FuNGI

A1D4M4

Protein Details

Accession

A1D4M4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
20-50	YNAYRAHTTRRLHKLRKKLGQTTPKGRKYTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
30-46	RLHKLRKKLGQTTPKGR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR026258 SRP68 IPR034652 SRP68-RBD IPR038253 SRP68_N_sf
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0005786 C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting GO:0008312 F:7S RNA binding GO:0030942 F:endoplasmic reticulum signal peptide binding GO:0005047 F:signal recognition particle binding GO:0006614 P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane
KEGG	nfi:NFIA_020750 -
Pfam	View protein in Pfam PF16969 SRP68
CDD	cd15481 SRP68-RBD

Amino Acid Sequences

MEITDFVFKQREDVLLAGDYNAYRAHTTRRLHKLRKKLGQTTPKGRKYTAKPPVTAEDISSNVAYVHVLLLSSERAWAQAMHMKSTHSADPSAKGIAGSARRHIVSRLNKASGYSQQLVLLLEDQATSGATDTDILEARAYLASLLGALYLEKRKWEQCIQSYAVSRIIYTTLSREDRKDAFRDLLTGTIDPSIRYAAYQMKLPRSRPLSSLAIQYFPSDANIRSEVERVDPDCLKEDIAGTRKTADGEIQQLPESITWRSRTVTLEDAAISQALASAAAAESRLKSWLADVEGKSASSKDKAAAYDSVIIASQDAVDATKTAIDDLANEGVEPSDKRMQSLQITRTAVNYALVGWRIGRNRVLCGANDGMTFETDKAEGLKRGKGAIREESTGKKLTRLREKVVLYDSILQSIEFILELPGVAADSTFVQELEAKRCYFRALRCLSIAQSHCYLGNSKNALALYSQAMQLTTQSTVSDQSSQLSNEPLRLDVSHSQVQALGSILQGLVAQYRGLVTLEKMAAEGPQTGNQRPVIERLHEFSGDNVDLSNLVPYPPKMQPIPVKPLFLDVAWNYIDYPREGAHAQEEAQLPMETGTEEKKGGRRGWFGFGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.2
3	0.2
4	0.18
5	0.17
6	0.15
7	0.14
8	0.14
9	0.13
10	0.12
11	0.14
12	0.22
13	0.28
14	0.35
15	0.44
16	0.54
17	0.63
18	0.72
19	0.79
20	0.83
21	0.85
22	0.89
23	0.89
24	0.87
25	0.87
26	0.87
27	0.88
28	0.88
29	0.88
30	0.87
31	0.81
32	0.75
33	0.74
34	0.71
35	0.72
36	0.71
37	0.68
38	0.62
39	0.63
40	0.65
41	0.61
42	0.53
43	0.45
44	0.38
45	0.32
46	0.32
47	0.26
48	0.21
49	0.16
50	0.15
51	0.12
52	0.09
53	0.08
54	0.06
55	0.06
56	0.06
57	0.07
58	0.08
59	0.08
60	0.09
61	0.09
62	0.09
63	0.1
64	0.1
65	0.13
66	0.18
67	0.19
68	0.21
69	0.22
70	0.22
71	0.24
72	0.28
73	0.27
74	0.23
75	0.25
76	0.24
77	0.26
78	0.27
79	0.25
80	0.22
81	0.18
82	0.17
83	0.2
84	0.24
85	0.24
86	0.25
87	0.28
88	0.28
89	0.3
90	0.31
91	0.35
92	0.37
93	0.45
94	0.48
95	0.47
96	0.47
97	0.47
98	0.49
99	0.46
100	0.44
101	0.36
102	0.3
103	0.28
104	0.28
105	0.27
106	0.23
107	0.18
108	0.11
109	0.09
110	0.08
111	0.08
112	0.07
113	0.06
114	0.06
115	0.05
116	0.05
117	0.05
118	0.05
119	0.06
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.08
124	0.08
125	0.09
126	0.08
127	0.08
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.05
132	0.04
133	0.04
134	0.03
135	0.04
136	0.07
137	0.1
138	0.11
139	0.13
140	0.17
141	0.19
142	0.25
143	0.31
144	0.36
145	0.39
146	0.45
147	0.45
148	0.47
149	0.47
150	0.43
151	0.4
152	0.32
153	0.27
154	0.21
155	0.19
156	0.15
157	0.13
158	0.14
159	0.16
160	0.21
161	0.23
162	0.24
163	0.28
164	0.32
165	0.35
166	0.36
167	0.33
168	0.32
169	0.3
170	0.3
171	0.26
172	0.23
173	0.21
174	0.17
175	0.15
176	0.14
177	0.14
178	0.12
179	0.12
180	0.1
181	0.09
182	0.09
183	0.11
184	0.14
185	0.15
186	0.19
187	0.23
188	0.31
189	0.35
190	0.37
191	0.42
192	0.41
193	0.42
194	0.39
195	0.41
196	0.37
197	0.34
198	0.39
199	0.33
200	0.29
201	0.28
202	0.26
203	0.22
204	0.17
205	0.17
206	0.12
207	0.11
208	0.13
209	0.14
210	0.14
211	0.14
212	0.16
213	0.14
214	0.15
215	0.16
216	0.14
217	0.16
218	0.16
219	0.16
220	0.18
221	0.18
222	0.16
223	0.14
224	0.14
225	0.15
226	0.19
227	0.19
228	0.16
229	0.17
230	0.17
231	0.18
232	0.17
233	0.14
234	0.11
235	0.15
236	0.17
237	0.16
238	0.16
239	0.16
240	0.16
241	0.15
242	0.14
243	0.11
244	0.12
245	0.13
246	0.14
247	0.15
248	0.16
249	0.17
250	0.19
251	0.2
252	0.18
253	0.16
254	0.15
255	0.15
256	0.13
257	0.11
258	0.08
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.03
263	0.03
264	0.03
265	0.03
266	0.03
267	0.04
268	0.04
269	0.04
270	0.05
271	0.06
272	0.06
273	0.06
274	0.06
275	0.08
276	0.1
277	0.14
278	0.14
279	0.16
280	0.16
281	0.16
282	0.16
283	0.14
284	0.13
285	0.1
286	0.11
287	0.09
288	0.11
289	0.12
290	0.14
291	0.14
292	0.14
293	0.15
294	0.14
295	0.13
296	0.11
297	0.1
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.03
306	0.03
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.05
311	0.05
312	0.05
313	0.06
314	0.08
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.07
320	0.07
321	0.09
322	0.13
323	0.13
324	0.15
325	0.16
326	0.19
327	0.23
328	0.29
329	0.28
330	0.29
331	0.31
332	0.3
333	0.3
334	0.28
335	0.23
336	0.17
337	0.14
338	0.08
339	0.08
340	0.08
341	0.07
342	0.07
343	0.1
344	0.12
345	0.13
346	0.17
347	0.16
348	0.18
349	0.22
350	0.23
351	0.19
352	0.22
353	0.21
354	0.18
355	0.17
356	0.16
357	0.12
358	0.11
359	0.12
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.07
364	0.08
365	0.09
366	0.13
367	0.15
368	0.17
369	0.18
370	0.21
371	0.23
372	0.25
373	0.28
374	0.31
375	0.31
376	0.31
377	0.33
378	0.33
379	0.34
380	0.34
381	0.31
382	0.3
383	0.31
384	0.37
385	0.45
386	0.47
387	0.48
388	0.51
389	0.51
390	0.49
391	0.48
392	0.41
393	0.32
394	0.32
395	0.28
396	0.22
397	0.21
398	0.17
399	0.14
400	0.13
401	0.11
402	0.05
403	0.05
404	0.04
405	0.04
406	0.04
407	0.04
408	0.04
409	0.04
410	0.03
411	0.03
412	0.03
413	0.04
414	0.05
415	0.05
416	0.05
417	0.05
418	0.09
419	0.11
420	0.16
421	0.19
422	0.19
423	0.19
424	0.2
425	0.23
426	0.25
427	0.27
428	0.32
429	0.32
430	0.34
431	0.36
432	0.37
433	0.35
434	0.37
435	0.35
436	0.28
437	0.26
438	0.24
439	0.23
440	0.22
441	0.23
442	0.18
443	0.23
444	0.22
445	0.21
446	0.23
447	0.22
448	0.21
449	0.19
450	0.19
451	0.14
452	0.13
453	0.14
454	0.11
455	0.12
456	0.11
457	0.12
458	0.12
459	0.1
460	0.09
461	0.09
462	0.09
463	0.11
464	0.13
465	0.14
466	0.13
467	0.14
468	0.16
469	0.17
470	0.17
471	0.2
472	0.19
473	0.19
474	0.2
475	0.19
476	0.18
477	0.17
478	0.21
479	0.21
480	0.26
481	0.27
482	0.27
483	0.26
484	0.26
485	0.26
486	0.22
487	0.18
488	0.13
489	0.08
490	0.09
491	0.08
492	0.06
493	0.07
494	0.06
495	0.06
496	0.06
497	0.06
498	0.06
499	0.06
500	0.07
501	0.07
502	0.08
503	0.08
504	0.12
505	0.13
506	0.12
507	0.12
508	0.12
509	0.12
510	0.13
511	0.15
512	0.12
513	0.18
514	0.21
515	0.23
516	0.26
517	0.28
518	0.3
519	0.29
520	0.32
521	0.31
522	0.32
523	0.33
524	0.33
525	0.35
526	0.33
527	0.32
528	0.27
529	0.29
530	0.24
531	0.21
532	0.17
533	0.14
534	0.13
535	0.13
536	0.14
537	0.08
538	0.08
539	0.11
540	0.12
541	0.18
542	0.2
543	0.25
544	0.25
545	0.32
546	0.41
547	0.46
548	0.54
549	0.52
550	0.53
551	0.48
552	0.5
553	0.44
554	0.35
555	0.34
556	0.24
557	0.24
558	0.22
559	0.22
560	0.18
561	0.19
562	0.21
563	0.16
564	0.18
565	0.15
566	0.18
567	0.18
568	0.18
569	0.2
570	0.2
571	0.2
572	0.23
573	0.24
574	0.22
575	0.24
576	0.22
577	0.19
578	0.17
579	0.16
580	0.11
581	0.11
582	0.14
583	0.14
584	0.15
585	0.19
586	0.25
587	0.32
588	0.37
589	0.43
590	0.48
591	0.49

A1D4M4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer