Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2X0PGM5

Protein Details
Accession A0A2X0PGM5    Localization Confidence Low Confidence Score 5.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
61-80SSSSRPTRPKCLACRSPSHRHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 8.5, cyto_nucl 6, pero 3, nucl 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025724  GAG-pre-integrase_dom  
IPR001584  Integrase_cat-core  
IPR001995  Peptidase_A2_cat  
IPR012337  RNaseH-like_sf  
IPR036397  RNaseH_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004190  F:aspartic-type endopeptidase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0015074  P:DNA integration  
GO:0006508  P:proteolysis  
Pfam View protein in Pfam  
PF13976  gag_pre-integrs  
PF00665  rve  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50175  ASP_PROT_RETROV  
PS50994  INTEGRASE  
Amino Acid Sequences MAQAPSSGFLTHPSLESFKVSFTDEQRTQRSLPAIDSLANRMRVQLRSTNVPSTQSALLASSSSRPTRPKCLACRSPSHRVAECPVRAKHPPPGPCRSCKQNHWSFDCEKALENSNTPDTADLTADSQHHVGCLATGLLAHCRQLRANAFVIDSGATLHMVSDKSLFTNYRHVAPTKIGGIAGGINAIGTGNIAFVAASGHPITLTGVLHTPGLPVNLLSVSRLCDTDNVRVAFTKYSIHIDKDGNNIAEGARLDEGLYLLDADHSKCQQLALLSCSQSSVPLLTLHRCLGHLAPSSIQKMVATGLLEGLGAGYSDEEVEKFVCNACLSAKGHRLPFPDSDSHSSERLGLVHSDVLSLPERSLTGKQYLVTFLDDYSRKLWAYAIGHKSEVFGVFKTWLAEVELETGATLKVLQTNNGGKYRSKAFTDFCKARGTRRQYSIPRTPQQNGRAERVNRSIVEGVLALLADAHLPKTFWEEAVAYFVYCKNLCQHSALDKETPNSVWQGERTNTLALHPFGCTAWLTVAPKLCSKLDPKAVRVLFAGYNLASKAFCFYDTTTKKIILGRNASFLNTEFPGLHGNSTEQDADTHFASTPIAKPQDTVKTWTPLVRCRIVLVTVACAVLVTVS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.25
4 0.23
5 0.2
6 0.2
7 0.23
8 0.25
9 0.27
10 0.35
11 0.38
12 0.44
13 0.48
14 0.51
15 0.49
16 0.49
17 0.5
18 0.42
19 0.38
20 0.35
21 0.31
22 0.31
23 0.31
24 0.33
25 0.33
26 0.35
27 0.33
28 0.33
29 0.37
30 0.36
31 0.39
32 0.39
33 0.38
34 0.44
35 0.48
36 0.49
37 0.46
38 0.46
39 0.42
40 0.39
41 0.36
42 0.27
43 0.23
44 0.18
45 0.17
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.18
50 0.21
51 0.25
52 0.31
53 0.36
54 0.45
55 0.53
56 0.58
57 0.63
58 0.71
59 0.76
60 0.74
61 0.8
62 0.78
63 0.79
64 0.77
65 0.74
66 0.66
67 0.61
68 0.62
69 0.6
70 0.59
71 0.56
72 0.52
73 0.51
74 0.53
75 0.53
76 0.55
77 0.53
78 0.56
79 0.56
80 0.64
81 0.64
82 0.66
83 0.69
84 0.7
85 0.7
86 0.7
87 0.73
88 0.71
89 0.73
90 0.72
91 0.72
92 0.65
93 0.64
94 0.59
95 0.5
96 0.43
97 0.37
98 0.37
99 0.33
100 0.32
101 0.29
102 0.28
103 0.27
104 0.25
105 0.23
106 0.18
107 0.17
108 0.15
109 0.12
110 0.11
111 0.13
112 0.13
113 0.14
114 0.13
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.1
119 0.07
120 0.08
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.06
125 0.1
126 0.11
127 0.13
128 0.14
129 0.16
130 0.16
131 0.22
132 0.25
133 0.25
134 0.27
135 0.27
136 0.25
137 0.24
138 0.24
139 0.18
140 0.14
141 0.1
142 0.08
143 0.06
144 0.06
145 0.06
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.09
151 0.1
152 0.13
153 0.14
154 0.14
155 0.23
156 0.24
157 0.27
158 0.29
159 0.29
160 0.29
161 0.29
162 0.3
163 0.23
164 0.22
165 0.17
166 0.14
167 0.13
168 0.12
169 0.1
170 0.07
171 0.05
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.03
181 0.03
182 0.03
183 0.04
184 0.04
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.07
208 0.09
209 0.09
210 0.1
211 0.1
212 0.13
213 0.16
214 0.2
215 0.26
216 0.24
217 0.24
218 0.24
219 0.25
220 0.22
221 0.2
222 0.16
223 0.12
224 0.17
225 0.18
226 0.18
227 0.21
228 0.22
229 0.24
230 0.26
231 0.28
232 0.22
233 0.21
234 0.2
235 0.16
236 0.16
237 0.13
238 0.1
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.07
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.03
248 0.05
249 0.05
250 0.06
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.1
258 0.11
259 0.12
260 0.15
261 0.14
262 0.14
263 0.15
264 0.13
265 0.12
266 0.11
267 0.08
268 0.06
269 0.08
270 0.1
271 0.11
272 0.12
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.13
277 0.11
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.14
282 0.16
283 0.17
284 0.16
285 0.15
286 0.11
287 0.1
288 0.1
289 0.09
290 0.07
291 0.06
292 0.05
293 0.05
294 0.05
295 0.05
296 0.04
297 0.03
298 0.02
299 0.02
300 0.02
301 0.02
302 0.02
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.04
307 0.04
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.11
315 0.12
316 0.15
317 0.2
318 0.22
319 0.25
320 0.27
321 0.29
322 0.27
323 0.28
324 0.28
325 0.26
326 0.26
327 0.29
328 0.29
329 0.29
330 0.27
331 0.24
332 0.21
333 0.19
334 0.16
335 0.13
336 0.09
337 0.08
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.07
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.09
349 0.11
350 0.12
351 0.13
352 0.14
353 0.15
354 0.15
355 0.16
356 0.15
357 0.15
358 0.13
359 0.11
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.15
365 0.14
366 0.14
367 0.14
368 0.14
369 0.17
370 0.23
371 0.26
372 0.26
373 0.26
374 0.26
375 0.26
376 0.22
377 0.21
378 0.14
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.11
383 0.11
384 0.1
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.08
389 0.1
390 0.09
391 0.08
392 0.08
393 0.08
394 0.07
395 0.06
396 0.06
397 0.04
398 0.09
399 0.09
400 0.11
401 0.15
402 0.2
403 0.24
404 0.28
405 0.29
406 0.25
407 0.28
408 0.33
409 0.32
410 0.3
411 0.29
412 0.28
413 0.35
414 0.43
415 0.42
416 0.38
417 0.43
418 0.41
419 0.45
420 0.51
421 0.51
422 0.5
423 0.54
424 0.62
425 0.61
426 0.69
427 0.72
428 0.72
429 0.71
430 0.68
431 0.67
432 0.66
433 0.66
434 0.66
435 0.6
436 0.55
437 0.57
438 0.54
439 0.55
440 0.52
441 0.48
442 0.39
443 0.39
444 0.35
445 0.26
446 0.25
447 0.19
448 0.14
449 0.1
450 0.1
451 0.06
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.06
460 0.11
461 0.12
462 0.11
463 0.13
464 0.13
465 0.14
466 0.17
467 0.17
468 0.12
469 0.13
470 0.14
471 0.15
472 0.14
473 0.15
474 0.17
475 0.21
476 0.22
477 0.24
478 0.26
479 0.3
480 0.35
481 0.36
482 0.35
483 0.34
484 0.34
485 0.33
486 0.31
487 0.25
488 0.22
489 0.21
490 0.18
491 0.19
492 0.23
493 0.23
494 0.24
495 0.25
496 0.25
497 0.24
498 0.23
499 0.26
500 0.21
501 0.2
502 0.18
503 0.17
504 0.15
505 0.16
506 0.14
507 0.1
508 0.11
509 0.14
510 0.15
511 0.17
512 0.22
513 0.23
514 0.25
515 0.27
516 0.27
517 0.28
518 0.31
519 0.36
520 0.42
521 0.45
522 0.45
523 0.52
524 0.51
525 0.48
526 0.44
527 0.39
528 0.3
529 0.25
530 0.25
531 0.15
532 0.16
533 0.15
534 0.15
535 0.12
536 0.11
537 0.13
538 0.11
539 0.12
540 0.13
541 0.16
542 0.26
543 0.29
544 0.34
545 0.33
546 0.34
547 0.36
548 0.39
549 0.42
550 0.4
551 0.45
552 0.42
553 0.45
554 0.45
555 0.43
556 0.38
557 0.34
558 0.29
559 0.21
560 0.2
561 0.15
562 0.15
563 0.19
564 0.19
565 0.18
566 0.16
567 0.16
568 0.16
569 0.19
570 0.19
571 0.14
572 0.15
573 0.16
574 0.17
575 0.16
576 0.16
577 0.13
578 0.13
579 0.13
580 0.15
581 0.16
582 0.22
583 0.25
584 0.24
585 0.25
586 0.32
587 0.41
588 0.41
589 0.44
590 0.42
591 0.44
592 0.46
593 0.5
594 0.48
595 0.46
596 0.51
597 0.5
598 0.45
599 0.42
600 0.43
601 0.39
602 0.39
603 0.32
604 0.28
605 0.24
606 0.23
607 0.2
608 0.17