Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D9E6

Protein Details
Accession A1D9E6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
82-108SQPGIPKLRRTAKKKLRFKGKGHEFSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-103IPKLRRTAKKKLRFKGKG
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10, cyto 6.5, pero 4, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0008156  P:negative regulation of DNA replication  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG nfi:NFIA_028580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MEIEGTLQDDRPASPKRADDLFDYDFGLDELWQETPNMPNNGAPMQSSARDESGLGLGLDEEVKVTKKRQPVAKLDESRLLSQPGIPKLRRTAKKKLRFKGKGHEFSDAARLLNFYQLWLDDLFPRAKFADGLAIIERLGHSKRLQAMRKEWIDEEKPKVTSENHNDALQASESSGSRSDDPVVAFDGLNMADTKRSRGDIAGDHTSDAEGMHIEDTLISSRQRGLDEGLFMTEDDDAAQQPDNRGAPDDDELDALLKEQELLLMNNASA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.34
3 0.37
4 0.4
5 0.41
6 0.39
7 0.41
8 0.39
9 0.35
10 0.32
11 0.27
12 0.23
13 0.21
14 0.17
15 0.1
16 0.08
17 0.08
18 0.08
19 0.08
20 0.09
21 0.1
22 0.14
23 0.21
24 0.22
25 0.22
26 0.22
27 0.24
28 0.25
29 0.25
30 0.21
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.2
36 0.19
37 0.19
38 0.18
39 0.16
40 0.14
41 0.13
42 0.11
43 0.08
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.08
51 0.1
52 0.13
53 0.18
54 0.24
55 0.31
56 0.38
57 0.45
58 0.52
59 0.59
60 0.66
61 0.66
62 0.63
63 0.63
64 0.57
65 0.52
66 0.44
67 0.37
68 0.27
69 0.24
70 0.27
71 0.27
72 0.31
73 0.3
74 0.31
75 0.38
76 0.48
77 0.54
78 0.55
79 0.6
80 0.64
81 0.74
82 0.8
83 0.81
84 0.83
85 0.83
86 0.82
87 0.81
88 0.81
89 0.8
90 0.73
91 0.68
92 0.57
93 0.49
94 0.48
95 0.38
96 0.27
97 0.18
98 0.16
99 0.13
100 0.15
101 0.13
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.09
108 0.07
109 0.1
110 0.11
111 0.1
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.1
116 0.09
117 0.11
118 0.09
119 0.1
120 0.1
121 0.1
122 0.09
123 0.09
124 0.09
125 0.07
126 0.08
127 0.09
128 0.09
129 0.11
130 0.17
131 0.25
132 0.3
133 0.33
134 0.36
135 0.42
136 0.43
137 0.42
138 0.38
139 0.35
140 0.34
141 0.34
142 0.35
143 0.3
144 0.3
145 0.28
146 0.29
147 0.27
148 0.31
149 0.34
150 0.37
151 0.35
152 0.35
153 0.34
154 0.33
155 0.31
156 0.23
157 0.16
158 0.09
159 0.08
160 0.08
161 0.09
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.11
166 0.12
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.12
173 0.11
174 0.1
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.06
179 0.09
180 0.1
181 0.13
182 0.14
183 0.15
184 0.15
185 0.16
186 0.19
187 0.2
188 0.26
189 0.28
190 0.26
191 0.25
192 0.25
193 0.23
194 0.2
195 0.15
196 0.1
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.06
204 0.07
205 0.09
206 0.09
207 0.1
208 0.12
209 0.15
210 0.16
211 0.16
212 0.18
213 0.19
214 0.21
215 0.2
216 0.19
217 0.17
218 0.16
219 0.15
220 0.11
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.08
226 0.11
227 0.12
228 0.13
229 0.18
230 0.19
231 0.19
232 0.22
233 0.22
234 0.22
235 0.23
236 0.24
237 0.19
238 0.18
239 0.18
240 0.16
241 0.14
242 0.12
243 0.1
244 0.08
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.1
249 0.11
250 0.13