FuNGI

A0A2X0MS56

Protein Details

Accession

A0A2X0MS56

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
231-250	KSYCSRCKVHGHKRGWRLCP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

plas 7, cyto 6.5, cyto_nucl 6, mito 5, nucl 4.5, extr 1, pero 1, golg 1, vacu 1

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
Pfam	View protein in Pfam PF14223 Retrotran_gag_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MRSVSEPDSHNGAGNCLYLKDIKGYKSWASKGYLNLRGDALWDVVIHSVDSLVADYWSTPRFANRRNELACKFFANALSEEQMGHCEHLDSAKDIWDTLKVIHSLGQSSCTMDLLSVLMQPYTGDIIPFKDIVNKVKIAMIDFKNLCAPLPNWKLFAAMLVRSLPDQYDSIVGNLASDVDVHMDWNAFYPTMNVELAKSRNRQKASLSDRIVDDSSFVACISTTAPKDYFKSYCSRCKVHGHKRGWRLCPSRNNNVNVSAPPSDSNSNSNVAAIGVDKTALMTYTFPYSKAMPVFPWIIDLGAKVHCIGDKSVISDFISEPLGISVTNQSRVNSPGHGSVTFLTSYGCRITLKKVYYMPGAQCGFISIDCLLESMTYVVGPQSNLIFSIRGKSILRSRPGRGFIMVAAPVQPVLSSSPPLMVPANCLTGTCTLMEAHRKLGHQSPAAIVLAVKSGAITGFILKDEKSTKAPHPLYCVFIDLGFVEHSNHHGDIIYLTIVDQHSTAKGTIVLKDKSAETIIGAWTFQAEAERQTGHKLKRVRSDNGCEFDSSLIRGLFEKQVIIVELTAPYAPEVNGQVEQLNGSLMGLVQSMLLDSGLPMRFCRMLSPLQLIKVFLGKKPNLTHLQPFGSTVFVHVSKERRTMLSPRSIQGVFIGKVYVSRHVSFVDTSPRAPSVVTSTQDRVDAPIPVFDPRPPLPKMLSVTPVSPVITPPIGADQPGGDLDVVPPMDEEDEDHDRPGDFHDAEESLDGEAEVALAPSESYAIVRTGPNPGQFENVDCSNILPAGSCRQPQPPNKVLPIITAILVNVLDTPPFFHDNLLYNAYCATVFAKEDIEIPKC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.21
3	0.16
4	0.18
5	0.16
6	0.17
7	0.22
8	0.25
9	0.26
10	0.29
11	0.34
12	0.39
13	0.45
14	0.48
15	0.46
16	0.46
17	0.48
18	0.53
19	0.57
20	0.58
21	0.51
22	0.49
23	0.44
24	0.4
25	0.37
26	0.3
27	0.22
28	0.14
29	0.12
30	0.11
31	0.12
32	0.12
33	0.1
34	0.08
35	0.08
36	0.07
37	0.07
38	0.07
39	0.06
40	0.06
41	0.06
42	0.07
43	0.11
44	0.12
45	0.13
46	0.13
47	0.21
48	0.28
49	0.36
50	0.46
51	0.5
52	0.58
53	0.62
54	0.7
55	0.66
56	0.64
57	0.58
58	0.51
59	0.45
60	0.38
61	0.36
62	0.31
63	0.28
64	0.26
65	0.25
66	0.23
67	0.22
68	0.19
69	0.19
70	0.16
71	0.15
72	0.12
73	0.11
74	0.11
75	0.14
76	0.16
77	0.15
78	0.15
79	0.19
80	0.19
81	0.19
82	0.19
83	0.18
84	0.18
85	0.17
86	0.21
87	0.17
88	0.17
89	0.2
90	0.21
91	0.21
92	0.21
93	0.22
94	0.18
95	0.19
96	0.19
97	0.16
98	0.14
99	0.11
100	0.11
101	0.09
102	0.09
103	0.09
104	0.09
105	0.08
106	0.08
107	0.08
108	0.08
109	0.1
110	0.09
111	0.08
112	0.09
113	0.11
114	0.13
115	0.14
116	0.13
117	0.18
118	0.21
119	0.26
120	0.29
121	0.28
122	0.27
123	0.29
124	0.29
125	0.25
126	0.31
127	0.27
128	0.31
129	0.31
130	0.31
131	0.31
132	0.31
133	0.28
134	0.23
135	0.22
136	0.24
137	0.32
138	0.32
139	0.31
140	0.31
141	0.32
142	0.28
143	0.31
144	0.24
145	0.17
146	0.17
147	0.16
148	0.16
149	0.15
150	0.16
151	0.13
152	0.11
153	0.11
154	0.1
155	0.12
156	0.12
157	0.12
158	0.13
159	0.12
160	0.1
161	0.1
162	0.09
163	0.06
164	0.06
165	0.05
166	0.06
167	0.06
168	0.06
169	0.07
170	0.07
171	0.07
172	0.08
173	0.09
174	0.07
175	0.07
176	0.08
177	0.09
178	0.11
179	0.11
180	0.1
181	0.1
182	0.15
183	0.19
184	0.25
185	0.3
186	0.37
187	0.44
188	0.47
189	0.48
190	0.48
191	0.54
192	0.56
193	0.59
194	0.53
195	0.48
196	0.46
197	0.47
198	0.42
199	0.32
200	0.25
201	0.16
202	0.14
203	0.11
204	0.1
205	0.07
206	0.06
207	0.06
208	0.07
209	0.11
210	0.12
211	0.14
212	0.16
213	0.18
214	0.21
215	0.25
216	0.25
217	0.23
218	0.3
219	0.33
220	0.41
221	0.46
222	0.47
223	0.47
224	0.56
225	0.64
226	0.66
227	0.7
228	0.7
229	0.72
230	0.79
231	0.83
232	0.78
233	0.77
234	0.74
235	0.72
236	0.74
237	0.73
238	0.73
239	0.72
240	0.7
241	0.62
242	0.59
243	0.53
244	0.43
245	0.4
246	0.31
247	0.24
248	0.21
249	0.22
250	0.2
251	0.19
252	0.21
253	0.18
254	0.19
255	0.18
256	0.17
257	0.14
258	0.12
259	0.11
260	0.09
261	0.08
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.11
272	0.12
273	0.12
274	0.14
275	0.14
276	0.17
277	0.18
278	0.18
279	0.14
280	0.17
281	0.18
282	0.16
283	0.16
284	0.13
285	0.11
286	0.11
287	0.1
288	0.09
289	0.08
290	0.09
291	0.07
292	0.08
293	0.08
294	0.09
295	0.1
296	0.12
297	0.12
298	0.13
299	0.13
300	0.14
301	0.13
302	0.14
303	0.13
304	0.11
305	0.11
306	0.09
307	0.08
308	0.07
309	0.07
310	0.06
311	0.06
312	0.1
313	0.11
314	0.14
315	0.15
316	0.16
317	0.17
318	0.2
319	0.21
320	0.17
321	0.17
322	0.17
323	0.18
324	0.17
325	0.16
326	0.15
327	0.15
328	0.13
329	0.12
330	0.09
331	0.07
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.08
336	0.09
337	0.14
338	0.19
339	0.21
340	0.23
341	0.25
342	0.27
343	0.28
344	0.31
345	0.27
346	0.27
347	0.27
348	0.23
349	0.2
350	0.19
351	0.16
352	0.13
353	0.13
354	0.07
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.05
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.04
363	0.03
364	0.03
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.09
376	0.09
377	0.11
378	0.12
379	0.14
380	0.21
381	0.26
382	0.32
383	0.33
384	0.36
385	0.39
386	0.42
387	0.4
388	0.33
389	0.28
390	0.22
391	0.2
392	0.17
393	0.12
394	0.09
395	0.08
396	0.07
397	0.07
398	0.06
399	0.04
400	0.05
401	0.06
402	0.06
403	0.06
404	0.07
405	0.07
406	0.09
407	0.09
408	0.08
409	0.1
410	0.1
411	0.12
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.11
416	0.12
417	0.09
418	0.09
419	0.07
420	0.09
421	0.13
422	0.13
423	0.15
424	0.16
425	0.17
426	0.18
427	0.23
428	0.26
429	0.22
430	0.23
431	0.2
432	0.19
433	0.19
434	0.17
435	0.12
436	0.08
437	0.07
438	0.06
439	0.05
440	0.03
441	0.03
442	0.03
443	0.04
444	0.04
445	0.04
446	0.04
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.08
451	0.1
452	0.12
453	0.14
454	0.17
455	0.19
456	0.29
457	0.32
458	0.31
459	0.36
460	0.36
461	0.36
462	0.32
463	0.31
464	0.22
465	0.18
466	0.17
467	0.1
468	0.1
469	0.07
470	0.07
471	0.06
472	0.06
473	0.08
474	0.1
475	0.1
476	0.09
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.06
482	0.04
483	0.04
484	0.06
485	0.06
486	0.06
487	0.06
488	0.06
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.1
494	0.1
495	0.14
496	0.2
497	0.2
498	0.2
499	0.21
500	0.21
501	0.19
502	0.19
503	0.14
504	0.09
505	0.1
506	0.1
507	0.09
508	0.08
509	0.07
510	0.06
511	0.06
512	0.06
513	0.06
514	0.05
515	0.06
516	0.08
517	0.09
518	0.09
519	0.15
520	0.21
521	0.22
522	0.28
523	0.32
524	0.37
525	0.45
526	0.52
527	0.54
528	0.55
529	0.61
530	0.62
531	0.6
532	0.55
533	0.46
534	0.4
535	0.34
536	0.28
537	0.2
538	0.15
539	0.11
540	0.1
541	0.11
542	0.12
543	0.13
544	0.13
545	0.12
546	0.1
547	0.1
548	0.11
549	0.1
550	0.08
551	0.07
552	0.07
553	0.07
554	0.07
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.07
560	0.08
561	0.09
562	0.1
563	0.1
564	0.1
565	0.1
566	0.1
567	0.09
568	0.07
569	0.05
570	0.05
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.04
575	0.04
576	0.03
577	0.03
578	0.04
579	0.04
580	0.04
581	0.03
582	0.03
583	0.08
584	0.09
585	0.1
586	0.1
587	0.12
588	0.14
589	0.14
590	0.16
591	0.15
592	0.17
593	0.19
594	0.26
595	0.26
596	0.27
597	0.28
598	0.26
599	0.24
600	0.26
601	0.24
602	0.21
603	0.27
604	0.25
605	0.3
606	0.33
607	0.39
608	0.39
609	0.41
610	0.44
611	0.41
612	0.42
613	0.37
614	0.36
615	0.29
616	0.25
617	0.21
618	0.17
619	0.16
620	0.13
621	0.15
622	0.17
623	0.22
624	0.24
625	0.29
626	0.3
627	0.29
628	0.32
629	0.38
630	0.41
631	0.45
632	0.45
633	0.41
634	0.45
635	0.42
636	0.38
637	0.34
638	0.33
639	0.24
640	0.21
641	0.2
642	0.15
643	0.18
644	0.19
645	0.22
646	0.2
647	0.21
648	0.22
649	0.22
650	0.24
651	0.22
652	0.24
653	0.26
654	0.24
655	0.24
656	0.24
657	0.24
658	0.23
659	0.22
660	0.2
661	0.18
662	0.22
663	0.24
664	0.26
665	0.28
666	0.29
667	0.3
668	0.29
669	0.25
670	0.21
671	0.22
672	0.18
673	0.19
674	0.19
675	0.2
676	0.21
677	0.19
678	0.24
679	0.24
680	0.29
681	0.27
682	0.3
683	0.3
684	0.34
685	0.37
686	0.35
687	0.37
688	0.33
689	0.32
690	0.31
691	0.3
692	0.25
693	0.22
694	0.18
695	0.17
696	0.16
697	0.15
698	0.13
699	0.17
700	0.16
701	0.16
702	0.15
703	0.12
704	0.13
705	0.13
706	0.13
707	0.08
708	0.08
709	0.08
710	0.11
711	0.1
712	0.09
713	0.09
714	0.09
715	0.1
716	0.09
717	0.1
718	0.13
719	0.19
720	0.2
721	0.21
722	0.21
723	0.21
724	0.21
725	0.23
726	0.23
727	0.17
728	0.17
729	0.19
730	0.19
731	0.19
732	0.19
733	0.17
734	0.1
735	0.1
736	0.09
737	0.07
738	0.06
739	0.06
740	0.05
741	0.04
742	0.04
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.05
747	0.05
748	0.05
749	0.06
750	0.07
751	0.09
752	0.11
753	0.12
754	0.19
755	0.23
756	0.28
757	0.3
758	0.3
759	0.33
760	0.32
761	0.34
762	0.32
763	0.29
764	0.25
765	0.22
766	0.22
767	0.18
768	0.18
769	0.15
770	0.11
771	0.12
772	0.17
773	0.22
774	0.24
775	0.26
776	0.34
777	0.43
778	0.5
779	0.57
780	0.59
781	0.62
782	0.64
783	0.67
784	0.58
785	0.53
786	0.48
787	0.4
788	0.32
789	0.25
790	0.2
791	0.16
792	0.15
793	0.12
794	0.09
795	0.08
796	0.08
797	0.08
798	0.1
799	0.13
800	0.17
801	0.17
802	0.17
803	0.2
804	0.24
805	0.29
806	0.31
807	0.27
808	0.24
809	0.24
810	0.24
811	0.2
812	0.16
813	0.14
814	0.11
815	0.12
816	0.13
817	0.15
818	0.14
819	0.19

A0A2X0MS56

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer