Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D9R3

Protein Details
Accession A1D9R3    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-64PVGPHFLAHARRKRHHRTFSEDERIQBasic
113-139RATPEQIKRAHRKKVLRHHPDKKAALGBasic
254-273QKRHVEKKNANARRKRKTEDBasic
342-361REKNKKAKEAAKNAAKKNKRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
119-135IKRAHRKKVLRHHPDKK
255-270KRHVEKKNANARRKRK
291-364IKKFRQQARAGKDKKRLEKEAEAKRLAEEKEKARLEEEQRKKEAEEAAKAEREKNKKAKEAAKNAAKKNKRILK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 13, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001623  DnaJ_domain  
IPR018253  DnaJ_domain_CS  
IPR036869  J_dom_sf  
IPR032003  RAC_head  
IPR042569  RAC_head_sf  
IPR044634  Zuotin/DnaJC2  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0015934  C:large ribosomal subunit  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0042788  C:polysomal ribosome  
GO:0015935  C:small ribosomal subunit  
GO:0030544  F:Hsp70 protein binding  
GO:0043022  F:ribosome binding  
GO:0051083  P:'de novo' cotranslational protein folding  
GO:0071409  P:cellular response to cycloheximide  
GO:0060548  P:negative regulation of cell death  
GO:0036003  P:positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress  
GO:0006450  P:regulation of translational fidelity  
GO:0000054  P:ribosomal subunit export from nucleus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
GO:0006452  P:translational frameshifting  
KEGG nfi:NFIA_029760  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00226  DnaJ  
PF16717  RAC_head  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00636  DNAJ_1  
PS50076  DNAJ_2  
CDD cd06257  DnaJ  
Amino Acid Sequences MASQVINVTLPALPQGWSAEKDFTAVGTLSATTQRNLEPVGPHFLAHARRKRHHRTFSEDERIQAQQNVKKTEDDDDDEISEPEDPMMLSRDAKDWKAQDHYAVLGLSKYRWRATPEQIKRAHRKKVLRHHPDKKAALGDRDENDNFFKCIQKAHELLTDPVKRRQFDSVDEAADVDPPSKKEVSKRGFYKAWGPVFEAEGRFSKVQPVPQLGDENSTQEEVETFYNFWYNFDSWRTFEYLDEDVPDDNENRDQKRHVEKKNANARRKRKTEDIARLRHLVDDCLAQDERIKKFRQQARAGKDKKRLEKEAEAKRLAEEKEKARLEEEQRKKEAEEAAKAEREKNKKAKEAAKNAAKKNKRILKGSVKDVNYFAESGEPSPAQVDSVLTDVDAIMAKIDSEELAALAERLTTAGKDAAAVKGVWTEEVKRLVDAGKLKDGEAKFFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.15
3 0.17
4 0.19
5 0.21
6 0.23
7 0.22
8 0.23
9 0.21
10 0.18
11 0.17
12 0.15
13 0.12
14 0.1
15 0.11
16 0.11
17 0.16
18 0.18
19 0.16
20 0.18
21 0.18
22 0.19
23 0.21
24 0.23
25 0.21
26 0.23
27 0.3
28 0.28
29 0.27
30 0.27
31 0.31
32 0.36
33 0.41
34 0.47
35 0.48
36 0.57
37 0.67
38 0.77
39 0.82
40 0.84
41 0.82
42 0.83
43 0.83
44 0.85
45 0.85
46 0.75
47 0.67
48 0.6
49 0.54
50 0.47
51 0.42
52 0.39
53 0.33
54 0.39
55 0.42
56 0.4
57 0.4
58 0.39
59 0.41
60 0.38
61 0.38
62 0.34
63 0.31
64 0.31
65 0.3
66 0.28
67 0.22
68 0.18
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.07
73 0.07
74 0.1
75 0.11
76 0.11
77 0.12
78 0.18
79 0.2
80 0.22
81 0.27
82 0.26
83 0.29
84 0.34
85 0.33
86 0.31
87 0.29
88 0.29
89 0.24
90 0.22
91 0.18
92 0.13
93 0.13
94 0.13
95 0.15
96 0.17
97 0.17
98 0.2
99 0.26
100 0.31
101 0.41
102 0.5
103 0.55
