Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2X0P533

Protein Details
Accession A0A2X0P533    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
438-478VGRVQEERKEKTQKKDKKEKKKKKDKEEGSKKEKKKRKKEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-478RKEKTQKKDKKEKKKKKDKEEGSKKEKKKRKKEE
Subcellular Location(s) nucl 12, mito 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MPSHTPSSLHLKHHPTSPAKPEQQPNGTGTASSASTSSDEFIRFAATMRLPLAPVWSADGAAGGEMGSGGIEGVRQVLAGWVMRYLPPLQCVLLTFSPTPTFVHPTSTFPSHASPFPPVSSSTRSGLTLTSRENSNKENDPKPTKNPDEQDEQEEEDKVKFKVLPMISGTGFGLPIVHFTGVGWRPRVGQKIVGSPTLSTPSHVSLLLHNLFNATLPASHIPSDEWRFDPDYVVPAFIRERQKMAFPTTSATKTANEEAEEAERTEEGIEADAEGGEEKEEELAQEEEARLAMEEDEMYADRGWWVNVRTGEPMGGEKGSVEFTIVSLTIANSMITVTGSLLSSPFSSKVPPQNPIIATYRSGLSNAADVMRRHTTEEHNRKRKEMAKELGEDDDESQSESESESESESEAKDGRRGERAVSMSPVDQVPRVKEEGVVGRVQEERKEKTQKKDKKEKKKKKDKEEGSKKEKKKRKKEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.59
3 0.61
4 0.64
5 0.66
6 0.66
7 0.71
8 0.72
9 0.73
10 0.72
11 0.68
12 0.62
13 0.56
14 0.48
15 0.4
16 0.33
17 0.26
18 0.2
19 0.16
20 0.14
21 0.11
22 0.12
23 0.12
24 0.13
25 0.13
26 0.13
27 0.13
28 0.14
29 0.14
30 0.13
31 0.14
32 0.18
33 0.16
34 0.17
35 0.19
36 0.19
37 0.18
38 0.18
39 0.2
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.14
44 0.13
45 0.13
46 0.13
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.05
51 0.04
52 0.04
53 0.04
54 0.03
55 0.03
56 0.03
57 0.03
58 0.03
59 0.03
60 0.04
61 0.04
62 0.04
63 0.04
64 0.05
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.15
75 0.16
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.2
80 0.18
81 0.2
82 0.19
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.21
87 0.18
88 0.22
89 0.19
90 0.26
91 0.25
92 0.28
93 0.32
94 0.33
95 0.32
96 0.28
97 0.31
98 0.27
99 0.28
100 0.26
101 0.25
102 0.24
103 0.24
104 0.23
105 0.22
106 0.24
107 0.27
108 0.28
109 0.26
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.24
114 0.23
115 0.21
116 0.2
117 0.21
118 0.23
119 0.25
120 0.27
121 0.28
122 0.3
123 0.34
124 0.38
125 0.41
126 0.46
127 0.53
128 0.55
129 0.6
130 0.64
131 0.62
132 0.63
133 0.62
134 0.58
135 0.57
136 0.54
137 0.51
138 0.44
139 0.41
140 0.34
141 0.31
142 0.27
143 0.21
144 0.21
145 0.16
146 0.16
147 0.14
148 0.14
149 0.2
150 0.2
151 0.21
152 0.21
153 0.23
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.13
158 0.13
159 0.09
160 0.08
161 0.05
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.06
167 0.13
168 0.16
169 0.19
170 0.19
171 0.18
172 0.21
173 0.25
174 0.29
175 0.24
176 0.25
177 0.25
178 0.31
179 0.32
180 0.31
181 0.28
182 0.24
183 0.24
184 0.24
185 0.21
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.1
193 0.16
194 0.17
195 0.15
196 0.14
197 0.13
198 0.12
199 0.12
200 0.11
201 0.06
202 0.04
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.08
207 0.08
208 0.09
209 0.13
210 0.15
211 0.16
212 0.16
213 0.17
214 0.18
215 0.18
216 0.19
217 0.15
218 0.15
219 0.13
220 0.13
221 0.11
222 0.1
223 0.11
224 0.16
225 0.2
226 0.18
227 0.19
228 0.19
229 0.23
230 0.24
231 0.27
232 0.23
233 0.18
234 0.2
235 0.21
236 0.22
237 0.2
238 0.19
239 0.16
240 0.17
241 0.18
242 0.17
243 0.14
244 0.14
245 0.13
246 0.14
247 0.13
248 0.11
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.04
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.07
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.05
284 0.05
285 0.06
286 0.06
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.09
293 0.13
294 0.15
295 0.16
296 0.17
297 0.17
298 0.17
299 0.15
300 0.15
301 0.12
302 0.11
303 0.09
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.08
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.05
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.08
332 0.09
333 0.09
334 0.11
335 0.16
336 0.25
337 0.29
338 0.31
339 0.33
340 0.38
341 0.38
342 0.4
343 0.4
344 0.32
345 0.29
346 0.27
347 0.26
348 0.2
349 0.2
350 0.16
351 0.13
352 0.12
353 0.11
354 0.12
355 0.14
356 0.14
357 0.19
358 0.22
359 0.22
360 0.23
361 0.26
362 0.33
363 0.41
364 0.52
365 0.58
366 0.64
367 0.66
368 0.67
369 0.71
370 0.7
371 0.68
372 0.67
373 0.64
374 0.61
375 0.62
376 0.61
377 0.55
378 0.48
379 0.4
380 0.31
381 0.25
382 0.18
383 0.15
384 0.13
385 0.11
386 0.1
387 0.1
388 0.09
389 0.08
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.1
394 0.11
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.18
400 0.22
401 0.25
402 0.3
403 0.31
404 0.31
405 0.35
406 0.37
407 0.36
408 0.35
409 0.33
410 0.27
411 0.28
412 0.28
413 0.22
414 0.22
415 0.23
416 0.24
417 0.26
418 0.28
419 0.26
420 0.26
421 0.29
422 0.32
423 0.32
424 0.3
425 0.26
426 0.26
427 0.3
428 0.31
429 0.32
430 0.32
431 0.35
432 0.43
433 0.54
434 0.59
435 0.65
436 0.74
437 0.78
438 0.82
439 0.87
440 0.89
441 0.9
442 0.94
443 0.94
444 0.95
445 0.96
446 0.96
447 0.96
448 0.97
449 0.96
450 0.96
451 0.96
452 0.96
453 0.95
454 0.95
455 0.93
456 0.92
457 0.91
458 0.91