FuNGI

A0A2X0MSM8

Protein Details

Accession

A0A2X0MSM8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1023-1043	LPSPSRTCPVRQQPRPPHWIA	Hydrophilic
1151-1179	FTDNEGRGRRRSRPRSHLRHPAHSPPRAF	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
1157-1171	RGRRRSRPRSHLRHP

Subcellular Location(s)

mito 12, extr 6, cyto_nucl 5, nucl 4.5, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MSPMSGTLDLLRALQPRILRGCLSSTPPPATHLPPAHAAPPAARCYKWSLDARLAAGSPRLPRSTPGDTLSPRARPPRFSLLLSHPSRLIPTDAFVVDSGATTHMVADRSLFTTYRQTAHTKIGGIAGGITAIGMGDVAFVAKTGHPITLRGVLHTPGLHVNLLSVSRLCDTDRVRLAFTSDGIDIAKDGRAIAHGTRVNDGLYLLDADHTKCQHLAFLSRSESPVPLLTLHRCLGHLAPSSIQKMIAAGLLDGFGAGYSDKDVEEFVCNACLGSKGHRLPFPDSESHSAERLGLVHSDVLSFPTPSLTGKRYLVTFLDDHSRKLWAYAIDHKSDVFPTFQTWLAEVELETNARLRILRTDNGGEYRSNAFTEFCKSKGIRRQYSIPYTPQQNGRAERVNLSIVEGVLALLADARLPATFWDEAAAYFVYCKNRCSHSALAKQTPESVWNGQRTTATALHPFGCTAWLTVAPDLRSKLDPKAARVIFTGYDLASKAFRFFDHSINKIVLGRNATFLDDDFPGLPVTTPVDADDTDRQFVVPADTPAPASRRGPHYAVDVAPGYTGGTLLNSTDTESSSSPSPEPSSSPSPTNPLSPSPALSPSLAASSSPSVSPTDSDYSADPLDLIGSQTPTRLGPPDVHRPDFSTYREPASAEESPDELDIIGRHSRDESPDEIDFLTQHHRAFIATDDDDPTLDAIEPVKSITSDPQTWREAMSSDEHNIWAEAAAAEFTAMRDDFKVFTIEPRSSVPPGATIVTSKFVWKTKRNASGEVTGRKARLVAQGNRQRDGIDFSETFAPVARFSSIRCLLALAAANGYHVHQADIDKAYLHGELDHDIWMTTPRGFDFPSDKVLRLRRSIYGLKQAGRIWNRHIDTSLRNLGYKATGTDHCIYSRIDDQQRPHYIALYVDDSSLSVQPSTRSNVSSPALNSGTASNDSARGVHPRNPNTPLDDGSIALSQERYIMDVLARFHFDTTTRGTTVPMTPGLSLTAIPGQGTERIRSWYLQAIGSLLYISLGTRPTLPSPSRTCPVRQQPRPPHWIAVKHVLRYLRATYRDELLYARGPAKVTGVVGYSDANWGACVDTSISTMGYVFYLAGAAVSWSSKRQTRVADSTTDAEYLALSHAGKEAIYLNQLLSELHVCPIAAAHIFTDNEGRGRRRSRPRSHLRHPAHSPPRAFCP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.22
3	0.26
4	0.3
5	0.32
6	0.29
7	0.28
8	0.32
9	0.33
10	0.37
11	0.37
12	0.39
13	0.41
14	0.4
15	0.42
16	0.42
17	0.42
18	0.45
19	0.42
20	0.4
21	0.4
22	0.41
23	0.39
24	0.37
25	0.34
26	0.29
27	0.31
28	0.34
29	0.34
30	0.32
31	0.32
32	0.36
33	0.4
34	0.44
35	0.45
36	0.45
37	0.48
38	0.51
39	0.5
40	0.46
41	0.42
42	0.35
43	0.31
44	0.29
45	0.27
46	0.29
47	0.3
48	0.28
49	0.31
50	0.37
51	0.41
52	0.41
53	0.4
54	0.43
55	0.42
56	0.48
57	0.51
58	0.49
59	0.49
60	0.54
61	0.54
62	0.51
63	0.56
64	0.59
65	0.57
66	0.54
67	0.54
68	0.53
69	0.59
70	0.57
71	0.52
72	0.44
73	0.4
74	0.4
75	0.35
76	0.3
77	0.21
78	0.2
79	0.21
80	0.2
81	0.2
82	0.19
83	0.17
84	0.14
85	0.13
86	0.12
87	0.09
88	0.09
89	0.08
90	0.09
91	0.11
92	0.12
93	0.11
94	0.12
95	0.13
96	0.15
97	0.17
98	0.16
99	0.16
100	0.24
101	0.26
102	0.28
103	0.29
104	0.31
105	0.33
106	0.39
107	0.4
108	0.33
109	0.31
110	0.3
111	0.27
112	0.23
113	0.2
114	0.13
115	0.1
116	0.08
117	0.06
118	0.04
119	0.03
120	0.03
121	0.02
122	0.02
123	0.02
124	0.03
125	0.03
126	0.03
127	0.03
128	0.05
129	0.06
130	0.09
131	0.1
132	0.13
133	0.14
134	0.16
135	0.19
136	0.25
137	0.25
138	0.25
139	0.26
140	0.24
141	0.26
142	0.25
143	0.23
144	0.18
145	0.2
146	0.17
147	0.15
148	0.15
149	0.14
150	0.14
151	0.14
152	0.11
153	0.11
154	0.12
155	0.13
156	0.13
157	0.18
158	0.2
159	0.27
160	0.33
161	0.33
162	0.34
163	0.33
164	0.35
165	0.3
166	0.28
167	0.22
168	0.16
169	0.15
170	0.13
171	0.13
172	0.11
173	0.1
174	0.11
175	0.08
176	0.08
177	0.07
178	0.09
179	0.11
180	0.12
181	0.18
182	0.2
183	0.21
184	0.23
185	0.24
186	0.22
187	0.2
188	0.2
189	0.12
190	0.1
191	0.09
192	0.07
193	0.08
194	0.09
195	0.11
196	0.15
197	0.15
198	0.16
199	0.16
200	0.16
201	0.18
202	0.18
203	0.22
204	0.21
205	0.25
206	0.27
207	0.28
208	0.29
209	0.28
210	0.26
211	0.22
212	0.21
213	0.17
214	0.16
215	0.19
216	0.2
217	0.23
218	0.23
219	0.23
220	0.21
221	0.22
222	0.21
223	0.23
224	0.24
225	0.21
226	0.22
227	0.25
228	0.27
229	0.25
230	0.24
231	0.18
232	0.15
233	0.14
234	0.13
235	0.09
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.05
242	0.03
243	0.03
244	0.03
245	0.03
246	0.04
247	0.05
248	0.05
249	0.06
250	0.06
251	0.07
252	0.1
253	0.11
254	0.1
255	0.11
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.11
260	0.1
261	0.14
262	0.22
263	0.25
264	0.3
265	0.32
266	0.36
267	0.39
268	0.43
269	0.43
270	0.4
271	0.39
272	0.4
273	0.42
274	0.39
275	0.35
276	0.3
277	0.25
278	0.21
279	0.18
280	0.14
281	0.1
282	0.09
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.1
288	0.1
289	0.1
290	0.09
291	0.09
292	0.1
293	0.11
294	0.15
295	0.14
296	0.17
297	0.19
298	0.21
299	0.2
300	0.22
301	0.21
302	0.21
303	0.19
304	0.17
305	0.25
306	0.24
307	0.25
308	0.23
309	0.24
310	0.21
311	0.21
312	0.23
313	0.16
314	0.19
315	0.28
316	0.31
317	0.31
318	0.31
319	0.31
320	0.29
321	0.27
322	0.24
323	0.16
324	0.12
325	0.12
326	0.14
327	0.15
328	0.15
329	0.14
330	0.14
331	0.13
332	0.13
333	0.11
334	0.1
335	0.09
336	0.09
337	0.08
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.09
342	0.08
343	0.14
344	0.18
345	0.2
346	0.22
347	0.25
348	0.27
349	0.29
350	0.3
351	0.23
352	0.21
353	0.22
354	0.2
355	0.17
356	0.16
357	0.14
358	0.14
359	0.2
360	0.19
361	0.17
362	0.23
363	0.23
364	0.3
365	0.38
366	0.47
367	0.47
368	0.5
369	0.56
370	0.57
371	0.65
372	0.61
373	0.57
374	0.52
375	0.5
376	0.49
377	0.48
378	0.46
