Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D1E3

Protein Details
Accession A1D1E3    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-68LEEARHGKKRKRVAGPEAAEBasic
144-189QTVRVESEEPKKKKKKRKQQEESTPALTKKEQKKARRVYPQPLVSFHydrophilic
655-681ALPDLSKKDKKELKKHGVKARQSNLKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
53-60RHGKKRKR
153-180PKKKKKKRKQQEESTPALTKKEQKKARR
661-719KKDKKELKKHGVKARQSNLKSVKDDKEHRKTRISTKSGFDRRMENKKKALIAASRNRKS
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 10
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044764  DDX52/Rok1_DEADc  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030490  P:maturation of SSU-rRNA  
KEGG nfi:NFIA_009150  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17957  DEADc_DDX52  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MDAFKLLTRATKLKGGAAPSSAQSSTRLPSTGKAANPQLFRSSEADKVLEEARHGKKRKRVAGPEAAESDDDGAELNFFGSSKARRSSASMAKEQEKEQQEQQEHRDDTSDADDADEMDEVQCRTVLNAHKIKVTDMRDLEEIQTVRVESEEPKKKKKKRKQQEESTPALTKKEQKKARRVYPQPLVSFKELRTRYKISRRLAENIAEQGFSVPTEVQLGTLPLLLEGFKVSGNSKDAESIEPDLLVVAPTGSGKTLSFLIPVINKIVRHHHEQEEERGIFSVVVAPTKELASQIVNEGRKLVHGTGVKITLMKKGMRVVDREDDDDENSHSEDSEEGSESEQDEPSTTRKKKGKAPVTKSDILVTTPLLLVNALSANRTKPMATLPLVRNIVLDEADVLLDELFRDQTLDIWRACTHPELRASLWSATMGSNIEDLAKSTIKERKQAYDRTNSYPLLRLVVGLKDSAIPNIEHKLVYAATEQGKLLGLRQLLHPAAASASDVRLRPPFLIFTQTIPRAIALHSELRYDIPAEAGGSSRIAVLHSDLSDGQRSEIMKNFRKGEIWILVTTDLLARGVDFRGINGVVNYDIPNSAAVYVHRVGRTGRAGREGGIAVTYYTKEDIPYVKSIANIIDVSEKLRGKDGEKSIQKWLLDALPDLSKKDKKELKKHGVKARQSNLKSVKDDKEHRKTRISTKSGFDRRMENKKKALIAASRNRKSKTQSTDPGSDNESWDGLDG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.38
4 0.36
5 0.35
6 0.3
7 0.33
8 0.27
9 0.24
10 0.23
11 0.24
12 0.24
13 0.24
14 0.25
15 0.22
16 0.24
17 0.3
18 0.33
19 0.33
20 0.37
21 0.43
22 0.47
23 0.49
24 0.49
25 0.47
26 0.43
27 0.43
28 0.4
29 0.35
30 0.33
31 0.33
32 0.31
33 0.26
34 0.27
35 0.28
36 0.25
37 0.24
38 0.28
39 0.34
40 0.43
41 0.5
42 0.55
43 0.6
44 0.69
45 0.76
46 0.78
47 0.79
48 0.79
49 0.82
50 0.79
51 0.76
52 0.68
53 0.6
54 0.49
55 0.4
56 0.32
57 0.21
58 0.16
59 0.1
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.06
67 0.1
68 0.14
69 0.19
70 0.24
71 0.25
72 0.27
73 0.32
74 0.4
75 0.45
76 0.48
77 0.49
78 0.51
79 0.56
80 0.57
81 0.54
82 0.53
83 0.49
84 0.47
85 0.46
86 0.49
87 0.48
88 0.51
89 0.54
90 0.55
91 0.51
92 0.48
93 0.44
94 0.36
95 0.32
96 0.3
97 0.26
98 0.16
99 0.15
100 0.15
101 0.13
102 0.13
103 0.11
104 0.08
105 0.07
106 0.09
107 0.09
108 0.09
109 0.09
110 0.09
111 0.09
112 0.15
113 0.21
114 0.28
115 0.34
116 0.35
117 0.38
118 0.38
119 0.41
120 0.42
121 0.4
122 0.38
123 0.34
124 0.35
125 0.34
126 0.34
127 0.32
128 0.31
129 0.27
130 0.2
131 0.2
132 0.16
133 0.15
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.23
138 0.33
139 0.38
140 0.48
141 0.59
142 0.68
143 0.78
144 0.85
145 0.86
146 0.87
147 0.93
148 0.93
149 0.94
150 0.96
151 0.93
152 0.88
153 0.82
154 0.76
155 0.65
156 0.57
157 0.49
158 0.47
159 0.48
160 0.52
161 0.55
162 0.59
163 0.69
164 0.76
165 0.82
166 0.84
167 0.82
168 0.81
169 0.82
170 0.8
171 0.74
172 0.69
173 0.63
174 0.57
175 0.53
176 0.45
177 0.45
178 0.41
179 0.42
180 0.43
181 0.45
182 0.5
183 0.57
184 0.64
185 0.61
186 0.65
187 0.65
188 0.64
189 0.61
190 0.56
191 0.49
192 0.45
193 0.39
194 0.3
195 0.26
196 0.21
197 0.17
198 0.13
199 0.11
200 0.07
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.09
220 0.11
221 0.12
222 0.12
223 0.14
224 0.15
225 0.15
226 0.17
227 0.16
228 0.15
229 0.13
230 0.13
231 0.1
232 0.09
233 0.08
234 0.06
235 0.03
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.08
247 0.1
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.14
252 0.14
253 0.15
254 0.23
255 0.24
256 0.3
257 0.34
258 0.36
259 0.41
260 0.43
261 0.46
262 0.45
263 0.42
264 0.36
265 0.31
266 0.27
267 0.2
268 0.17
269 0.16
270 0.09
271 0.1
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.11
277 0.07
278 0.08
279 0.07
280 0.08
281 0.1
282 0.15
283 0.15
284 0.15
285 0.16
286 0.14
287 0.14
288 0.16
289 0.13
290 0.13
291 0.14
292 0.16
293 0.17
294 0.18
295 0.17
296 0.17
297 0.17
298 0.16
299 0.17
300 0.17
301 0.16
302 0.19
303 0.24
304 0.24
305 0.26
306 0.26
307 0.29
308 0.3
309 0.3
310 0.28
311 0.24
312 0.22
313 0.21
314 0.18
315 0.13
316 0.12
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.08
327 0.08
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.12
334 0.2
335 0.21
336 0.28
337 0.33
338 0.38
339 0.45
340 0.54
341 0.61
342 0.62
343 0.68
344 0.7
345 0.72
346 0.69
347 0.62
348 0.53
349 0.43
350 0.33
351 0.26
352 0.17
353 0.1
354 0.08
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.04
360 0.05
361 0.04
362 0.05
363 0.06
364 0.06
365 0.07
366 0.08
367 0.08
368 0.07
369 0.09
370 0.12
371 0.13
372 0.19
373 0.2
374 0.26
375 0.26
376 0.26
377 0.24
378 0.2
379 0.2
380 0.13
381 0.11
382 0.05
383 0.05
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.03
393 0.04
394 0.04
395 0.06
396 0.09
397 0.12
398 0.12
399 0.14
400 0.14
401 0.15
402 0.16
403 0.16
404 0.15
405 0.16
406 0.18
407 0.19
408 0.19
409 0.2
410 0.22
411 0.19
412 0.18
413 0.14
414 0.12
415 0.1
416 0.1
417 0.09
418 0.07
419 0.06
420 0.06
421 0.06
422 0.06
423 0.06
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.12
428 0.18
429 0.2
430 0.26
431 0.28
432 0.34
433 0.4
434 0.48
435 0.49
436 0.53
437 0.56
438 0.55
439 0.57
440 0.5
441 0.45
442 0.41
443 0.35
444 0.27
445 0.23
446 0.18
447 0.15
448 0.15
449 0.14
450 0.1
451 0.1
452 0.1
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.09
457 0.1
458 0.13
459 0.14
460 0.12
461 0.11
462 0.13
463 0.11
464 0.12
465 0.11
466 0.12
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.12
471 0.13
472 0.12
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.11
477 0.12
478 0.16
479 0.15
480 0.15
481 0.14
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.09
486 0.06
487 0.07
488 0.09
489 0.1
490 0.12
491 0.13
492 0.14
493 0.15
494 0.16
495 0.17
496 0.15
497 0.2
498 0.19
499 0.2
500 0.26
501 0.26
502 0.26
503 0.23
504 0.22
505 0.18
506 0.18
507 0.17
508 0.13
509 0.17
510 0.16
511 0.17
512 0.17
513 0.17
514 0.17
515 0.16
516 0.13
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.07
530 0.09
531 0.09
532 0.1
533 0.11
534 0.12
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.14
539 0.16
540 0.17
541 0.22
542 0.28
543 0.33
544 0.38
545 0.41
546 0.4
547 0.4
548 0.39
549 0.39
550 0.36
551 0.31
552 0.26
553 0.24
554 0.23
555 0.21
556 0.2
557 0.15
558 0.1
559 0.07
560 0.06
561 0.06
562 0.07
563 0.07
564 0.1
565 0.09
566 0.09
567 0.12
568 0.13
569 0.13
570 0.12
571 0.12
572 0.1
573 0.11
574 0.12
575 0.09
576 0.09
577 0.09
578 0.09
579 0.09
580 0.09
581 0.08
582 0.08
583 0.13
584 0.14
585 0.18
586 0.18
587 0.19
588 0.19
589 0.24
590 0.31
591 0.32
592 0.32
593 0.33
594 0.34
595 0.34
596 0.36
597 0.31
598 0.23
599 0.18
600 0.16
601 0.11
602 0.12
603 0.11
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.1
608 0.13
609 0.16
610 0.18
611 0.21
612 0.22
613 0.22
614 0.22
615 0.23
616 0.21
617 0.2
618 0.17
619 0.14
620 0.16
621 0.15
622 0.16
623 0.21
624 0.22
625 0.2
626 0.25
627 0.26
628 0.25
629 0.34
630 0.38
631 0.43
632 0.48
633 0.5
634 0.52
635 0.55
636 0.53
637 0.44
638 0.41
639 0.33
640 0.28
641 0.26
642 0.22
643 0.23
644 0.24
645 0.25
646 0.3
647 0.32
648 0.33
649 0.42
650 0.48
651 0.52
652 0.62
653 0.71
654 0.75
655 0.8
656 0.87
657 0.88
658 0.89
659 0.88
660 0.87
661 0.86
662 0.85
663 0.77
664 0.77
665 0.76
666 0.73
667 0.69
668 0.67
669 0.65
670 0.65
671 0.73
672 0.73
673 0.75
674 0.77
675 0.77
676 0.79
677 0.78
678 0.79
679 0.8
680 0.76
681 0.71
682 0.7
683 0.75
684 0.75
685 0.73
686 0.66
687 0.64
688 0.67
689 0.72
690 0.73
691 0.7
692 0.69
693 0.7
694 0.71
695 0.65
696 0.64
697 0.61
698 0.62
699 0.65
700 0.68
701 0.7
702 0.73
703 0.72
704 0.71
705 0.7
706 0.7
707 0.68
708 0.68
709 0.69
710 0.7
711 0.74
712 0.71
713 0.66
714 0.61
715 0.53
716 0.46
717 0.38
718 0.31