Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

C4R2A0

Protein Details
Accession C4R2A0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
256-286SESDGEKRSKKEKKRRRRKRSTIGKEKEISFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
85-88KKAR
262-280KRSKKEKKRRRRKRSTIGK
Subcellular Location(s) cyto 9, cyto_nucl 8, mito 6, nucl 5, extr 3, pero 1, E.R. 1, cysk 1, vacu 1
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG ppa:PAS_chr2-2_0488  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTATAVNAKDVKKLKDALVASFFELSKAAQEASTATVNFFNAIEQPLPGDIAGIAKLARAVGDVDYSVAGAQSTSQKRAAAAAAKKARDPNAPKKPLTMYFAYSALARKEIMEERARKGLPPLSSLEMTHETSKKWKDLPSEERDEWKRKYNEELELYQHEKDRYIDDLISTGAEIPEEYQKAAHTRKRKIEFANASNLLKHPKLEHHAIAEAVGSVGDDTGVVNDGVHLDNEEDVAAAASAAVAAAAAAVEDAVSESDGEKRSKKEKKRRRRKRSTIGKEKEISFSFFYPTLLVDCILYLYCIVW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.44
3 0.45
4 0.42
5 0.41
6 0.38
7 0.34
8 0.33
9 0.3
10 0.22
11 0.21
12 0.16
13 0.13
14 0.13
15 0.12
16 0.09
17 0.1
18 0.11
19 0.13
20 0.16
21 0.14
22 0.14
23 0.15
24 0.15
25 0.15
26 0.14
27 0.11
28 0.1
29 0.12
30 0.12
31 0.1
32 0.11
33 0.11
34 0.11
35 0.1
36 0.09
37 0.07
38 0.07
39 0.07
40 0.07
41 0.06
42 0.06
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.07
51 0.08
52 0.08
53 0.08
54 0.07
55 0.06
56 0.05
57 0.04
58 0.05
59 0.13
60 0.16
61 0.19
62 0.21
63 0.21
64 0.22
65 0.23
66 0.25
67 0.24
68 0.25
69 0.32
70 0.36
71 0.37
72 0.39
73 0.41
74 0.42
75 0.43
76 0.48
77 0.49
78 0.54
79 0.59
80 0.57
81 0.57
82 0.58
83 0.53
84 0.49
85 0.41
86 0.32
87 0.28
88 0.28
89 0.25
90 0.21
91 0.2
92 0.16
93 0.14
94 0.12
95 0.1
96 0.13
97 0.14
98 0.18
99 0.23
100 0.26
101 0.28
102 0.33
103 0.33
104 0.3
105 0.31
106 0.31
107 0.25
108 0.24
109 0.24
110 0.21
111 0.22
112 0.21
113 0.22
114 0.2
115 0.21
116 0.22
117 0.2
118 0.18
119 0.23
120 0.25
121 0.25
122 0.24
123 0.26
124 0.29
125 0.36
126 0.44
127 0.44
128 0.49
129 0.47
130 0.51
131 0.53
132 0.53
133 0.47
134 0.48
135 0.43
136 0.37
137 0.43
138 0.4
139 0.41
140 0.38
141 0.38
142 0.32
143 0.33
144 0.33
145 0.28
146 0.27
147 0.21
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.11
155 0.11
156 0.1
157 0.09
158 0.08
159 0.06
160 0.04
161 0.04
162 0.04
163 0.05
164 0.07
165 0.08
166 0.08
167 0.08
168 0.09
169 0.14
170 0.2
171 0.25
172 0.31
173 0.38
174 0.48
175 0.53
176 0.58
177 0.57
178 0.61
179 0.62
180 0.57
181 0.58
182 0.52
183 0.47
184 0.42
185 0.39
186 0.33
187 0.26
188 0.23
189 0.17
190 0.19
191 0.24
192 0.27
193 0.28
194 0.26
195 0.27
196 0.26
197 0.24
198 0.19
199 0.14
200 0.09
201 0.07
202 0.05
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.03
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.07
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.04
225 0.04
226 0.03
227 0.03
228 0.03
229 0.02
230 0.02
231 0.02
232 0.02
233 0.02
234 0.02
235 0.02
236 0.02
237 0.02
238 0.02
239 0.02
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.05
245 0.1
246 0.13
247 0.17
248 0.2
249 0.26
250 0.36
251 0.46
252 0.56
253 0.63
254 0.71
255 0.8
256 0.87
257 0.93
258 0.94
259 0.96
260 0.97
261 0.96
262 0.97
263 0.97
264 0.97
265 0.94
266 0.92
267 0.86
268 0.78
269 0.74
270 0.64
271 0.57
272 0.49
273 0.42
274 0.36
275 0.3
276 0.28
277 0.21
278 0.2
279 0.18
280 0.15
281 0.14
282 0.11
283 0.1
284 0.11
285 0.1
286 0.1