FuNGI

A0A2X0PL52

Protein Details

Accession

A0A2X0PL52

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
155-183	DDEDSHRERDRPRKKKRRRRAGGNQFLDI	Basic
444-463	GSDGKKRKKGSGNVAFRPPQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
161-175	RERDRPRKKKRRRRA
448-452	KKRKK

Subcellular Location(s)

nucl 18.5, cyto_nucl 12, cyto 4.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR041973 KOW_Spt5_1 IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR039385 NGN_Euk IPR039659 SPT5 IPR022581 Spt5_N
Gene Ontology	GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N
CDD	cd06081 KOW_Spt5_1 cd09888 NGN_Euk

Amino Acid Sequences

MQSQHEEDKVSTSSLGDRQEAPKPVIDPIILDGDDADKVVGEATGDQTSTNQPRQPIVVDEEEEEEDEEGGQAMQSPKSDSVAPSLPKSAAKRTLTDVQDEADQDQDQDQDDDEDEQVAASRKKNARSREEEDDDSDDEDQDDDDEQDEDDDDDDDEDSHRERDRPRKKKRRRRAGGNQFLDIEADVDEDEDEEEDEGEEGFVANDDFIVNQRRAPRGGLLADGDDDDMGDLVEGEGDLDGDASHRLLDRRRMAKRDREAAELAASFRNRYGKSNYVGEGDAEWAPKALLMPGVNDPSIWGVKCKIGRERDLVMSISRKAAALAASDNAEPLEIISAMHRDSLKGFIYIEARSETAVRKACNGLLNIYINGINGLFLIDIEEMPDLLKTKQKKPEINVGAWVRIKRGKHAGDLAQIIDFAENDEELVLKFIPRIDLTPKEDTLGSDGKKRKKGSGNVAFRPPQNFFNPDEIVKIYGGKEVSRKPGKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.26
3	0.25
4	0.27
5	0.3
6	0.37
7	0.41
8	0.38
9	0.38
10	0.36
11	0.36
12	0.34
13	0.3
14	0.24
15	0.22
16	0.24
17	0.2
18	0.19
19	0.16
20	0.15
21	0.15
22	0.14
23	0.11
24	0.06
25	0.06
26	0.06
27	0.06
28	0.05
29	0.06
30	0.09
31	0.1
32	0.1
33	0.1
34	0.12
35	0.2
36	0.26
37	0.3
38	0.3
39	0.32
40	0.34
41	0.36
42	0.37
43	0.33
44	0.31
45	0.3
46	0.29
47	0.28
48	0.28
49	0.27
50	0.25
51	0.21
52	0.16
53	0.12
54	0.11
55	0.09
56	0.07
57	0.06
58	0.05
59	0.08
60	0.1
61	0.11
62	0.12
63	0.15
64	0.15
65	0.17
66	0.19
67	0.17
68	0.2
69	0.25
70	0.27
71	0.26
72	0.28
73	0.28
74	0.31
75	0.34
76	0.36
77	0.39
78	0.39
79	0.39
80	0.42
81	0.49
82	0.46
83	0.45
84	0.39
85	0.31
86	0.31
87	0.3
88	0.24
89	0.18
90	0.16
91	0.14
92	0.14
93	0.13
94	0.12
95	0.11
96	0.11
97	0.1
98	0.11
99	0.11
100	0.1
101	0.1
102	0.09
103	0.08
104	0.1
105	0.13
106	0.15
107	0.15
108	0.24
109	0.28
110	0.36
111	0.43
112	0.5
113	0.56
114	0.62
115	0.66
116	0.67
117	0.68
118	0.62
119	0.58
120	0.53
121	0.44
122	0.37
123	0.31
124	0.21
125	0.16
126	0.14
127	0.11
128	0.08
129	0.07
130	0.06
131	0.07
132	0.07
133	0.06
134	0.06
135	0.07
136	0.06
137	0.06
138	0.06
139	0.06
140	0.06
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.08
146	0.1
147	0.11
148	0.15
149	0.22
150	0.32
151	0.43
152	0.53
153	0.63
154	0.73
155	0.82
156	0.9
157	0.94
158	0.95
159	0.94
160	0.95
161	0.94
162	0.95
163	0.94
164	0.86
165	0.77
166	0.65
167	0.55
168	0.44
169	0.32
170	0.21
171	0.11
172	0.07
173	0.05
174	0.05
175	0.04
176	0.04
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.04
185	0.04
