FuNGI

A1CYN1

Protein Details

Accession

A1CYN1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
5-30	NAPAATSRPPNKPLRKGRTTSARPAM	Hydrophilic
446-466	YIEWEVSRHRRKRQSNFDLVN	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR034397 Prp24_RRM1 IPR035979 RBD_domain_sf IPR000504 RRM_dom IPR031766 RRM_occluded IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
KEGG	nfi:NFIA_034170 -
Pfam	View protein in Pfam PF00076 RRM_1 PF16842 RRM_occluded
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12296 RRM1_Prp24 cd12299 RRM4_Prp24 cd00590 RRM_SF

Amino Acid Sequences

MSANNAPAATSRPPNKPLRKGRTTSARPAMTSSPLAHHVYAPSQLNDPSPPATSSPSAGPNMGGGNGTPPSVDLPPSRQASTPGMDTLADLASMQHHQPQRSNTSILRGTESYESQLSPSTMYPHVNPISHNTPTPRTSFDIAMSEGPREGAARRNYADTSLRPDAQRMATELFAQIQDNPHIYEAHVNFIRLLHEGFVNHVYPPNNPDIHGDPRKYDLLRDMRTAREEMDKLFAMGEDLWAEWIQDESMLAQSVEERIAVMELCQRSIEEEYGSTKLWTIYGEWVLYLYNSANGDTGSNQWSEEDKLVGREVFTWQSVLDVWQRGAEATRWRIHDSHLVWDRFLDLQVQDLSRRPSQERASQVKGFFDARLQTPHATWDQTFQAFSGFVSTYYNANYEEIMADTAGRLATPIKEKYNAREHLEIKLRNAVDAGEFGLEWAAYSEYIEWEVSRHRRKRQSNFDLVNAIYQRAVLRFPTDSNLWEDYVMFLIDQNTHGNARATTISTLERATRHCPCSGTLWSQYLLSSEREGQSFQKIADIKHKATSTGLLDAGGMEEVLKVHTAWCSYLRRRAFLSDSTDEDLDVAEVGIRSAIESVQELGEKKYGRSYQGDPLFRLERIYIRYLSESGSWDSARETFKGLVGRRGNSYEFWLTYYHWELISWSKFVQGEATADAARRTPNPSFATAVLKQAIKRTDLDWPEKIMQVYVAHCEDYEDSDELQQAILETRKAMKAITARREKEAAAALQQQQAVAADLASQAEKRKREDDTGVNGYPSSKKARAEEPAPAPAPAPPAPQPEPVALRRDRENATVVVKNLPHHITEHRVRQFFRHCGTIKGLKMLPGDDGNSETAIIEFETREEALVAQTRDQKLLDDNAIEVHLGSGSTLFVTNFPSTADESYIRNLFREYGEIVDIRFPSLKYNTHRRFCYVQFKSSGDAHNATTLNGTRVGSDLNLVVKISDPTRREDRHGPVYEGREIHISNIDWKANEGDLKEVFQKYGTIETVRIPRKVDGGSKGFGYIVFSTKEEAEAALAMHEQEFRSRPLQVRISTPQGAKRTATTIVNRVQSPAAEANGTKAPSVEPEGTAKERSARTLGLMNVPDTVNDARIRAMVEPYGPLIKIVLRPDHQGAIVEFADVNHAGKASLELEGQEIAPGRKLHVGTVSELLKQSAEKKGGPGQATKSKDKATFLQPTGPIKRPVQPGQRGGRRGGLGVKRVSISSTASQAGSTKAEEGAKSATTMTTTNVTTESGAHPVGGEKTRKSNDDFRAMIQRNRGE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.57
2	0.66
3	0.72
4	0.78
5	0.8
6	0.83
7	0.81
8	0.83
9	0.83
10	0.81
11	0.8
12	0.79
13	0.73
14	0.64
15	0.63
16	0.57
17	0.5
18	0.46
19	0.38
20	0.32
21	0.33
22	0.35
23	0.31
24	0.3
25	0.28
26	0.27
27	0.31
28	0.3
29	0.27
30	0.27
31	0.28
32	0.28
33	0.28
34	0.28
35	0.25
36	0.24
37	0.24
38	0.22
39	0.26
40	0.25
41	0.25
42	0.26
43	0.29
44	0.28
45	0.27
46	0.25
47	0.22
48	0.22
49	0.2
50	0.16
51	0.11
52	0.13
53	0.13
54	0.13
55	0.11
56	0.1
57	0.13
58	0.14
59	0.17
60	0.17
61	0.21
62	0.29
63	0.33
64	0.34
65	0.32
66	0.35
67	0.37
68	0.37
69	0.34
70	0.28
71	0.25
72	0.23
73	0.22
74	0.2
75	0.15
76	0.11
77	0.09
78	0.08
79	0.09
80	0.11
81	0.12
82	0.17
83	0.22
84	0.25
85	0.31
86	0.38
87	0.43
88	0.45
89	0.49
90	0.44
91	0.47
92	0.49
93	0.45
94	0.43
95	0.36
96	0.35
97	0.34
98	0.33
99	0.29
100	0.25
101	0.24
102	0.2
103	0.22
104	0.19
105	0.17
106	0.17
107	0.18
108	0.19
109	0.22
110	0.22
111	0.27
112	0.31
113	0.3
114	0.3
115	0.33
116	0.36
117	0.36
118	0.39
119	0.36
120	0.38
121	0.4
122	0.41
123	0.38
124	0.37
125	0.38
126	0.35
127	0.33
128	0.3
129	0.29
130	0.31
131	0.28
132	0.24
133	0.21
134	0.2
135	0.17
136	0.15
137	0.15
138	0.18
139	0.22
140	0.27
141	0.28
142	0.32
143	0.32
144	0.35
145	0.39
146	0.33
147	0.37
148	0.37
149	0.38
150	0.36
151	0.37
152	0.38
153	0.36
154	0.35
155	0.3
156	0.27
157	0.24
158	0.24
159	0.23
160	0.2
161	0.17
162	0.16
163	0.15
164	0.16
165	0.17
166	0.18
167	0.18
168	0.18
169	0.17
170	0.17
171	0.23
172	0.21
173	0.26
174	0.26
175	0.25
176	0.24
177	0.25
178	0.25
179	0.19
180	0.19
181	0.12
182	0.13
183	0.12
184	0.14
185	0.17
186	0.16
187	0.15
188	0.19
189	0.19
190	0.19
191	0.23
192	0.26
193	0.24
194	0.24
195	0.27
196	0.28
197	0.37
198	0.43
199	0.41
200	0.36
201	0.4
202	0.44
203	0.41
204	0.38
205	0.37
206	0.39
207	0.4
208	0.45
209	0.44
210	0.42
211	0.45
212	0.44
213	0.37
214	0.35
215	0.32
216	0.28
217	0.29
218	0.25
219	0.23
220	0.22
221	0.19
222	0.14
223	0.12
224	0.12
225	0.08
226	0.07
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.07
231	0.07
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.05
236	0.07
237	0.07
238	0.07
239	0.06
240	0.07
241	0.08
242	0.08
243	0.07
244	0.06
245	0.06
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.12
250	0.12
251	0.13
252	0.13
253	0.12
254	0.14
255	0.16
256	0.17
257	0.12
258	0.13
259	0.15
260	0.17
261	0.18
262	0.15
263	0.14
264	0.13
265	0.13
266	0.12
267	0.11
268	0.13
269	0.14
270	0.14
271	0.13
272	0.13
273	0.13
274	0.12
275	0.11
276	0.07
277	0.08
278	0.09
279	0.09
280	0.09
281	0.09
282	0.1
283	0.1
284	0.12
285	0.11
286	0.11
287	0.11
288	0.12
289	0.13
290	0.15
291	0.15
292	0.14
293	0.13
294	0.14
295	0.16
296	0.15
297	0.14
298	0.13
299	0.15
300	0.15
301	0.15
302	0.14
303	0.12
304	0.12
305	0.12
306	0.13
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.14
311	0.14
312	0.14
313	0.15
314	0.16
315	0.19
316	0.22
317	0.27
318	0.29
319	0.31
320	0.32
321	0.33
322	0.38
323	0.33
324	0.37
325	0.4
326	0.39
327	0.36
328	0.35
329	0.34
330	0.27
331	0.25
332	0.18
333	0.1
334	0.12
335	0.14
336	0.15
337	0.15
338	0.17
339	0.22
340	0.22
341	0.25
342	0.25
343	0.3
344	0.34
345	0.4
346	0.45
347	0.48
348	0.52
349	0.53
350	0.51
351	0.46
352	0.43
353	0.37
354	0.28
355	0.24
356	0.21
357	0.18
358	0.2
359	0.22
360	0.2
361	0.19
362	0.22
363	0.22
364	0.21
365	0.19
366	0.19
367	0.2
368	0.2
369	0.19
370	0.16
371	0.15
372	0.13
373	0.12
374	0.12
375	0.09
376	0.08
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.13
382	0.1
383	0.11
384	0.1
385	0.09
386	0.09
387	0.08
388	0.08
389	0.06
390	0.06
391	0.05
392	0.06
393	0.05
394	0.04
395	0.04
396	0.05
397	0.08
398	0.13
399	0.16
400	0.18
401	0.24
402	0.26
403	0.32
404	0.41
405	0.43
406	0.42
407	0.46
408	0.45
409	0.47
410	0.54
411	0.49
412	0.41
413	0.42
414	0.38
415	0.31
416	0.3
417	0.22
418	0.15
419	0.14
420	0.12
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.13
438	0.21
439	0.31
440	0.37
441	0.45
442	0.55
443	0.65
444	0.74
445	0.79
446	0.8
447	0.81
448	0.77
449	0.71
450	0.64
451	0.54
452	0.48
453	0.37
454	0.28
455	0.17
456	0.15
457	0.13
458	0.11
459	0.11
460	0.08
461	0.1
462	0.1
463	0.11
464	0.14
465	0.14
466	0.14
467	0.17
468	0.18
469	0.17
470	0.16
471	0.15
472	0.12
473	0.12
474	0.11
475	0.06
476	0.05
477	0.06
478	0.06
479	0.07
480	0.08
481	0.08
482	0.09
483	0.1
484	0.1
485	0.09
486	0.11
487	0.1
488	0.11
489	0.1
490	0.11
491	0.11
492	0.11
493	0.12
494	0.12
495	0.13
496	0.15
497	0.19
498	0.24
499	0.25
500	0.26
501	0.26
502	0.26
503	0.29
504	0.3
505	0.29
506	0.26
507	0.25
508	0.24
509	0.23
510	0.22
511	0.18
512	0.16
513	0.13
514	0.11
515	0.12
516	0.13
517	0.13
518	0.14
519	0.14
520	0.16
521	0.16
522	0.15
523	0.17
524	0.17
525	0.18
526	0.26
527	0.29
528	0.27
529	0.3
530	0.31
531	0.26
532	0.25
533	0.27
534	0.19
535	0.17
536	0.16
537	0.11
538	0.11
539	0.1
540	0.09
541	0.07
542	0.05
543	0.03
544	0.03
545	0.03
546	0.03
547	0.04
548	0.03
549	0.04
550	0.05
551	0.06
552	0.07
553	0.11
554	0.18
555	0.2
556	0.28
557	0.29
558	0.3
559	0.3
560	0.33
561	0.31
562	0.28
563	0.32
564	0.27
565	0.28
566	0.27
567	0.26
568	0.23
569	0.19
570	0.16
571	0.09
572	0.07
573	0.04
574	0.03
575	0.03
576	0.03
577	0.03
578	0.03
579	0.03
580	0.03
581	0.04
582	0.03
583	0.04
584	0.05
585	0.05
586	0.06
587	0.07
588	0.08
589	0.11
590	0.11
591	0.11
592	0.16
593	0.17
594	0.19
595	0.22
596	0.24
597	0.29
598	0.35
599	0.37
600	0.32
601	0.34
602	0.33
603	0.29
604	0.27
605	0.2
606	0.16
607	0.17
608	0.18
609	0.16
610	0.15
611	0.16
612	0.16
613	0.16
614	0.14
615	0.13
616	0.12
617	0.12
618	0.11
619	0.11
620	0.11
621	0.13
622	0.13
623	0.11
624	0.12
625	0.11
626	0.13
627	0.18
628	0.18
629	0.23
630	0.24
631	0.25
632	0.25
633	0.27
634	0.25
635	0.21
636	0.24
637	0.17
638	0.15
639	0.15
640	0.14
641	0.13
642	0.14
643	0.16
644	0.13
645	0.12
646	0.11
647	0.11
648	0.15
649	0.16
650	0.14
651	0.12
652	0.14
653	0.14
654	0.14
655	0.14
656	0.09
657	0.09
658	0.09
659	0.1
660	0.08
661	0.08
662	0.09
663	0.08
664	0.09
665	0.09
666	0.12
667	0.12
668	0.18
669	0.19
670	0.21
671	0.22
672	0.22
673	0.26
674	0.23
675	0.24
676	0.2
677	0.2
678	0.19
679	0.21
680	0.21
681	0.17
682	0.18
683	0.17
684	0.22
685	0.25
686	0.29
687	0.26
688	0.28
689	0.28
690	0.28
691	0.27
692	0.2
693	0.17
694	0.14
695	0.13
696	0.13
697	0.12
698	0.1
699	0.1
700	0.11
701	0.1
702	0.1
703	0.11
704	0.09
705	0.09
706	0.1
707	0.1
708	0.09
709	0.09
710	0.07
711	0.06
712	0.06
713	0.07
714	0.06
715	0.07
716	0.08
717	0.09
718	0.1
719	0.09
720	0.11
721	0.17
722	0.24
723	0.33
724	0.39
725	0.4
726	0.42
727	0.44
728	0.41
729	0.36
730	0.32
731	0.24
732	0.18
733	0.21
734	0.2
735	0.22
736	0.21
737	0.19
738	0.16
739	0.15
740	0.13
741	0.08
742	0.07
743	0.04
744	0.04
745	0.05
746	0.05
747	0.06
748	0.09
749	0.14
750	0.17
751	0.2
752	0.23
753	0.25
754	0.29
755	0.34
756	0.35
757	0.38
758	0.41
759	0.38
760	0.35
761	0.33
762	0.3
763	0.26
764	0.23
765	0.21
766	0.18
767	0.2
768	0.23
769	0.28
770	0.31
771	0.32
772	0.36
773	0.34
774	0.36
775	0.34
776	0.32
777	0.27
778	0.24
779	0.25
780	0.19
781	0.19
782	0.17
783	0.22
784	0.24
785	0.26
786	0.27
787	0.25
788	0.28
789	0.28
790	0.32
791	0.28
792	0.28
793	0.29
794	0.33
795	0.32
796	0.3
797	0.3
798	0.25
799	0.27
800	0.27
801	0.24
802	0.23
803	0.23
804	0.21
805	0.22
806	0.22
807	0.18
808	0.18
809	0.2
810	0.24
811	0.28
812	0.36
813	0.39
814	0.41
815	0.41
816	0.45
817	0.5
818	0.48
819	0.45
820	0.44
821	0.39
822	0.39
823	0.43
824	0.44
825	0.37
826	0.36
827	0.34
828	0.29
829	0.29
830	0.27
831	0.23
832	0.17
833	0.17
834	0.13
835	0.14
836	0.11
837	0.11
838	0.1
839	0.08
840	0.07
841	0.07
842	0.06
843	0.05
844	0.05
845	0.05
846	0.06
847	0.06
848	0.06
849	0.06
850	0.06
851	0.07
852	0.12
853	0.12
854	0.14
855	0.2
856	0.21
857	0.22
858	0.22
859	0.21
860	0.19
861	0.22
862	0.2
863	0.14
864	0.14
865	0.13
866	0.13
867	0.12
868	0.09
869	0.06
870	0.05
871	0.04
872	0.04
873	0.04
874	0.04
875	0.04
876	0.05
877	0.05
878	0.05
879	0.09
880	0.09
881	0.09
882	0.09
883	0.11
884	0.12
885	0.12
886	0.14
887	0.12
888	0.13
889	0.17
890	0.19
891	0.18
892	0.17
893	0.17
894	0.16
895	0.15
896	0.16
897	0.14
898	0.12
899	0.14
900	0.13
901	0.13
902	0.15
903	0.14
904	0.14
905	0.14
906	0.13
907	0.16
908	0.19
909	0.25
910	0.28
911	0.39
912	0.47
913	0.53
914	0.54
915	0.55
916	0.57
917	0.57
918	0.62
919	0.55
920	0.51
921	0.48
922	0.48
923	0.46
924	0.45
925	0.41
926	0.33
927	0.31
928	0.26
929	0.27
930	0.25
931	0.22
932	0.21
933	0.19
934	0.17
935	0.17
936	0.17
937	0.12
938	0.12
939	0.13
940	0.1
941	0.1
942	0.1
943	0.09
944	0.09
945	0.09
946	0.09
947	0.09
948	0.11
949	0.12
950	0.17
951	0.17
952	0.22
953	0.31
954	0.34
955	0.38
956	0.45
957	0.5
958	0.53
959	0.55
960	0.54
961	0.51
962	0.52
963	0.51
964	0.44
965	0.38
966	0.31
967	0.28
968	0.24
969	0.23
970	0.19
971	0.2
972	0.23
973	0.23
974	0.2
975	0.21
976	0.21
977	0.19
978	0.2
979	0.16
980	0.16
981	0.16
982	0.18
983	0.21
984	0.2
985	0.19
986	0.17
987	0.18
988	0.15
989	0.19
990	0.19
991	0.15
992	0.16
993	0.2
994	0.29
995	0.32
996	0.33
997	0.31
998	0.31
999	0.33
1000	0.35
1001	0.36
1002	0.34
1003	0.34
1004	0.34
1005	0.32
1006	0.31
1007	0.27
1008	0.24
1009	0.22
1010	0.16
1011	0.14
1012	0.15
1013	0.15
1014	0.16
1015	0.16
1016	0.16
1017	0.13
1018	0.12
1019	0.1
1020	0.08
1021	0.08
1022	0.07
1023	0.07
1024	0.07
1025	0.07
1026	0.08
1027	0.08
1028	0.11
1029	0.13
1030	0.16
1031	0.18
1032	0.22
1033	0.26
1034	0.32
1035	0.39
1036	0.37
1037	0.42
1038	0.44
1039	0.49
1040	0.5
1041	0.49
1042	0.48
1043	0.45
1044	0.46
1045	0.4
1046	0.37
1047	0.34
1048	0.32
1049	0.35
1050	0.32
1051	0.34
1052	0.38
1053	0.41
1054	0.39
1055	0.38
1056	0.35
1057	0.3
1058	0.3
1059	0.26
1060	0.21
1061	0.17
1062	0.17
1063	0.19
1064	0.21
1065	0.22
1066	0.17
1067	0.15
1068	0.15
1069	0.16
1070	0.21
1071	0.19
1072	0.16
1073	0.19
1074	0.24
1075	0.26
1076	0.27
1077	0.26
1078	0.27
1079	0.27
1080	0.29
1081	0.28
1082	0.24
1083	0.24
1084	0.27
1085	0.28
1086	0.28
1087	0.28
1088	0.25
1089	0.25
1090	0.24
1091	0.22
1092	0.2
1093	0.19
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.16
1097	0.14
1098	0.16
1099	0.17
1100	0.15
1101	0.16
1102	0.14
1103	0.14
1104	0.15
1105	0.16
1106	0.17
1107	0.16
1108	0.14
1109	0.13
1110	0.15
1111	0.18
1112	0.21
1113	0.26
1114	0.26
1115	0.3
1116	0.33
1117	0.34
1118	0.32
1119	0.3
1120	0.26
1121	0.24
1122	0.22
1123	0.18
1124	0.15
1125	0.13
1126	0.15
1127	0.13
1128	0.14
1129	0.09
1130	0.09
1131	0.09
1132	0.09
1133	0.11
1134	0.09
1135	0.1
1136	0.1
1137	0.09
1138	0.11
1139	0.11
1140	0.11
1141	0.11
1142	0.12
1143	0.12
1144	0.16
1145	0.16
1146	0.17
1147	0.21
1148	0.22
1149	0.22
1150	0.26
1151	0.27
1152	0.25
1153	0.31
1154	0.3
1155	0.28
1156	0.28
1157	0.27
1158	0.21
1159	0.21
1160	0.23
1161	0.25
1162	0.27
1163	0.26
1164	0.3
1165	0.37
1166	0.42
1167	0.43
1168	0.44
1169	0.44
1170	0.49
1171	0.54
1172	0.55
1173	0.53
1174	0.53
1175	0.54
1176	0.53
1177	0.52
1178	0.52
1179	0.55
1180	0.52
1181	0.54
1182	0.53
1183	0.58
1184	0.6
1185	0.59
1186	0.57
1187	0.51
1188	0.56
1189	0.57
1190	0.61
1191	0.63
1192	0.65
1193	0.68
1194	0.73
1195	0.78
1196	0.74
1197	0.69
1198	0.66
1199	0.57
1200	0.51
1201	0.51
1202	0.46
1203	0.44
1204	0.43
1205	0.43
1206	0.38
1207	0.37
1208	0.36
1209	0.29
1210	0.27
1211	0.23
1212	0.25
1213	0.24
1214	0.22
1215	0.23
1216	0.22
1217	0.23
1218	0.2
1219	0.18
1220	0.16
1221	0.17
1222	0.2
1223	0.19
1224	0.21
1225	0.21
1226	0.2
1227	0.19
1228	0.19
1229	0.16
1230	0.15
1231	0.16
1232	0.16
1233	0.16
1234	0.16
1235	0.17
1236	0.17
1237	0.17
1238	0.16
1239	0.18
1240	0.18
1241	0.17
1242	0.16
1243	0.15
1244	0.15
1245	0.16
1246	0.21
1247	0.25
1248	0.28
1249	0.29
1250	0.38
1251	0.44
1252	0.47
1253	0.51
1254	0.56
1255	0.57
1256	0.61
1257	0.59
1258	0.54
1259	0.6
1260	0.61
1261	0.59

A1CYN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer