Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367JYC2

Protein Details
Accession A0A367JYC2    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-109IHSSLSKRDKNDKKSRQQDRKDVTQDKNHydrophilic
571-602LEKFWAYNHYRKDKKKLKFNPRMKQLLEKYKTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-138GSRRPGRGRGRA
584-587KKKL
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006607  DM15  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MVTLVAEPVHSETEPKKVPAPIPAVNVWQVNKLNTPQTSAVNDDAWPAPVEALKQQEVVPEKSISTKSISKGQWKPLTPTIIHSSLSKRDKNDKKSRQQDRKDVTQDKNENSVPEIQFNRSYALRGGSRRPGRGRGRADIGFRRSFKPYQDADTLKSYILQQIEYYFSIDNLCKDVYLRSQMNTEGYVPISLIAGFNRIKNLTVDMDLVRASLQLSELLEINQDATMLRRKEGWETWILPAKKTTKAESNPQPEARRKSIQPEVRRQSIQEKPQKEDHEEDLFDFEDEEWIDGSRPNTIKKYYISDEEEEDDEFDDDKVARIMIVTQHKRDRTHQHFDRAKMNDDILDMINEGLYQYETGIGRKTQVPQSKIGTLDPEHFKKQKEDAKPTRFYPVQPESLPANAPIHKEAHVGWVLSDQPYHPSGDGLLSTSLGKSPALSTSLESNMAHSFGSFQHPSHELLRDKFVQHKYHKYHAKALKERKQLGVGQSHEMNTLYRFWSHFLRDHFNNRMYNEFKRLSIEDANQGYRYGLECLFRFYSYGLERRYRPDVFLDFEQLTLEDYDHGSLYGLEKFWAYNHYRKDKKKLKFNPRMKQLLEKYKTIKDFRNSSILQKTEGATYSVPHHQNPKTKKEKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.31
3 0.34
4 0.37
5 0.39
6 0.43
7 0.48
8 0.45
9 0.46
10 0.46
11 0.44
12 0.43
13 0.44
14 0.37
15 0.37
16 0.35
17 0.32
18 0.34
19 0.35
20 0.38
21 0.35
22 0.39
23 0.35
24 0.37
25 0.37
26 0.36
27 0.34
28 0.29
29 0.28
30 0.26
31 0.24
32 0.21
33 0.19
34 0.16
35 0.14
36 0.14
37 0.16
38 0.16
39 0.21
40 0.2
41 0.21
42 0.21
43 0.26
44 0.3
45 0.31
46 0.3
47 0.27
48 0.26
49 0.3
50 0.31
51 0.27
52 0.28
53 0.3
54 0.3
55 0.37
56 0.41
57 0.46
58 0.52
59 0.6
60 0.63
61 0.61
62 0.64
63 0.62
64 0.63
65 0.54
66 0.53
67 0.49
68 0.43
69 0.41
70 0.38
71 0.36
72 0.39
73 0.46
74 0.45
75 0.44
76 0.53
77 0.61
78 0.69
79 0.75
80 0.77
81 0.8
82 0.86
83 0.92
84 0.92
85 0.92
86 0.92
87 0.88
88 0.87
89 0.86
90 0.84
91 0.79
92 0.79
93 0.76
94 0.69
95 0.68
96 0.59
97 0.5
98 0.44
99 0.46
100 0.36
101 0.35
102 0.35
103 0.31
104 0.32
105 0.32
106 0.33
107 0.25
108 0.26
109 0.21
110 0.24
111 0.26
112 0.27
113 0.32
114 0.38
115 0.44
116 0.49
117 0.52
118 0.57
119 0.6
120 0.66
121 0.66
122 0.62
123 0.63
124 0.6
125 0.61
126 0.6
127 0.58
128 0.55
129 0.52
130 0.49
131 0.48
132 0.47
133 0.44
134 0.44
135 0.4
136 0.39
137 0.44
138 0.43
139 0.41
140 0.42
141 0.4
142 0.32
143 0.3
144 0.25
145 0.22
146 0.2
147 0.17
148 0.13
149 0.14
150 0.16
151 0.16
152 0.16
153 0.12
154 0.12
155 0.14
156 0.14
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.11
161 0.12
162 0.14
163 0.15
164 0.21
165 0.21
166 0.2
167 0.22
168 0.24
169 0.24
170 0.23
171 0.21
172 0.15
173 0.14
174 0.13
175 0.11
176 0.1
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.06
181 0.09
182 0.1
183 0.11
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.17
189 0.14
190 0.14
191 0.16
192 0.13
193 0.14
194 0.13
195 0.12
196 0.09
197 0.08
198 0.07
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.13
214 0.13
215 0.14
216 0.16
217 0.17
218 0.21
219 0.23
220 0.24
221 0.22
222 0.24
223 0.27
224 0.33
225 0.32
226 0.28
227 0.32
228 0.32
229 0.33
230 0.32
231 0.32
232 0.33
233 0.36
234 0.45
235 0.49
236 0.53
237 0.53
238 0.56
239 0.58
240 0.57
241 0.59
242 0.56
243 0.52
244 0.46
245 0.47
246 0.51
247 0.53
248 0.54
249 0.58
250 0.58
251 0.58
252 0.58
253 0.53
254 0.52
255 0.51
256 0.52
257 0.5
258 0.47
259 0.46
260 0.52
261 0.53
262 0.49
263 0.45
264 0.4
265 0.36
266 0.33
267 0.29
268 0.24
269 0.21
270 0.18
271 0.15
272 0.1
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.05
277 0.05
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.11
282 0.12
283 0.14
284 0.16
285 0.18
286 0.2
287 0.2
288 0.25
289 0.23
290 0.27
291 0.28
292 0.26
293 0.26
294 0.25
295 0.24
296 0.19
297 0.17
298 0.12
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.05
304 0.06
305 0.05
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.09
311 0.18
312 0.2
313 0.24
314 0.29
315 0.33
316 0.35
317 0.41
318 0.46
319 0.45
320 0.53
321 0.54
322 0.59
323 0.61
324 0.62
325 0.64
326 0.56
327 0.51
328 0.42
329 0.37
330 0.27
331 0.22
332 0.21
333 0.13
334 0.11
335 0.08
336 0.07
337 0.06
338 0.05
339 0.05
340 0.04
341 0.03
342 0.03
343 0.03
344 0.06
345 0.06
346 0.07
347 0.08
348 0.08
349 0.1
350 0.12
351 0.16
352 0.2
353 0.26
354 0.28
355 0.31
356 0.34
357 0.35
358 0.33
359 0.31
360 0.27
361 0.22
362 0.25
363 0.27
364 0.27
365 0.29
366 0.31
367 0.33
368 0.33
369 0.4
370 0.42
371 0.45
372 0.52
373 0.58
374 0.63
375 0.65
376 0.63
377 0.63
378 0.56
379 0.49
380 0.47
381 0.41
382 0.38
383 0.34
384 0.35
385 0.29
386 0.29
387 0.28
388 0.21
389 0.19
390 0.17
391 0.18
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.17
396 0.16
397 0.18
398 0.17
399 0.15
400 0.13
401 0.14
402 0.14
403 0.13
404 0.13
405 0.09
406 0.1
407 0.11
408 0.12
409 0.1
410 0.1
411 0.1
412 0.1
413 0.1
414 0.09
415 0.08
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.08
425 0.1
426 0.1
427 0.11
428 0.13
429 0.15
430 0.16
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.14
435 0.13
436 0.1
437 0.1
438 0.09
439 0.15
440 0.15
441 0.14
442 0.17
443 0.19
444 0.22
445 0.23
446 0.29
447 0.27
448 0.28
449 0.32
450 0.32
451 0.32
452 0.38
453 0.41
454 0.44
455 0.47
456 0.55
457 0.56
458 0.62
459 0.69
460 0.64
461 0.68
462 0.66
463 0.7
464 0.69
465 0.74
466 0.74
467 0.75
468 0.75
469 0.68
470 0.66
471 0.59
472 0.55
473 0.52
474 0.45
475 0.4
476 0.38
477 0.35
478 0.32
479 0.28
480 0.24
481 0.17
482 0.17
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.16
487 0.2
488 0.24
489 0.27
490 0.3
491 0.36
492 0.4
493 0.47
494 0.51
495 0.51
496 0.52
497 0.48
498 0.51
499 0.47
500 0.46
501 0.46
502 0.41
503 0.36
504 0.36
505 0.36
506 0.34
507 0.35
508 0.34
509 0.33
510 0.35
511 0.36
512 0.33
513 0.32
514 0.27
515 0.23
516 0.21
517 0.17
518 0.15
519 0.16
520 0.16
521 0.21
522 0.23
523 0.22
524 0.21
525 0.19
526 0.23
527 0.24
528 0.31
529 0.31
530 0.35
531 0.37
532 0.42
533 0.49
534 0.44
535 0.41
536 0.41
537 0.4
538 0.39
539 0.39
540 0.38
541 0.31
542 0.3
543 0.28
544 0.22
545 0.2
546 0.15
547 0.13
548 0.09
549 0.09
550 0.1
551 0.1
552 0.1
553 0.09
554 0.09
555 0.1
556 0.12
557 0.11
558 0.11
559 0.11
560 0.11
561 0.12
562 0.19
563 0.23
564 0.27
565 0.37
566 0.47
567 0.56
568 0.64
569 0.74
570 0.76
571 0.8
572 0.84
573 0.86
574 0.87
575 0.88
576 0.91
577 0.91
578 0.91
579 0.9
580 0.82
581 0.82
582 0.8
583 0.8
584 0.74
585 0.71
586 0.67
587 0.66
588 0.71
589 0.66
590 0.65
591 0.62
592 0.65
593 0.62
594 0.66
595 0.59
596 0.59
597 0.62
598 0.55
599 0.49
600 0.45
601 0.42
602 0.36
603 0.36
604 0.31
605 0.22
606 0.22
607 0.25
608 0.3
609 0.32
610 0.32
611 0.4
612 0.44
613 0.54
614 0.6
615 0.66