0.45
316 0.43
317 0.4
318 0.4
319 0.42
320 0.39
321 0.37
322 0.41
323 0.4
324 0.36
325 0.38
326 0.37
327 0.33
328 0.33
329 0.31
330 0.25
331 0.22
332 0.23
333 0.19
334 0.18
335 0.18
336 0.19
337 0.22
338 0.22
339 0.22
340 0.19
341 0.2
342 0.21
343 0.21
344 0.24
345 0.22
346 0.2
347 0.22
348 0.29
349 0.29
350 0.27
351 0.27
352 0.22
353 0.26
354 0.24
355 0.23
356 0.15
357 0.13
358 0.14
359 0.14
360 0.14
361 0.1
362 0.1
363 0.08
364 0.14
365 0.16
366 0.15
367 0.17
368 0.17
369 0.16
370 0.2
371 0.22
372 0.17
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.15
377 0.15
378 0.1
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.1
383 0.1
384 0.08
385 0.08
386 0.1
387 0.16
388 0.23
389 0.26
390 0.28
391 0.36
392 0.41
393 0.43
394 0.48
395 0.48
396 0.49
397 0.53
398 0.54
399 0.55
400 0.56
401 0.56
402 0.53
403 0.52
404 0.45
405 0.39
406 0.36
407 0.27
408 0.22
409 0.2
410 0.16
411 0.11
412 0.1
413 0.08
414 0.08
415 0.07
416 0.06
417 0.07
418 0.08
419 0.08
420 0.07
421 0.06
422 0.06
423 0.09
424 0.1
425 0.08
426 0.08
427 0.1
428 0.11
429 0.13
430 0.2
431 0.25
432 0.29
433 0.38
434 0.41
435 0.43
436 0.46
437 0.46
438 0.42
439 0.42
440 0.42
441 0.36
442 0.38
443 0.37
444 0.35
445 0.38
446 0.38
447 0.42
448 0.42
449 0.44
450 0.42
451 0.46
452 0.46
453 0.41
454 0.39
455 0.3
456 0.3
457 0.26
458 0.24
459 0.26
460 0.25
461 0.26
462 0.28
463 0.3
464 0.25
465 0.26
466 0.27
467 0.2
468 0.23
469 0.29
470 0.31
471 0.36
472 0.36
473 0.36
474 0.35
475 0.34
476 0.32
477 0.26
478 0.21
479 0.15
480 0.15
481 0.16
482 0.16
483 0.19
484 0.2
485 0.2
486 0.25
487 0.26
488 0.29
489 0.32
490 0.35
491 0.33
492 0.38
493 0.42
494 0.47
495 0.5
496 0.52
497 0.49
498 0.48
499 0.49
500 0.41
501 0.35
502 0.25
503 0.23