Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R335

Protein Details
Accession C4R335    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
81-100GNQQRQQRLKQEKRKLEAEKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR022023  U1snRNP70_N  
Gene Ontology GO:0000243  C:commitment complex  
GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0071004  C:U2-type prespliceosome  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0030619  F:U1 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0449  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF12220  U1snRNP70_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd21615  RRM_SNP1_like  
Amino Acid Sequences MNTIKESKGLTASVNVRSSDSAATFPPVIAKLFEPKPPFKFLEPVDYPIEQRRTKIVKGVGGLLDLVKKYNEEVPYTVTEGNQQRQQRLKQEKRKLEAEKLQRDLAAWNPEKDLNMIGDASRTIFVARLDYNSTEVDLQNSLGVFGEIDRIRVVRDVNTDKSKGYGFVVFKQPDDARTAYRNSSSLKINNRPVLVDIERGRTVKNWKPRRLGGGLGGRHYTKRQIEKLTRQAPRYDRYPPPERYSTSSNRGAYRGGAGSGGFRSHGGGGREGQGNFRSSDQRDNRRGGWNGQRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.31
4 0.31
5 0.31
6 0.26
7 0.23
8 0.18
9 0.16
10 0.19
11 0.18
12 0.17
13 0.18
14 0.17
15 0.16
16 0.16
17 0.17
18 0.22
19 0.24
20 0.3
21 0.34
22 0.39
23 0.42
24 0.46
25 0.48
26 0.43
27 0.47
28 0.43
29 0.47
30 0.43
31 0.43
32 0.41
33 0.39
34 0.38
35 0.39
36 0.45
37 0.35
38 0.34
39 0.39
40 0.4
41 0.41
42 0.45
43 0.42
44 0.38
45 0.39
46 0.41
47 0.33
48 0.28
49 0.27
50 0.2
51 0.18
52 0.14
53 0.13
54 0.1
55 0.09
56 0.11
57 0.16
58 0.17
59 0.17
60 0.18
61 0.21
62 0.22
63 0.25
64 0.24
65 0.19
66 0.23
67 0.26
68 0.29
69 0.31
70 0.32
71 0.35
72 0.41
73 0.46
74 0.5
75 0.56
76 0.63
77 0.68
78 0.75
79 0.78
80 0.77
81 0.8
82 0.75
83 0.73
84 0.71
85 0.7
86 0.67
87 0.62
88 0.57
89 0.48
90 0.44
91 0.37
92 0.33
93 0.32
94 0.26
95 0.23
96 0.24
97 0.25
98 0.24
99 0.24
100 0.2
101 0.11
102 0.1
103 0.09
104 0.08
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.06
112 0.06
113 0.08
114 0.09
115 0.1
116 0.11
117 0.11
118 0.13
119 0.12
120 0.12
121 0.11
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.06
129 0.05
130 0.05
131 0.04
132 0.04
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.08
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.08
142 0.14
143 0.17
144 0.22
145 0.25
146 0.26
147 0.24
148 0.25
149 0.24
150 0.19
151 0.17
152 0.17
153 0.15
154 0.18
155 0.26
156 0.25
157 0.25
158 0.28
159 0.27
160 0.23
161 0.25
162 0.23
163 0.18
164 0.2
165 0.22
166 0.2
167 0.21
168 0.22
169 0.2
170 0.22
171 0.24
172 0.27
173 0.32
174 0.38
175 0.43
176 0.44
177 0.42
178 0.4
179 0.37
180 0.37
181 0.3
182 0.29
183 0.24
184 0.25
185 0.27
186 0.27
187 0.26
188 0.24
189 0.3
190 0.32
191 0.4
192 0.46
193 0.52
194 0.59
195 0.62
196 0.65
197 0.6
198 0.56
199 0.53
200 0.51
201 0.46
202 0.41
203 0.39
204 0.33
205 0.32
206 0.31
207 0.31
208 0.29
209 0.35
210 0.39
211 0.47
212 0.55
213 0.63
214 0.71
215 0.74
216 0.73
217 0.68
218 0.69
219 0.66
220 0.62
221 0.56
222 0.54
223 0.52
224 0.54
225 0.6
226 0.59
227 0.6
228 0.61
229 0.6
230 0.58
231 0.58
232 0.57
233 0.55
234 0.57
235 0.54
236 0.5
237 0.48
238 0.44
239 0.37
240 0.34
241 0.28
242 0.2
243 0.17
244 0.15
245 0.15
246 0.15
247 0.15
248 0.11
249 0.1
250 0.11
251 0.13
252 0.17
253 0.17
254 0.19
255 0.2
256 0.24
257 0.29
258 0.28
259 0.3
260 0.28
261 0.28
262 0.27
263 0.29
264 0.31
265 0.29
266 0.4
267 0.45
268 0.53
269 0.58
270 0.62
271 0.63
272 0.66
273 0.67
274 0.65
275 0.66