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.03
195	0.05
196	0.09
197	0.09
198	0.12
199	0.16
200	0.17
201	0.18
202	0.19
203	0.19
204	0.18
205	0.19
206	0.17
207	0.14
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.09
212	0.06
213	0.05
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.02
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.02
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.02
227	0.02
228	0.03
229	0.03
230	0.03
231	0.04
232	0.05
233	0.06
234	0.09
235	0.16
236	0.22
237	0.3
238	0.35
239	0.42
240	0.47
241	0.54
242	0.58
243	0.61
244	0.56
245	0.51
246	0.48
247	0.42
248	0.37
249	0.28
250	0.23
251	0.17
252	0.15
253	0.12
254	0.12
255	0.16
256	0.16
257	0.19
258	0.23
259	0.25
260	0.28
261	0.31
262	0.3
263	0.27
264	0.26
265	0.23
266	0.19
267	0.16
268	0.13
269	0.11
270	0.09
271	0.08
272	0.07
273	0.07
274	0.07
275	0.05
276	0.07
277	0.06
278	0.08
279	0.1
280	0.12
281	0.12
282	0.11
283	0.11
284	0.11
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.1
289	0.14
290	0.17
291	0.2
292	0.26
293	0.29
294	0.33
295	0.36
296	0.38
297	0.37
298	0.36
299	0.33
300	0.28
301	0.26
302	0.23
303	0.2
304	0.17
305	0.14
306	0.12
307	0.12
308	0.11
309	0.09
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.08
316	0.08
317	0.06
318	0.05
319	0.05
320	0.04
321	0.04
322	0.05
323	0.06
324	0.07
325	0.09
326	0.09
327	0.09
328	0.1
329	0.13
330	0.14
331	0.13
332	0.14
333	0.14
334	0.16
335	0.16
336	0.16
337	0.14
338	0.13
339	0.13
340	0.15
341	0.14
342	0.18
343	0.21
344	0.2
345	0.22
346	0.23
347	0.26
348	0.28
349	0.28
350	0.23
351	0.23
352	0.24
353	0.22
354	0.21
355	0.18
356	0.14
357	0.13
358	0.11
359	0.07
360	0.05
361	0.06
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.06
366	0.05
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.07
372	0.07
373	0.08
374	0.14
375	0.19
376	0.27
377	0.37
378	0.45
379	0.52
380	0.56
381	0.65
382	0.66
383	0.63
384	0.63
385	0.57
386	0.54
387	0.51
388	0.46
389	0.4
390	0.38
391	0.37
392	0.36
393	0.42
394	0.39
395	0.41
396	0.47
397	0.47
398	0.47
399	0.48
400	0.42
401	0.33
402	0.29
403	0.24
404	0.18
405	0.13
406	0.09
407	0.08
408	0.07
409	0.06
410	0.06
411	0.07
412	0.06
413	0.08
414	0.07
415	0.07
416	0.08
417	0.09
418	0.13
419	0.13
420	0.16
421	0.21
422	0.28
423	0.34
424	0.38
425	0.37
426	0.36
427	0.36
428	0.34
429	0.33
430	0.33
431	0.29
432	0.32
433	0.4
434	0.47
435	0.54
436	0.57
437	0.6
438	0.63
439	0.71
440	0.73
441	0.76
442	0.77
443	0.76
444	0.82
445	0.77
446	0.71
447	0.67
448	0.59
449	0.54
450	0.5
451	0.47
452	0.42
453	0.44
454	0.44
455	0.39
456	0.39
457	0.34
458	0.3
459	0.27
460	0.26
461	0.2
462	0.2
463	0.21
464	0.21
465	0.27
466	0.31
467	0.41

A0A2X0PL52

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer