Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D540

Protein Details
Accession A1D540    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-22AVYKTVSKKKSRQIAEDQDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 10, nucl 9, mito 8, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR026532  BRX1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
KEGG nfi:NFIA_022440  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MAAVYKTVSKKKSRQIAEDQDEVDMEMEDLLAGADDTSDSDEDEDEHTAEAAKKQLAAGFMPKSRVLMLTSRGVTYRHRHLLSDLCALLPHTHKESKLDTKKKTAGYNLLLNSLADLHSCNVIFFLEARKRGQDLYLWLARPPNGPTIKFHLTNLHTMGELNTGFSGNCLKGGRGIVVFDRSFDEQGPVMSSPGNEYRGLIREMLRGVFCVPKRGVKGMKPFIDRVIGVFGVDGKIWIRVYEIRESEGGAKKDDENSKPAPKGKNAQPEISLVEIGPRFVLTPIVILEGSFGGPVIYENKEYVSPNQVRSEIRLSKAARYAKRRDVQTNLISKRSTLGLAEGERKPGPLDTKSLFS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.77
3 0.81
4 0.78
5 0.74
6 0.65
7 0.56
8 0.49
9 0.4
10 0.3
11 0.19
12 0.13
13 0.07
14 0.06
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.04
19 0.03
20 0.03
21 0.03
22 0.03
23 0.04
24 0.06
25 0.06
26 0.07
27 0.07
28 0.08
29 0.09
30 0.11
31 0.12
32 0.1
33 0.1
34 0.1
35 0.12
36 0.13
37 0.14
38 0.16
39 0.15
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.17
44 0.18
45 0.21
46 0.23
47 0.25
48 0.27
49 0.26
50 0.25
51 0.25
52 0.24
53 0.21
54 0.2
55 0.21
56 0.24
57 0.25
58 0.25
59 0.25
60 0.26
61 0.29
62 0.31
63 0.36
64 0.38
65 0.38
66 0.38
67 0.4
68 0.45
69 0.44
70 0.43
71 0.34
72 0.26
73 0.25
74 0.25
75 0.25
76 0.2
77 0.19
78 0.19
79 0.22
80 0.23
81 0.26
82 0.32
83 0.4
84 0.48
85 0.54
86 0.53
87 0.59
88 0.64
89 0.65
90 0.63
91 0.58
92 0.55
93 0.5
94 0.52
95 0.44
96 0.4
97 0.35
98 0.3
99 0.25
100 0.18
101 0.14
102 0.08
103 0.07
104 0.06
105 0.08
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.13
113 0.16
114 0.19
115 0.2
116 0.21
117 0.22
118 0.23
119 0.23
120 0.18
121 0.17
122 0.21
123 0.24
124 0.23
125 0.23
126 0.24
127 0.24
128 0.23
129 0.21
130 0.23
131 0.22
132 0.22
133 0.24
134 0.3
135 0.33
136 0.32
137 0.31
138 0.3
139 0.29
140 0.31
141 0.3
142 0.23
143 0.19
144 0.18
145 0.18
146 0.13
147 0.11
148 0.09
149 0.07
150 0.07
151 0.06
152 0.07
153 0.08
154 0.06
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.11
160 0.11
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.12
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.12
170 0.12
171 0.12
172 0.09
173 0.09
174 0.1
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.09
180 0.11
181 0.12
182 0.11
183 0.11
184 0.13
185 0.15
186 0.16
187 0.15
188 0.14
189 0.14
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.12
195 0.16
196 0.15
197 0.18
198 0.19
199 0.22
200 0.24
201 0.29
202 0.32
203 0.32
204 0.42
205 0.44
206 0.49
207 0.48
208 0.47
209 0.43
210 0.41
211 0.35
212 0.27
213 0.22
214 0.15
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.08
220 0.07
221 0.05
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.09
226 0.12
227 0.15
228 0.21
229 0.21
230 0.21
231 0.21
232 0.22
233 0.27
234 0.29
235 0.27
236 0.23
237 0.24
238 0.23
239 0.3
240 0.35
241 0.31
242 0.3
243 0.35
244 0.4
245 0.43
246 0.48
247 0.46
248 0.45
249 0.52
250 0.55
251 0.59
252 0.57
253 0.55
254 0.5
255 0.47
256 0.44
257 0.37
258 0.29
259 0.18
260 0.19
261 0.16
262 0.15
263 0.13
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.11
268 0.07
269 0.08
270 0.08
271 0.1
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.07
278 0.06
279 0.04
280 0.05
281 0.06
282 0.08
283 0.1
284 0.11
285 0.11
286 0.13
287 0.16
288 0.18
289 0.2
290 0.26
291 0.29
292 0.32
293 0.36
294 0.38
295 0.37
296 0.4
297 0.46
298 0.41
299 0.4
300 0.44
301 0.41
302 0.43
303 0.5
304 0.54
305 0.53
306 0.56
307 0.62
308 0.65
309 0.7
310 0.72
311 0.71
312 0.7
313 0.7
314 0.7
315 0.72
316 0.66
317 0.64
318 0.57
319 0.5
320 0.46
321 0.39
322 0.31
323 0.22
324 0.2
325 0.21
326 0.25
327 0.32
328 0.31
329 0.34
330 0.33
331 0.32
332 0.31
333 0.3
334 0.32
335 0.28
336 0.33