FuNGI

A0A2X0NJC2

Protein Details

Accession

A0A2X0NJC2

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
448-467	LRTIKTQKLRQTPRHIRMCL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 18, cyto 5.5, cyto_nucl 5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR000477 RT_dom IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MMLSVPFLRTRMLVGWGVFTVARRALRSVAKALTNHWPRAAQPLLDVVDDPALEDLSESEARTRLAALLEKYSDVFVDSLPMDRLPPYRPVNHEIPLIDPNEKWAEHSAKYTRGRFWVSGPIDSAAPVFAIPKKNSQTARFVIDLRARNSNTAKRFSPIPDMTSVRYEVARSRYRSKFDVAAAFEQVRVIPEHVDRTGFATVTGTYTSRVMQFGDTNAPNTLNLLTSAMFQPCLSFAKIFFDDVHVHSDTRRAHLRHIEILLMTLRHYRFYLGSNKSEWFSKSLDSLGAIISDDGIEVDPAKWERIRQWPTPHNKTDVQRFLGTVNWMRDHLPHLSITLEPITALLAQSTSWRWNEHEQQAFDTVKSLVPATLRPIDGAKVTSASTRFTCSPMPVAVPTRFFSAKFNGAQLNYHVTDKEFLAVVSACRAFEQHLIGYPFVIVTDHQALRTIKTQKLRQTPRHIRMCLELSRFDFEFEFIAGKNNSLADSLSRLWEVKEGSPEDQVKENELEDMFFDGERHGFTTHGESLPEERPYTSPSPDRLPPVDFAFGPQRDDCEAGSPGYYALKDESQDEDVNGRDLGNLFLKEECHEFTTPGSPGSHRLAENIMDTVDSSTGPLSPPIAVNRVQAIAAAPANDAPIPVDADADELDLLGAAADEVNDAPVVHRPPDPLPQPFLDAVIRAYAHDSQAQVIVDDPLSWPMFRVTEEGRILRVHPDESLSLFVPRGLATGVVDSDKVPSLRELVLAEIHRSVGHAGHRITLAAIRPLYWWSSMSADCAKFCHSCEDCARGKASTQVPYGRLHPMPIPSGPWEQVAIDFMTGLPPVEFEGMMVAQIMVVTDTWGKMVHLIPLPADADSELVADRYYATIFRLHGTPSAIVSDRDPKFTSQFWRALQAKVGTVLRMSTAAHPETDGSSENRIKMVTQTLRIMVSSNHEAWASRLVEAEFALNSSVAVSTSLSAFEATYGYLPRRWPTDSWSVSDVPRAEAFARIRQLRNLDVTDAIIGARLDQTHQANKHRRPDDPAFRTGSYVYLSTKNLAVPEGMKSKLLPRYIGPFRIRAAIPATSSYDLELPPAMSRVHILFVEDVADAADNSAIPERIVRDRRNARGNRSFLVRWIGRKDIDDTWMSEQSLRFDHPSYSTPTLRNSIARIAACPPVDFLLGGTMSGKQRYTDSNTRRKSLR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.21
2	0.22
3	0.21
4	0.22
5	0.2
6	0.18
7	0.18
8	0.19
9	0.21
10	0.21
11	0.23
12	0.27
13	0.33
14	0.36
15	0.39
16	0.39
17	0.41
18	0.4
19	0.42
20	0.47
21	0.48
22	0.47
23	0.44
24	0.41
25	0.37
26	0.44
27	0.44
28	0.34
29	0.28
30	0.31
31	0.3
32	0.28
33	0.28
34	0.2
35	0.19
36	0.17
37	0.16
38	0.11
39	0.09
40	0.09
41	0.08
42	0.08
43	0.11
44	0.12
45	0.12
46	0.14
47	0.15
48	0.16
49	0.16
50	0.17
51	0.14
52	0.16
53	0.21
54	0.21
55	0.24
56	0.25
57	0.25
58	0.25
59	0.23
60	0.2
61	0.16
62	0.15
63	0.09
64	0.12
65	0.12
66	0.13
67	0.14
68	0.14
69	0.14
70	0.17
71	0.2
72	0.19
73	0.27
74	0.31
75	0.36
76	0.41
77	0.47
78	0.49
79	0.5
80	0.51
81	0.43
82	0.41
83	0.39
84	0.36
85	0.31
86	0.26
87	0.27
88	0.27
89	0.27
90	0.25
91	0.28
92	0.3
93	0.3
94	0.37
95	0.38
96	0.42
97	0.5
98	0.52
99	0.5
100	0.51
101	0.55
102	0.49
103	0.47
104	0.48
105	0.43
106	0.41
107	0.38
108	0.34
109	0.29
110	0.27
111	0.24
112	0.14
113	0.11
114	0.09
115	0.09
116	0.13
117	0.2
118	0.22
119	0.3
120	0.35
121	0.42
122	0.48
123	0.5
124	0.53
125	0.49
126	0.52
127	0.47
128	0.44
129	0.43
130	0.45
131	0.47
132	0.42
133	0.46
134	0.42
135	0.45
136	0.51
137	0.52
138	0.51
139	0.5
140	0.49
141	0.43
142	0.47
143	0.45
144	0.48
145	0.42
146	0.39
147	0.4
148	0.41
149	0.4
150	0.39
151	0.37
152	0.28
153	0.26
154	0.25
155	0.24
156	0.3
157	0.35
158	0.37
159	0.45
160	0.5
161	0.54
162	0.56
163	0.55
164	0.51
165	0.48
166	0.5
167	0.45
168	0.41
169	0.39
170	0.36
171	0.32
172	0.27
173	0.23
174	0.17
175	0.15
176	0.13
177	0.13
178	0.14
179	0.18
180	0.19
181	0.19
182	0.18
183	0.2
184	0.21
185	0.18
186	0.16
187	0.13
188	0.13
189	0.13
190	0.14
191	0.11
192	0.1
193	0.11
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.13
198	0.14
199	0.15
200	0.16
201	0.23
202	0.22
203	0.22
204	0.23
205	0.22
206	0.2
207	0.2
208	0.18
209	0.11
210	0.11
211	0.1
212	0.09
213	0.1
214	0.13
215	0.12
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.12
220	0.14
221	0.14
222	0.13
223	0.13
224	0.19
225	0.2
226	0.2
227	0.19
228	0.2
229	0.21
230	0.22
231	0.26
232	0.21
233	0.2
234	0.19
235	0.25
236	0.23
237	0.26
238	0.32
239	0.29
240	0.34
241	0.41
242	0.45
243	0.44
244	0.43
245	0.39
246	0.31
247	0.31
248	0.27
249	0.2
250	0.17
251	0.17
252	0.16
253	0.16
254	0.17
255	0.17
256	0.16
257	0.21
258	0.29
259	0.29
260	0.32
261	0.33
262	0.34
263	0.34
264	0.35
265	0.32
266	0.25
267	0.22
268	0.2
269	0.19
270	0.18
271	0.18
272	0.15
273	0.14
274	0.12
275	0.1
276	0.09
277	0.07
278	0.06
279	0.05
280	0.05
281	0.04
282	0.04
283	0.04
284	0.05
285	0.05
286	0.08
287	0.09
288	0.11
289	0.12
290	0.14
291	0.2
292	0.29
293	0.35
294	0.39
295	0.48
296	0.55
297	0.64
298	0.71
299	0.69
300	0.64
301	0.65
302	0.64
303	0.64
304	0.61
305	0.55
306	0.47
307	0.44
308	0.4
309	0.36
310	0.34
311	0.29
312	0.25
313	0.22
314	0.22
315	0.22
316	0.23
317	0.23
318	0.22
319	0.18
320	0.15
321	0.15
322	0.15
323	0.14
324	0.14
325	0.12
326	0.1
327	0.08
328	0.08
329	0.08
330	0.07
331	0.07
332	0.05
333	0.04
334	0.05
335	0.07
336	0.08
337	0.11
338	0.12
339	0.14
340	0.17
341	0.24
342	0.31
343	0.37
344	0.42
345	0.4
346	0.41
347	0.44
348	0.41
349	0.34
350	0.28
351	0.21
352	0.15
353	0.15
354	0.13
355	0.1
356	0.1
357	0.11
358	0.14
359	0.16
360	0.16
361	0.16
362	0.17
363	0.16
364	0.17
365	0.17
366	0.13
367	0.1
368	0.11
369	0.13
370	0.13
371	0.14
372	0.14
373	0.17
374	0.17
375	0.18
376	0.19
377	0.18
378	0.19
379	0.18
380	0.19
381	0.17
382	0.21
383	0.21
384	0.22
385	0.22
386	0.23
387	0.23
388	0.22
389	0.22
390	0.22
391	0.25
392	0.23
393	0.24
394	0.24
395	0.23
396	0.24
397	0.22
398	0.23
399	0.19
400	0.19
401	0.17
402	0.15
403	0.16
404	0.15
405	0.14
406	0.09
407	0.08
408	0.09
409	0.09
410	0.08
411	0.1
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.09
416	0.09
417	0.11
418	0.13
419	0.1
420	0.14
421	0.16
422	0.16
423	0.15
424	0.14
425	0.12
426	0.1
427	0.09
428	0.05
429	0.07
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.17
434	0.17
435	0.19
436	0.26
437	0.28
438	0.27
439	0.33
440	0.39
441	0.42
442	0.52
443	0.6
444	0.62
445	0.68
446	0.75
447	0.77
448	0.81
449	0.74
450	0.65
451	0.6
452	0.56
453	0.5
454	0.42
455	0.35
456	0.28
457	0.3
458	0.28
459	0.25
460	0.2
461	0.15
462	0.13
463	0.11
464	0.1
465	0.07
466	0.11
467	0.1
468	0.1
469	0.1
470	0.09
471	0.09
472	0.09
473	0.09
474	0.06
475	0.09
476	0.09
477	0.1
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.12
482	0.13
483	0.12
484	0.16
485	0.17
486	0.17
487	0.22
488	0.22
489	0.21
490	0.24
491	0.23
492	0.21
493	0.2
494	0.19
495	0.16
496	0.14
497	0.13
498	0.09
499	0.1
500	0.08
501	0.07
502	0.07
503	0.06
504	0.06
505	0.06
506	0.07
507	0.06
508	0.06
509	0.07
510	0.11
511	0.12
512	0.13
513	0.13
514	0.12
515	0.15
516	0.17
517	0.18
518	0.15
519	0.14
520	0.14
521	0.18
522	0.2
523	0.19
524	0.2
525	0.21
526	0.25
527	0.26
528	0.29
529	0.26
530	0.26
531	0.24
532	0.23
533	0.22
534	0.18
535	0.18
536	0.21
537	0.2
538	0.2
539	0.18
540	0.17
541	0.17
542	0.18
543	0.16
544	0.12
545	0.13
546	0.11
547	0.11
548	0.1
549	0.09
550	0.09
551	0.09
552	0.06
553	0.06
554	0.07
555	0.07
556	0.08
557	0.1
558	0.12
559	0.12
560	0.12
561	0.12
562	0.11
563	0.12
564	0.1
565	0.09
566	0.06
567	0.07
568	0.07
569	0.08
570	0.08
571	0.08
572	0.08
573	0.09
574	0.09
575	0.1
576	0.1
577	0.11
578	0.11
579	0.11
580	0.11
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.1
586	0.13
587	0.15
588	0.17
589	0.15
590	0.15
591	0.15
592	0.15
593	0.15
594	0.13
595	0.1
596	0.07
597	0.07
598	0.07
599	0.06
600	0.05
601	0.04
602	0.04
603	0.05
604	0.05
605	0.05
606	0.05
607	0.05
608	0.07
609	0.08
610	0.1
611	0.1
612	0.11
613	0.12
614	0.11
615	0.11
616	0.1
617	0.09
618	0.08
619	0.07
620	0.07
621	0.06
622	0.06
623	0.06
624	0.06
625	0.06
626	0.05
627	0.05
628	0.05
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.05
633	0.05
634	0.05
635	0.04
636	0.04
637	0.03
638	0.03
639	0.03
640	0.02
641	0.02
642	0.02
643	0.02
644	0.02
645	0.02
646	0.02
647	0.03
648	0.03
649	0.03
650	0.03
651	0.07
652	0.08
653	0.09
654	0.11
655	0.13
656	0.15
657	0.21
658	0.25
659	0.23
660	0.25
661	0.24
662	0.26
663	0.24
664	0.23
665	0.17
666	0.14
667	0.12
668	0.11
669	0.1
670	0.08
671	0.09
672	0.09
673	0.09
674	0.11
675	0.1
676	0.1
677	0.12
678	0.11
679	0.09
680	0.09
681	0.09
682	0.07
683	0.07
684	0.07
685	0.07
686	0.08
687	0.08
688	0.08
689	0.08
690	0.09
691	0.09
692	0.11
693	0.11
694	0.16
695	0.18
696	0.18
697	0.19
698	0.19
699	0.19
700	0.2
701	0.19
702	0.14
703	0.12
704	0.14
705	0.13
706	0.13
707	0.14
708	0.11
709	0.11
710	0.1
711	0.1
712	0.09
713	0.08
714	0.08
715	0.06
716	0.05
717	0.05
718	0.06
719	0.06
720	0.06
721	0.06
722	0.06
723	0.07
724	0.08
725	0.08
726	0.08
727	0.08
728	0.1
729	0.1
730	0.11
731	0.1
732	0.1
733	0.13
734	0.13
735	0.13
736	0.11
737	0.11
738	0.1
739	0.1
740	0.1
741	0.09
742	0.11
743	0.14
744	0.14
745	0.15
746	0.16
747	0.15
748	0.15
749	0.15
750	0.13
751	0.12
752	0.12
753	0.11
754	0.12
755	0.13
756	0.14
757	0.12
758	0.12
759	0.1
760	0.13
761	0.12
762	0.15
763	0.18
764	0.18
765	0.18
766	0.18
767	0.2
768	0.18
769	0.19
770	0.25
771	0.21
772	0.24
773	0.27
774	0.33
775	0.32
776	0.33
777	0.34
778	0.25
779	0.25
780	0.27
781	0.29
782	0.27
783	0.28
784	0.29
785	0.3
786	0.31
787	0.33
788	0.32
789	0.28
790	0.24
791	0.24
792	0.22
793	0.23
794	0.21
795	0.21
796	0.19
797	0.22
798	0.21
799	0.19
800	0.17
801	0.15
802	0.15
803	0.14
804	0.11
805	0.08
806	0.07
807	0.07
808	0.07
809	0.06
810	0.06
811	0.05
812	0.04
813	0.05
814	0.06
815	0.06
816	0.05
817	0.06
818	0.06
819	0.06
820	0.06
821	0.05
822	0.04
823	0.04
824	0.04
825	0.03
826	0.03
827	0.04
828	0.04
829	0.05
830	0.05
831	0.06
832	0.06
833	0.08
834	0.09
835	0.12
836	0.14
837	0.14
838	0.14
839	0.15
840	0.16
841	0.13
842	0.13
843	0.08
844	0.07
845	0.07
846	0.07
847	0.06
848	0.05
849	0.05
850	0.05
851	0.05
852	0.05
853	0.06
854	0.06
855	0.07
856	0.09
857	0.1
858	0.12
859	0.13
860	0.13
861	0.15
862	0.17
863	0.16
864	0.14
865	0.16
866	0.16
867	0.15
868	0.16
869	0.24
870	0.22
871	0.26
872	0.26
873	0.25
874	0.27
875	0.31
876	0.35
877	0.32
878	0.37
879	0.34
880	0.42
881	0.42
882	0.41
883	0.41
884	0.37
885	0.31
886	0.3
887	0.29
888	0.2
889	0.18
890	0.17
891	0.13
892	0.12
893	0.13
894	0.12
895	0.15
896	0.16
897	0.16
898	0.16
899	0.16
900	0.16
901	0.16
902	0.15
903	0.13
904	0.18
905	0.21
906	0.21
907	0.21
908	0.21
909	0.2
910	0.2
911	0.27
912	0.25
913	0.26
914	0.27
915	0.28
916	0.28
917	0.28
918	0.26
919	0.19
920	0.2
921	0.21
922	0.19
923	0.19
924	0.18
925	0.19
926	0.19
927	0.24
928	0.2
929	0.16
930	0.17
931	0.16
932	0.16
933	0.16
934	0.16
935	0.09
936	0.09
937	0.09
938	0.07
939	0.07
940	0.06
941	0.06
942	0.05
943	0.06
944	0.06
945	0.06
946	0.06
947	0.07
948	0.07
949	0.07
950	0.07
951	0.06
952	0.07
953	0.06
954	0.08
955	0.09
956	0.11
957	0.14
958	0.16
959	0.18
960	0.22
961	0.24
962	0.24
963	0.28
964	0.37
965	0.37
966	0.38
967	0.4
968	0.38
969	0.36
970	0.39
971	0.34
972	0.26
973	0.24
974	0.22
975	0.19
976	0.23
977	0.25
978	0.26
979	0.33
980	0.35
981	0.37
982	0.4
983	0.43
984	0.4
985	0.42
986	0.38
987	0.32
988	0.28
989	0.26
990	0.22
991	0.19
992	0.15
993	0.11
994	0.09
995	0.08
996	0.09
997	0.08
998	0.09
999	0.14
1000	0.19
1001	0.25
1002	0.31
1003	0.4
1004	0.49
1005	0.56
1006	0.65
1007	0.64
1008	0.64
1009	0.65
1010	0.7
1011	0.71
1012	0.67
1013	0.65
1014	0.6
1015	0.57
1016	0.55
1017	0.47
1018	0.38
1019	0.29
1020	0.24
1021	0.21
1022	0.2
1023	0.21
1024	0.21
1025	0.22
1026	0.21
1027	0.2
1028	0.19
1029	0.17
1030	0.15
1031	0.19
1032	0.22
1033	0.21
1034	0.21
1035	0.21
1036	0.27
1037	0.32
1038	0.33
1039	0.29
1040	0.28
1041	0.36
1042	0.42
1043	0.5
1044	0.46
1045	0.43
1046	0.42
1047	0.46
1048	0.43
1049	0.37
1050	0.35
1051	0.29
1052	0.28
1053	0.27
1054	0.29
1055	0.25
1056	0.25
1057	0.23
1058	0.21
1059	0.18
1060	0.18
1061	0.16
1062	0.13
1063	0.12
1064	0.14
1065	0.13
1066	0.11
1067	0.13
1068	0.13
1069	0.15
1070	0.14
1071	0.15
1072	0.13
1073	0.14
1074	0.15
1075	0.12
1076	0.11
1077	0.09
1078	0.09
1079	0.07
1080	0.07
1081	0.07
1082	0.05
1083	0.07
1084	0.09
1085	0.09
1086	0.09
1087	0.11
1088	0.15
1089	0.24
1090	0.33
1091	0.35
1092	0.44
1093	0.53
1094	0.61
1095	0.69
1096	0.73
1097	0.73
1098	0.75
1099	0.76
1100	0.69
1101	0.67
1102	0.6
1103	0.53
1104	0.55
1105	0.49
1106	0.46
1107	0.47
1108	0.48
1109	0.43
1110	0.45
1111	0.46
1112	0.4
1113	0.4
1114	0.36
1115	0.34
1116	0.34
1117	0.35
1118	0.33
1119	0.32
1120	0.3
1121	0.29
1122	0.3
1123	0.29
1124	0.26
1125	0.24
1126	0.26
1127	0.27
1128	0.29
1129	0.33
1130	0.36
1131	0.38
1132	0.38
1133	0.41
1134	0.43
1135	0.43
1136	0.43
1137	0.38
1138	0.38
1139	0.39
1140	0.37
1141	0.34
1142	0.33
1143	0.36
1144	0.33
1145	0.31
1146	0.26
1147	0.22
1148	0.22
1149	0.19
1150	0.17
1151	0.15
1152	0.14
1153	0.14
1154	0.13
1155	0.16
1156	0.18
1157	0.21
1158	0.21
1159	0.18
1160	0.21
1161	0.27
1162	0.36
1163	0.42
1164	0.49
1165	0.57
1166	0.63

A0A2X0NJC2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer