Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1D9J2

Protein Details
Accession A1D9J2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
110-137QKNSSDAKTDKKKMKRFRLTHNQTRFLMHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047152  Caudal_homeobox  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR001356  Homeobox_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG nfi:NFIA_029040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00046  Homeodomain  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50071  HOMEOBOX_2  
CDD cd00086  homeodomain  
Amino Acid Sequences MQPSAVLKAENAFSATNAVATSNHVRSSEAEMPPPKEAESRSTEETLSRMRLDQLNHSESHPSGVSRPASPSASKASTLEGKKRPQEEARGDEKDDGEAMGISSDEGGDQKNSSDAKTDKKKMKRFRLTHNQTRFLMSEFTRQAHPDAAHRERLSREIPGLTPRQVQVWFQNRRAKLKRLTSNDRERMLKSRALPDDFDTTQVLRTPFDNKTLSETPVASPRNYMASSTDSNSLKMLLTDGLQRINDDEYVVSPLSSSSTTGNCFPSAGPDRTPDHFPQHGILGPRPAATLPELQRNTRGTFPFPRSSSFSEVSYHAGLHLPGRFSRPGVEPLNHPGLPYARRPIDYGIPRPANGMVVGYDHSRPMEGSVSPTGQQEQQLPYNVDNHNQQVPSYQTTLTIPAPKGFGSIEMNSHMQPRHMPALHSIPVSDAPDYRPYSYEHHPYSMQTALPYSQANASSMSLPASFPPDTTHVPQVAVSTEDRINQSPQILDPMRGKFGNPSYDYAGYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.13
4 0.12
5 0.12
6 0.1
7 0.15
8 0.21
9 0.21
10 0.23
11 0.23
12 0.24
13 0.26
14 0.34
15 0.37
16 0.33
17 0.38
18 0.42
19 0.44
20 0.46
21 0.45
22 0.38
23 0.34
24 0.33
25 0.32
26 0.34
27 0.36
28 0.38
29 0.38
30 0.38
31 0.34
32 0.36
33 0.34
34 0.31
35 0.27
36 0.24
37 0.26
38 0.29
39 0.31
40 0.37
41 0.4
42 0.4
43 0.39
44 0.39
45 0.38
46 0.34
47 0.35
48 0.27
49 0.21
50 0.19
51 0.24
52 0.25
53 0.24
54 0.27
55 0.28
56 0.3
57 0.29
58 0.3
59 0.31
60 0.31
61 0.3
62 0.27
63 0.27
64 0.32
65 0.37
66 0.43
67 0.43
68 0.49
69 0.55
70 0.57
71 0.6
72 0.58
73 0.63
74 0.62
75 0.62
76 0.62
77 0.59
78 0.57
79 0.53
80 0.47
81 0.38
82 0.3
83 0.23
84 0.15
85 0.11
86 0.1
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.05
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.06
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.19
102 0.21
103 0.3
104 0.39
105 0.48
106 0.53
107 0.62
108 0.71
109 0.75
110 0.84
111 0.85
112 0.82
113 0.84
114 0.86
115 0.86
116 0.87
117 0.85
118 0.81
119 0.71
120 0.67
121 0.57
122 0.48
123 0.42
124 0.33
125 0.32
126 0.28
127 0.28
128 0.27
129 0.27
130 0.26
131 0.26
132 0.25
133 0.23
134 0.3
135 0.32
136 0.37
137 0.36
138 0.38
139 0.35
140 0.39
141 0.34
142 0.28
143 0.26
144 0.22
145 0.23
146 0.25
147 0.27
148 0.25
149 0.26
150 0.24
151 0.25
152 0.24
153 0.24
154 0.28
155 0.34
156 0.38
157 0.42
158 0.5
159 0.5
160 0.58
161 0.63
162 0.62
163 0.6
164 0.64
165 0.66
166 0.67
167 0.73
168 0.73
169 0.77
170 0.76
171 0.71
172 0.65
173 0.58
174 0.55
175 0.5
176 0.44
177 0.37
178 0.38
179 0.39
180 0.38
181 0.37
182 0.33
183 0.35
184 0.31
185 0.29
186 0.23
187 0.18
188 0.17
189 0.19
190 0.17
191 0.12
192 0.13
193 0.16
194 0.16
195 0.21
196 0.21
197 0.19
198 0.25
199 0.27
200 0.27
201 0.24
202 0.24
203 0.2
204 0.26
205 0.27
206 0.2
207 0.19
208 0.18
209 0.2
210 0.19
211 0.18
212 0.13
213 0.15
214 0.16
215 0.17
216 0.22
217 0.19
218 0.19
219 0.19
220 0.18
221 0.14
222 0.12
223 0.11
224 0.06
225 0.07
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.1
234 0.08
235 0.07
236 0.06
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.08
247 0.09
248 0.11
249 0.12
250 0.11
251 0.12
252 0.11
253 0.16
254 0.2
255 0.2
256 0.19
257 0.22
258 0.24
259 0.26
260 0.3
261 0.26
262 0.26
263 0.26
264 0.26
265 0.23
266 0.22
267 0.22
268 0.2
269 0.19
270 0.16
271 0.15
272 0.14
273 0.14
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.16
278 0.15
279 0.23
280 0.25
281 0.25
282 0.29
283 0.31
284 0.31
285 0.3
286 0.3
287 0.25
288 0.31
289 0.36
290 0.38
291 0.37
292 0.38
293 0.38
294 0.4
295 0.41
296 0.36
297 0.31
298 0.27
299 0.27
300 0.26
301 0.22
302 0.18
303 0.13
304 0.12
305 0.11
306 0.12
307 0.12
308 0.11
309 0.12
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.18
314 0.19
315 0.23
316 0.25
317 0.26
318 0.25
319 0.3
320 0.35
321 0.32
322 0.29
323 0.25
324 0.25
325 0.26
326 0.26
327 0.28
328 0.24
329 0.25
330 0.27
331 0.28
332 0.32
333 0.35
334 0.37
335 0.39
336 0.38
337 0.37
338 0.37
339 0.35
340 0.27
341 0.22
342 0.18
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.09
352 0.1
353 0.11
354 0.1
355 0.13
356 0.15
357 0.16
358 0.17
359 0.18
360 0.18
361 0.17
362 0.19
363 0.19
364 0.2
365 0.23
366 0.26
367 0.27
368 0.26
369 0.31
370 0.3
371 0.29
372 0.28
373 0.28
374 0.29
375 0.27
376 0.26
377 0.24
378 0.26
379 0.26
380 0.25
381 0.22
382 0.19
383 0.2
384 0.23
385 0.22
386 0.24
387 0.22
388 0.22
389 0.23
390 0.21
391 0.22
392 0.18
393 0.18
394 0.17
395 0.17
396 0.17
397 0.19
398 0.21
399 0.2
400 0.24
401 0.22
402 0.19
403 0.2
404 0.23
405 0.28
406 0.28
407 0.29
408 0.3
409 0.36
410 0.38
411 0.36
412 0.31
413 0.25
414 0.26
415 0.26
416 0.23
417 0.17
418 0.17
419 0.24
420 0.27
421 0.26
422 0.25
423 0.26
424 0.31
425 0.36
426 0.42
427 0.38
428 0.39
429 0.39
430 0.39
431 0.4
432 0.37
433 0.31
434 0.23
435 0.22
436 0.19
437 0.2
438 0.19
439 0.17
440 0.17
441 0.18
442 0.17
443 0.17
444 0.17
445 0.16
446 0.16
447 0.16
448 0.14
449 0.13
450 0.13
451 0.16
452 0.15
453 0.14
454 0.18
455 0.21
456 0.25
457 0.29
458 0.34
459 0.3
460 0.31
461 0.31
462 0.29
463 0.26
464 0.23
465 0.2
466 0.18
467 0.19
468 0.22
469 0.24
470 0.25
471 0.27
472 0.27
473 0.28
474 0.26
475 0.25
476 0.31
477 0.29
478 0.31
479 0.34
480 0.36
481 0.39
482 0.37
483 0.37
484 0.36
485 0.4
486 0.45
487 0.42
488 0.42
489 0.43