104 0.61
105 0.67
106 0.73
107 0.78
108 0.79
109 0.79
110 0.76
111 0.77
112 0.77
113 0.81
114 0.83
115 0.83
116 0.86
117 0.86
118 0.87
119 0.88
120 0.8
121 0.72
122 0.69
123 0.61
124 0.55
125 0.48
126 0.43
127 0.36
128 0.39
129 0.35
130 0.29
131 0.28
132 0.25
133 0.23
134 0.19
135 0.2
136 0.16
137 0.19
138 0.2
139 0.23
140 0.23
141 0.25
142 0.28
143 0.26
144 0.28
145 0.33
146 0.36
147 0.33
148 0.39
149 0.41
150 0.37
151 0.37
152 0.42
153 0.36
154 0.33
155 0.38
156 0.34
157 0.3
158 0.29
159 0.28
160 0.21
161 0.2
162 0.17
163 0.11
164 0.09
165 0.09
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.19
170 0.29
171 0.33
172 0.4
173 0.43
174 0.46
175 0.47
176 0.47
177 0.48
178 0.45
179 0.42
180 0.35
181 0.33
182 0.28
183 0.28
184 0.28
185 0.21
186 0.16
187 0.14
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.18
192 0.18
193 0.2
194 0.22
195 0.23
196 0.22
197 0.23
198 0.25
199 0.19
200 0.2
201 0.17
202 0.16
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.08
207 0.08
208 0.07
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.11
217 0.11
218 0.11
219 0.14
220 0.15
221 0.14
222 0.15
223 0.17
224 0.14
225 0.14
226 0.16
227 0.15
228 0.13
229 0.13
230 0.12
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.08
235 0.08
236 0.12
237 0.16
238 0.17
239 0.19
240 0.2
241 0.26
242 0.36
243 0.44
244 0.46
245 0.53
246 0.57
247 0.65
248 0.74
249 0.77
250 0.75
251 0.76
252 0.79
253 0.78
254 0.8
255 0.76
256 0.73
257 0.72
258 0.73
259 0.74
260 0.75
261 0.71
262 0.67
263 0.64
264 0.57
265 0.51
266 0.42
267 0.31
268 0.23
269 0.18
270 0.15
271 0.16
272 0.15
273 0.12
274 0.15
275 0.2
276 0.23
277 0.27
278 0.29
279 0.3
280 0.4
281 0.46
282 0.52
283 0.57
284 0.61
285 0.64
286 0.73
287 0.75
288 0.74
289 0.77
290 0.75
291 0.75
292 0.74
293 0.72
294 0.68
295 0.7
296 0.72
297 0.72
298 0.72
299 0.64
300 0.56
301 0.52
302 0.51
303 0.43
304 0.4
305 0.36
306 0.32
307 0.39
308 0.4
309 0.39
310 0.35
311 0.4
312 0.42
313 0.48
314 0.53
315 0.52
316 0.53
317 0.54
318 0.53
319 0.5
320 0.49
321 0.44
322 0.4
323 0.37
324 0.39
325 0.42
326 0.42
327 0.44
328 0.45
329 0.46
330 0.5
331 0.55
332 0.58
333 0.61
334 0.68
335 0.72
336 0.74
337 0.77
338 0.78
339 0.78
340 0.79
341 0.79
342 0.81
343 0.78
344 0.74
345 0.74
346 0.73
347 0.7
348 0.67
349 0.69
350 0.7
351 0.7
352 0.73
353 0.71
354 0.64
355 0.59
356 0.55
357 0.49
358 0.39
359 0.32
360 0.23
361 0.19
362 0.18
363 0.16
364 0.18
365 0.15
366 0.14
367 0.15
368 0.15
369 0.11
370 0.11
371 0.1
372 0.08
373 0.09
374 0.09
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.08
379 0.07
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.06
384 0.06
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.06
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.06
395 0.05
396 0.06
397 0.07
398 0.06
399 0.08
400 0.1
401 0.09
402 0.11
403 0.13
404 0.14
405 0.15
406 0.15
407 0.14
408 0.15
409 0.16
410 0.16
411 0.17
412 0.18
413 0.22
414 0.28
415 0.28
416 0.25
417 0.27
418 0.26
419 0.3
420 0.33
421 0.32
422 0.34
423 0.34
424 0.35
425 0.41
426 0.4