Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D0D0

Protein Details
Accession A1D0D0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
151-171FSLAKYTLRKRKKFLKRFTVLHydrophilic
360-384FKSNRRSAYYKKRSRWERVRRVVDEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
161-162RK
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG nfi:NFIA_040260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MHSYIRPYQHVALRLPSELTKIVRLVPNTVVFLGKYGSFPANTIIGRPFYLTFEIIDVSGENNDNCLRIVSPAELHAETLIADGEGEGDDVEVNEEGIPIRTNREIVDDASTQKMTAEEIEALKKVSTGAGREIIEKLLESHSALDQKTAFSLAKYTLRKRKKFLKRFTVLPVDVSLLTNYMLEGKEAMKTMELRDESIGLIGCWGNVHHGGQSSFEGVVASKPNGRYLVIDETGGLVVAAMAERMGILYPHDQEDEDQELAEGSEENGERQQTNAMAQALARRRHMAASGNSITVIHANKQPSLSLLRYFGYDQDNPDESHPLYKHMKTVSWMQLLDPHADTIYANEPEVIPDETLATFKSNRRSAYYKKRSRWERVRRVVDEARAGNFDGLIVATLMEPASVLKHTVPLLAGSAPVVVYSPTIEPLTELADLYSTPRRTAYITRKREIIAQHSLQQSLQRQSQDSEKKPQEPDFSELDKDFALDPSLLLAPTIETSRVRAWQVLPGRTHPLMSGRGGAEGYIFHAIRVFPSHQNIQAAGNPSRKKRKVAAQQESATPAESGSGVDVEMQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.34
4 0.32
5 0.3
6 0.29
7 0.26
8 0.25
9 0.29
10 0.32
11 0.32
12 0.32
13 0.34
14 0.35
15 0.33
16 0.32
17 0.28
18 0.23
19 0.22
20 0.2
21 0.16
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.15
26 0.16
27 0.17
28 0.2
29 0.2
30 0.21
31 0.22
32 0.21
33 0.21
34 0.23
35 0.21
36 0.19
37 0.21
38 0.2
39 0.17
40 0.16
41 0.16
42 0.14
43 0.13
44 0.11
45 0.09
46 0.11
47 0.12
48 0.1
49 0.12
50 0.13
51 0.13
52 0.13
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.14
57 0.14
58 0.14
59 0.16
60 0.19
61 0.18
62 0.18
63 0.16
64 0.15
65 0.12
66 0.12
67 0.1
68 0.05
69 0.05
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.05
74 0.04
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.05
80 0.05
81 0.05
82 0.06
83 0.06
84 0.07
85 0.09
86 0.08
87 0.12
88 0.13
89 0.14
90 0.14
91 0.18
92 0.19
93 0.19
94 0.23
95 0.22
96 0.23
97 0.25
98 0.24
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.11
106 0.13
107 0.15
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.13
116 0.16
117 0.2
118 0.21
119 0.22
120 0.23
121 0.21
122 0.19
123 0.17
124 0.15
125 0.12
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.13
130 0.17
131 0.17
132 0.17
133 0.16
134 0.16
135 0.16
136 0.17
137 0.14
138 0.1
139 0.12
140 0.14
141 0.21
142 0.26
143 0.34
144 0.42
145 0.52
146 0.58
147 0.63
148 0.71
149 0.74
150 0.79
151 0.81
152 0.82
153 0.77
154 0.77
155 0.76
156 0.74
157 0.64
158 0.54
159 0.44
160 0.35
161 0.3
162 0.26
163 0.19
164 0.1
165 0.1
166 0.08
167 0.07
168 0.08
169 0.07
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.16
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.14
187 0.07
188 0.08
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.11
200 0.12
201 0.11
202 0.1
203 0.1
204 0.09
205 0.07
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.11
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.14
215 0.15
216 0.19
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.14
221 0.14
222 0.13
223 0.09
224 0.04
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.02
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.04
236 0.06
237 0.07
238 0.08
239 0.09
240 0.09
241 0.09
242 0.12
243 0.14
244 0.12
245 0.11
246 0.1
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.06
251 0.03
252 0.06
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.09
260 0.07
261 0.08
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.14
267 0.18
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.2
273 0.21
274 0.21
275 0.17
276 0.22
277 0.22
278 0.21
279 0.2
280 0.2
281 0.18
282 0.16
283 0.14
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.14
288 0.14
289 0.14
290 0.13
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.14
297 0.15
298 0.16
299 0.16
300 0.16
301 0.16
302 0.18
303 0.19
304 0.19
305 0.19
306 0.19
307 0.15
308 0.19
309 0.18
310 0.2
311 0.23
312 0.23
313 0.25
314 0.24
315 0.25
316 0.22
317 0.29
318 0.3
319 0.29
320 0.28
321 0.25
322 0.29
323 0.29
324 0.29
325 0.22
326 0.16
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.09
331 0.12
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.11
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.08
346 0.1
347 0.14
348 0.22
349 0.25
350 0.26
351 0.31
352 0.37
353 0.45
354 0.53
355 0.61
356 0.63
357 0.66
358 0.74
359 0.78
360 0.82
361 0.84
362 0.84
363 0.84
364 0.85
365 0.86
366 0.79
367 0.78
368 0.72
369 0.64
370 0.58
371 0.49
372 0.4
373 0.32
374 0.3
375 0.22
376 0.17
377 0.14
378 0.08
379 0.06
380 0.05
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.05
391 0.06
392 0.06
393 0.09
394 0.09
395 0.1
396 0.1
397 0.09
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.07
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.05
406 0.04
407 0.04
408 0.06
409 0.06
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.1
417 0.09
418 0.08
419 0.08
420 0.08
421 0.11
422 0.17
423 0.15
424 0.16
425 0.17
426 0.18
427 0.21
428 0.3
429 0.38
430 0.42
431 0.5
432 0.52
433 0.54
434 0.54
435 0.56
436 0.51
437 0.47
438 0.45
439 0.4
440 0.44
441 0.43
442 0.43
443 0.38
444 0.39
445 0.38
446 0.35
447 0.36
448 0.32
449 0.32
450 0.33
451 0.42
452 0.47
453 0.46
454 0.51
455 0.53
456 0.57
457 0.6
458 0.64
459 0.62
460 0.56
461 0.55
462 0.51
463 0.47
464 0.44
465 0.4
466 0.35
467 0.27
468 0.24
469 0.2
470 0.15
471 0.14
472 0.1
473 0.1
474 0.11
475 0.12
476 0.1
477 0.09
478 0.09
479 0.08
480 0.09
481 0.1
482 0.1
483 0.1
484 0.14
485 0.17
486 0.21
487 0.22
488 0.24
489 0.24
490 0.3
491 0.37
492 0.4
493 0.4
494 0.4
495 0.45
496 0.42
497 0.41
498 0.35
499 0.32
500 0.3
501 0.28
502 0.29
503 0.23
504 0.24
505 0.23
506 0.21
507 0.17
508 0.13
509 0.14
510 0.15
511 0.14
512 0.13
513 0.15
514 0.15
515 0.16
516 0.21
517 0.23
518 0.23
519 0.29
520 0.33
521 0.35
522 0.38
523 0.37
524 0.35
525 0.36
526 0.37
527 0.37
528 0.41
529 0.43
530 0.5
531 0.6
532 0.62
533 0.64
534 0.67
535 0.71
536 0.74
537 0.79
538 0.8
539 0.79
540 0.78
541 0.75
542 0.71
543 0.61
544 0.51
545 0.39
546 0.29
547 0.2
548 0.16
549 0.12
550 0.1
551 0.09
552 0.08