FuNGI

A0A2X0NCA4

Protein Details

Accession

A0A2X0NCA4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
281-304	HPPPGPCRSCKKKDHWSLDCKKAL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

extr 13, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MTTTPPLATGANPPIPAEQLAALTSLLSGLTAAASGTATPATTSGTTRTAFPKHARLDGAKTFANWTRQLRLCLADDIRSYVLDGIAPDDWTPSQRSARDAVAREVLANSIDSAEVSAVLDKIPTADLTAPTIYSTLKSRYAPDDATRTLELFSRLWGFRPMPGTVAEFDGWIMDFKAVAQEIIDTKTTINDVLATLLLAIAHPSLESFKASFTDEQRTQRTLPDIDSLADRMRVQLRSTNIPSTQSALLASSSSRSTRLKCLACRSPSHRVAECPTRAQHPPPGPCRSCKKKDHWSLDCKKALEDGKKPDTADSTVDSQHHVGCLATGLLARRRQLRNHSFVVDSGATSHMVSDKSLFTTYRHIAPTKIGGIAGGINAIGTGNIAFIAASGHPITLTGVLHTPGLFVNLLSVSRLCDTDDVRVAFTKHGIHIDKDGNDIAEGARLDEGLYLLDADHSKCQHLALLSRSQSSVPLLTLHRCLGHLAPSSIQKMVAAGLLEGLRAGYSDEEVEKFVCNACLSAKGHRLPFPDSDSHSSERLGLVHSDVLSFPERSLTGKRYLVTFLDDYSRKLWAYAIGHKSEVFGIFKTWLAEVELETGATLKVLRTDNGGEYCSRAFTEFCKTRGTRRQYSIPRTPQQNGRAERVNRSIVEGVLALLVDAHLPKTFWEEAAAYFVYCKNLCQHAALDKATPNSVWQGDHTTASALHPFGCTAWLTVAPELRSKLDPKAVRVFFTGYDLASKAFRFYDTTTQKIILGRNATFLDTEFPGLHGDPTEQDGDTHFASAPTTESQTVVKTWTPLPQVRLDLQDVHHPDFSTYREPASAEESPDELDLIGRHSRDESPDEIDFLTRHHRAFIAIDDDTSDTEAIQPVKSITSDPQTWREAMSSDKREVWAKAATDEFTSMRDDFKVFTIEDRAIRSTLLRQRCSYSQE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.28
2	0.29
3	0.28
4	0.23
5	0.17
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.12
10	0.1
11	0.09
12	0.08
13	0.06
14	0.05
15	0.05
16	0.04
17	0.04
18	0.04
19	0.04
20	0.04
21	0.04
22	0.04
23	0.06
24	0.06
25	0.06
26	0.06
27	0.07
28	0.09
29	0.1
30	0.12
31	0.14
32	0.18
33	0.19
34	0.22
35	0.28
36	0.3
37	0.35
38	0.4
39	0.46
40	0.46
41	0.51
42	0.52
43	0.51
44	0.54
45	0.53
46	0.52
47	0.43
48	0.4
49	0.4
50	0.4
51	0.42
52	0.4
53	0.39
54	0.43
55	0.47
56	0.49
57	0.47
58	0.46
59	0.43
60	0.43
61	0.41
62	0.37
63	0.33
64	0.33
65	0.31
66	0.27
67	0.25
68	0.19
69	0.17
70	0.13
71	0.12
72	0.11
73	0.11
74	0.12
75	0.11
76	0.12
77	0.13
78	0.14
79	0.17
80	0.19
81	0.24
82	0.26
83	0.29
84	0.3
85	0.36
86	0.41
87	0.41
88	0.41
89	0.39
90	0.37
91	0.35
92	0.32
93	0.26
94	0.19
95	0.17
96	0.13
97	0.09
98	0.08
99	0.07
100	0.07
101	0.07
102	0.06
103	0.06
104	0.07
105	0.07
106	0.07
107	0.07
108	0.06
109	0.07
110	0.07
111	0.07
112	0.08
113	0.1
114	0.11
115	0.14
116	0.15
117	0.14
118	0.14
119	0.15
120	0.13
121	0.12
122	0.15
123	0.16
124	0.21
125	0.22
126	0.25
127	0.29
128	0.33
129	0.35
130	0.36
131	0.39
132	0.35
133	0.38
134	0.35
135	0.31
136	0.28
137	0.27
138	0.24
139	0.18
140	0.19
141	0.2
142	0.2
143	0.21
144	0.25
145	0.24
146	0.25
147	0.28
148	0.27
149	0.22
150	0.24
151	0.24
152	0.2
153	0.22
154	0.18
155	0.14
156	0.14
157	0.13
158	0.11
159	0.1
160	0.09
161	0.06
162	0.06
163	0.06
164	0.09
165	0.09
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.11
170	0.13
171	0.14
172	0.11
173	0.11
174	0.12
175	0.13
176	0.11
177	0.1
178	0.09
179	0.08
180	0.09
181	0.08
182	0.07
183	0.06
184	0.06
185	0.06
186	0.05
187	0.05
188	0.04
189	0.04
190	0.04
191	0.04
192	0.06
193	0.07
194	0.08
195	0.08
196	0.09
197	0.11
198	0.13
199	0.17
200	0.19
201	0.27
202	0.31
203	0.36
204	0.4
205	0.42
206	0.4
207	0.4
208	0.41
209	0.35
210	0.31
211	0.29
212	0.25
213	0.23
214	0.23
215	0.21
216	0.18
217	0.18
218	0.16
219	0.15
220	0.19
221	0.2
222	0.2
223	0.23
224	0.26
225	0.32
226	0.35
227	0.36
228	0.33
229	0.34
230	0.33
231	0.32
232	0.28
233	0.21
234	0.18
235	0.14
236	0.13
237	0.11
238	0.1
239	0.09
240	0.1
241	0.1
242	0.13
243	0.16
244	0.18
245	0.25
246	0.33
247	0.37
248	0.41
249	0.49
250	0.54
251	0.55
252	0.6
253	0.59
254	0.61
255	0.61
256	0.61
257	0.55
258	0.5
259	0.52
260	0.53
261	0.49
262	0.44
263	0.4
264	0.39
265	0.4
266	0.39
267	0.41
268	0.4
269	0.45
270	0.48
271	0.55
272	0.53
273	0.57
274	0.64
275	0.66
276	0.67
277	0.68
278	0.7
279	0.71
280	0.79
281	0.83
282	0.82
283	0.83
284	0.82
285	0.83
286	0.78
287	0.68
288	0.58
289	0.54
290	0.51
291	0.47
292	0.45
293	0.44
294	0.44
295	0.46
296	0.46
297	0.41
298	0.38
299	0.32
300	0.27
301	0.21
302	0.19
303	0.19
304	0.19
305	0.19
306	0.17
307	0.16
308	0.14
309	0.12
310	0.09
311	0.07
312	0.07
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.08
317	0.12
318	0.15
319	0.17
320	0.24
321	0.28
322	0.32
323	0.42
324	0.48
325	0.49
326	0.5
327	0.51
328	0.43
329	0.4
330	0.39
331	0.29
332	0.21
333	0.16
334	0.13
335	0.11
336	0.1
337	0.1
338	0.08
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.09
343	0.1
344	0.12
345	0.12
346	0.11
347	0.17
348	0.19
349	0.22
350	0.23
351	0.23
352	0.22
353	0.23
354	0.25
355	0.2
356	0.19
357	0.14
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.09
362	0.06
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.03
368	0.02
369	0.02
370	0.02
371	0.02
372	0.03
373	0.02
374	0.03
375	0.04
376	0.03
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.05
381	0.05
382	0.06
383	0.06
384	0.06
385	0.06
386	0.06
387	0.07
388	0.07
389	0.07
390	0.07
391	0.06
392	0.07
393	0.06
394	0.05
395	0.05
396	0.06
397	0.06
398	0.06
399	0.06
400	0.06
401	0.06
402	0.07
403	0.07
404	0.08
405	0.09
406	0.11
407	0.15
408	0.14
409	0.14
410	0.15
411	0.16
412	0.14
413	0.15
414	0.14
415	0.11
416	0.15
417	0.16
418	0.15
419	0.19
420	0.21
421	0.2
422	0.2
423	0.19
424	0.15
425	0.13
426	0.13
427	0.09
428	0.08
429	0.07
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.03
437	0.03
438	0.03
439	0.03
440	0.04
441	0.05
442	0.05
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.09
448	0.09
449	0.09
450	0.11
451	0.12
452	0.17
453	0.18
454	0.18
455	0.19
456	0.17
457	0.17
458	0.15
459	0.13
460	0.08
461	0.09
462	0.1
463	0.11
464	0.12
465	0.12
466	0.12
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.14
471	0.13
472	0.13
473	0.14
474	0.15
475	0.16
476	0.16
477	0.15
478	0.11
479	0.09
480	0.09
481	0.08
482	0.06
483	0.05
484	0.05
485	0.05
486	0.05
487	0.05
488	0.04
489	0.03
490	0.03
491	0.04
492	0.03
493	0.03
494	0.04
495	0.05
496	0.05
497	0.06
498	0.07
499	0.07
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.07
506	0.11
507	0.12
508	0.16
509	0.21
510	0.23
511	0.26
512	0.28
513	0.3
514	0.28
515	0.3
516	0.3
517	0.27
518	0.27
519	0.3
520	0.3
521	0.3
522	0.27
523	0.25
524	0.22
525	0.19
526	0.17
527	0.13
528	0.1
529	0.08
530	0.09
531	0.08
532	0.08
533	0.08
534	0.09
535	0.1
536	0.1
537	0.09
538	0.1
539	0.1
540	0.12
541	0.15
542	0.16
543	0.19
544	0.21
545	0.22
546	0.21
547	0.23
548	0.21
549	0.21
550	0.19
551	0.15
552	0.18
553	0.18
554	0.18
555	0.18
556	0.19
557	0.15
558	0.15
559	0.15
560	0.14
561	0.17
562	0.23
563	0.26
564	0.26
565	0.26
566	0.26
567	0.26
568	0.22
569	0.21
570	0.14
571	0.1
572	0.1
573	0.1
574	0.11
575	0.11
576	0.1
577	0.09
578	0.09
579	0.09
580	0.08
581	0.1
582	0.09
583	0.08
584	0.08
585	0.08
586	0.06
587	0.06
588	0.06
589	0.04
590	0.08
591	0.09
592	0.1
593	0.12
594	0.14
595	0.16
596	0.18
597	0.19
598	0.14
599	0.15
600	0.15
601	0.14
602	0.12
603	0.11
604	0.1
605	0.11
606	0.21
607	0.23
608	0.24
609	0.31
610	0.32
611	0.4
612	0.49
613	0.55
614	0.53
615	0.55
616	0.63
617	0.65
618	0.72
619	0.74
620	0.73
621	0.72
622	0.69
623	0.68
624	0.66
625	0.65
626	0.65
627	0.58
628	0.54
629	0.56
630	0.53
631	0.53
632	0.51
633	0.46
634	0.38
635	0.37
636	0.34
637	0.25
638	0.24
639	0.18
640	0.13
641	0.1
642	0.09
643	0.05
644	0.04
645	0.04
646	0.04
647	0.04
648	0.04
649	0.04
650	0.05
651	0.05
652	0.1
653	0.11
654	0.11
655	0.12
656	0.13
657	0.13
658	0.16
659	0.16
660	0.11
661	0.12
662	0.13
663	0.14
664	0.13
665	0.14
666	0.15
667	0.18
668	0.2
669	0.2
670	0.22
671	0.24
672	0.28
673	0.28
674	0.26
675	0.25
676	0.25
677	0.24
678	0.22
679	0.17
680	0.17
681	0.17
682	0.15
683	0.14
684	0.18
685	0.19
686	0.19
687	0.19
688	0.16
689	0.15
690	0.15
691	0.16
692	0.11
693	0.11
694	0.1
695	0.1
696	0.09
697	0.1
698	0.1
699	0.08
700	0.09
701	0.1
702	0.11
703	0.13
704	0.16
705	0.15
706	0.18
707	0.19
708	0.2
709	0.22
710	0.23
711	0.25
712	0.3
713	0.32
714	0.35
715	0.43
716	0.42
717	0.41
718	0.4
719	0.38
720	0.3
721	0.31
722	0.27
723	0.17
724	0.17
725	0.16
726	0.15
727	0.15
728	0.14
729	0.12
730	0.12
731	0.13
732	0.14
733	0.17
734	0.26
735	0.3
736	0.33
737	0.34
738	0.34
739	0.35
740	0.36
741	0.35
742	0.3
743	0.29
744	0.26
745	0.28
746	0.28
747	0.26
748	0.23
749	0.21
750	0.19
751	0.15
752	0.16
753	0.12
754	0.12
755	0.13
756	0.14
757	0.13
758	0.11
759	0.11
760	0.11
761	0.13
762	0.14
763	0.12
764	0.12
765	0.13
766	0.16
767	0.15
768	0.15
769	0.13
770	0.11
771	0.12
772	0.12
773	0.12
774	0.11
775	0.14
776	0.13
777	0.14
778	0.15
779	0.16
780	0.17
781	0.17
782	0.17
783	0.17
784	0.18
785	0.23
786	0.29
787	0.31
788	0.34
789	0.36
790	0.39
791	0.39
792	0.41
793	0.37
794	0.34
795	0.32
796	0.36
797	0.35
798	0.35
799	0.34
800	0.31
801	0.29
802	0.29
803	0.31
804	0.28
805	0.25
806	0.23
807	0.22
808	0.23
809	0.23
810	0.27
811	0.26
812	0.22
813	0.23
814	0.22
815	0.22
816	0.21
817	0.2
818	0.13
819	0.12
820	0.1
821	0.12
822	0.15
823	0.14
824	0.15
825	0.17
826	0.2
827	0.23
828	0.26
829	0.25
830	0.27
831	0.28
832	0.28
833	0.26
834	0.26
835	0.22
836	0.2
837	0.25
838	0.23
839	0.23
840	0.23
841	0.23
842	0.23
843	0.25
844	0.27
845	0.25
846	0.22
847	0.21
848	0.21
849	0.21
850	0.2
851	0.19
852	0.15
853	0.09
854	0.1
855	0.14
856	0.14
857	0.13
858	0.13
859	0.13
860	0.15
861	0.15
862	0.16
863	0.17
864	0.23
865	0.28
866	0.32
867	0.37
868	0.39
869	0.39
870	0.38
871	0.35
872	0.3
873	0.32
874	0.37
875	0.37
876	0.38
877	0.4
878	0.41
879	0.44
880	0.44
881	0.4
882	0.36
883	0.32
884	0.32
885	0.32
886	0.31
887	0.28
888	0.29
889	0.25
890	0.21
891	0.23
892	0.19
893	0.18
894	0.19
895	0.18
896	0.17
897	0.19
898	0.21
899	0.18
900	0.21
901	0.23
902	0.25
903	0.28
904	0.3
905	0.3
906	0.27
907	0.28
908	0.27
909	0.31
910	0.36
911	0.42
912	0.44
913	0.44
914	0.5

A0A2X0NCA4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer