FuNGI

A0A2X0LBX6

Protein Details

Accession

A0A2X0LBX6

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
473-492	LRTIKTQKLRQTPRHIRMCL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 13, cyto 6.5, cyto_nucl 5.5, nucl 3.5, extr 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd00024 CD_CSD cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MSSIPPGVRQFCAHTLSVPAPALAQRRAKHPGASTVLTVPKLHLPKRPDQHAQLPHKPHPLPQALQLRAQGGVELRSISLLGQYALTEVEVPRLLLRVDSSQYPLADKYRSQWAEHSAKYTRGRFWVSGPIDSAAPVFAIPKKNSQTARFVIDLRARNSNTVKRFSPIPDMTNVRYEVARSRYRSKFDVAAAFEQVRVIPEHVDRTGFATVTGTYTSRVMQFGDTNAPNTLNLLTSAMFQPCLPFAKIFFDDVHVHSDTRRAHLRHIKILLMTLRHYRFYLGSKKSEWFSKSLDSLGTIISDVSIEVDPAKWVRIRQWPIPCNKTDVQRFLGTVNWMRDHLPHLSKILEPITALMAQATSWRWNEREQQAFDTVKSLVPAILRPIDGAKVTSGEHKMYLFTDASRVGIGACLASGPNRSQAVPTRFFSAKFNGAQLNYHVTDKEFLAVVSACRAFEQHLIGYPFVIVTDHQALRTIKTQKLRQTPRHIRMCLELSRFDFEFEFIAGKNNTLADSLLRLWEVKQGSHEDQVKENELEDMFFDGERHEFTTPGESLPEERPCTSPSPDRLPPVDFALGPQHDDCEAGSPGYYALKEESQDEDVNGQELGNLFLKEECHEFITPGESLLEERPYTSPSHDRLPPVDCAFGPWGHGYDAGSPGSPHLAENIMDAVDWSIGRLSPPIAVNRVHAIATAPANDPPIPVDADADELDLLGVATDDVNDTPVVHRPPDPLPQPFLDTVIRAYANDSQAQVIITDPLSWPMFRVTEEGRILRVHPDESISLFVPRGLATGVVNSDKVPSLRELVLSEIHRSVGHAGHRITLAAIRPLYWWSSMSADCAEFCRSCEDCTRGKASTQVPYGRLHPMPIPSGPWEQVAIDFMTGLPPVELEGMMVAQIMVVTDTWGKMVHLIPLPADADSELVAEKYYATVFRLHGMPSAIVSDRDPKFTSQFWRALQAKIGTVLRMSTAAHPETDGSSENRIKMVTQTLRIMVSSNHEAWASRLVEAEFALNSSVAVSTSLSAFEATYGYLPRCWPSDSWSVSDVPRAEAFARIRQLRNLDVTDAIIGARLNQSHQANKHRRPDDPAFRTGSYVYLSTKNLAVPDGMKSKLLPRYIGPFRIRAAIPATSSYDLELPPAMSRVHNCFHARLLRPCVENDAERFPGRDPAVLFVEDVADAADNSAIPERIVRDRRNARGARSFLVRWVGRNDTDDTWMSEQSIRLDHPSVLDAYLARLDRSNRRLAAR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.3
2	0.32
3	0.31
4	0.33
5	0.27
6	0.22
7	0.2
8	0.23
9	0.27
10	0.29
11	0.35
12	0.34
13	0.4
14	0.47
15	0.49
16	0.5
17	0.49
18	0.52
19	0.5
20	0.5
21	0.45
22	0.44
23	0.45
24	0.41
25	0.38
26	0.31
27	0.32
28	0.38
29	0.4
30	0.41
31	0.43
32	0.51
33	0.6
34	0.66
35	0.67
36	0.66
37	0.72
38	0.76
39	0.79
40	0.78
41	0.77
42	0.76
43	0.77
44	0.71
45	0.66
46	0.65
47	0.63
48	0.56
49	0.57
50	0.6
51	0.53
52	0.56
53	0.53
54	0.45
55	0.38
56	0.36
57	0.28
58	0.2
59	0.19
60	0.16
61	0.14
62	0.13
63	0.12
64	0.12
65	0.1
66	0.1
67	0.09
68	0.09
69	0.08
70	0.08
71	0.09
72	0.09
73	0.09
74	0.09
75	0.08
76	0.11
77	0.11
78	0.12
79	0.12
80	0.13
81	0.13
82	0.13
83	0.15
84	0.16
85	0.18
86	0.2
87	0.23
88	0.25
89	0.26
90	0.27
91	0.27
92	0.27
93	0.27
94	0.26
95	0.26
96	0.33
97	0.35
98	0.35
99	0.37
100	0.42
101	0.46
102	0.47
103	0.5
104	0.43
105	0.48
106	0.54
107	0.54
108	0.5
109	0.48
110	0.51
111	0.46
112	0.46
113	0.48
114	0.43
115	0.41
116	0.38
117	0.33
118	0.28
119	0.27
120	0.24
121	0.14
122	0.11
123	0.09
124	0.09
125	0.13
126	0.2
127	0.22
128	0.3
129	0.34
130	0.42
131	0.48
132	0.5
133	0.53
134	0.49
135	0.52
136	0.47
137	0.44
138	0.43
139	0.45
140	0.46
141	0.42
142	0.46
143	0.42
144	0.45
145	0.5
146	0.52
147	0.5
148	0.5
149	0.49
150	0.43
151	0.47
152	0.45
153	0.48
154	0.43
155	0.4
156	0.41
157	0.45
158	0.44
159	0.45
160	0.42
161	0.34
162	0.3
163	0.29
164	0.29
165	0.31
166	0.36
167	0.36
168	0.44
169	0.49
170	0.54
171	0.56
172	0.53
173	0.51
174	0.48
175	0.49
176	0.45
177	0.41
178	0.39
179	0.36
180	0.32
181	0.27
182	0.23
183	0.17
184	0.15
185	0.13
186	0.13
187	0.14
188	0.18
189	0.19
190	0.19
191	0.18
192	0.2
193	0.21
194	0.18
195	0.16
196	0.13
197	0.13
198	0.13
199	0.14
200	0.11
201	0.1
202	0.11
203	0.13
204	0.13
205	0.13
206	0.13
207	0.14
208	0.15
209	0.16
210	0.23
211	0.22
212	0.22
213	0.23
214	0.22
215	0.2
216	0.2
217	0.18
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.13
224	0.12
225	0.12
226	0.11
227	0.12
228	0.13
229	0.16
230	0.16
231	0.14
232	0.15
233	0.21
234	0.22
235	0.23
236	0.21
237	0.22
238	0.23
239	0.24
240	0.28
241	0.22
242	0.21
243	0.2
244	0.26
245	0.23
246	0.26
247	0.32
248	0.29
249	0.37
250	0.46
251	0.51
252	0.52
253	0.53
254	0.5
255	0.43
256	0.45
257	0.4
258	0.33
259	0.3
260	0.3
261	0.3
262	0.29
263	0.29
264	0.26
265	0.25
266	0.3
267	0.37
268	0.34
269	0.36
270	0.38
271	0.41
272	0.42
273	0.46
274	0.41
275	0.35
276	0.33
277	0.33
278	0.32
279	0.3
280	0.27
281	0.22
282	0.2
283	0.17
284	0.14
285	0.1
286	0.08
287	0.07
288	0.06
289	0.05
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.08
296	0.08
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.18
301	0.28
302	0.33
303	0.39
304	0.49
305	0.53
306	0.6
307	0.65
308	0.6
309	0.57
310	0.56
311	0.56
312	0.53
313	0.51
314	0.46
315	0.42
316	0.41
317	0.35
318	0.34
319	0.3
320	0.28
321	0.26
322	0.24
323	0.23
324	0.23
325	0.23
326	0.23
327	0.26
328	0.24
329	0.22
330	0.22
331	0.23
332	0.22
333	0.24
334	0.22
335	0.16
336	0.13
337	0.13
338	0.13
339	0.11
340	0.11
341	0.08
342	0.07
343	0.06
344	0.08
345	0.09
346	0.1
347	0.12
348	0.15
349	0.16
350	0.2
351	0.29
352	0.34
353	0.41
354	0.4
355	0.41
356	0.45
357	0.44
358	0.4
359	0.34
360	0.27
361	0.2
362	0.18
363	0.15
364	0.1
365	0.1
366	0.11
367	0.12
368	0.13
369	0.12
370	0.12
371	0.13
372	0.13
373	0.13
374	0.12
375	0.1
376	0.09
377	0.1
378	0.14
379	0.15
380	0.15
381	0.15
382	0.15
383	0.15
384	0.15
385	0.17
386	0.13
387	0.11
388	0.12
389	0.12
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.05
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.05
401	0.07
402	0.07
403	0.11
404	0.12
405	0.13
406	0.15
407	0.23
408	0.29
409	0.32
410	0.32
411	0.33
412	0.33
413	0.34
414	0.34
415	0.3
416	0.29
417	0.25
418	0.26
419	0.24
420	0.23
421	0.23
422	0.22
423	0.23
424	0.19
425	0.19
426	0.17
427	0.15
428	0.16
429	0.15
430	0.14
431	0.09
432	0.08
433	0.09
434	0.09
435	0.08
436	0.1
437	0.1
438	0.09
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.11
443	0.13
444	0.1
445	0.14
446	0.16
447	0.15
448	0.15
449	0.14
450	0.12
451	0.1
452	0.09
453	0.05
454	0.07
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.17
459	0.17
460	0.19
461	0.26
462	0.28
463	0.26
464	0.33
465	0.39
466	0.42
467	0.52
468	0.6
469	0.62
470	0.68
471	0.75
472	0.77
473	0.81
474	0.74
475	0.65
476	0.6
477	0.56
478	0.5
479	0.42
480	0.35
481	0.28
482	0.3
483	0.28
484	0.25
485	0.2
486	0.15
487	0.13
488	0.11
489	0.1
490	0.07
491	0.11
492	0.1
493	0.1
494	0.1
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.09
499	0.06
500	0.07
501	0.08
502	0.08
503	0.08
504	0.08
505	0.08
506	0.12
507	0.13
508	0.11
509	0.13
510	0.17
511	0.19
512	0.25
513	0.29
514	0.25
515	0.28
516	0.29
517	0.3
518	0.25
519	0.23
520	0.19
521	0.15
522	0.13
523	0.1
524	0.1
525	0.07
526	0.07
527	0.07
528	0.06
529	0.06
530	0.07
531	0.08
532	0.07
533	0.07
534	0.08
535	0.12
536	0.12
537	0.11
538	0.11
539	0.1
540	0.12
541	0.15
542	0.19
543	0.16
544	0.17
545	0.18
546	0.2
547	0.23
548	0.23
549	0.25
550	0.26
551	0.31
552	0.33
553	0.34
554	0.34
555	0.33
556	0.3
557	0.28
558	0.25
559	0.17
560	0.16
561	0.18
562	0.16
563	0.15
564	0.14
565	0.12
566	0.11
567	0.11
568	0.1
569	0.09
570	0.09
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.07
575	0.08
576	0.08
577	0.05
578	0.06
579	0.07
580	0.07
581	0.09
582	0.1
583	0.12
584	0.12
585	0.12
586	0.11
587	0.11
588	0.11
589	0.09
590	0.07
591	0.05
592	0.05
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.07
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.09
601	0.08
602	0.09
603	0.1
604	0.1
605	0.09
606	0.11
607	0.1
608	0.09
609	0.08
610	0.06
611	0.07
612	0.08
613	0.09
614	0.07
615	0.08
616	0.08
617	0.1
618	0.1
619	0.12
620	0.16
621	0.16
622	0.21
623	0.23
624	0.24
625	0.25
626	0.26
627	0.27
628	0.23
629	0.22
630	0.17
631	0.17
632	0.17
633	0.15
634	0.14
635	0.11
636	0.1
637	0.1
638	0.1
639	0.08
640	0.08
641	0.1
642	0.09
643	0.08
644	0.07
645	0.07
646	0.08
647	0.07
648	0.06
649	0.05
650	0.06
651	0.06
652	0.07
653	0.07
654	0.06
655	0.06
656	0.06
657	0.05
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.04
664	0.05
665	0.05
666	0.07
667	0.09
668	0.1
669	0.12
670	0.13
671	0.14
672	0.15
673	0.15
674	0.13
675	0.11
676	0.1
677	0.1
678	0.1
679	0.11
680	0.1
681	0.1
682	0.11
683	0.11
684	0.1
685	0.09
686	0.1
687	0.09
688	0.08
689	0.08
690	0.07
691	0.08
692	0.08
693	0.08
694	0.06
695	0.05
696	0.05
697	0.05
698	0.04
699	0.02
700	0.02
701	0.02
702	0.02
703	0.02
704	0.03
705	0.03
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.05
710	0.1
711	0.11
712	0.12
713	0.13
714	0.15
715	0.18
716	0.25
717	0.28
718	0.26
719	0.27
720	0.27
721	0.29
722	0.26
723	0.26
724	0.2
725	0.16
726	0.14
727	0.14
728	0.13
729	0.1
730	0.12
731	0.13
732	0.14
733	0.15
734	0.15
735	0.13
736	0.13
737	0.13
738	0.11
739	0.07
740	0.07
741	0.06
742	0.06
743	0.06
744	0.08
745	0.09
746	0.08
747	0.09
748	0.09
749	0.1
750	0.1
751	0.13
752	0.12
753	0.17
754	0.19
755	0.19
756	0.19
757	0.19
758	0.19
759	0.2
760	0.2
761	0.15
762	0.13
763	0.14
764	0.13
765	0.14
766	0.15
767	0.12
768	0.11
769	0.1
770	0.1
771	0.09
772	0.08
773	0.08
774	0.06
775	0.06
776	0.05
777	0.06
778	0.08
779	0.08
780	0.08
781	0.08
782	0.09
783	0.09
784	0.09
785	0.1
786	0.1
787	0.12
788	0.12
789	0.13
790	0.13
791	0.13
792	0.17
793	0.17
794	0.17
795	0.15
796	0.15
797	0.14
798	0.14
799	0.14
800	0.13
801	0.15
802	0.17
803	0.17
804	0.18
805	0.18
806	0.18
807	0.16
808	0.15
809	0.14
810	0.13
811	0.12
812	0.11
813	0.12
814	0.13
815	0.14
816	0.13
817	0.12
818	0.1
819	0.13
820	0.13
821	0.14
822	0.14
823	0.13
824	0.12
825	0.14
826	0.15
827	0.12
828	0.13
829	0.17
830	0.17
831	0.18
832	0.23
833	0.25
834	0.26
835	0.3
836	0.33
837	0.29
838	0.29
839	0.33
840	0.32
841	0.34
842	0.36
843	0.36
844	0.34
845	0.34
846	0.36
847	0.35
848	0.32
849	0.27
850	0.24
851	0.23
852	0.23
853	0.22
854	0.22
855	0.2
856	0.22
857	0.21
858	0.2
859	0.18
860	0.16
861	0.15
862	0.15
863	0.11
864	0.08
865	0.08
866	0.07
867	0.07
868	0.07
869	0.06
870	0.04
871	0.04
872	0.05
873	0.05
874	0.05
875	0.04
876	0.04
877	0.04
878	0.04
879	0.04
880	0.03
881	0.03
882	0.03
883	0.03
884	0.03
885	0.03
886	0.04
887	0.04
888	0.05
889	0.05
890	0.06
891	0.06
892	0.08
893	0.09
894	0.13
895	0.14
896	0.14
897	0.14
898	0.16
899	0.16
900	0.14
901	0.13
902	0.09
903	0.07
904	0.07
905	0.07
906	0.06
907	0.05
908	0.05
909	0.05
910	0.05
911	0.05
912	0.06
913	0.06
914	0.07
915	0.1
916	0.11
917	0.13
918	0.15
919	0.15
920	0.16
921	0.17
922	0.16
923	0.13
924	0.15
925	0.13
926	0.12
927	0.13
928	0.19
929	0.19
930	0.23
931	0.24
932	0.24
933	0.26
934	0.29
935	0.35
936	0.33
937	0.38
938	0.35
939	0.43
940	0.43
941	0.41
942	0.42
943	0.37
944	0.31
945	0.3
946	0.3
947	0.21
948	0.19
949	0.18
950	0.14
951	0.13
952	0.13
953	0.12
954	0.16
955	0.16
956	0.16
957	0.16
958	0.16
959	0.16
960	0.17
961	0.15
962	0.13
963	0.19
964	0.21
965	0.22
966	0.22
967	0.21
968	0.2
969	0.21
970	0.28
971	0.25
972	0.26
973	0.28
974	0.29
975	0.29
976	0.28
977	0.27
978	0.19
979	0.2
980	0.21
981	0.2
982	0.19
983	0.19
984	0.19
985	0.19
986	0.25
987	0.2
988	0.16
989	0.17
990	0.16
991	0.16
992	0.16
993	0.16
994	0.09
995	0.09
996	0.09
997	0.07
998	0.07
999	0.06
1000	0.06
1001	0.05
1002	0.06
1003	0.06
1004	0.06
1005	0.06
1006	0.07
1007	0.07
1008	0.07
1009	0.07
1010	0.07
1011	0.07
1012	0.06
1013	0.08
1014	0.1
1015	0.1
1016	0.12
1017	0.13
1018	0.15
1019	0.17
1020	0.18
1021	0.18
1022	0.22
1023	0.29
1024	0.3
1025	0.32
1026	0.33
1027	0.33
1028	0.31
1029	0.35
1030	0.3
1031	0.24
1032	0.22
1033	0.21
1034	0.19
1035	0.23
1036	0.25
1037	0.26
1038	0.33
1039	0.36
1040	0.37
1041	0.4
1042	0.43
1043	0.4
1044	0.43
1045	0.39
1046	0.33
1047	0.28
1048	0.27
1049	0.22
1050	0.19
1051	0.15
1052	0.11
1053	0.09
1054	0.09
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.11
1058	0.18
1059	0.21
1060	0.27
1061	0.34
1062	0.44
1063	0.51
1064	0.6
1065	0.68
1066	0.66
1067	0.66
1068	0.68
1069	0.72
1070	0.72
1071	0.68
1072	0.65
1073	0.6
1074	0.57
1075	0.55
1076	0.47
1077	0.38
1078	0.29
1079	0.25
1080	0.22
1081	0.21
1082	0.21
1083	0.21
1084	0.22
1085	0.21
1086	0.2
1087	0.19
1088	0.18
1089	0.15
1090	0.19
1091	0.22
1092	0.21
1093	0.21
1094	0.21
1095	0.27
1096	0.32
1097	0.33
1098	0.3
1099	0.28
1100	0.37
1101	0.42
1102	0.5
1103	0.46
1104	0.43
1105	0.43
1106	0.47
1107	0.44
1108	0.37
1109	0.35
1110	0.29
1111	0.28
1112	0.27
1113	0.29
1114	0.25
1115	0.25
1116	0.23
1117	0.22
1118	0.18
1119	0.18
1120	0.16
1121	0.13
1122	0.12
1123	0.14
1124	0.14
1125	0.15
1126	0.18
1127	0.23
1128	0.25
1129	0.31
1130	0.33
1131	0.33
1132	0.38
1133	0.45
1134	0.47
1135	0.49
1136	0.54
1137	0.52
1138	0.52
1139	0.51
1140	0.51
1141	0.47
1142	0.44
1143	0.41
1144	0.39
1145	0.38
1146	0.37
1147	0.37
1148	0.32
1149	0.35
1150	0.33
1151	0.32
1152	0.27
1153	0.27
1154	0.29
1155	0.28
1156	0.27
1157	0.19
1158	0.19
1159	0.15
1160	0.14
1161	0.1
1162	0.07
1163	0.06
1164	0.06
1165	0.06
1166	0.05
1167	0.07
1168	0.1
1169	0.09
1170	0.09
1171	0.12
1172	0.15
1173	0.25
1174	0.33
1175	0.36
1176	0.44
1177	0.53
1178	0.62
1179	0.69
1180	0.7
1181	0.68
1182	0.7
1183	0.69
1184	0.64
1185	0.61
1186	0.54
1187	0.48
1188	0.52
1189	0.46
1190	0.4
1191	0.42
1192	0.43
1193	0.39
1194	0.41
1195	0.41
1196	0.34
1197	0.37
1198	0.35
1199	0.34
1200	0.31
1201	0.29
1202	0.28
1203	0.26
1204	0.26
1205	0.25
1206	0.26
1207	0.23
1208	0.24
1209	0.26
1210	0.25
1211	0.24
1212	0.25
1213	0.23
1214	0.19
1215	0.19
1216	0.15
1217	0.15
1218	0.19
1219	0.18
1220	0.17
1221	0.2
1222	0.25
1223	0.34
1224	0.39
1225	0.45

A0A2X0LBX6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer