FuNGI

A0A2X0LHY4

Protein Details

Accession

A0A2X0LHY4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1036-1055	KNPTLHHRSRHIRIREHFVR	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

extr 9, cyto 6.5, cyto_nucl 5.5, nucl 3.5, mito 2, plas 2, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR001995 Peptidase_A2_cat IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004190 F:aspartic-type endopeptidase activity GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0006508 P:proteolysis GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50175 ASP_PROT_RETROV PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MIAFVIIIALYHTVETALAHATGRYHTMTQLDTSHLDSTVSVTVRPSVNVVALLGRLPLNRELHLPNDTLVLDSGASHHMVKDASLFDAWHTRSHVAVDGAGGSLMAQGTGSIMIRTSKQRTIKLCNVYYVPDLPANLISVMQLRRERVYTHFGKTIELRSQGQLIGVASLIANQLSTLDATPIRSTVSPVAAAAIPLLTLHQRFGHLSLPNLRRAVSSGQLQGQTWTYSAAECKAFSCDTCKAAKATRTPFPTSDSRASQPLELVHSDVLTLPEPATDGERYVVTFIDDFSRKTWVSALRNKSQVFDTFQRWHAMIERSTGLKLRTLRTDNGAERTNRTIVEGTIALLQHSGLPMTLWREALRYVVDTKNLSPHSAIDHKIPDTIWYGKPPSTANLRAFGCRAWHTTPRHKRAKLDPKAKPFIFVGIENKTKAWTLYDPETTSFFQSRDVRFDENVFPARDAPTGQPKPRATSTAGDWTFVDAAHGSRTVPRLSLPPVVHENRFAALETDASDDATIEMSDDGFDTPSDMSMAQFSLSPPASDVTDDSADPIDFLSCPSRAAAFAATTADSPVVELEGPTEDPQNWSQAVKSGKEEIWRQAAADEFHSLTTEYKCFTPVDSSSLPPGAKVLGSRFIFRTKRDQLGKITSHKGRLVAQGFSQRPGIDYDETFAPVAKFTSIRALIALAAAKKLHVHQADVDKAYLHGELKEDLYMRVPQGVDMPGKVLKLHRSIYGLKQAGRVWNEHIDLTLKSLHYRATAKDHCVYVRRDGDHYHYIALYVDDLLMVSPSEDEIERILNGLEQKYGIKRLGPAQYILGIQIKRQADKSIILSQEAYITSILRRFGMSDSSPASTPMAPNRQLEHSLAETSKTARTRYMQAIGCLLYAATGTRPDISYAVGYLARFSASPTPEHWTAIKTVFRYLRGTARLGLHYSSEQGKFSGFTGYSDADWGTCTTSSRSTMGYSFHLAGSVISWSSKVQNRVADSTTDAEYLALSHASKEAGHLQELLMELGIDTRAPVQLYGDNQGAIALAKNPTLHHRSRHIRIREHFVRDQVRLGTIQVDYVDTKTMVADIFTKALGPLVFKVHRDNLGLRG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.07
3	0.07
4	0.08
5	0.08
6	0.09
7	0.09
8	0.11
9	0.12
10	0.15
11	0.16
12	0.16
13	0.17
14	0.2
15	0.21
16	0.22
17	0.23
18	0.24
19	0.23
20	0.24
21	0.24
22	0.21
23	0.2
24	0.17
25	0.18
26	0.19
27	0.18
28	0.16
29	0.16
30	0.2
31	0.2
32	0.21
33	0.2
34	0.17
35	0.17
36	0.17
37	0.17
38	0.14
39	0.13
40	0.13
41	0.12
42	0.13
43	0.12
44	0.15
45	0.2
46	0.22
47	0.22
48	0.26
49	0.28
50	0.3
51	0.32
52	0.3
53	0.25
54	0.25
55	0.24
56	0.2
57	0.18
58	0.15
59	0.11
60	0.1
61	0.11
62	0.1
63	0.12
64	0.11
65	0.11
66	0.12
67	0.13
68	0.13
69	0.14
70	0.14
71	0.14
72	0.15
73	0.15
74	0.14
75	0.22
76	0.23
77	0.23
78	0.25
79	0.24
80	0.24
81	0.26
82	0.27
83	0.2
84	0.2
85	0.17
86	0.14
87	0.13
88	0.12
89	0.1
90	0.07
91	0.06
92	0.06
93	0.05
94	0.04
95	0.04
96	0.05
97	0.06
98	0.06
99	0.06
100	0.07
101	0.09
102	0.12
103	0.2
104	0.24
105	0.31
106	0.37
107	0.45
108	0.51
109	0.59
110	0.64
111	0.67
112	0.63
113	0.61
114	0.55
115	0.51
116	0.47
117	0.4
118	0.34
119	0.26
120	0.24
121	0.21
122	0.2
123	0.18
124	0.15
125	0.12
126	0.11
127	0.14
128	0.15
129	0.2
130	0.22
131	0.24
132	0.26
133	0.28
134	0.3
135	0.29
136	0.37
137	0.36
138	0.38
139	0.41
140	0.38
141	0.4
142	0.41
143	0.42
144	0.39
145	0.38
146	0.35
147	0.31
148	0.33
149	0.3
150	0.27
151	0.23
152	0.17
153	0.13
154	0.11
155	0.09
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.06
160	0.05
161	0.04
162	0.05
163	0.05
164	0.06
165	0.06
166	0.08
167	0.09
168	0.11
169	0.12
170	0.12
171	0.13
172	0.13
173	0.15
174	0.16
175	0.17
176	0.16
177	0.15
178	0.16
179	0.15
180	0.14
181	0.12
182	0.08
183	0.06
184	0.06
185	0.07
186	0.08
187	0.08
188	0.1
189	0.11
190	0.13
191	0.14
192	0.16
193	0.21
194	0.2
195	0.23
196	0.32
197	0.34
198	0.37
199	0.37
200	0.35
201	0.3
202	0.32
203	0.31
204	0.26
205	0.27
206	0.25
207	0.29
208	0.3
209	0.29
210	0.28
211	0.26
212	0.22
213	0.18
214	0.16
215	0.12
216	0.11
217	0.13
218	0.14
219	0.14
220	0.13
221	0.14
222	0.16
223	0.16
224	0.16
225	0.2
226	0.2
227	0.22
228	0.24
229	0.25
230	0.25
231	0.3
232	0.35
233	0.38
234	0.4
235	0.44
236	0.47
237	0.5
238	0.48
239	0.48
240	0.48
241	0.46
242	0.46
243	0.43
244	0.4
245	0.4
246	0.4
247	0.35
248	0.31
249	0.27
250	0.24
251	0.2
252	0.19
253	0.15
254	0.14
255	0.13
256	0.12
257	0.12
258	0.09
259	0.09
260	0.08
261	0.07
262	0.08
263	0.08
264	0.1
265	0.09
266	0.09
267	0.1
268	0.1
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.08
273	0.08
274	0.08
275	0.13
276	0.13
277	0.14
278	0.15
279	0.19
280	0.18
281	0.19
282	0.23
283	0.25
284	0.32
285	0.4
286	0.46
287	0.47
288	0.54
289	0.54
290	0.51
291	0.46
292	0.41
293	0.39
294	0.37
295	0.37
296	0.35
297	0.37
298	0.37
299	0.34
300	0.32
301	0.31
302	0.3
303	0.25
304	0.24
305	0.23
306	0.22
307	0.23
308	0.24
309	0.2
310	0.2
311	0.23
312	0.23
313	0.28
314	0.31
315	0.32
316	0.34
317	0.4
318	0.38
319	0.39
320	0.41
321	0.35
322	0.34
323	0.36
324	0.33
325	0.26
326	0.25
327	0.22
328	0.17
329	0.18
330	0.15
331	0.12
332	0.13
333	0.13
334	0.11
335	0.1
336	0.09
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.04
341	0.04
342	0.06
343	0.08
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.11
348	0.11
349	0.13
350	0.12
351	0.11
352	0.14
353	0.15
354	0.18
355	0.18
356	0.18
357	0.24
358	0.24
359	0.23
360	0.2
361	0.19
362	0.21
363	0.24
364	0.24
365	0.2
366	0.23
367	0.22
368	0.23
369	0.22
370	0.19
371	0.18
372	0.21
373	0.19
374	0.2
375	0.22
376	0.22
377	0.24
378	0.23
379	0.22
380	0.25
381	0.29
382	0.27
383	0.31
384	0.31
385	0.31
386	0.31
387	0.28
388	0.24
389	0.21
390	0.23
391	0.21
392	0.28
393	0.33
394	0.43
395	0.53
396	0.6
397	0.67
398	0.66
399	0.68
400	0.71
401	0.76
402	0.75
403	0.76
404	0.74
405	0.73
406	0.79
407	0.72
408	0.64
409	0.53
410	0.46
411	0.37
412	0.32
413	0.27
414	0.23
415	0.25
416	0.23
417	0.23
418	0.2
419	0.19
420	0.17
421	0.16
422	0.12
423	0.14
424	0.18
425	0.21
426	0.21
427	0.21
428	0.24
429	0.22
430	0.22
431	0.2
432	0.16
433	0.19
434	0.24
435	0.24
436	0.26
437	0.28
438	0.27
439	0.27
440	0.29
441	0.26
442	0.24
443	0.26
444	0.23
445	0.2
446	0.19
447	0.19
448	0.17
449	0.16
450	0.15
451	0.22
452	0.26
453	0.28
454	0.35
455	0.35
456	0.39
457	0.39
458	0.39
459	0.31
460	0.28
461	0.29
462	0.31
463	0.3
464	0.27
465	0.25
466	0.23
467	0.21
468	0.18
469	0.15
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.07
474	0.06
475	0.08
476	0.1
477	0.1
478	0.1
479	0.11
480	0.12
481	0.15
482	0.21
483	0.19
484	0.2
485	0.26
486	0.28
487	0.28
488	0.26
489	0.24
490	0.19
491	0.19
492	0.16
493	0.11
494	0.09
495	0.08
496	0.08
497	0.09
498	0.08
499	0.08
500	0.07
501	0.06
502	0.06
503	0.06
504	0.05
505	0.04
506	0.04
507	0.03
508	0.04
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.05
514	0.05
515	0.05
516	0.05
517	0.05
518	0.05
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.05
524	0.08
525	0.08
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.08
531	0.09
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.08
536	0.08
537	0.08
538	0.08
539	0.07
540	0.05
541	0.04
542	0.05
543	0.07
544	0.06
545	0.07
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.08
550	0.08
551	0.06
552	0.06
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.07
557	0.06
558	0.05
559	0.05
560	0.04
561	0.04
562	0.03
563	0.03
564	0.04
565	0.04
566	0.05
567	0.06
568	0.07
569	0.06
570	0.09
571	0.1
572	0.11
573	0.11
574	0.11
575	0.1
576	0.14
577	0.16
578	0.15
579	0.16
580	0.17
581	0.18
582	0.22
583	0.24
584	0.22
585	0.24
586	0.23
587	0.21
588	0.19
589	0.2
590	0.16
591	0.15
592	0.14
593	0.1
594	0.1
595	0.1
596	0.1
597	0.09
598	0.1
599	0.1
600	0.1
601	0.09
602	0.11
603	0.11
604	0.11
605	0.13
606	0.12
607	0.17
608	0.17
609	0.18
610	0.17
611	0.2
612	0.19
613	0.15
614	0.15
615	0.1
616	0.09
617	0.09
618	0.1
619	0.14
620	0.15
621	0.17
622	0.18
623	0.25
624	0.27
625	0.29
626	0.36
627	0.34
628	0.41
629	0.44
630	0.46
631	0.43
632	0.49
633	0.51
634	0.47
635	0.49
636	0.44
637	0.43
638	0.41
639	0.37
640	0.32
641	0.34
642	0.31
643	0.25
644	0.25
645	0.3
646	0.29
647	0.29
648	0.28
649	0.21
650	0.2
651	0.2
652	0.21
653	0.14
654	0.14
655	0.14
656	0.14
657	0.15
658	0.14
659	0.12
660	0.1
661	0.08
662	0.09
663	0.08
664	0.07
665	0.07
666	0.13
667	0.12
668	0.12
669	0.12
670	0.12
671	0.11
672	0.12
673	0.13
674	0.07
675	0.08
676	0.08
677	0.08
678	0.08
679	0.09
680	0.15
681	0.14
682	0.15
683	0.18
684	0.24
685	0.27
686	0.27
687	0.27
688	0.2
689	0.2
690	0.2
691	0.17
692	0.11
693	0.08
694	0.09
695	0.09
696	0.1
697	0.11
698	0.11
699	0.1
700	0.12
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.13
705	0.11
706	0.13
707	0.15
708	0.14
709	0.12
710	0.14
711	0.13
712	0.13
713	0.14
714	0.14
715	0.16
716	0.2
717	0.22
718	0.22
719	0.25
720	0.28
721	0.31
722	0.37
723	0.36
724	0.32
725	0.34
726	0.34
727	0.35
728	0.34
729	0.31
730	0.26
731	0.27
732	0.27
733	0.23
734	0.22
735	0.18
736	0.17
737	0.17
738	0.16
739	0.13
740	0.13
741	0.13
742	0.14
743	0.16
744	0.18
745	0.19
746	0.25
747	0.28
748	0.32
749	0.35
750	0.35
751	0.34
752	0.38
753	0.38
754	0.36
755	0.39
756	0.36
757	0.35
758	0.35
759	0.38
760	0.38
761	0.36
762	0.29
763	0.23
764	0.21
765	0.2
766	0.18
767	0.12
768	0.07
769	0.06
770	0.05
771	0.05
772	0.04
773	0.04
774	0.04
775	0.04
776	0.03
777	0.04
778	0.05
779	0.05
780	0.05
781	0.06
782	0.07
783	0.07
784	0.07
785	0.07
786	0.08
787	0.1
788	0.11
789	0.1
790	0.1
791	0.12
792	0.14
793	0.18
794	0.17
795	0.16
796	0.18
797	0.24
798	0.3
799	0.29
800	0.28
801	0.26
802	0.27
803	0.25
804	0.24
805	0.23
806	0.16
807	0.15
808	0.21
809	0.22
810	0.22
811	0.23
812	0.24
813	0.21
814	0.24
815	0.28
816	0.28
817	0.27
818	0.27
819	0.26
820	0.24
821	0.24
822	0.21
823	0.17
824	0.11
825	0.11
826	0.11
827	0.13
828	0.13
829	0.11
830	0.11
831	0.12
832	0.13
833	0.17
834	0.17
835	0.18
836	0.2
837	0.21
838	0.21
839	0.2
840	0.21
841	0.17
842	0.18
843	0.22
844	0.27
845	0.29
846	0.31
847	0.33
848	0.35
849	0.36
850	0.35
851	0.31
852	0.26
853	0.26
854	0.24
855	0.22
856	0.2
857	0.19
858	0.23
859	0.22
860	0.22
861	0.23
862	0.26
863	0.31
864	0.35
865	0.41
866	0.38
867	0.37
868	0.38
869	0.35
870	0.31
871	0.25
872	0.19
873	0.11
874	0.08
875	0.08
876	0.06
877	0.07
878	0.08
879	0.09
880	0.1
881	0.11
882	0.12
883	0.12
884	0.12
885	0.11
886	0.12
887	0.12
888	0.12
889	0.11
890	0.11
891	0.1
892	0.1
893	0.11
894	0.16
895	0.16
896	0.18
897	0.19
898	0.25
899	0.26
900	0.28
901	0.27
902	0.22
903	0.24
904	0.28
905	0.3
906	0.24
907	0.3
908	0.32
909	0.34
910	0.35
911	0.35
912	0.37
913	0.36
914	0.38
915	0.35
916	0.35
917	0.35
918	0.34
919	0.32
920	0.27
921	0.24
922	0.25
923	0.26
924	0.23
925	0.21
926	0.2
927	0.19
928	0.18
929	0.18
930	0.2
931	0.15
932	0.15
933	0.18
934	0.19
935	0.18
936	0.18
937	0.18
938	0.12
939	0.13
940	0.12
941	0.11
942	0.1
943	0.12
944	0.14
945	0.17
946	0.19
947	0.2
948	0.21
949	0.21
950	0.22
951	0.23
952	0.24
953	0.24
954	0.23
955	0.21
956	0.2
957	0.18
958	0.16
959	0.14
960	0.12
961	0.09
962	0.08
963	0.09
964	0.09
965	0.16
966	0.22
967	0.25
968	0.29
969	0.34
970	0.38
971	0.42
972	0.42
973	0.37
974	0.35
975	0.33
976	0.3
977	0.24
978	0.2
979	0.16
980	0.14
981	0.13
982	0.11
983	0.09
984	0.08
985	0.08
986	0.09
987	0.1
988	0.1
989	0.12
990	0.18
991	0.19
992	0.2
993	0.2
994	0.19
995	0.2
996	0.21
997	0.19
998	0.11
999	0.09
1000	0.08
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.06
1004	0.05
1005	0.06
1006	0.08
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.11
1010	0.14
1011	0.17
1012	0.21
1013	0.21
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.18
1017	0.16
1018	0.13
1019	0.11
1020	0.1
1021	0.1
1022	0.12
1023	0.13
1024	0.15
1025	0.23
1026	0.29
1027	0.34
1028	0.37
1029	0.46
1030	0.54
1031	0.63
1032	0.72
1033	0.73
1034	0.75
1035	0.76
1036	0.8
1037	0.79
1038	0.78
1039	0.72
1040	0.71
1041	0.69
1042	0.61
1043	0.6
1044	0.52
1045	0.45
1046	0.38
1047	0.34
1048	0.29
1049	0.22
1050	0.21
1051	0.17
1052	0.17
1053	0.16
1054	0.16
1055	0.17
1056	0.14
1057	0.14
1058	0.13
1059	0.13
1060	0.11
1061	0.11
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.13
1065	0.13
1066	0.13
1067	0.12
1068	0.14
1069	0.14
1070	0.14
1071	0.15
1072	0.22
1073	0.25
1074	0.26
1075	0.33
1076	0.36
1077	0.39
1078	0.41

A0A2X0LHY4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer