FuNGI

A0A2X0MD97

Protein Details

Accession

A0A2X0MD97

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
158-194	DPECPKYDPNAKRGRNKNHSNKKKKQHQHSKGSADSE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-184	AKRGRNKNHSNKKKKQH

Subcellular Location(s)

cyto 7.5, cyto_nucl 7.5, nucl 6.5, mito 6, plas 3, pero 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MVKSKSLSAKDIWEKLKQHHEGNADPFKIRTLLYEISNASYDEDTNLGEFLKGITDKVDQLDDLGQKFKDEAIVAFMLQALPPSYEMLKQAIKLSDKCSVDYAVNRLTDEYSERKLTGKYDKLLKNAGALAVREGTQVKRDPNCICRGCKGTGHYQIDPECPKYDPNAKRGRNKNHSNKKKKQHQHSKGSADSEESASFALVVKSLEESHSLHINVANRVSQNDQSEIWILDTGASQHYVGNASLLTDRQHGSLNVQTASGQVVHCDTYGTVRFKLRSGASLSLSNVYHLPGAPVNLVSTRALYRSGASCGWEDGRDVMTIKIKGLTVAKTLNGTGYTLDFTRIVEDQAHVATRATVGAPLMEWHRRYGHIAVSSLKELVKSGAVDGLVLTDEKVHDCEPCISSKSRASKFSESVTHVTDVLQRVFMDIGFVAEDQVDFQGRKAYLAIVDQYSTAKWTFPLKTKSAEEVTRVWIAFRQGVEKMTGRKIKRVRTDNGNEFTNKLIGADFQSQGILHETSAPYTPQQNGTVERFNGSLMAIVRAVLAASKLSWKYWSYAMEYATFVANRVLHSKLDGKTAYEVFYGKKPKVSHFRPFGSTVFAQVPKSKRPITLYAGSQRLIETRLTRWLGLKSRASRALVSLPSSSIFHPRSCARTQPLESGSIRGTFIGYDNEYNYRVLVDSDSEHKVIITRDIAVLNLQPEEVRAPEVTTLLEGPDEDEGPVLEGNDAGDELQDEVAGEQIAPARPNRPRWEYGDPAVRGRNPGRFEEIDAGNEIHQRTRGQRRIVEQQGLFVTEIPELDPEPPIMSGYAMISTDRPAVPSSYEEAMNSAEADKWKEAIQDELNAMDRHQVLADSDLPHGARALGSKWVFARKENAQGEVIRYKARLVAQGFAQRSGIDYNETFAPVARSTTILFLIAIAASQGLCLEQFDYDSAIPRVGIVLSLAKSFVSITKQAPREWNSAVNNLMVACGYSRSDADSCLYVKRVEEMFVYITLYVDDGLAASNDQTFLDSEIQAFNKVYQLKRLGPVKVFLGLEFLRTSKFIFVHQSKYIRSLVATYGGDHGSKHPAKVPMEPRSNMEHSTEPFDDIALYQSAVGALQYAAHRARPDIVTSVRAAASKVSAPTQADWIAVKRIIRYLQGTIDWGLKYNLEGSTVFELYSDASWGDDMLTGKSIGAFVSIMAGAAISWQSKQQSMVATSTTEAEILAASAAAKEAMWLRRLAADLKIQQPGSTLLWEDNQAVIAIAQNPAHHGRTKHYSVHHFYIRERVTIGDIRIKYCKTGAMTADLLTKPLARNLFELHRDGLGMGQRSRGTCGIGKLARAWRGAGWRQMAVWLVVIH

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.55
2	0.58
3	0.66
4	0.62
5	0.58
6	0.57
7	0.58
8	0.57
9	0.61
10	0.62
11	0.54
12	0.5
13	0.45
14	0.41
15	0.37
16	0.31
17	0.25
18	0.22
19	0.24
20	0.25
21	0.29
22	0.28
23	0.29
24	0.3
25	0.27
26	0.23
27	0.2
28	0.18
29	0.15
30	0.15
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.1
35	0.09
36	0.09
37	0.08
38	0.12
39	0.12
40	0.11
41	0.14
42	0.16
43	0.17
44	0.2
45	0.21
46	0.16
47	0.18
48	0.23
49	0.24
50	0.24
51	0.26
52	0.24
53	0.23
54	0.24
55	0.22
56	0.2
57	0.17
58	0.16
59	0.17
60	0.18
61	0.17
62	0.16
63	0.16
64	0.13
65	0.12
66	0.12
67	0.09
68	0.09
69	0.09
70	0.11
71	0.12
72	0.14
73	0.16
74	0.19
75	0.21
76	0.22
77	0.26
78	0.3
79	0.34
80	0.36
81	0.38
82	0.41
83	0.4
84	0.4
85	0.37
86	0.33
87	0.32
88	0.33
89	0.34
90	0.31
91	0.31
92	0.3
93	0.29
94	0.27
95	0.25
96	0.26
97	0.26
98	0.25
99	0.27
100	0.27
101	0.29
102	0.3
103	0.34
104	0.39
105	0.41
106	0.42
107	0.49
108	0.54
109	0.56
110	0.59
111	0.54
112	0.48
113	0.42
114	0.39
115	0.32
116	0.27
117	0.25
118	0.21
119	0.2
120	0.19
121	0.19
122	0.18
123	0.21
124	0.25
125	0.3
126	0.33
127	0.39
128	0.44
129	0.49
130	0.57
131	0.57
132	0.56
133	0.56
134	0.56
135	0.54
136	0.53
137	0.51
138	0.5
139	0.54
140	0.57
141	0.52
142	0.52
143	0.51
144	0.53
145	0.52
146	0.46
147	0.37
148	0.32
149	0.32
150	0.33
151	0.41
152	0.4
153	0.46
154	0.53
155	0.59
156	0.68
157	0.77
158	0.81
159	0.82
160	0.86
161	0.88
162	0.89
163	0.92
164	0.93
165	0.93
166	0.93
167	0.94
168	0.93
169	0.93
170	0.93
171	0.93
172	0.93
173	0.92
174	0.89
175	0.83
176	0.77
177	0.66
178	0.58
179	0.49
180	0.41
181	0.31
182	0.23
183	0.18
184	0.13
185	0.13
186	0.11
187	0.09
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.12
195	0.13
196	0.15
197	0.19
198	0.19
199	0.19
200	0.21
201	0.24
202	0.24
203	0.24
204	0.24
205	0.21
206	0.23
207	0.25
208	0.27
209	0.26
210	0.26
211	0.24
212	0.23
213	0.24
214	0.23
215	0.2
216	0.16
217	0.13
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.1
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.13
235	0.14
236	0.14
237	0.17
238	0.16
239	0.18
240	0.21
241	0.23
242	0.2
243	0.2
244	0.19
245	0.17
246	0.17
247	0.15
248	0.11
249	0.09
250	0.1
251	0.1
252	0.1
253	0.1
254	0.09
255	0.13
256	0.19
257	0.21
258	0.23
259	0.27
260	0.28
261	0.28
262	0.34
263	0.3
264	0.28
265	0.3
266	0.31
267	0.29
268	0.31
269	0.31
270	0.29
271	0.27
272	0.24
273	0.2
274	0.17
275	0.15
276	0.12
277	0.13
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.14
292	0.15
293	0.17
294	0.16
295	0.17
296	0.17
297	0.18
298	0.19
299	0.17
300	0.15
301	0.14
302	0.14
303	0.13
304	0.14
305	0.14
306	0.17
307	0.17
308	0.17
309	0.18
310	0.16
311	0.18
312	0.2
313	0.19
314	0.17
315	0.18
316	0.19
317	0.18
318	0.18
319	0.17
320	0.15
321	0.13
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.11
349	0.15
350	0.15
351	0.17
352	0.19
353	0.2
354	0.24
355	0.25
356	0.26
357	0.24
358	0.25
359	0.26
360	0.26
361	0.26
362	0.23
363	0.21
364	0.16
365	0.14
366	0.13
367	0.12
368	0.1
369	0.09
370	0.1
371	0.1
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.07
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.1
385	0.14
386	0.14
387	0.17
388	0.19
389	0.2
390	0.23
391	0.29
392	0.37
393	0.38
394	0.42
395	0.46
396	0.48
397	0.49
398	0.49
399	0.48
400	0.43
401	0.41
402	0.38
403	0.32
404	0.26
405	0.24
406	0.24
407	0.21
408	0.18
409	0.16
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.13
414	0.09
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.07
425	0.06
426	0.07
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.13
434	0.15
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.1
440	0.11
441	0.1
442	0.08
443	0.09
444	0.14
445	0.17
446	0.24
447	0.3
448	0.3
449	0.35
450	0.37
451	0.4
452	0.39
453	0.37
454	0.32
455	0.29
456	0.3
457	0.28
458	0.25
459	0.21
460	0.19
461	0.19
462	0.18
463	0.16
464	0.16
465	0.14
466	0.15
467	0.18
468	0.18
469	0.2
470	0.25
471	0.32
472	0.3
473	0.37
474	0.43
475	0.49
476	0.55
477	0.59
478	0.57
479	0.61
480	0.68
481	0.68
482	0.66
483	0.6
484	0.51
485	0.45
486	0.4
487	0.31
488	0.22
489	0.14
490	0.1
491	0.08
492	0.1
493	0.12
494	0.12
495	0.11
496	0.11
497	0.11
498	0.12
499	0.13
500	0.1
501	0.07
502	0.1
503	0.1
504	0.1
505	0.11
506	0.11
507	0.1
508	0.12
509	0.14
510	0.14
511	0.16
512	0.17
513	0.19
514	0.22
515	0.25
516	0.23
517	0.22
518	0.2
519	0.17
520	0.16
521	0.12
522	0.11
523	0.08
524	0.09
525	0.08
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.05
531	0.04
532	0.03
533	0.04
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.11
538	0.12
539	0.13
540	0.16
541	0.18
542	0.18
543	0.2
544	0.21
545	0.2
546	0.19
547	0.18
548	0.16
549	0.14
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.09
554	0.11
555	0.12
556	0.11
557	0.13
558	0.18
559	0.17
560	0.21
561	0.21
562	0.19
563	0.21
564	0.22
565	0.21
566	0.16
567	0.16
568	0.12
569	0.18
570	0.21
571	0.19
572	0.23
573	0.24
574	0.3
575	0.39
576	0.43
577	0.47
578	0.49
579	0.52
580	0.5
581	0.52
582	0.46
583	0.4
584	0.34
585	0.28
586	0.24
587	0.22
588	0.2
589	0.22
590	0.24
591	0.23
592	0.28
593	0.28
594	0.27
595	0.3
596	0.34
597	0.34
598	0.36
599	0.36
600	0.37
601	0.37
602	0.34
603	0.31
604	0.26
605	0.21
606	0.18
607	0.16
608	0.12
609	0.11
610	0.17
611	0.18
612	0.18
613	0.19
614	0.22
615	0.25
616	0.29
617	0.33
618	0.3
619	0.33
620	0.36
621	0.35
622	0.31
623	0.28
624	0.27
625	0.23
626	0.21
627	0.18
628	0.15
629	0.14
630	0.15
631	0.14
632	0.16
633	0.17
634	0.15
635	0.18
636	0.19
637	0.24
638	0.24
639	0.28
640	0.25
641	0.29
642	0.3
643	0.32
644	0.32
645	0.31
646	0.29
647	0.27
648	0.24
649	0.19
650	0.18
651	0.12
652	0.11
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.08
658	0.09
659	0.1
660	0.11
661	0.11
662	0.1
663	0.08
664	0.08
665	0.07
666	0.07
667	0.06
668	0.06
669	0.1
670	0.11
671	0.11
672	0.11
673	0.1
674	0.12
675	0.11
676	0.12
677	0.09
678	0.08
679	0.09
680	0.09
681	0.1
682	0.08
683	0.09
684	0.08
685	0.07
686	0.06
687	0.05
688	0.05
689	0.06
690	0.06
691	0.06
692	0.06
693	0.06
694	0.06
695	0.07
696	0.07
697	0.06
698	0.06
699	0.05
700	0.05
701	0.04
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.05
709	0.05
710	0.05
711	0.04
712	0.04
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.03
717	0.03
718	0.03
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.04
725	0.04
726	0.03
727	0.03
728	0.05
729	0.06
730	0.07
731	0.08
732	0.13
733	0.17
734	0.23
735	0.29
736	0.32
737	0.34
738	0.4
739	0.46
740	0.45
741	0.45
742	0.47
743	0.42
744	0.39
745	0.39
746	0.33
747	0.31
748	0.29
749	0.31
750	0.25
751	0.26
752	0.28
753	0.26
754	0.27
755	0.28
756	0.26
757	0.21
758	0.2
759	0.19
760	0.14
761	0.16
762	0.15
763	0.11
764	0.12
765	0.13
766	0.18
767	0.28
768	0.34
769	0.36
770	0.39
771	0.43
772	0.51
773	0.54
774	0.53
775	0.43
776	0.39
777	0.35
778	0.32
779	0.28
780	0.19
781	0.15
782	0.09
783	0.09
784	0.07
785	0.07
786	0.06
787	0.07
788	0.07
789	0.06
790	0.07
791	0.07
792	0.07
793	0.06
794	0.06
795	0.06
796	0.05
797	0.06
798	0.05
799	0.06
800	0.06
801	0.07
802	0.09
803	0.08
804	0.09
805	0.09
806	0.1
807	0.1
808	0.12
809	0.14
810	0.13
811	0.13
812	0.12
813	0.13
814	0.12
815	0.11
816	0.1
817	0.08
818	0.08
819	0.08
820	0.1
821	0.1
822	0.1
823	0.11
824	0.13
825	0.12
826	0.15
827	0.15
828	0.15
829	0.15
830	0.15
831	0.17
832	0.15
833	0.15
834	0.14
835	0.13
836	0.11
837	0.11
838	0.1
839	0.08
840	0.1
841	0.13
842	0.11
843	0.11
844	0.12
845	0.12
846	0.12
847	0.12
848	0.09
849	0.07
850	0.07
851	0.08
852	0.13
853	0.13
854	0.14
855	0.16
856	0.22
857	0.23
858	0.23
859	0.28
860	0.25
861	0.34
862	0.34
863	0.34
864	0.3
865	0.31
866	0.33
867	0.3
868	0.28
869	0.2
870	0.19
871	0.17
872	0.18
873	0.19
874	0.2
875	0.19
876	0.2
877	0.22
878	0.28
879	0.28
880	0.26
881	0.25
882	0.19
883	0.19
884	0.18
885	0.15
886	0.11
887	0.1
888	0.11
889	0.11
890	0.12
891	0.11
892	0.1
893	0.12
894	0.1
895	0.1
896	0.09
897	0.1
898	0.1
899	0.11
900	0.11
901	0.09
902	0.08
903	0.08
904	0.07
905	0.06
906	0.05
907	0.04
908	0.04
909	0.03
910	0.03
911	0.03
912	0.03
913	0.03
914	0.03
915	0.04
916	0.04
917	0.05
918	0.05
919	0.07
920	0.07
921	0.1
922	0.1
923	0.1
924	0.1
925	0.09
926	0.09
927	0.07
928	0.07
929	0.05
930	0.08
931	0.08
932	0.09
933	0.09
934	0.08
935	0.08
936	0.09
937	0.1
938	0.1
939	0.13
940	0.16
941	0.24
942	0.27
943	0.29
944	0.36
945	0.39
946	0.4
947	0.39
948	0.43
949	0.37
950	0.38
951	0.36
952	0.29
953	0.25
954	0.2
955	0.18
956	0.11
957	0.08
958	0.06
959	0.06
960	0.06
961	0.07
962	0.07
963	0.1
964	0.1
965	0.11
966	0.12
967	0.14
968	0.14
969	0.15
970	0.17
971	0.15
972	0.15
973	0.18
974	0.17
975	0.16
976	0.15
977	0.15
978	0.15
979	0.15
980	0.15
981	0.11
982	0.1
983	0.09
984	0.08
985	0.07
986	0.05
987	0.04
988	0.04
989	0.04
990	0.04
991	0.04
992	0.04
993	0.04
994	0.05
995	0.05
996	0.06
997	0.06
998	0.08
999	0.1
1000	0.1
1001	0.11
1002	0.13
1003	0.14
1004	0.15
1005	0.15
1006	0.13
1007	0.16
1008	0.2
1009	0.2
1010	0.24
1011	0.29
1012	0.31
1013	0.37
1014	0.42
1015	0.41
1016	0.38
1017	0.4
1018	0.35
1019	0.34
1020	0.31
1021	0.24
1022	0.24
1023	0.19
1024	0.19
1025	0.18
1026	0.17
1027	0.13
1028	0.14
1029	0.15
1030	0.13
1031	0.14
1032	0.15
1033	0.23
1034	0.26
1035	0.31
1036	0.37
1037	0.41
1038	0.38
1039	0.42
1040	0.41
1041	0.32
1042	0.29
1043	0.25
1044	0.2
1045	0.21
1046	0.2
1047	0.17
1048	0.18
1049	0.19
1050	0.18
1051	0.17
1052	0.18
1053	0.22
1054	0.23
1055	0.23
1056	0.26
1057	0.31
1058	0.33
1059	0.41
1060	0.48
1061	0.48
1062	0.54
1063	0.54
1064	0.52
1065	0.53
1066	0.53
1067	0.46
1068	0.41
1069	0.36
1070	0.3
1071	0.36
1072	0.33
1073	0.27
1074	0.25
1075	0.23
1076	0.2
1077	0.16
1078	0.16
1079	0.1
1080	0.09
1081	0.08
1082	0.08
1083	0.07
1084	0.07
1085	0.07
1086	0.05
1087	0.04
1088	0.06
1089	0.07
1090	0.11
1091	0.12
1092	0.14
1093	0.15
1094	0.16
1095	0.2
1096	0.19
1097	0.21
1098	0.22
1099	0.23
1100	0.24
1101	0.24
1102	0.25
1103	0.22
1104	0.21
1105	0.2
1106	0.15
1107	0.15
1108	0.16
1109	0.16
1110	0.16
1111	0.18
1112	0.19
1113	0.2
1114	0.22
1115	0.21
1116	0.2
1117	0.19
1118	0.2
1119	0.2
1120	0.21
1121	0.21
1122	0.19
1123	0.23
1124	0.24
1125	0.26
1126	0.27
1127	0.26
1128	0.27
1129	0.27
1130	0.27
1131	0.24
1132	0.26
1133	0.23
1134	0.21
1135	0.19
1136	0.16
1137	0.15
1138	0.16
1139	0.14
1140	0.12
1141	0.13
1142	0.14
1143	0.18
1144	0.18
1145	0.17
1146	0.15
1147	0.14
1148	0.14
1149	0.14
1150	0.11
1151	0.07
1152	0.07
1153	0.07
1154	0.07
1155	0.07
1156	0.09
1157	0.09
1158	0.1
1159	0.11
1160	0.11
1161	0.11
1162	0.11
1163	0.11
1164	0.08
1165	0.08
1166	0.07
1167	0.05
1168	0.07
1169	0.07
1170	0.06
1171	0.06
1172	0.06
1173	0.05
1174	0.06
1175	0.07
1176	0.06
1177	0.06
1178	0.1
1179	0.12
1180	0.13
1181	0.15
1182	0.17
1183	0.22
1184	0.24
1185	0.25
1186	0.23
1187	0.23
1188	0.22
1189	0.22
1190	0.19
1191	0.14
1192	0.11
1193	0.09
1194	0.08
1195	0.07
1196	0.06
1197	0.05
1198	0.04
1199	0.04
1200	0.05
1201	0.05
1202	0.04
1203	0.06
1204	0.11
1205	0.15
1206	0.17
1207	0.17
1208	0.18
1209	0.21
1210	0.23
1211	0.24
1212	0.22
1213	0.27
1214	0.31
1215	0.35
1216	0.39
1217	0.37
1218	0.35
1219	0.35
1220	0.34
1221	0.28
1222	0.24
1223	0.2
1224	0.16
1225	0.18
1226	0.2
1227	0.19
1228	0.16
1229	0.15
1230	0.13
1231	0.12
1232	0.1
1233	0.11
1234	0.1
1235	0.11
1236	0.12
1237	0.12
1238	0.16
1239	0.19
1240	0.22
1241	0.25
1242	0.25
1243	0.3
1244	0.38
1245	0.43
1246	0.46
1247	0.5
1248	0.56
1249	0.59
1250	0.65
1251	0.65
1252	0.59
1253	0.56
1254	0.59
1255	0.54
1256	0.46
1257	0.39
1258	0.33
1259	0.31
1260	0.33
1261	0.34
1262	0.33
1263	0.32
1264	0.35
1265	0.4
1266	0.39
1267	0.36
1268	0.33
1269	0.35
1270	0.3
1271	0.34
1272	0.32
1273	0.32
1274	0.32
1275	0.31
1276	0.36
1277	0.31
1278	0.28
1279	0.23
1280	0.24
1281	0.2
1282	0.25
1283	0.27
1284	0.22
1285	0.25
1286	0.3
1287	0.37
1288	0.37
1289	0.4
1290	0.36
1291	0.33
1292	0.31
1293	0.29
1294	0.27
1295	0.25
1296	0.26
1297	0.23
1298	0.27
1299	0.29
1300	0.3
1301	0.34
1302	0.31
1303	0.3
1304	0.28
1305	0.31
1306	0.35
1307	0.35
1308	0.36
1309	0.39
1310	0.44
1311	0.45
1312	0.43
1313	0.4
1314	0.36
1315	0.42
1316	0.46
1317	0.46
1318	0.43
1319	0.39
1320	0.38
1321	0.39
1322	0.36
1323	0.28

A0A2X0MD97

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer