Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D4P1

Protein Details
Accession A1D4P1    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
94-116DSAVGERRRPQRGKKDLRGSESPBasic
187-212ESKTGRSSQKTKTKSKKKAVDRAPSFHydrophilic
317-338SDALRKFRTQPKQRIREQQQFCHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
100-108RRRPQRGKK
196-204KTKTKSKKK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG nfi:NFIA_020920  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MVTPTSKPNSSFSKVYLTKNNYSGRSLHPNAKRPGKRAEDSAKEESTQDDESFEANWDERIVDNEDITAEPASSPVSSLEVQENEIPPGFEDFDSAVGERRRPQRGKKDLRGSESPTFSRKRNADEMANRAQTDAEKEDYVFGWSQSQKKRKQGYAGKKSDGSFWKAQGSTTVPSQSKSSPSSSASESKTGRSSQKTKTKSKKKAVDRAPSFMVPPDIDDLLPSSSGNRTKPEFIVPASLPNDTISSSSGFASSAQISHFFDSDDDCSSGTSLSSVPENLLEEFSQMEDVLLSDTDDSENAELKPSLCPWCKKAVDSDALRKFRTQPKQRIREQQQFCESHQKETAEKEWKERGYPDIDWDTFDERIKCHFDDLDSIIVPEGNSYYRNVLDTMLKSGKAKNFRLTLAGDALETICCGYYGTRGANKMLQALTARFSRKLRRLAAEDHIVKIAGPVIYAQAVLVPELAVRLVKEDMGVDVDSARQILRESIEIGEKLNFAPNDVVPIPVESENADAIIV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.57
4 0.56
5 0.57
6 0.62
7 0.66
8 0.58
9 0.56
10 0.53
11 0.5
12 0.53
13 0.52
14 0.53
15 0.55
16 0.61
17 0.67
18 0.74
19 0.74
20 0.69
21 0.74
22 0.74
23 0.69
24 0.69
25 0.7
26 0.68
27 0.69
28 0.7
29 0.62
30 0.54
31 0.51
32 0.43
33 0.38
34 0.31
35 0.24
36 0.19
37 0.17
38 0.17
39 0.17
40 0.16
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.11
47 0.14
48 0.17
49 0.16
50 0.16
51 0.15
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.13
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.09
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.16
67 0.16
68 0.18
69 0.21
70 0.22
71 0.2
72 0.2
73 0.19
74 0.15
75 0.17
76 0.16
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.13
82 0.13
83 0.16
84 0.16
85 0.19
86 0.25
87 0.32
88 0.41
89 0.47
90 0.56
91 0.62
92 0.71
93 0.8
94 0.83
95 0.86
96 0.83
97 0.83
98 0.79
99 0.75
100 0.71
101 0.65
102 0.57
103 0.53
104 0.5
105 0.45
106 0.48
107 0.44
108 0.44
109 0.46
110 0.47
111 0.49
112 0.52
113 0.56
114 0.56
115 0.55
116 0.48
117 0.41
118 0.38
119 0.3
120 0.28
121 0.24
122 0.18
123 0.16
124 0.16
125 0.17
126 0.17
127 0.18
128 0.15
129 0.12
130 0.16
131 0.19
132 0.26
133 0.34
134 0.42
135 0.47
136 0.56
137 0.64
138 0.63
139 0.69
140 0.72
141 0.75
142 0.77
143 0.77
144 0.71
145 0.67
146 0.63
147 0.6
148 0.53
149 0.48
150 0.4
151 0.35
152 0.37
153 0.33
154 0.32
155 0.28
156 0.27
157 0.23
158 0.22
159 0.26
160 0.21
161 0.22
162 0.24
163 0.23
164 0.24
165 0.25
166 0.26
167 0.23
168 0.24
169 0.26
170 0.27
171 0.31
172 0.29
173 0.32
174 0.3
175 0.29
176 0.3
177 0.31
178 0.33
179 0.35
180 0.39
181 0.42
182 0.51
183 0.56
184 0.64
185 0.71
186 0.77
187 0.8
188 0.84
189 0.84
190 0.84
191 0.87
192 0.86
193 0.86
194 0.78
195 0.72
196 0.65
197 0.56
198 0.47
199 0.38
200 0.3
201 0.19
202 0.16
203 0.13
204 0.11
205 0.1
206 0.09
207 0.1
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.1
213 0.13
214 0.14
215 0.16
216 0.18
217 0.2
218 0.21
219 0.23
220 0.21
221 0.19
222 0.22
223 0.19
224 0.22
225 0.21
226 0.2
227 0.17
228 0.16
229 0.16
230 0.11
231 0.12
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.07
242 0.07
243 0.08
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.04
276 0.04
277 0.04
278 0.04
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.04
284 0.05
285 0.05
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.1
292 0.12
293 0.18
294 0.2
295 0.23
296 0.24
297 0.33
298 0.34
299 0.34
300 0.36
301 0.35
302 0.38
303 0.4
304 0.46
305 0.45
306 0.47
307 0.47
308 0.44
309 0.45
310 0.46
311 0.53
312 0.54
313 0.56
314 0.64
315 0.72
316 0.79
317 0.83
318 0.83
319 0.83
320 0.79
321 0.75
322 0.73
323 0.67
324 0.61
325 0.62
326 0.54
327 0.47
328 0.46
329 0.4
330 0.33
331 0.34
332 0.39
333 0.37
334 0.38
335 0.39
336 0.42
337 0.42
338 0.42
339 0.39
340 0.36
341 0.32
342 0.31
343 0.31
344 0.3
345 0.29
346 0.28
347 0.29
348 0.27
349 0.24
350 0.26
351 0.22
352 0.17
353 0.21
354 0.23
355 0.22
356 0.21
357 0.2
358 0.18
359 0.21
360 0.23
361 0.21
362 0.17
363 0.17
364 0.15
365 0.14
366 0.13
367 0.1
368 0.08
369 0.07
370 0.08
371 0.09
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.12
376 0.13
377 0.17
378 0.17
379 0.22
380 0.22
381 0.23
382 0.23
383 0.28
384 0.33
385 0.37
386 0.4
387 0.4
388 0.42
389 0.41
390 0.43
391 0.4
392 0.36
393 0.3
394 0.26
395 0.19
396 0.16
397 0.15
398 0.12
399 0.1
400 0.08
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.05
405 0.08
406 0.11
407 0.16
408 0.19
409 0.21
410 0.24
411 0.26
412 0.27
413 0.28
414 0.25
415 0.23
416 0.22
417 0.21
418 0.22
419 0.24
420 0.26
421 0.27
422 0.32
423 0.39
424 0.44
425 0.52
426 0.55
427 0.57
428 0.59
429 0.6
430 0.62
431 0.62
432 0.57
433 0.5
434 0.44
435 0.37
436 0.31
437 0.26
438 0.22
439 0.12
440 0.1
441 0.09
442 0.09
443 0.1
444 0.1
445 0.09
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.08
450 0.07
451 0.06
452 0.07
453 0.07
454 0.06
455 0.06
456 0.08
457 0.09
458 0.09
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.12
463 0.12
464 0.1
465 0.1
466 0.11
467 0.11
468 0.11
469 0.1
470 0.08
471 0.09
472 0.11
473 0.12
474 0.13
475 0.15
476 0.17
477 0.21
478 0.21
479 0.22
480 0.21
481 0.2
482 0.19
483 0.24
484 0.21
485 0.19
486 0.22
487 0.21
488 0.25
489 0.25
490 0.25
491 0.19
492 0.2
493 0.22
494 0.19
495 0.2
496 0.14
497 0.15
498 0.14