Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DDK8

Protein Details
Accession A1DDK8    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-313LEKERQKKLREEKAREKQLABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
260-310RKPARKTTKLTAAEKEARAKEREAAKAQREHEKQLEKERQKKLREEKAREK
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG nfi:NFIA_073810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MPEVINLLSSTPPPPASQPRQRLVATLPSDPPLSSAPQPLLSDDVESLFAYDDIDKPAKRRRISEEVESPRDVDAQFSTTNLFLFSDDDVALPSDGPSTLRIPARNEESDPIVFTSPAPVPGARSLTTHQTNFRETNTITIDDDDDDDDDDDDDGDAHVDICNDAATGKDHIEDFSDQLAMPDIDELMRHARAATESGHENSLFSSRTASLLAGLKERSQATSSTGSRTKLRAAGPSKKSQERDVLDLDDDLSEVVAASRKPARKTTKLTAAEKEARAKEREAAKAQREHEKQLEKERQKKLREEKAREKQLAADLAEVNKLKVDKKESTPEMILDLASSFRETSVGNQSIELMKRLGVEHTFFTSSIPNIVKWRRKVTARYNEAAGHWEPCPHHIRDEDHVLCLVTAQEFVNMAIAPADPVTGTTELELHLSRIKNAYPRHKLIYLIEGLTAWMRKNQNSRNRAFQAQVRRQLVPDDPSSSTRRRNPPAKTAESTPPVDDDTIEDALLELQVTHACLIHHTSAAAESAEWIKNFTEHISTIPYKRERMDGNDSAFCMDTGQVKPGEDKADTFVKMLQEVNRVTASMAYGIAARYPSVVDLVRGMRRHGPTMLEDVKKSANKNGALTDSRIGPAASKRLYKVFMGLDPSSTDI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.33
3 0.42
4 0.5
5 0.58
6 0.6
7 0.66
8 0.65
9 0.61
10 0.55
11 0.54
12 0.48
13 0.43
14 0.4
15 0.36
16 0.37
17 0.33
18 0.31
19 0.24
20 0.25
21 0.22
22 0.25
23 0.25
24 0.28
25 0.28
26 0.27
27 0.28
28 0.24
29 0.23
30 0.19
31 0.18
32 0.15
33 0.14
34 0.13
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.15
41 0.2
42 0.21
43 0.26
44 0.35
45 0.43
46 0.46
47 0.51
48 0.54
49 0.6
50 0.64
51 0.68
52 0.69
53 0.7
54 0.7
55 0.65
56 0.57
57 0.48
58 0.44
59 0.35
60 0.26
61 0.19
62 0.17
63 0.16
64 0.16
65 0.17
66 0.14
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.09
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.11
79 0.09
80 0.09
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.1
85 0.11
86 0.16
87 0.2
88 0.23
89 0.26
90 0.32
91 0.38
92 0.39
93 0.39
94 0.36
95 0.37
96 0.34
97 0.31
98 0.27
99 0.22
100 0.19
101 0.16
102 0.18
103 0.15
104 0.16
105 0.16
106 0.14
107 0.16
108 0.2
109 0.23
110 0.2
111 0.21
112 0.22
113 0.28
114 0.33
115 0.33
116 0.36
117 0.36
118 0.41
119 0.4
120 0.4
121 0.37
122 0.32
123 0.34
124 0.31
125 0.29
126 0.25
127 0.24
128 0.23
129 0.18
130 0.19
131 0.14
132 0.11
133 0.1
134 0.1
135 0.09
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.06
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.05
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.13
160 0.13
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.06
173 0.07
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.1
179 0.1
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.16
185 0.17
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.15
190 0.13
191 0.11
192 0.12
193 0.11
194 0.12
195 0.12
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.15
200 0.15
201 0.16
202 0.16
203 0.18
204 0.19
205 0.17
206 0.15
207 0.15
208 0.16
209 0.23
210 0.23
211 0.25
212 0.28
213 0.28
214 0.3
215 0.31
216 0.3
217 0.28
218 0.29
219 0.32
220 0.36
221 0.44
222 0.46
223 0.53
224 0.56
225 0.57
226 0.58
227 0.53
228 0.54
229 0.47
230 0.46
231 0.39
232 0.35
233 0.29
234 0.27
235 0.23
236 0.15
237 0.12
238 0.08
239 0.06
240 0.04
241 0.03
242 0.04
243 0.05
244 0.05
245 0.07
246 0.13
247 0.17
248 0.2
249 0.28
250 0.36
251 0.41
252 0.49
253 0.53
254 0.58
255 0.61
256 0.63
257 0.57
258 0.57
259 0.55
260 0.5
261 0.49
262 0.42
263 0.39
264 0.37
265 0.35
266 0.33
267 0.33
268 0.36
269 0.36
270 0.38
271 0.4
272 0.44
273 0.45
274 0.49
275 0.46
276 0.45
277 0.45
278 0.45
279 0.43
280 0.47
281 0.54
282 0.52
283 0.6
284 0.65
285 0.66
286 0.65
287 0.71
288 0.71
289 0.71
290 0.74
291 0.74
292 0.76
293 0.78
294 0.81
295 0.73
296 0.64
297 0.56
298 0.49
299 0.43
300 0.32
301 0.24
302 0.17
303 0.16
304 0.18
305 0.15
306 0.12
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.13
311 0.18
312 0.19
313 0.23
314 0.31
315 0.31
316 0.33
317 0.32
318 0.29
319 0.25
320 0.21
321 0.17
322 0.1
323 0.08
324 0.06
325 0.05
326 0.05
327 0.04
328 0.04
329 0.05
330 0.05
331 0.08
332 0.15
333 0.17
334 0.16
335 0.16
336 0.17
337 0.19
338 0.2
339 0.18
340 0.11
341 0.09
342 0.1
343 0.1
344 0.11
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.12
352 0.12
353 0.11
354 0.13
355 0.13
356 0.12
357 0.17
358 0.24
359 0.3
360 0.33
361 0.39
362 0.4
363 0.44
364 0.52
365 0.56
366 0.6
367 0.59
368 0.57
369 0.53
370 0.5
371 0.45
372 0.4
373 0.3
374 0.22
375 0.16
376 0.18
377 0.16
378 0.19
379 0.23
380 0.2
381 0.22
382 0.24
383 0.27
384 0.27
385 0.36
386 0.32
387 0.28
388 0.27
389 0.25
390 0.21
391 0.18
392 0.14
393 0.06
394 0.06
395 0.06
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.07
400 0.06
401 0.06
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.03
408 0.04
409 0.07
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.08
415 0.09
416 0.09
417 0.08
418 0.12
419 0.12
420 0.13
421 0.15
422 0.16
423 0.21
424 0.28
425 0.37
426 0.4
427 0.44
428 0.48
429 0.48
430 0.48
431 0.43
432 0.41
433 0.33
434 0.26
435 0.22
436 0.17
437 0.16
438 0.15
439 0.15
440 0.1
441 0.14
442 0.16
443 0.2
444 0.29
445 0.37
446 0.46
447 0.53
448 0.56
449 0.59
450 0.62
451 0.6
452 0.54
453 0.52
454 0.53
455 0.54
456 0.59
457 0.53
458 0.5
459 0.47
460 0.47
461 0.45
462 0.38
463 0.32
464 0.27
465 0.26
466 0.29
467 0.33
468 0.35
469 0.39
470 0.44
471 0.5
472 0.55
473 0.62
474 0.64
475 0.69
476 0.73
477 0.72
478 0.67
479 0.63
480 0.62
481 0.58
482 0.54
483 0.45
484 0.37
485 0.31
486 0.28
487 0.23
488 0.18
489 0.16
490 0.15
491 0.14
492 0.12
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.08
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.12
506 0.12
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.12
511 0.12
512 0.11
513 0.08
514 0.08
515 0.11
516 0.14
517 0.13
518 0.14
519 0.13
520 0.14
521 0.15
522 0.15
523 0.14
524 0.13
525 0.14
526 0.2
527 0.23
528 0.25
529 0.33
530 0.35
531 0.36
532 0.37
533 0.41
534 0.39
535 0.43
536 0.48
537 0.46
538 0.47
539 0.46
540 0.45
541 0.41
542 0.37
543 0.29
544 0.21
545 0.16
546 0.16
547 0.15
548 0.18
549 0.18
550 0.19
551 0.21
552 0.23
553 0.26
554 0.21
555 0.21
556 0.22
557 0.26
558 0.26
559 0.25
560 0.25
561 0.22
562 0.23
563 0.25
564 0.25
565 0.26
566 0.26
567 0.28
568 0.26
569 0.24
570 0.23
571 0.21
572 0.18
573 0.12
574 0.12
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.11
579 0.1
580 0.09
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.11
585 0.11
586 0.11
587 0.15
588 0.2
589 0.25
590 0.26
591 0.29
592 0.33
593 0.36
594 0.39
595 0.37
596 0.35
597 0.32
598 0.4
599 0.45
600 0.41
601 0.39
602 0.38
603 0.43
604 0.44
605 0.43
606 0.42
607 0.41
608 0.41
609 0.43
610 0.45
611 0.45
612 0.43
613 0.44
614 0.4
615 0.35
616 0.32
617 0.3
618 0.25
619 0.22
620 0.24
621 0.3
622 0.32
623 0.34
624 0.37
625 0.41
626 0.44
627 0.41
628 0.41
629 0.37
630 0.36
631 0.38
632 0.35
633 0.32