FuNGI

A0A2X0NEW1

Protein Details

Accession

A0A2X0NEW1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
83-108	QHPPPGPCRSCKKKDHWSLDCKKALE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

extr 18, cyto 5, mito 3, cyto_nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MPSCLTAAPIATSSSASRTGGVELCSISLLGQYALTEVEVPRLLVQCTQSALLASSSSRSTRLKCLACRSPSHRVAECPTRAQHPPPGPCRSCKKKDHWSLDCKKALEDGKKPDTADSTVDSQHHVGCLATGLLARRRQLRNHSFVVDSGATSHMVSDKSLFTTYRHIAPTKIGGIAGGINAIGTGNIAFIAASGHPITLTGVLHTPGLFVNLLSVSRLCDTDDVRVAFTKHGIHIDKDGNDIAEGARLDEGLYLLDADHSKCQHLALLSRSQSSVPLLTLHRCLGHLAPSSIQKMVAAGLLEGLRAGYSDEEVEKFVCNACLSAKGHRLPFPDSDSHSSERLGLVHSDVLSFPERSLTGKRYLVTFLDDYSRKLWAYAIGHKSEVFGIFKTWLAEVELETGATLKVLRTDNGGEYCSRAFTEFCKTRGTRRQYSIPRTPQQNGRAERVNRSIVEGVLALLVDAHLPKTFWEEAAAYFVYCKNLCQHAALDKATPNSVWQGDHTTASALHPFGCTAWLTVAPELRSKLDPKAVRVFFTGYDLASKAFRFYDTTTQKIILGRNATFLDTEFPGLHGDPTEQDGDTHFASAPTTESQTVVKTWTPLPQVRLDLQDVHHPDFSTYREPASAEESPDELDLIGRHSRDESPDEIDFLTRHHRAFIAIDDDTSDTEAIQPVKSITSDPQTWREAMSSDKREVWAKAATDEFTSMRDDFKVFTIEDRATVPAGATIVTSKFVWKTKRNALGEVTGHKARLVAQGNRQRDGIDFNETFAPVARFSSIRSLLALAAANGLHVHQADIDKAYLHGDLDHDIWMTAPRGFDLPSDKVLRLRRSIYGLKQAGRIWNRHIDASLRALGYTATGTDHCVYSWLDDRQCPHYIALYVDDLLMISPELAEIERVISGLDQRYGIRRFDDGSIALSQERYIMDVLARFHFDTTTRGTTVPMTPGLSLTAIPGQGTERIRSWYLQAIGSLLYISLGTRPDIAFAVSYLARFANNPGRRHWIAARITGVVGYSDANWGACIDTSVSTMGYVFYIAGSAVSWSSKRQSRVADSTTDAEYLALSHAGKEGIYLSQLLEELHVQPVAPAHIFTDNEAAAAVAHDPVRVSGTRHIRLREHFVRDMVNRGDISLSHVGTSDMVADIFTKALAQRSLSTHCYALGLRTRHPRLGLPRIRVGGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.18
3	0.17
4	0.17
5	0.17
6	0.2
7	0.21
8	0.21
9	0.2
10	0.18
11	0.17
12	0.16
13	0.15
14	0.12
15	0.1
16	0.09
17	0.08
18	0.08
19	0.07
20	0.08
21	0.08
22	0.08
23	0.09
24	0.08
25	0.12
26	0.12
27	0.13
28	0.15
29	0.17
30	0.18
31	0.19
32	0.21
33	0.2
34	0.21
35	0.21
36	0.19
37	0.17
38	0.17
39	0.15
40	0.14
41	0.12
42	0.13
43	0.14
44	0.15
45	0.19
46	0.23
47	0.26
48	0.33
49	0.42
50	0.47
51	0.52
52	0.6
53	0.65
54	0.66
55	0.72
56	0.7
57	0.72
58	0.71
59	0.71
60	0.65
61	0.61
62	0.63
63	0.64
64	0.61
65	0.57
66	0.53
67	0.52
68	0.52
69	0.52
70	0.53
71	0.52
72	0.57
73	0.59
74	0.66
75	0.64
76	0.68
77	0.74
78	0.75
79	0.76
80	0.76
81	0.78
82	0.79
83	0.85
84	0.88
85	0.87
86	0.88
87	0.88
88	0.88
89	0.84
90	0.74
91	0.64
92	0.61
93	0.59
94	0.56
95	0.55
96	0.54
97	0.54
98	0.57
99	0.56
100	0.52
101	0.48
102	0.41
103	0.36
104	0.3
105	0.27
106	0.27
107	0.28
108	0.27
109	0.25
110	0.23
111	0.21
112	0.18
113	0.14
114	0.11
115	0.11
116	0.09
117	0.08
118	0.09
119	0.12
120	0.18
121	0.22
122	0.25
123	0.33
124	0.38
125	0.44
126	0.53
127	0.59
128	0.6
129	0.62
130	0.62
131	0.54
132	0.5
133	0.48
134	0.38
135	0.28
136	0.23
137	0.19
138	0.16
139	0.15
140	0.15
141	0.12
142	0.12
143	0.12
144	0.13
145	0.13
146	0.15
147	0.17
148	0.17
149	0.17
150	0.24
151	0.26
152	0.29
153	0.32
154	0.31
155	0.3
156	0.33
157	0.36
158	0.3
159	0.28
160	0.22
161	0.18
162	0.18
163	0.17
164	0.14
165	0.08
166	0.06
167	0.05
168	0.05
169	0.05
170	0.04
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.03
175	0.03
176	0.03
177	0.03
178	0.05
179	0.05
180	0.07
181	0.07
182	0.07
183	0.07
184	0.08
185	0.09
186	0.09
187	0.09
188	0.08
189	0.1
190	0.1
191	0.11
192	0.11
193	0.11
194	0.09
195	0.1
196	0.09
197	0.07
198	0.08
199	0.09
200	0.09
201	0.09
202	0.1
203	0.1
204	0.11
205	0.11
206	0.11
207	0.13
208	0.14
209	0.18
210	0.23
211	0.22
212	0.23
213	0.24
214	0.25
215	0.23
216	0.24
217	0.21
218	0.18
219	0.24
220	0.25
221	0.24
222	0.28
223	0.33
224	0.31
225	0.31
226	0.3
227	0.23
228	0.21
229	0.2
230	0.14
231	0.12
232	0.11
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.08
238	0.08
239	0.05
240	0.05
241	0.05
242	0.05
243	0.07
244	0.08
245	0.09
246	0.12
247	0.13
248	0.14
249	0.14
250	0.15
251	0.15
252	0.16
253	0.19
254	0.2
255	0.27
256	0.27
257	0.28
258	0.29
259	0.26
260	0.26
261	0.23
262	0.2
263	0.13
264	0.15
265	0.16
266	0.17
267	0.2
268	0.2
269	0.19
270	0.18
271	0.19
272	0.17
273	0.2
274	0.2
275	0.19
276	0.21
277	0.23
278	0.25
279	0.24
280	0.22
281	0.16
282	0.14
283	0.13
284	0.12
285	0.08
286	0.07
287	0.08
288	0.08
289	0.07
290	0.07
291	0.06
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.04
296	0.05
297	0.06
298	0.07
299	0.08
300	0.09
301	0.09
302	0.09
303	0.1
304	0.1
305	0.1
306	0.09
307	0.09
308	0.09
309	0.15
310	0.16
311	0.21
312	0.27
313	0.29
314	0.32
315	0.36
316	0.38
317	0.35
318	0.37
319	0.36
320	0.34
321	0.34
322	0.36
323	0.36
324	0.36
325	0.33
326	0.3
327	0.26
328	0.23
329	0.2
330	0.16
331	0.12
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.11
338	0.12
339	0.12
340	0.11
341	0.11
342	0.12
343	0.14
344	0.18
345	0.19
346	0.22
347	0.24
348	0.25
349	0.25
350	0.26
351	0.25
352	0.24
353	0.21
354	0.17
355	0.2
356	0.21
357	0.21
358	0.2
359	0.21
360	0.17
361	0.17
362	0.16
363	0.15
364	0.18
365	0.25
366	0.28
367	0.28
368	0.29
369	0.28
370	0.28
371	0.24
372	0.22
373	0.15
374	0.11
375	0.11
376	0.11
377	0.12
378	0.12
379	0.11
380	0.1
381	0.09
382	0.1
383	0.09
384	0.1
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.04
393	0.08
394	0.1
395	0.1
396	0.12
397	0.14
398	0.17
399	0.18
400	0.19
401	0.14
402	0.15
403	0.15
404	0.14
405	0.12
406	0.1
407	0.09
408	0.11
409	0.2
410	0.22
411	0.24
412	0.3
413	0.31
414	0.39
415	0.48
416	0.54
417	0.52
418	0.53
419	0.62
420	0.63
421	0.71
422	0.72
423	0.71
424	0.69
425	0.67
426	0.66
427	0.63
428	0.62
429	0.62
430	0.56
431	0.51
432	0.53
433	0.5
434	0.51
435	0.47
436	0.43
437	0.34
438	0.34
439	0.31
440	0.22
441	0.21
442	0.16
443	0.12
444	0.08
445	0.08
446	0.05
447	0.04
448	0.04
449	0.03
450	0.03
451	0.04
452	0.04
453	0.04
454	0.05
455	0.09
456	0.09
457	0.09
458	0.11
459	0.11
460	0.11
461	0.14
462	0.14
463	0.09
464	0.1
465	0.1
466	0.11
467	0.11
468	0.11
469	0.11
470	0.14
471	0.15
472	0.16
473	0.17
474	0.19
475	0.22
476	0.22
477	0.21
478	0.2
479	0.2
480	0.19
481	0.17
482	0.13
483	0.12
484	0.12
485	0.11
486	0.1
487	0.13
488	0.14
489	0.14
490	0.14
491	0.12
492	0.11
493	0.11
494	0.12
495	0.08
496	0.08
497	0.07
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.08
506	0.08
507	0.1
508	0.1
509	0.12
510	0.12
511	0.13
512	0.15
513	0.16
514	0.17
515	0.22
516	0.23
517	0.25
518	0.33
519	0.32
520	0.32
521	0.31
522	0.3
523	0.23
524	0.24
525	0.21
526	0.12
527	0.12
528	0.11
529	0.1
530	0.1
531	0.1
532	0.08
533	0.08
534	0.08
535	0.09
536	0.11
537	0.2
538	0.22
539	0.25
540	0.25
541	0.25
542	0.26
543	0.27
544	0.26
545	0.19
546	0.19
547	0.17
548	0.18
549	0.18
550	0.17
551	0.14
552	0.14
553	0.12
554	0.09
555	0.1
556	0.08
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.08
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.08
565	0.08
566	0.07
567	0.07
568	0.08
569	0.1
570	0.09
571	0.09
572	0.08
573	0.07
574	0.07
575	0.07
576	0.08
577	0.06
578	0.08
579	0.07
580	0.08
581	0.08
582	0.09
583	0.09
584	0.1
585	0.1
586	0.1
587	0.11
588	0.14
589	0.18
590	0.19
591	0.21
592	0.22
593	0.24
594	0.23
595	0.25
596	0.21
597	0.19
598	0.18
599	0.21
600	0.21
601	0.21
602	0.2
603	0.18
604	0.18
605	0.17
606	0.19
607	0.17
608	0.15
609	0.13
610	0.13
611	0.13
612	0.14
613	0.18
614	0.16
615	0.14
616	0.14
617	0.14
618	0.13
619	0.13
620	0.12
621	0.07
622	0.06
623	0.05
624	0.07
625	0.08
626	0.08
627	0.08
628	0.1
629	0.11
630	0.13
631	0.15
632	0.14
633	0.17
634	0.17
635	0.17
636	0.16
637	0.16
638	0.13
639	0.12
640	0.16
641	0.14
642	0.14
643	0.14
644	0.14
645	0.14
646	0.15
647	0.16
648	0.14
649	0.12
650	0.12
651	0.12
652	0.12
653	0.11
654	0.11
655	0.09
656	0.05
657	0.05
658	0.08
659	0.08
660	0.07
661	0.07
662	0.07
663	0.08
664	0.08
665	0.09
666	0.09
667	0.12
668	0.16
669	0.18
670	0.22
671	0.23
672	0.23
673	0.23
674	0.21
675	0.18
676	0.19
677	0.25
678	0.24
679	0.25
680	0.25
681	0.26
682	0.28
683	0.28
684	0.26
685	0.21
686	0.18
687	0.18
688	0.18
689	0.17
690	0.16
691	0.16
692	0.14
693	0.11
694	0.13
695	0.11
696	0.11
697	0.11
698	0.11
699	0.11
700	0.11
701	0.13
702	0.1
703	0.11
704	0.14
705	0.13
706	0.14
707	0.14
708	0.13
709	0.11
710	0.11
711	0.1
712	0.07
713	0.07
714	0.06
715	0.05
716	0.05
717	0.05
718	0.07
719	0.07
720	0.07
721	0.1
722	0.15
723	0.22
724	0.27
725	0.34
726	0.41
727	0.5
728	0.51
729	0.51
730	0.48
731	0.46
732	0.43
733	0.39
734	0.34
735	0.26
736	0.24
737	0.22
738	0.2
739	0.16
740	0.21
741	0.24
742	0.23
743	0.31
744	0.39
745	0.42
746	0.43
747	0.42
748	0.35
749	0.3
750	0.31
751	0.24
752	0.22
753	0.2
754	0.2
755	0.21
756	0.2
757	0.19
758	0.17
759	0.16
760	0.09
761	0.1
762	0.09
763	0.09
764	0.1
765	0.16
766	0.16
767	0.15
768	0.16
769	0.16
770	0.15
771	0.16
772	0.15
773	0.08
774	0.08
775	0.07
776	0.07
777	0.06
778	0.06
779	0.05
780	0.05
781	0.05
782	0.06
783	0.06
784	0.07
785	0.08
786	0.08
787	0.08
788	0.08
789	0.09
790	0.08
791	0.07
792	0.07
793	0.07
794	0.08
795	0.09
796	0.09
797	0.08
798	0.08
799	0.08
800	0.09
801	0.09
802	0.09
803	0.08
804	0.09
805	0.09
806	0.1
807	0.11
808	0.15
809	0.16
810	0.19
811	0.22
812	0.22
813	0.27
814	0.34
815	0.36
816	0.35
817	0.36
818	0.34
819	0.37
820	0.42
821	0.41
822	0.44
823	0.44
824	0.42
825	0.43
826	0.42
827	0.44
828	0.42
829	0.41
830	0.36
831	0.39
832	0.38
833	0.35
834	0.34
835	0.29
836	0.27
837	0.28
838	0.26
839	0.19
840	0.17
841	0.16
842	0.15
843	0.14
844	0.11
845	0.08
846	0.06
847	0.06
848	0.09
849	0.1
850	0.1
851	0.09
852	0.11
853	0.11
854	0.12
855	0.18
856	0.2
857	0.21
858	0.23
859	0.26
860	0.29
861	0.31
862	0.3
863	0.25
864	0.23
865	0.22
866	0.22
867	0.21
868	0.17
869	0.14
870	0.13
871	0.12
872	0.09
873	0.08
874	0.07
875	0.05
876	0.03
877	0.03
878	0.03
879	0.04
880	0.04
881	0.04
882	0.04
883	0.05
884	0.05
885	0.05
886	0.05
887	0.05
888	0.08
889	0.1
890	0.11
891	0.11
892	0.12
893	0.19
894	0.22
895	0.23
896	0.21
897	0.21
898	0.22
899	0.23
900	0.25
901	0.19
902	0.19
903	0.18
904	0.17
905	0.16
906	0.14
907	0.12
908	0.12
909	0.11
910	0.1
911	0.09
912	0.08
913	0.09
914	0.12
915	0.14
916	0.14
917	0.16
918	0.15
919	0.15
920	0.15
921	0.15
922	0.16
923	0.19
924	0.21
925	0.21
926	0.21
927	0.21
928	0.23
929	0.24
930	0.24
931	0.2
932	0.18
933	0.17
934	0.17
935	0.17
936	0.14
937	0.12
938	0.11
939	0.11
940	0.1
941	0.09
942	0.1
943	0.1
944	0.15
945	0.17
946	0.18
947	0.18
948	0.21
949	0.23
950	0.23
951	0.24
952	0.25
953	0.25
954	0.24
955	0.22
956	0.19
957	0.18
958	0.17
959	0.15
960	0.08
961	0.06
962	0.05
963	0.05
964	0.06
965	0.07
966	0.08
967	0.1
968	0.1
969	0.11
970	0.11
971	0.12
972	0.1
973	0.09
974	0.12
975	0.11
976	0.11
977	0.11
978	0.11
979	0.11
980	0.11
981	0.16
982	0.23
983	0.29
984	0.31
985	0.34
986	0.42
987	0.43
988	0.48
989	0.46
990	0.45
991	0.42
992	0.45
993	0.43
994	0.36
995	0.34
996	0.3
997	0.26
998	0.17
999	0.14
1000	0.1
1001	0.08
1002	0.08
1003	0.08
1004	0.08
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.08
1008	0.07
1009	0.08
1010	0.08
1011	0.08
1012	0.09
1013	0.1
1014	0.09
1015	0.09
1016	0.09
1017	0.09
1018	0.07
1019	0.07
1020	0.06
1021	0.05
1022	0.05
1023	0.05
1024	0.05
1025	0.05
1026	0.05
1027	0.06
1028	0.08
1029	0.08
1030	0.11
1031	0.18
1032	0.24
1033	0.28
1034	0.33
1035	0.39
1036	0.46
1037	0.53
1038	0.54
1039	0.5
1040	0.48
1041	0.47
1042	0.43
1043	0.36
1044	0.28
1045	0.2
1046	0.16
1047	0.13
1048	0.11
1049	0.1
1050	0.08
1051	0.08
1052	0.1
1053	0.1
1054	0.1
1055	0.1
1056	0.1
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.1
1060	0.09
1061	0.09
1062	0.1
1063	0.1
1064	0.1
1065	0.11
1066	0.11
1067	0.12
1068	0.12
1069	0.11
1070	0.11
1071	0.13
1072	0.14
1073	0.13
1074	0.12
1075	0.12
1076	0.16
1077	0.17
1078	0.18
1079	0.2
1080	0.18
1081	0.17
1082	0.17
1083	0.15
1084	0.1
1085	0.11
1086	0.1
1087	0.07
1088	0.08
1089	0.08
1090	0.09
1091	0.09
1092	0.13
1093	0.13
1094	0.16
1095	0.22
1096	0.32
1097	0.39
1098	0.44
1099	0.49
1100	0.52
1101	0.57
1102	0.63
1103	0.63
1104	0.61
1105	0.58
1106	0.55
1107	0.56
1108	0.52
1109	0.54
1110	0.46
1111	0.42
1112	0.35
1113	0.31
1114	0.3
1115	0.23
1116	0.27
1117	0.25
1118	0.23
1119	0.19
1120	0.19
1121	0.19
1122	0.18
1123	0.18
1124	0.13
1125	0.08
1126	0.08
1127	0.07
1128	0.08
1129	0.08
1130	0.08
1131	0.07
1132	0.08
1133	0.09
1134	0.14
1135	0.15
1136	0.17
1137	0.2
1138	0.25
1139	0.31
1140	0.33
1141	0.34
1142	0.3
1143	0.29
1144	0.29
1145	0.26
1146	0.28
1147	0.31
1148	0.3
1149	0.35
1150	0.45
1151	0.49
1152	0.51
1153	0.53
1154	0.54
1155	0.55
1156	0.63
1157	0.64
1158	0.61
1159	0.63

A0A2X0NEW1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer