Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2X0MSH6

Protein Details
Accession A0A2X0MSH6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-75DAPHRQQQHQHQQQQQHPHPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011129  CSD  
IPR002059  CSP_DNA-bd  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00313  CSD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51857  CSD_2  
CDD cd04458  CSP_CDS  
Amino Acid Sequences MAMSTYPALAHHHHHHYHSAQQQMHDAQSRGTAAASAHSNSSAALDLDLSNLSLQDAPHRQQQHQHQQQQQHPHPALHNLHQQHFKSRSAFEEPSHQAPQSQRSARSHPNDFVHPLHAGRSSQPTLFQPQPFGASNAPPDHPLHATTKLDTPRRRGVVKFFNSLKGFGFIVDNDPAALGGQEVFCHFSAISGKGGFRSLAEGEEVEYELVQGPKGFQATNLTGPQGESCGRTVVGDPKARITKPSPYMPFAMPQFLSTDPYAPQGCVFAAAGSPYNLVYVPASVAVSPGQFNGYGHALAPGREGRHGASPFGSNYSFTPPGPLNGAPGASSHTNGVDSSRGGTGSDSDHYSSSLSAPTSYPSSRGGIGAPPAAPFGAADYGKDNALFDKDSTRNQGSNTANGSSFGFAPFSPASSSQLPLFDDGARSARAFDSHLIPSQAPGSSSNRPSSRGSLISASSVSGNVVSSLLPAPSNVFDALRPAPIGSRSRSPGTNHGTPLGNGSLSGNEWKSSPVLYTSASSSGEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.49
3 0.48
4 0.54
5 0.53
6 0.54
7 0.48
8 0.46
9 0.5
10 0.46
11 0.48
12 0.45
13 0.4
14 0.32
15 0.32
16 0.31
17 0.25
18 0.22
19 0.18
20 0.13
21 0.16
22 0.18
23 0.16
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.14
28 0.15
29 0.13
30 0.1
31 0.09
32 0.09
33 0.09
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.09
41 0.09
42 0.16
43 0.21
44 0.24
45 0.31
46 0.36
47 0.37
48 0.44
49 0.54
50 0.58
51 0.63
52 0.69
53 0.69
54 0.74
55 0.79
56 0.82
57 0.78
58 0.77
59 0.69
60 0.63
61 0.58
62 0.58
63 0.55
64 0.51
65 0.52
66 0.46
67 0.5
68 0.54
69 0.53
70 0.54
71 0.53
72 0.51
73 0.47
74 0.44
75 0.43
76 0.43
77 0.44
78 0.36
79 0.42
80 0.41
81 0.43
82 0.44
83 0.39
84 0.35
85 0.36
86 0.42
87 0.41
88 0.43
89 0.43
90 0.46
91 0.53
92 0.58
93 0.61
94 0.6
95 0.57
96 0.56
97 0.53
98 0.52
99 0.47
100 0.41
101 0.35
102 0.3
103 0.26
104 0.25
105 0.22
106 0.2
107 0.25
108 0.25
109 0.23
110 0.26
111 0.26
112 0.3
113 0.34
114 0.33
115 0.28
116 0.27
117 0.3
118 0.29
119 0.28
120 0.24
121 0.2
122 0.23
123 0.24
124 0.24
125 0.22
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.22
130 0.21
131 0.23
132 0.24
133 0.23
134 0.29
135 0.33
136 0.4
137 0.42
138 0.45
139 0.48
140 0.52
141 0.54
142 0.5
143 0.52
144 0.54
145 0.54
146 0.55
147 0.49
148 0.51
149 0.49
150 0.47
151 0.39
152 0.31
153 0.26
154 0.19
155 0.18
156 0.11
157 0.13
158 0.13
159 0.12
160 0.09
161 0.09
162 0.08
163 0.07
164 0.07
165 0.04
166 0.04
167 0.04
168 0.04
169 0.05
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.12
179 0.12
180 0.12
181 0.13
182 0.12
183 0.1
184 0.11
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.05
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.11
205 0.13
206 0.17
207 0.17
208 0.16
209 0.15
210 0.15
211 0.15
212 0.12
213 0.11
214 0.09
215 0.09
216 0.09
217 0.09
218 0.09
219 0.11
220 0.15
221 0.2
222 0.22
223 0.21
224 0.25
225 0.29
226 0.29
227 0.31
228 0.27
229 0.29
230 0.31
231 0.38
232 0.36
233 0.35
234 0.37
235 0.35
236 0.35
237 0.28
238 0.25
239 0.18
240 0.16
241 0.15
242 0.13
243 0.15
244 0.12
245 0.12
246 0.1
247 0.13
248 0.13
249 0.11
250 0.11
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.08
281 0.07
282 0.07
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.13
291 0.11
292 0.17
293 0.18
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.19
299 0.18
300 0.12
301 0.13
302 0.17
303 0.17
304 0.15
305 0.18
306 0.16
307 0.16
308 0.19
309 0.18
310 0.14
311 0.13
312 0.14
313 0.11
314 0.11
315 0.13
316 0.1
317 0.11
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.08
324 0.08
325 0.09
326 0.09
327 0.09
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.1
332 0.11
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.1
340 0.1
341 0.09
342 0.09
343 0.09
344 0.11
345 0.14
346 0.14
347 0.15
348 0.15
349 0.16
350 0.16
351 0.16
352 0.16
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.14
357 0.13
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.08
362 0.08
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.11
367 0.12
368 0.13
369 0.13
370 0.12
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.1
375 0.17
376 0.19
377 0.22
378 0.28
379 0.31
380 0.3
381 0.31
382 0.39
383 0.33
384 0.35
385 0.35
386 0.31
387 0.27
388 0.27
389 0.26
390 0.19
391 0.17
392 0.13
393 0.11
394 0.09
395 0.14
396 0.13
397 0.13
398 0.14
399 0.15
400 0.18
401 0.19
402 0.21
403 0.17
404 0.2
405 0.19
406 0.19
407 0.19
408 0.16
409 0.16
410 0.16
411 0.17
412 0.16
413 0.15
414 0.15
415 0.14
416 0.14
417 0.15
418 0.16
419 0.18
420 0.19
421 0.22
422 0.23
423 0.22
424 0.22
425 0.22
426 0.21
427 0.17
428 0.18
429 0.21
430 0.26
431 0.3
432 0.37
433 0.37
434 0.4
435 0.42
436 0.43
437 0.43
438 0.38
439 0.37
440 0.33
441 0.31
442 0.3
443 0.27
444 0.23
445 0.17
446 0.15
447 0.13
448 0.1
449 0.09
450 0.07
451 0.08
452 0.07
453 0.08
454 0.09
455 0.09
456 0.09
457 0.09
458 0.11
459 0.11
460 0.14
461 0.13
462 0.13
463 0.12
464 0.17
465 0.18
466 0.18
467 0.17
468 0.16
469 0.18
470 0.23
471 0.28
472 0.27
473 0.33
474 0.36
475 0.4
476 0.44
477 0.46
478 0.5
479 0.53
480 0.55
481 0.5
482 0.5
483 0.48
484 0.43
485 0.42
486 0.35
487 0.27
488 0.21
489 0.19
490 0.16
491 0.16
492 0.21
493 0.18
494 0.16
495 0.17
496 0.18
497 0.18
498 0.18
499 0.18
500 0.15
501 0.16
502 0.18
503 0.19
504 0.2
505 0.22