FuNGI

A1CWS5

Protein Details

Accession

A1CWS5

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
110-135	DTKTWLLQAKKRQKKIEKERALKLAQ	Hydrophilic
282-307	DVSEIKIKKPKKKKVKATRQRPVDED	Basic
354-374	SLTRQRRAAFKKRQKVRPEDI	Hydrophilic
620-643	KGSGRMKTEKRLKKIEEEKKREAM	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
72-88	AKRRREAKNAAIKKARD
119-128	KKRQKKIEKE
287-300	KIKKPKKKKVKATR
364-366	KKR
621-640	GSGRMKTEKRLKKIEEEKKR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13.333, mito_nucl 11.166, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR045347 HIND IPR005011 SNU66/SART1
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	nfi:NFIA_105650 -
Pfam	View protein in Pfam PF19252 HIND PF03343 SART-1

Amino Acid Sequences

MADALSIEQNNKIRVALGLKPLPVPDADATSGPVFKETREGSTSEEDAGSTLESRQALASENWKKLQEEAEAKRRREAKNAAIKKARDAAQRARMLEGSTLGESGDVDMDTKTWLLQAKKRQKKIEKERALKLAQELEERERAAEYSTADLAGLKVGHEVGEFEEGEEHVLTLKDTTIDENEEEGDELEDVNLREKEKVAERLELKKRKPVYDPTEENAGILAQYDEEIEGKKRKRFTLDAQGSTVEEREAKRQEVSDRLKQNLVSLDLGAIESTPVSDYMDVSEIKIKKPKKKKVKATRQRPVDEDDIFPTTESTQNGAMEVDASNGVPVPAPRKWESSENVSFVDDDDLQASLTRQRRAAFKKRQKVRPEDIARQLREESQTPMDAENEEAEEPGLVIDETSEFVSNLQKPILPERRERRRTTTPAESVKEESVERIKEEPADDDADVDMERSYNDIEDEEDLKERIKREDSQLQQISGTGLEEETTLDQGLGATLNMLKQRGLVKPSDAVEHNALLRARQRFLHEKTHLETEAEKRARQQRERDRASGKLDRMSAREREEYARWENKQRDQQDARHMAEVFNKEYKPDVQLKYVDEFGRLMNQKEAFKHLSHQFHGKGSGRMKTEKRLKKIEEEKKREAMSALDSSQHTGMNNAMGATARKNRQAGVRLG

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.23
2	0.26
3	0.26
4	0.31
5	0.33
6	0.34
7	0.35
8	0.35
9	0.33
10	0.28
11	0.27
12	0.2
13	0.2
14	0.2
15	0.19
16	0.21
17	0.22
18	0.23
19	0.19
20	0.21
21	0.17
22	0.16
23	0.24
24	0.23
25	0.26
26	0.27
27	0.28
28	0.29
29	0.34
30	0.35
31	0.28
32	0.27
33	0.21
34	0.19
35	0.19
36	0.15
37	0.1
38	0.1
39	0.12
40	0.11
41	0.12
42	0.12
43	0.12
44	0.15
45	0.17
46	0.26
47	0.3
48	0.35
49	0.38
50	0.4
51	0.4
52	0.4
53	0.41
54	0.4
55	0.42
56	0.46
57	0.53
58	0.59
59	0.59
60	0.64
61	0.67
62	0.62
63	0.61
64	0.61
65	0.61
66	0.63
67	0.7
68	0.72
69	0.72
70	0.7
71	0.66
72	0.66
73	0.61
74	0.57
75	0.56
76	0.56
77	0.58
78	0.62
79	0.58
80	0.53
81	0.49
82	0.42
83	0.36
84	0.29
85	0.22
86	0.17
87	0.16
88	0.13
89	0.12
90	0.1
91	0.1
92	0.09
93	0.06
94	0.06
95	0.06
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.07
100	0.08
101	0.13
102	0.18
103	0.25
104	0.35
105	0.46
106	0.56
107	0.64
108	0.73
109	0.77
110	0.83
111	0.88
112	0.89
113	0.88
114	0.86
115	0.85
116	0.83
117	0.75
118	0.66
119	0.58
120	0.53
121	0.44
122	0.4
123	0.35
124	0.32
125	0.33
126	0.31
127	0.28
128	0.22
129	0.2
130	0.18
131	0.17
132	0.14
133	0.13
134	0.13
135	0.13
136	0.12
137	0.12
138	0.1
139	0.1
140	0.09
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.1
149	0.09
150	0.09
151	0.1
152	0.1
153	0.11
154	0.1
155	0.09
156	0.07
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.07
161	0.07
162	0.07
163	0.09
164	0.1
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.12
169	0.11
170	0.11
171	0.1
172	0.09
173	0.07
174	0.06
175	0.06
176	0.07
177	0.07
178	0.11
179	0.12
180	0.12
181	0.13
182	0.14
183	0.18
184	0.22
185	0.29
186	0.28
187	0.33
188	0.36
189	0.45
190	0.54
191	0.59
192	0.56
193	0.56
194	0.58
195	0.56
196	0.58
197	0.58
198	0.56
199	0.58
200	0.6
201	0.55
202	0.56
203	0.52
204	0.45
205	0.35
206	0.27
207	0.17
208	0.13
209	0.1
210	0.04
211	0.04
212	0.04
213	0.04
214	0.05
215	0.06
216	0.09
217	0.16
218	0.21
219	0.26
220	0.3
221	0.33
222	0.38
223	0.43
224	0.47
225	0.51
226	0.55
227	0.53
228	0.5
229	0.47
230	0.42
231	0.36
232	0.29
233	0.18
234	0.13
235	0.11
236	0.16
237	0.18
238	0.19
239	0.2
240	0.22
241	0.24
242	0.31
243	0.36
244	0.38
245	0.4
246	0.41
247	0.42
248	0.39
249	0.39
250	0.31
251	0.27
252	0.2
253	0.15
254	0.13
255	0.11
256	0.11
257	0.08
258	0.06
259	0.04
260	0.03
261	0.03
262	0.03
263	0.03
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.08
269	0.08
270	0.08
271	0.14
272	0.14
273	0.16
274	0.23
275	0.28
276	0.35
277	0.46
278	0.55
279	0.61
280	0.7
281	0.8
282	0.85
283	0.9
284	0.92
285	0.92
286	0.91
287	0.89
288	0.82
289	0.73
290	0.66
291	0.59
292	0.5
293	0.39
294	0.32
295	0.25
296	0.22
297	0.19
298	0.15
299	0.12
300	0.12
301	0.12
302	0.11
303	0.11
304	0.1
305	0.11
306	0.1
307	0.09
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.04
315	0.04
316	0.04
317	0.05
318	0.08
319	0.09
320	0.13
321	0.15
322	0.18
323	0.2
324	0.24
325	0.26
326	0.3
327	0.31
328	0.28
329	0.27
330	0.25
331	0.23
332	0.19
333	0.18
334	0.11
335	0.08
336	0.07
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.06
341	0.1
342	0.14
343	0.16
344	0.17
345	0.19
346	0.27
347	0.35
348	0.46
349	0.51
350	0.57
351	0.65
352	0.73
353	0.8
354	0.8
355	0.81
356	0.77
357	0.76
358	0.73
359	0.7
360	0.71
361	0.69
362	0.62
363	0.55
364	0.49
365	0.41
366	0.36
367	0.31
368	0.24
369	0.18
370	0.19
371	0.17
372	0.17
373	0.15
374	0.13
375	0.12
376	0.1
377	0.09
378	0.08
379	0.07
380	0.06
381	0.05
382	0.05
383	0.04
384	0.04
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.12
398	0.13
399	0.13
400	0.23
401	0.31
402	0.3
403	0.38
404	0.47
405	0.58
406	0.64
407	0.67
408	0.66
409	0.67
410	0.71
411	0.69
412	0.68
413	0.65
414	0.64
415	0.62
416	0.56
417	0.49
418	0.43
419	0.37
420	0.28
421	0.23
422	0.21
423	0.19
424	0.18
425	0.17
426	0.17
427	0.17
428	0.18
429	0.17
430	0.15
431	0.17
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.09
438	0.07
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.06
443	0.05
444	0.06
445	0.06
446	0.07
447	0.09
448	0.1
449	0.1
450	0.11
451	0.11
452	0.13
453	0.15
454	0.16
455	0.18
456	0.21
457	0.23
458	0.29
459	0.39
460	0.41
461	0.48
462	0.49
463	0.46
464	0.41
465	0.38
466	0.32
467	0.22
468	0.19
469	0.09
470	0.06
471	0.06
472	0.06
473	0.06
474	0.06
475	0.06
476	0.06
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.06
481	0.05
482	0.04
483	0.04
484	0.05
485	0.07
486	0.09
487	0.09
488	0.09
489	0.12
490	0.16
491	0.2
492	0.22
493	0.22
494	0.23
495	0.26
496	0.28
497	0.29
498	0.26
499	0.25
500	0.24
501	0.24
502	0.22
503	0.22
504	0.21
505	0.19
506	0.23
507	0.23
508	0.23
509	0.24
510	0.3
511	0.35
512	0.41
513	0.49
514	0.47
515	0.49
516	0.5
517	0.53
518	0.48
519	0.4
520	0.39
521	0.33
522	0.4
523	0.38
524	0.35
525	0.37
526	0.45
527	0.53
528	0.57
529	0.63
530	0.64
531	0.72
532	0.78
533	0.78
534	0.73
535	0.69
536	0.7
537	0.67
538	0.59
539	0.53
540	0.51
541	0.46
542	0.46
543	0.46
544	0.44
545	0.41
546	0.42
547	0.39
548	0.4
549	0.4
550	0.41
551	0.44
552	0.47
553	0.46
554	0.52
555	0.56
556	0.6
557	0.66
558	0.63
559	0.65
560	0.63
561	0.66
562	0.67
563	0.69
564	0.62
565	0.57
566	0.55
567	0.46
568	0.46
569	0.44
570	0.37
571	0.35
572	0.32
573	0.29
574	0.31
575	0.32
576	0.31
577	0.36
578	0.35
579	0.35
580	0.39
581	0.41
582	0.41
583	0.44
584	0.38
585	0.31
586	0.29
587	0.24
588	0.29
589	0.28
590	0.27
591	0.28
592	0.32
593	0.34
594	0.36
595	0.42
596	0.36
597	0.35
598	0.41
599	0.43
600	0.46
601	0.46
602	0.51
603	0.48
604	0.47
605	0.54
606	0.5
607	0.49
608	0.47
609	0.5
610	0.47
611	0.53
612	0.54
613	0.57
614	0.64
615	0.66
616	0.69
617	0.72
618	0.72
619	0.74
620	0.81
621	0.81
622	0.82
623	0.82
624	0.81
625	0.79
626	0.76
627	0.67
628	0.57
629	0.49
630	0.44
631	0.4
632	0.33
633	0.3
634	0.29
635	0.3
636	0.3
637	0.28
638	0.22
639	0.18
640	0.18
641	0.16
642	0.16
643	0.13
644	0.13
645	0.13
646	0.14
647	0.19
648	0.26
649	0.28
650	0.34
651	0.36
652	0.39
653	0.45

A1CWS5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer