FuNGI

A0A2X0LSM4

Protein Details

Accession

A0A2X0LSM4

Localization Confidence

Low

Confidence Score

8.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-26	MSPSQKKKKKCSTKKITPVHAKLAAR	Hydrophilic
171-191	QGLVRLIFKRHKKNADRAELS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

mito 15, nucl 6, cyto 6, cyto_nucl 6

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR000477 RT_dom
Pfam	View protein in Pfam PF00078 RVT_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL
CDD	cd01650 RT_nLTR_like

Amino Acid Sequences

MSPSQKKKKKCSTKKITPVHAKLAARNSDSKITALRLSNGELTHDIDVALDHTQAHFQRLYHIDPRDPDRVDRLRDEFLAPITAARTCDDPRSDPLFLRRLSESQIDLLQRPITEDEVVAAIGTTHPGRSPGPSGVPYELYQTAPKAWAKVLTKAYNAMIERGSLSPKQGQGLVRLIFKRHKKNADRAELSSYRPITLRECDYKIFTKVYVARLNQILPDLLPPQQHGFVKDRRSADAALHLRLLIEEVGARRTEFPAAALLSLDQSSAYDLVEHDWIFAIFDALGAPATFLRVLRMLYSGDSTSARYIINGFLTAPVRLTCGLGQGDPASSSVWDIVFQPFLDALHRRNIALNLSIPALHPYPQSRAITSLAFADDVVVAVAGLGSLNLLDDLALDWRHATNGRLNTDKTVVLPIGRRWDPGQRPLVVKAAGESLEWIGLPFDPSGDTELAYANLIERLEATLEGVQHRWLTHHTRAFYVNRYAIPKILHFLAADIPPPEVVKKLDDMLVDFVRGGKGRTSYGRDIVFTAKLKGGLGVIRMQDVVDAVAARIWDVLLGAQSDLDLATDLWPHPSTPIPSDLHPRWRAALGVPKQQDAQVNPRTLTTANLLALPTLLGSLHTPIRGRQTINAVHIPDYLRLQGYPKVADLYRRELYAGGGFHLWTPPADVLGDNSEYDRRGLPQRLAIAAWYRFTVDRHKNTPLAVAVAAGRLNVPPRIGTSAPLEAILPKPVARFAMEQRLPDPVLPQQASQYKLLNMARPYTIRRIRRVLNAKAFTNTLGLKGPPQPDDLRSFWKAVNSKALTAREREVWFKLILRFTPTRKLQHQQNHDTSPASVLCDALGLDTIDNTHYTAVQRMFGLPKLKASLRDQEGAGRTIEIFTGLVLEMISSGRWGCKSGGRGWRVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.95
2	0.94
3	0.94
4	0.93
5	0.89
6	0.86
7	0.82
8	0.74
9	0.7
10	0.68
11	0.64
12	0.57
13	0.56
14	0.52
15	0.5
16	0.48
17	0.43
18	0.38
19	0.35
20	0.36
21	0.34
22	0.34
23	0.3
24	0.32
25	0.34
26	0.31
27	0.31
28	0.26
29	0.26
30	0.23
31	0.21
32	0.18
33	0.13
34	0.13
35	0.12
36	0.11
37	0.09
38	0.08
39	0.09
40	0.15
41	0.16
42	0.19
43	0.2
44	0.19
45	0.27
46	0.3
47	0.36
48	0.38
49	0.41
50	0.41
51	0.44
52	0.51
53	0.5
54	0.49
55	0.46
56	0.48
57	0.51
58	0.51
59	0.52
60	0.51
61	0.47
62	0.46
63	0.45
64	0.38
65	0.32
66	0.29
67	0.22
68	0.19
69	0.17
70	0.16
71	0.16
72	0.15
73	0.17
74	0.17
75	0.23
76	0.26
77	0.28
78	0.33
79	0.39
80	0.39
81	0.39
82	0.44
83	0.45
84	0.42
85	0.42
86	0.39
87	0.34
88	0.37
89	0.37
90	0.31
91	0.26
92	0.3
93	0.29
94	0.27
95	0.28
96	0.25
97	0.22
98	0.22
99	0.22
100	0.19
101	0.17
102	0.16
103	0.14
104	0.13
105	0.13
106	0.1
107	0.08
108	0.06
109	0.06
110	0.08
111	0.07
112	0.07
113	0.08
114	0.1
115	0.12
116	0.15
117	0.19
118	0.2
119	0.24
120	0.26
121	0.29
122	0.29
123	0.3
124	0.27
125	0.28
126	0.26
127	0.23
128	0.23
129	0.21
130	0.2
131	0.22
132	0.23
133	0.21
134	0.2
135	0.26
136	0.27
137	0.33
138	0.4
139	0.39
140	0.39
141	0.4
142	0.4
143	0.38
144	0.36
145	0.31
146	0.23
147	0.2
148	0.2
149	0.19
150	0.21
151	0.16
152	0.19
153	0.21
154	0.22
155	0.23
156	0.26
157	0.26
158	0.27
159	0.32
160	0.32
161	0.33
162	0.33
163	0.36
164	0.4
165	0.47
166	0.53
167	0.55
168	0.63
169	0.66
170	0.74
171	0.8
172	0.83
173	0.79
174	0.71
175	0.7
176	0.63
177	0.58
178	0.54
179	0.45
180	0.35
181	0.31
182	0.31
183	0.26
184	0.28
185	0.32
186	0.31
187	0.33
188	0.34
189	0.37
190	0.39
191	0.38
192	0.34
193	0.28
194	0.29
195	0.31
196	0.35
197	0.38
198	0.35
199	0.36
200	0.36
201	0.36
202	0.3
203	0.27
204	0.21
205	0.14
206	0.15
207	0.13
208	0.14
209	0.14
210	0.15
211	0.16
212	0.21
213	0.22
214	0.23
215	0.28
216	0.31
217	0.37
218	0.41
219	0.41
220	0.38
221	0.4
222	0.37
223	0.33
224	0.36
225	0.33
226	0.28
227	0.26
228	0.24
229	0.21
230	0.19
231	0.19
232	0.09
233	0.06
234	0.07
235	0.07
236	0.09
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.12
241	0.13
242	0.11
243	0.11
244	0.12
245	0.12
246	0.12
247	0.11
248	0.1
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.05
253	0.05
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.05
258	0.05
259	0.07
260	0.09
261	0.09
262	0.08
263	0.08
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.07
268	0.04
269	0.05
270	0.04
271	0.04
272	0.05
273	0.04
274	0.04
275	0.04
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.06
280	0.07
281	0.08
282	0.08
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.12
287	0.11
288	0.11
289	0.11
290	0.12
291	0.11
292	0.11
293	0.11
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.1
298	0.09
299	0.09
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.11
304	0.09
305	0.1
306	0.1
307	0.11
308	0.08
309	0.11
310	0.11
311	0.11
312	0.11
313	0.1
314	0.1
315	0.1
316	0.1
317	0.07
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.06
322	0.06
323	0.07
324	0.08
325	0.08
326	0.08
327	0.08
328	0.07
329	0.08
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.17
334	0.18
335	0.18
336	0.19
337	0.2
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.13
342	0.13
343	0.13
344	0.11
345	0.12
346	0.11
347	0.1
348	0.11
349	0.12
350	0.15
351	0.21
352	0.21
353	0.2
354	0.21
355	0.22
356	0.2
357	0.19
358	0.16
359	0.11
360	0.1
361	0.09
362	0.07
363	0.06
364	0.05
365	0.05
366	0.03
367	0.03
368	0.03
369	0.03
370	0.02
371	0.02
372	0.02
373	0.02
374	0.02
375	0.02
376	0.02
377	0.02
378	0.02
379	0.02
380	0.03
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.08
389	0.13
390	0.17
391	0.2
392	0.22
393	0.23
394	0.24
395	0.25
396	0.23
397	0.18
398	0.15
399	0.13
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.18
404	0.18
405	0.19
406	0.19
407	0.27
408	0.29
409	0.33
410	0.36
411	0.32
412	0.33
413	0.34
414	0.35
415	0.27
416	0.24
417	0.18
418	0.15
419	0.12
420	0.1
421	0.09
422	0.06
423	0.06
424	0.06
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.05
432	0.05
433	0.07
434	0.07
435	0.07
436	0.06
437	0.07
438	0.07
439	0.07
440	0.06
441	0.04
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.05
450	0.05
451	0.06
452	0.07
453	0.07
454	0.08
455	0.08
456	0.08
457	0.08
458	0.11
459	0.16
460	0.21
461	0.25
462	0.25
463	0.26
464	0.3
465	0.32
466	0.31
467	0.29
468	0.26
469	0.24
470	0.26
471	0.24
472	0.23
473	0.22
474	0.18
475	0.17
476	0.15
477	0.14
478	0.11
479	0.11
480	0.11
481	0.11
482	0.11
483	0.1
484	0.09
485	0.09
486	0.09
487	0.09
488	0.07
489	0.08
490	0.08
491	0.09
492	0.09
493	0.11
494	0.11
495	0.12
496	0.14
497	0.13
498	0.12
499	0.11
500	0.1
501	0.1
502	0.1
503	0.1
504	0.08
505	0.09
506	0.11
507	0.15
508	0.2
509	0.21
510	0.25
511	0.25
512	0.24
513	0.24
514	0.24
515	0.24
516	0.2
517	0.19
518	0.15
519	0.15
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.09
524	0.1
525	0.11
526	0.11
527	0.11
528	0.11
529	0.1
530	0.09
531	0.08
532	0.07
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.04
537	0.04
538	0.04
539	0.04
540	0.04
541	0.04
542	0.03
543	0.04
544	0.04
545	0.04
546	0.04
547	0.04
548	0.04
549	0.04
550	0.04
551	0.04
552	0.03
553	0.03
554	0.04
555	0.05
556	0.06
557	0.08
558	0.08
559	0.08
560	0.09
561	0.11
562	0.13
563	0.14
564	0.18
565	0.18
566	0.19
567	0.27
568	0.29
569	0.36
570	0.36
571	0.35
572	0.32
573	0.31
574	0.3
575	0.25
576	0.31
577	0.27
578	0.32
579	0.33
580	0.32
581	0.32
582	0.33
583	0.34
584	0.28
585	0.32
586	0.3
587	0.31
588	0.31
589	0.3
590	0.3
591	0.26
592	0.25
593	0.19
594	0.15
595	0.13
596	0.14
597	0.14
598	0.12
599	0.12
600	0.1
601	0.07
602	0.05
603	0.04
604	0.04
605	0.04
606	0.07
607	0.08
608	0.1
609	0.1
610	0.12
611	0.19
612	0.22
613	0.23
614	0.24
615	0.29
616	0.31
617	0.35
618	0.37
619	0.31
620	0.29
621	0.3
622	0.28
623	0.23
624	0.2
625	0.17
626	0.14
627	0.13
628	0.15
629	0.17
630	0.18
631	0.17
632	0.17
633	0.19
634	0.19
635	0.25
636	0.26
637	0.29
638	0.28
639	0.27
640	0.27
641	0.24
642	0.25
643	0.22
644	0.19
645	0.13
646	0.12
647	0.12
648	0.12
649	0.12
650	0.11
651	0.07
652	0.09
653	0.08
654	0.08
655	0.08
656	0.08
657	0.09
658	0.11
659	0.12
660	0.11
661	0.12
662	0.13
663	0.13
664	0.14
665	0.13
666	0.14
667	0.2
668	0.24
669	0.25
670	0.27
671	0.29
672	0.29
673	0.29
674	0.27
675	0.26
676	0.24
677	0.22
678	0.18
679	0.17
680	0.17
681	0.19
682	0.27
683	0.31
684	0.37
685	0.41
686	0.45
687	0.46
688	0.45
689	0.47
690	0.38
691	0.3
692	0.23
693	0.19
694	0.15
695	0.14
696	0.13
697	0.1
698	0.09
699	0.08
700	0.1
701	0.11
702	0.11
703	0.1
704	0.12
705	0.17
706	0.17
707	0.18
708	0.21
709	0.22
710	0.21
711	0.21
712	0.19
713	0.16
714	0.17
715	0.17
716	0.14
717	0.12
718	0.13
719	0.14
720	0.15
721	0.16
722	0.18
723	0.21
724	0.31
725	0.32
726	0.33
727	0.33
728	0.36
729	0.34
730	0.3
731	0.28
732	0.21
733	0.27
734	0.26
735	0.26
736	0.28
737	0.33
738	0.35
739	0.35
740	0.34
741	0.27
742	0.33
743	0.35
744	0.34
745	0.31
746	0.31
747	0.32
748	0.32
749	0.36
750	0.39
751	0.45
752	0.46
753	0.51
754	0.55
755	0.58
756	0.65
757	0.7
758	0.69
759	0.71
760	0.69
761	0.64
762	0.6
763	0.55
764	0.45
765	0.4
766	0.31
767	0.22
768	0.2
769	0.18
770	0.19
771	0.24
772	0.27
773	0.25
774	0.29
775	0.3
776	0.32
777	0.37
778	0.37
779	0.38
780	0.37
781	0.38
782	0.35
783	0.4
784	0.39
785	0.37
786	0.43
787	0.38
788	0.4
789	0.44
790	0.49
791	0.44
792	0.45
793	0.45
794	0.42
795	0.42
796	0.42
797	0.39
798	0.35
799	0.34
800	0.35
801	0.37
802	0.35
803	0.34
804	0.37
805	0.4
806	0.41
807	0.49
808	0.51
809	0.54
810	0.56
811	0.62
812	0.65
813	0.69
814	0.75
815	0.76
816	0.77
817	0.73
818	0.68
819	0.62
820	0.53
821	0.47
822	0.37
823	0.29
824	0.21
825	0.17
826	0.15
827	0.14
828	0.13
829	0.09
830	0.09
831	0.07
832	0.07
833	0.07
834	0.08
835	0.08
836	0.09
837	0.09
838	0.08
839	0.1
840	0.11
841	0.17
842	0.18
843	0.19
844	0.2
845	0.23
846	0.25
847	0.28
848	0.32
849	0.27
850	0.3
851	0.34
852	0.36
853	0.39
854	0.41
855	0.46
856	0.45
857	0.48
858	0.44
859	0.46
860	0.46
861	0.42
862	0.37
863	0.28
864	0.24
865	0.21
866	0.2
867	0.14
868	0.1
869	0.08
870	0.09
871	0.08
872	0.07
873	0.07
874	0.06
875	0.06
876	0.07
877	0.07
878	0.06
879	0.07
880	0.1
881	0.11
882	0.14
883	0.16
884	0.22
885	0.27
886	0.35
887	0.43

A0A2X0LSM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer