Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2X0L3F9

Protein Details
Accession A0A2X0L3F9    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
108-133DGEGKSKKKLKVKKVKDPNAPKRPASBasic
217-236GKEYTGKKRGRKSNAEKAAEBasic
257-281ASGSGDKKKMPKSSKKQKDAAPAPSHydrophilic
309-328VSKRGKALPEEKPKSKKAKHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
111-130GKSKKKLKVKKVKDPNAPKR
223-228KKRGRK
263-273KKKMPKSSKKQ
303-328PPKKSPVSKRGKALPEEKPKSKKAKH
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.166, cyto 9.5, mito_nucl 8.499, cyto_mito 6.999
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MSDKRQAPTIAVSPSQPAFAELFGPAPSSRLRLLCHPCRALANAYVELASSLTRAANAADAYARELGVAATPAQLEALVANPPNLPFYGAKHGSKAAAAAAGSDDEEDGEGKSKKKLKVKKVKDPNAPKRPASAYIEFQNSVREQFRTAAPEATYQEILRKISGIWQAMSDAEKKQWNDITAEKTLEYEEAKKHYKPVEGAEAVAALPAVITVGKDGKEYTGKKRGRKSNAEKAAEAAHGLVDTNGNIDVATGGILASGSGDKKKMPKSSKKQKDAAPAPSESEESESDSDDSSEEEEEVAPPPKKSPVSKRGKALPEEKPKSKKAKH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.29
3 0.23
4 0.2
5 0.16
6 0.15
7 0.16
8 0.12
9 0.13
10 0.11
11 0.14
12 0.11
13 0.12
14 0.13
15 0.15
16 0.18
17 0.2
18 0.22
19 0.29
20 0.39
21 0.46
22 0.53
23 0.52
24 0.51
25 0.51
26 0.51
27 0.45
28 0.41
29 0.37
30 0.29
31 0.28
32 0.26
33 0.22
34 0.2
35 0.16
36 0.11
37 0.07
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.11
49 0.12
50 0.11
51 0.09
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.07
60 0.06
61 0.06
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.07
67 0.08
68 0.09
69 0.09
70 0.1
71 0.1
72 0.12
73 0.1
74 0.14
75 0.22
76 0.26
77 0.26
78 0.27
79 0.28
80 0.26
81 0.26
82 0.22
83 0.14
84 0.11
85 0.1
86 0.08
87 0.07
88 0.07
89 0.07
90 0.06
91 0.06
92 0.04
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.08
97 0.1
98 0.12
99 0.18
100 0.24
101 0.3
102 0.39
103 0.48
104 0.55
105 0.64
106 0.73
107 0.78
108 0.82
109 0.86
110 0.87
111 0.9
112 0.89
113 0.89
114 0.84
115 0.73
116 0.67
117 0.6
118 0.54
119 0.49
120 0.41
121 0.34
122 0.33
123 0.34
124 0.3
125 0.28
126 0.26
127 0.2
128 0.2
129 0.18
130 0.15
131 0.14
132 0.15
133 0.16
134 0.17
135 0.18
136 0.17
137 0.16
138 0.19
139 0.18
140 0.18
141 0.17
142 0.14
143 0.15
144 0.15
145 0.15
146 0.12
147 0.11
148 0.09
149 0.14
150 0.17
151 0.15
152 0.14
153 0.14
154 0.14
155 0.14
156 0.15
157 0.12
158 0.09
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.17
163 0.18
164 0.18
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.21
169 0.22
170 0.19
171 0.17
172 0.16
173 0.15
174 0.13
175 0.12
176 0.12
177 0.17
178 0.2
179 0.2
180 0.24
181 0.26
182 0.28
183 0.27
184 0.28
185 0.31
186 0.28
187 0.28
188 0.23
189 0.2
190 0.17
191 0.15
192 0.11
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.02
198 0.02
199 0.03
200 0.05
201 0.06
202 0.07
203 0.07
204 0.09
205 0.17
206 0.2
207 0.27
208 0.35
209 0.41
210 0.47
211 0.56
212 0.64
213 0.66
214 0.74
215 0.76
216 0.77
217 0.81
218 0.77
219 0.68
220 0.6
221 0.54
222 0.43
223 0.33
224 0.23
225 0.13
226 0.09
227 0.09
228 0.07
229 0.05
230 0.05
231 0.06
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.03
245 0.05
246 0.06
247 0.08
248 0.09
249 0.12
250 0.19
251 0.26
252 0.35
253 0.44
254 0.54
255 0.64
256 0.74
257 0.83
258 0.85
259 0.85
260 0.83
261 0.84
262 0.81
263 0.79
264 0.72
265 0.63
266 0.57
267 0.52
268 0.46
269 0.36
270 0.31
271 0.22
272 0.21
273 0.2
274 0.18
275 0.17
276 0.17
277 0.17
278 0.13
279 0.13
280 0.11
281 0.11
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.09
286 0.12
287 0.18
288 0.19
289 0.19
290 0.22
291 0.28
292 0.33
293 0.41
294 0.49
295 0.53
296 0.62
297 0.68
298 0.74
299 0.77
300 0.79
301 0.78
302 0.76
303 0.76
304 0.76
305 0.78
306 0.8
307 0.78
308 0.79