Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A367JCM9

Protein Details
Accession A0A367JCM9    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-78QEEEARKRQKTKEDQLSNKKVHFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035896  AN1-like_Znf  
IPR047313  SMN_C  
IPR010304  SMN_Tudor  
IPR000058  Znf_AN1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0097504  C:Gemini of coiled bodies  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF06003  SMN  
PF01428  zf-AN1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51039  ZF_AN1  
CDD cd22852  SMN_C  
Amino Acid Sequences MSIKVPDTWDSNIIEYWDALLKSYKTCHEQPTSFDTLEKVTQSIMDNLPKETLKQQEEEARKRQKTKEDQLSNKKVHFKDQYEGQEEEQYEQEEEEYEQEEEEEYEQEKEEYEQEEEQYDQEEQAENINEQTQYDYSIPPPPPPVSTGDDDGLSNVIMAWYYAGYYTALYQSRHGSRTKNEAVTKEEATIREQQSTPSSSSTTTTTTTTTTTATRKHLRTPSPEPRDIETTVPPSIPSPSESKNDNKPVQTNKGRCFKCRIKVPLAKQAANKCRCDYVFCDTHRYPDRHDCEIDYAKMDRELLAKNNPKLHERPKGGRSFQRIDSL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.18
3 0.17
4 0.17
5 0.15
6 0.15
7 0.18
8 0.18
9 0.2
10 0.25
11 0.28
12 0.3
13 0.36
14 0.42
15 0.47
16 0.48
17 0.5
18 0.53
19 0.53
20 0.47
21 0.43
22 0.36
23 0.31
24 0.31
25 0.27
26 0.2
27 0.15
28 0.17
29 0.18
30 0.21
31 0.22
32 0.25
33 0.25
34 0.26
35 0.29
36 0.27
37 0.27
38 0.28
39 0.32
40 0.29
41 0.29
42 0.33
43 0.38
44 0.47
45 0.52
46 0.57
47 0.59
48 0.63
49 0.68
50 0.7
51 0.72
52 0.73
53 0.76
54 0.78
55 0.78
56 0.82
57 0.85
58 0.88
59 0.83
60 0.77
61 0.75
62 0.65
63 0.64
64 0.62
65 0.55
66 0.51
67 0.54
68 0.56
69 0.52
70 0.52
71 0.45
72 0.41
73 0.38
74 0.35
75 0.27
76 0.21
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.1
81 0.1
82 0.09
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.1
117 0.09
118 0.1
119 0.08
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.11
124 0.17
125 0.17
126 0.17
127 0.2
128 0.19
129 0.19
130 0.2
131 0.22
132 0.19
133 0.21
134 0.21
135 0.19
136 0.19
137 0.18
138 0.16
139 0.12
140 0.09
141 0.06
142 0.04
143 0.04
144 0.03
145 0.03
146 0.03
147 0.02
148 0.02
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.04
154 0.07
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.15
159 0.18
160 0.2
161 0.22
162 0.22
163 0.23
164 0.32
165 0.35
166 0.37
167 0.37
168 0.37
169 0.39
170 0.39
171 0.37
172 0.3
173 0.28
174 0.22
175 0.22
176 0.27
177 0.24
178 0.24
179 0.23
180 0.23
181 0.24
182 0.25
183 0.24
184 0.18
185 0.18
186 0.15
187 0.17
188 0.17
189 0.16
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.14
194 0.15
195 0.14
196 0.14
197 0.15
198 0.17
199 0.19
200 0.25
201 0.32
202 0.33
203 0.4
204 0.46
205 0.49
206 0.53
207 0.6
208 0.64
209 0.64
210 0.67
211 0.62
212 0.58
213 0.57
214 0.5
215 0.43
216 0.36
217 0.31
218 0.27
219 0.25
220 0.21
221 0.18
222 0.18
223 0.16
224 0.15
225 0.16
226 0.19
227 0.22
228 0.26
229 0.3
230 0.37
231 0.45
232 0.48
233 0.47
234 0.5
235 0.54
236 0.6
237 0.64
238 0.63
239 0.62
240 0.68
241 0.67
242 0.64
243 0.66
244 0.65
245 0.64
246 0.66
247 0.66
248 0.66
249 0.73
250 0.75
251 0.76
252 0.74
253 0.7
254 0.66
255 0.69
256 0.69
257 0.66
258 0.64
259 0.56
260 0.55
261 0.51
262 0.5
263 0.44
264 0.42
265 0.43
266 0.41
267 0.47
268 0.41
269 0.49
270 0.53
271 0.52
272 0.51
273 0.53
274 0.57
275 0.54
276 0.55
277 0.49
278 0.48
279 0.51
280 0.45
281 0.38
282 0.34
283 0.31
284 0.3
285 0.28
286 0.22
287 0.21
288 0.23
289 0.25
290 0.34
291 0.4
292 0.44
293 0.51
294 0.52
295 0.55
296 0.6
297 0.64
298 0.64
299 0.64
300 0.68
301 0.7
302 0.77
303 0.78
304 0.79
305 0.78
306 0.74