379	0.44
380	0.43
381	0.42
382	0.43
383	0.4
384	0.38
385	0.34
386	0.3
387	0.24
388	0.22
389	0.18
390	0.12
391	0.11
392	0.09
393	0.07
394	0.05
395	0.05
396	0.03
397	0.03
398	0.03
399	0.02
400	0.02
401	0.03
402	0.03
403	0.03
404	0.04
405	0.07
406	0.07
407	0.07
408	0.08
409	0.08
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.06
414	0.07
415	0.1
416	0.15
417	0.16
418	0.18
419	0.2
420	0.23
421	0.26
422	0.31
423	0.35
424	0.38
425	0.46
426	0.5
427	0.51
428	0.49
429	0.47
430	0.43
431	0.36
432	0.29
433	0.24
434	0.23
435	0.23
436	0.25
437	0.25
438	0.24
439	0.24
440	0.24
441	0.25
442	0.23
443	0.19
444	0.18
445	0.19
446	0.19
447	0.19
448	0.18
449	0.13
450	0.12
451	0.1
452	0.08
453	0.08
454	0.07
455	0.08
456	0.09
457	0.11
458	0.11
459	0.13
460	0.13
461	0.15
462	0.16
463	0.17
464	0.18
465	0.23
466	0.24
467	0.25
468	0.33
469	0.32
470	0.31
471	0.3
472	0.29
473	0.22
474	0.21
475	0.19
476	0.1
477	0.1
478	0.09
479	0.09
480	0.09
481	0.09
482	0.09
483	0.08
484	0.08
485	0.14
486	0.16
487	0.23
488	0.27
489	0.28
490	0.29
491	0.29
492	0.29
493	0.25
494	0.24
495	0.19
496	0.17
497	0.16
498	0.16
499	0.16
500	0.16
501	0.13
502	0.13
503	0.12
504	0.1
505	0.1
506	0.08
507	0.08
508	0.08
509	0.07
510	0.07
511	0.05
512	0.06
513	0.06
514	0.06
515	0.06
516	0.07
517	0.07
518	0.09
519	0.14
520	0.14
521	0.14
522	0.14
523	0.13
524	0.12
525	0.13
526	0.13
527	0.09
528	0.09
529	0.1
530	0.1
531	0.11
532	0.12
533	0.13
534	0.13
535	0.13
536	0.15
537	0.19
538	0.22
539	0.23
540	0.22
541	0.23
542	0.24
543	0.22
544	0.21
545	0.16
546	0.13
547	0.12
548	0.1
549	0.08
550	0.05
551	0.05
552	0.03
553	0.03
554	0.03
555	0.03
556	0.04
557	0.04
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.07
562	0.07
563	0.09
564	0.09
565	0.1
566	0.1
567	0.1
568	0.11
569	0.1
570	0.11
571	0.15
572	0.19
573	0.19
574	0.21
575	0.21
576	0.23
577	0.23
578	0.24
579	0.21
580	0.18
581	0.19
582	0.18
583	0.18
584	0.16
585	0.16
586	0.15
587	0.14
588	0.13
589	0.1
590	0.1
591	0.09
592	0.08
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.08
600	0.08
601	0.1
602	0.11
603	0.11
604	0.12
605	0.11
606	0.13
607	0.12
608	0.12
609	0.09
610	0.07
611	0.06
612	0.06
613	0.06
614	0.04
615	0.05
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.07
620	0.07
621	0.09
622	0.09
623	0.13
624	0.18
625	0.28
626	0.32
627	0.33
628	0.33
629	0.34
630	0.36
631	0.35
632	0.34
633	0.29
634	0.26
635	0.26
636	0.26
637	0.24
638	0.21
639	0.23
640	0.21
641	0.16
642	0.16
643	0.14
644	0.14
645	0.13
646	0.12
647	0.07
648	0.06
649	0.05
650	0.07
651	0.09
652	0.08
653	0.09
654	0.1
655	0.11
656	0.13
657	0.16
658	0.15
659	0.17
660	0.17
661	0.18
662	0.16
663	0.16
664	0.13
665	0.12
666	0.14
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.12
671	0.12
672	0.12
673	0.13
674	0.12
675	0.11
676	0.12
677	0.13
678	0.13
679	0.13
680	0.12
681	0.11
682	0.07
683	0.06
684	0.06
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.05
691	0.06
692	0.09
693	0.13
694	0.16
695	0.18
696	0.23
697	0.24
698	0.24
699	0.25
700	0.22
701	0.18
702	0.16
703	0.17
704	0.14
705	0.14
706	0.14
707	0.14
708	0.14
709	0.13
710	0.11
711	0.08
712	0.07
713	0.05
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.04
718	0.04
719	0.04
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.06
724	0.07
725	0.08
726	0.09
727	0.11
728	0.09
729	0.13
730	0.17
731	0.17
732	0.17
733	0.2
734	0.22
735	0.21
736	0.21
737	0.18
738	0.15
739	0.15
740	0.15
741	0.12
742	0.1
743	0.1
744	0.12
745	0.12
746	0.12
747	0.14
748	0.18
749	0.25
750	0.3
751	0.37
752	0.43
753	0.52
754	0.54
755	0.55
756	0.54
757	0.55
758	0.56
759	0.52
760	0.47
761	0.4
762	0.37
763	0.33
764	0.3
765	0.25
766	0.26
767	0.3
768	0.31
769	0.39
770	0.47
771	0.5
772	0.51
773	0.48
774	0.41
775	0.34
776	0.33
777	0.24
778	0.21
779	0.18
780	0.19
781	0.21
782	0.2
783	0.19
784	0.16
785	0.15
786	0.1
787	0.11
788	0.11
789	0.09
790	0.1
791	0.18
792	0.18
793	0.18
794	0.18
795	0.18
796	0.16
797	0.18
798	0.18
799	0.11
800	0.09
801	0.08
802	0.09
803	0.08
804	0.09
805	0.08
806	0.07
807	0.07
808	0.08
809	0.09
810	0.12
811	0.13
812	0.13
813	0.11
814	0.11
815	0.12
816	0.11
817	0.11
818	0.08
819	0.07
820	0.09
821	0.09
822	0.09
823	0.08
824	0.08
825	0.08
826	0.1
827	0.1
828	0.1
829	0.1
830	0.1
831	0.12
832	0.12
833	0.14
834	0.17
835	0.17
836	0.25
837	0.26
838	0.26
839	0.31
840	0.37
841	0.39
842	0.39
843	0.4
844	0.35
845	0.4
846	0.44
847	0.42
848	0.45
849	0.45
850	0.43
851	0.44
852	0.43
853	0.45
854	0.43
855	0.42
856	0.37
857	0.41
858	0.4
859	0.38
860	0.37
861	0.33
862	0.32
863	0.36
864	0.38
865	0.31
866	0.3
867	0.29
868	0.28
869	0.26
870	0.24
871	0.18
872	0.15
873	0.16
874	0.2
875	0.23
876	0.23
877	0.22
878	0.23
879	0.22
880	0.21
881	0.24
882	0.27
883	0.31
884	0.34
885	0.38
886	0.45
887	0.49
888	0.49
889	0.45
890	0.39
891	0.33
892	0.3
893	0.28
894	0.22
895	0.18
896	0.14
897	0.14
898	0.12
899	0.13
900	0.13
901	0.11
902	0.08
903	0.09
904	0.11
905	0.14
906	0.18
907	0.19
908	0.19
909	0.2
910	0.25
911	0.26
912	0.28
913	0.26
914	0.27
915	0.26
916	0.24
917	0.23
918	0.19
919	0.2
920	0.17
921	0.18
922	0.13
923	0.13
924	0.13
925	0.14
926	0.14
927	0.19
928	0.21
929	0.28
930	0.35
931	0.4
932	0.46
933	0.49
934	0.5
935	0.47
936	0.47
937	0.41
938	0.36
939	0.31
940	0.25
941	0.23
942	0.21
943	0.17
944	0.15
945	0.13
946	0.09
947	0.1
948	0.1
949	0.09
950	0.08
951	0.09
952	0.1
953	0.12
954	0.14
955	0.14
956	0.17
957	0.16
958	0.16
959	0.16
960	0.16
961	0.17
962	0.2
963	0.22
964	0.22
965	0.21
966	0.22
967	0.24
968	0.25
969	0.25
970	0.21
971	0.19
972	0.17
973	0.18
974	0.18
975	0.15
976	0.13
977	0.11
978	0.11
979	0.1
980	0.1
981	0.1
982	0.1
983	0.16
984	0.18
985	0.19
986	0.18
987	0.22
988	0.24
989	0.24
990	0.25
991	0.26
992	0.26
993	0.25
994	0.23
995	0.2
996	0.19
997	0.18
998	0.16
999	0.09
1000	0.07
1001	0.06
1002	0.06
1003	0.07
1004	0.07
1005	0.08
1006	0.1
1007	0.12
1008	0.14
1009	0.22
1010	0.24
1011	0.29
1012	0.35
1013	0.41
1014	0.46
1015	0.47
1016	0.49
1017	0.52
1018	0.62
1019	0.65
1020	0.67
1021	0.72
1022	0.77
1023	0.83
1024	0.86
1025	0.8
1026	0.76
1027	0.72
1028	0.7
1029	0.65
1030	0.65
1031	0.61
1032	0.55
1033	0.55
1034	0.5
1035	0.45
1036	0.43
1037	0.43
1038	0.4
1039	0.39
1040	0.41
1041	0.39
1042	0.41
1043	0.4
1044	0.37
1045	0.32
1046	0.28
1047	0.27
1048	0.25
1049	0.25
1050	0.22
1051	0.22
1052	0.22
1053	0.22
1054	0.2
1055	0.17
1056	0.16
1057	0.15
1058	0.14
1059	0.14
1060	0.14
1061	0.12
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.1
1065	0.09
1066	0.09
1067	0.09
1068	0.08
1069	0.08
1070	0.08
1071	0.09
1072	0.1
1073	0.1
1074	0.1
1075	0.1
1076	0.1
1077	0.09
1078	0.08
1079	0.07
1080	0.06
1081	0.05
1082	0.05
1083	0.05
1084	0.05
1085	0.04
1086	0.05
1087	0.05
1088	0.06
1089	0.08
1090	0.1
1091	0.16
1092	0.21
1093	0.25
1094	0.3
1095	0.37
1096	0.44
1097	0.52
1098	0.52
1099	0.52
1100	0.5
1101	0.49
1102	0.45
1103	0.38
1104	0.29
1105	0.21
1106	0.17
1107	0.14
1108	0.11
1109	0.1
1110	0.09
1111	0.09
1112	0.1
1113	0.11
1114	0.1
1115	0.11
1116	0.12
1117	0.12
1118	0.14
1119	0.14
1120	0.13
1121	0.14
1122	0.14
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.13
1126	0.12
1127	0.12
1128	0.13
1129	0.12
1130	0.11
1131	0.12
1132	0.12
1133	0.1
1134	0.1
1135	0.1
1136	0.14
1137	0.14
1138	0.15
1139	0.19
1140	0.18
1141	0.23
1142	0.28
1143	0.31
1144	0.35
1145	0.42
1146	0.51
1147	0.59
1148	0.68
1149	0.73
1150	0.79
1151	0.86
1152	0.88
1153	0.92
1154	0.93
1155	0.9
1156	0.89
1157	0.86
1158	0.86
1159	0.84
1160	0.82
1161	0.77

A0A2X0MSM8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer