Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2X0M080

Protein Details
Accession A0A2X0M080    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
384-408METPKSNPLLKKKKKRELGQAAIAKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
320-323RRRR
393-399LKKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 13, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007900  TAF4_C  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
Pfam View protein in Pfam  
PF05236  TAF4  
Amino Acid Sequences MPPASSPPPPSSLSQATVSTPTASTSVSTPKPAGGGVGGGGAGAGGGGGLQLPGGGIGNKGKAKANPSAETSRTFQGIIIRNTTRATSKEPHEPNTNTSMTTGGGNSKSEHEGSTNVQDLMDAVGASGVDINAEEDSLRQHRPVGSHSNPTSTSHPNPSTTHTTTTTSAPSAPAAPSTSTLTELDQRIHSQSFIEPQVLADVVRKIAAEYSLKSLEGQTIPLIALACRTRLMDLISNSISVRDHRLGAHHLREPPFGHALKRRRIDRTLGEGEEEEQHGGVGEDEVLEGEKEPVWDAVVYDEPEKALWVLEKVDREEERRRRRERVLRDEKEQEEKELREAVEASERAREEQERGPEGLSTPGLDRTDQTTTTTNTLGSTTAGMETPKSNPLLKKKKKRELGQAAIAKNLSGDVQKRLTDQIAMRSLGGRSFSWLSGAGAAGGGSTMSTPNRPHTQSAIGTPTLGTTPTAGSSSLNPFPSSLNRLTTIPSLHDANRQKLDAEESWRQGAHVVELKDLLFALDNQRGMGAGKGAGKVASLKARAGVVRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.35
3 0.33
4 0.33
5 0.32
6 0.26
7 0.22
8 0.2
9 0.18
10 0.16
11 0.15
12 0.15
13 0.22
14 0.22
15 0.26
16 0.25
17 0.25
18 0.26
19 0.24
20 0.22
21 0.15
22 0.13
23 0.1
24 0.1
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.05
29 0.04
30 0.03
31 0.02
32 0.01
33 0.02
34 0.02
35 0.02
36 0.02
37 0.02
38 0.02
39 0.02
40 0.03
41 0.04
42 0.05
43 0.06
44 0.09
45 0.15
46 0.17
47 0.19
48 0.23
49 0.26
50 0.3
51 0.37
52 0.41
53 0.4
54 0.44
55 0.49
56 0.47
57 0.47
58 0.46
59 0.4
60 0.35
61 0.31
62 0.26
63 0.28
64 0.33
65 0.32
66 0.35
67 0.34
68 0.35
69 0.35
70 0.36
71 0.31
72 0.26
73 0.3
74 0.3
75 0.34
76 0.42
77 0.46
78 0.5
79 0.55
80 0.55
81 0.52
82 0.52
83 0.48
84 0.39
85 0.34
86 0.3
87 0.21
88 0.2
89 0.17
90 0.14
91 0.15
92 0.16
93 0.17
94 0.18
95 0.2
96 0.2
97 0.2
98 0.17
99 0.18
100 0.2
101 0.23
102 0.23
103 0.2
104 0.19
105 0.18
106 0.17
107 0.15
108 0.13
109 0.08
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.04
116 0.03
117 0.04
118 0.04
119 0.04
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.08
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.15
128 0.18
129 0.2
130 0.25
131 0.31
132 0.32
133 0.39
134 0.4
135 0.42
136 0.41
137 0.42
138 0.41
139 0.38
140 0.38
141 0.37
142 0.38
143 0.38
144 0.38
145 0.4
146 0.43
147 0.4
148 0.39
149 0.34
150 0.35
151 0.33
152 0.33
153 0.3
154 0.23
155 0.21
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.13
160 0.12
161 0.12
162 0.11
163 0.12
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.14
168 0.14
169 0.17
170 0.18
171 0.18
172 0.17
173 0.18
174 0.19
175 0.19
176 0.17
177 0.14
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.13
183 0.12
184 0.13
185 0.12
186 0.11
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.07
193 0.08
194 0.1
195 0.1
196 0.1
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.14
202 0.15
203 0.13
204 0.13
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.09
210 0.06
211 0.09
212 0.08
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.12
219 0.13
220 0.14
221 0.17
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.16
226 0.14
227 0.11
228 0.14
229 0.12
230 0.13
231 0.12
232 0.15
233 0.19
234 0.23
235 0.26
236 0.26
237 0.29
238 0.29
239 0.31
240 0.3
241 0.28
242 0.28
243 0.25
244 0.25
245 0.28
246 0.34
247 0.4
248 0.45
249 0.46
250 0.46
251 0.48
252 0.5
253 0.46
254 0.47
255 0.43
256 0.37
257 0.34
258 0.29
259 0.27
260 0.24
261 0.2
262 0.11
263 0.07
264 0.06
265 0.06
266 0.06
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.07
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.07
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.07
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.16
301 0.17
302 0.21
303 0.3
304 0.39
305 0.47
306 0.55
307 0.59
308 0.62
309 0.7
310 0.75
311 0.76
312 0.77
313 0.78
314 0.72
315 0.73
316 0.74
317 0.67
318 0.65
319 0.56
320 0.48
321 0.41
322 0.37
323 0.33
324 0.3
325 0.27
326 0.19
327 0.19
328 0.16
329 0.17
330 0.17
331 0.16
332 0.16
333 0.16
334 0.17
335 0.18
336 0.18
337 0.17
338 0.21
339 0.26
340 0.24
341 0.25
342 0.24
343 0.23
344 0.22
345 0.2
346 0.16
347 0.11
348 0.1
349 0.12
350 0.12
351 0.12
352 0.13
353 0.14
354 0.17
355 0.16
356 0.18
357 0.18
358 0.19
359 0.21
360 0.21
361 0.17
362 0.15
363 0.15
364 0.13
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.1
373 0.11
374 0.13
375 0.15
376 0.18
377 0.23
378 0.34
379 0.44
380 0.53
381 0.63
382 0.71
383 0.79
384 0.84
385 0.87
386 0.87
387 0.87
388 0.84
389 0.82
390 0.78
391 0.69
392 0.62
393 0.54
394 0.42
395 0.31
396 0.23
397 0.15
398 0.12
399 0.13
400 0.15
401 0.18
402 0.2
403 0.21
404 0.23
405 0.23
406 0.24
407 0.24
408 0.27
409 0.28
410 0.28
411 0.26
412 0.26
413 0.25
414 0.22
415 0.23
416 0.15
417 0.15
418 0.17
419 0.17
420 0.16
421 0.16
422 0.15
423 0.14
424 0.14
425 0.1
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.04
431 0.03
432 0.03
433 0.05
434 0.06
435 0.1
436 0.12
437 0.18
438 0.26
439 0.28
440 0.31
441 0.33
442 0.38
443 0.38
444 0.4
445 0.39
446 0.32
447 0.3
448 0.27
449 0.24
450 0.18
451 0.16
452 0.12
453 0.08
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.11
459 0.14
460 0.19
461 0.23
462 0.23
463 0.22
464 0.22
465 0.25
466 0.29
467 0.32
468 0.29
469 0.28
470 0.28
471 0.29
472 0.31
473 0.32
474 0.28
475 0.25
476 0.25
477 0.25
478 0.25
479 0.34
480 0.37
481 0.41
482 0.44
483 0.42
484 0.4
485 0.38
486 0.42
487 0.38
488 0.39
489 0.38
490 0.37
491 0.39
492 0.38
493 0.36
494 0.33
495 0.29
496 0.27
497 0.26
498 0.24
499 0.22
500 0.24
501 0.24
502 0.22
503 0.2
504 0.15
505 0.1
506 0.11
507 0.15
508 0.18
509 0.18
510 0.18
511 0.18
512 0.18
513 0.18
514 0.18
515 0.14
516 0.12
517 0.15
518 0.16
519 0.17
520 0.16
521 0.16
522 0.18
523 0.21
524 0.25
525 0.24
526 0.24
527 0.25
528 0.29
529 0.32