Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1DJ01

Protein Details
Accession A1DJ01    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
224-266DSEFPKISRQEKKRIKQEKKEAKKAEKERKKHGKNKEGPFESLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
231-259SRQEKKRIKQEKKEAKKAEKERKKHGKNK
Subcellular Location(s) plas 18, E.R. 5, vacu 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007568  RTA1  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
KEGG nfi:NFIA_093210  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04479  RTA1  
Amino Acid Sequences MGASWELLAFVFRTLQTRHQDNEPFATAHTLLYLLAPLWINAFIYMTLGRLIHFFIPERRLGGISAKRYGFIFVWLDILAFIVQLVGASITTQHDAPTSTTMLGIHIYMGGIGLQELFVLIFGVLAIHLHRRMVQMENYGGLDYEKTTRGSVSWRWLFWALYASLTLITIRIIFRLCQYARGTDPTNPILTQEAYEYVLDAAPMFLALLILNVIHPGRVLQGPDSEFPKISRQEKKRIKQEKKEAKKAEKERKKHGKNKEGPFESLSIQEGSHIYDSRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.25
3 0.31
4 0.36
5 0.39
6 0.45
7 0.5
8 0.49
9 0.52
10 0.47
11 0.4
12 0.35
13 0.36
14 0.28
15 0.22
16 0.19
17 0.14
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.06
22 0.08
23 0.08
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.09
28 0.08
29 0.09
30 0.07
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.09
35 0.08
36 0.09
37 0.08
38 0.1
39 0.1
40 0.11
41 0.13
42 0.17
43 0.2
44 0.21
45 0.22
46 0.21
47 0.21
48 0.2
49 0.26
50 0.27
51 0.28
52 0.33
53 0.31
54 0.31
55 0.3
56 0.32
57 0.24
58 0.21
59 0.19
60 0.13
61 0.15
62 0.14
63 0.13
64 0.11
65 0.11
66 0.07
67 0.05
68 0.05
69 0.03
70 0.03
71 0.03
72 0.03
73 0.02
74 0.02
75 0.03
76 0.04
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.06
81 0.07
82 0.08
83 0.09
84 0.11
85 0.11
86 0.1
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.09
91 0.08
92 0.06
93 0.05
94 0.05
95 0.04
96 0.04
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.02
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.02
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.07
118 0.08
119 0.1
120 0.12
121 0.13
122 0.14
123 0.14
124 0.15
125 0.14
126 0.13
127 0.11
128 0.09
129 0.07
130 0.06
131 0.07
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.09
136 0.09
137 0.13
138 0.15
139 0.21
140 0.22
141 0.21
142 0.23
143 0.24
144 0.24
145 0.21
146 0.21
147 0.13
148 0.11
149 0.11
150 0.09
151 0.08
152 0.08
153 0.07
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.08
162 0.15
163 0.15
164 0.2
165 0.21
166 0.23
167 0.24
168 0.28
169 0.29
170 0.25
171 0.29
172 0.26
173 0.26
174 0.23
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.15
179 0.12
180 0.11
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.03
192 0.03
193 0.03
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.07
205 0.09
206 0.1
207 0.11
208 0.15
209 0.18
210 0.2
211 0.23
212 0.22
213 0.21
214 0.22
215 0.28
216 0.31
217 0.37
218 0.44
219 0.49
220 0.58
221 0.68
222 0.76
223 0.8
224 0.84
225 0.87
226 0.87
227 0.92
228 0.92
229 0.92
230 0.93
231 0.92
232 0.91
233 0.91
234 0.91
235 0.91
236 0.9
237 0.87
238 0.87
239 0.88
240 0.89
241 0.88
242 0.88
243 0.88
244 0.88
245 0.91
246 0.9
247 0.84
248 0.76
249 0.7
250 0.61
251 0.52
252 0.44
253 0.35
254 0.25
255 0.2
256 0.19
257 0.16
258 0.17
259 0.19