FuNGI

A0A2X0MSK2

Protein Details

Accession

A0A2X0MSK2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
123-158	MDPECPKYDAKKNHGRARNRNKKKKQDSKESADSNE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
133-147	KKNHGRARNRNKKKK

Subcellular Location(s)

cyto 10, pero 9, nucl 8

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MELSNAKYDEDENMGEFLKSMIDKADQLDDLGQKFGDEAMIAYILQALPPSYEMLKQAIRLGENRSVDHVINRLTDEYTERKLSGKFDKLLKNAGALAVQSTQASRDPNCVCRGCKGKGHFAMDPECPKYDAKKNHGRARNRNKKKKQDSKESADSNELAEFVLTVKSLDESHSLQDNVANRVSQLNQGEIWILDTGASQHYVGDASLLSNRQSGNLKVQTASGQVVHCDTYGMVRFKLKSGASLSLANVYHLPGAPVNLISTRALFKSGAKCGWEDGKDVMTITYQGVILAKTLSGTGYALDFTRIVEDQAHVATRATVGAPLMEWHRRYRHVPVSSIMELVKSGAVEGLVLTDEKVHDCEPCISSKSRASKFSELATQVTDVLQRVFMDIGFVAEDQVDFQGRKAYLAIVDQYSTAKWTFPLKTKSAEEVTRRVRTDNGTEFTNKLTGADFQSQGILHETSAPYTPQQNGTVEHFNGSLMAIVRAVLAASKLSWKYWSYALVYATFVANRILHAKLEGKTAYEVFYGKKPKVSHFRPFGSTVYAQVPKSKRSKLESTSVKGIFIGYDSEYNYRVLVDPDSDHKVIVTRDISVLEHKSEQVGVPEVTTLPVGPDEEKGPVDNDEIVVDELQDQVDGEQMPPARQNRPRWEYGDPAVKGRNPGRYEEIDANNEIPHCTRSQRRDAEQQVMYGSAMSASLPPVPSNYKEAMASPEADKWIAAIKAELDAMARHQVLIDLDLPSGARALGSKWVFTRKENAQGEVTRYKARLVAQGFAQRPGIDYNETFAPVARPSTILSLVGTAAAQGLFLEQFDFDSAFLNGTMTEMVYMKYPKGWDRPQTGQALRLVKSMYGTKQAPREWNAAVNSLMVERGYKRSDADSCLYVKRVDEKFIYITLYVDDGMVASNDQEFLDSEIEAFNKVYKLKRLGPVKLFLGLEFERTSDYIFVHQSKYIRDLVAMYGGGSVSKHLVKVPMEPRSDVEHSTDPFDDVALYQSAVGALQYAAHRARPDIVTSVCAAASKVSAPTQADWIAVKRIIRYLQGTVDWGLKFNHGGSTVFELYSDASWGDDMSTGKSIGAFVSILAGAAISWQSKQQSMVATSTTEAEILAASAAAKEAMWLWRLAADLELEQPKATLIWEDNQAVIAIALNPAHHGRTKHYNVHHFYIRERVTAGDIRIKYCKTGAMTADILTKPLARNLFELHCEGMGMVGAGARVLCGGPAEAAGCLHEIASFWPSCFSLFSTTHSISHLA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.18
2	0.17
3	0.16
4	0.13
5	0.13
6	0.12
7	0.11
8	0.12
9	0.14
10	0.15
11	0.17
12	0.22
13	0.19
14	0.2
15	0.23
16	0.25
17	0.24
18	0.24
19	0.21
20	0.17
21	0.17
22	0.16
23	0.12
24	0.08
25	0.07
26	0.08
27	0.08
28	0.08
29	0.08
30	0.09
31	0.09
32	0.09
33	0.09
34	0.08
35	0.08
36	0.09
37	0.11
38	0.11
39	0.13
40	0.15
41	0.19
42	0.21
43	0.22
44	0.26
45	0.27
46	0.28
47	0.3
48	0.33
49	0.36
50	0.36
51	0.36
52	0.36
53	0.36
54	0.34
55	0.34
56	0.32
57	0.28
58	0.27
59	0.28
60	0.24
61	0.22
62	0.23
63	0.25
64	0.25
65	0.28
66	0.29
67	0.27
68	0.29
69	0.31
70	0.36
71	0.4
72	0.43
73	0.44
74	0.49
75	0.57
76	0.57
77	0.61
78	0.55
79	0.48
80	0.41
81	0.37
82	0.29
83	0.21
84	0.2
85	0.15
86	0.14
87	0.12
88	0.12
89	0.12
90	0.14
91	0.18
92	0.17
93	0.24
94	0.28
95	0.33
96	0.4
97	0.43
98	0.42
99	0.47
100	0.53
101	0.5
102	0.54
103	0.54
104	0.57
105	0.6
106	0.64
107	0.58
108	0.56
109	0.55
110	0.54
111	0.54
112	0.47
113	0.4
114	0.36
115	0.36
116	0.38
117	0.43
118	0.46
119	0.5
120	0.57
121	0.65
122	0.73
123	0.8
124	0.83
125	0.85
126	0.87
127	0.89
128	0.9
129	0.91
130	0.92
131	0.95
132	0.96
133	0.95
134	0.94
135	0.94
136	0.93
137	0.91
138	0.9
139	0.83
140	0.75
141	0.68
142	0.58
143	0.48
144	0.38
145	0.29
146	0.19
147	0.14
148	0.11
149	0.08
150	0.08
151	0.06
152	0.06
153	0.06
154	0.07
155	0.08
156	0.1
157	0.13
158	0.14
159	0.17
160	0.21
161	0.21
162	0.2
163	0.23
164	0.25
165	0.25
166	0.25
167	0.22
168	0.18
169	0.21
170	0.22
171	0.24
172	0.22
173	0.2
174	0.19
175	0.19
176	0.19
177	0.16
178	0.16
179	0.11
180	0.09
181	0.07
182	0.07
183	0.08
184	0.08
185	0.09
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.07
194	0.1
195	0.11
196	0.11
197	0.13
198	0.13
199	0.16
200	0.19
201	0.21
202	0.27
203	0.3
204	0.31
205	0.29
206	0.3
207	0.29
208	0.27
209	0.27
210	0.2
211	0.16
212	0.15
213	0.16
214	0.16
215	0.14
216	0.12
217	0.11
218	0.12
219	0.18
220	0.19
221	0.2
222	0.23
223	0.24
224	0.25
225	0.31
226	0.27
227	0.25
228	0.27
229	0.29
230	0.28
231	0.29
232	0.28
233	0.27
234	0.27
235	0.23
236	0.2
237	0.17
238	0.16
239	0.14
240	0.14
241	0.09
242	0.1
243	0.1
244	0.1
245	0.1
246	0.1
247	0.11
248	0.11
249	0.12
250	0.13
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.18
255	0.23
256	0.27
257	0.28
258	0.28
259	0.28
260	0.29
261	0.34
262	0.3
263	0.26
264	0.23
265	0.22
266	0.21
267	0.21
268	0.18
269	0.12
270	0.12
271	0.1
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.07
279	0.07
280	0.06
281	0.06
282	0.06
283	0.05
284	0.06
285	0.05
286	0.06
287	0.06
288	0.06
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.09
293	0.09
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.1
301	0.1
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.08
306	0.07
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.11
312	0.15
313	0.17
314	0.21
315	0.26
316	0.3
317	0.33
318	0.4
319	0.46
320	0.45
321	0.46
322	0.44
323	0.46
324	0.43
325	0.41
326	0.32
327	0.23
328	0.19
329	0.17
330	0.14
331	0.07
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.05
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.04
340	0.04
341	0.05
342	0.06
343	0.06
344	0.08
345	0.08
346	0.09
347	0.11
348	0.14
349	0.15
350	0.17
351	0.2
352	0.2
353	0.23
354	0.3
355	0.37
356	0.38
357	0.42
358	0.46
359	0.49
360	0.49
361	0.47
362	0.46
363	0.39
364	0.35
365	0.3
366	0.24
367	0.19
368	0.17
369	0.16
370	0.11
371	0.1
372	0.09
373	0.08
374	0.09
375	0.08
376	0.08
377	0.07
378	0.06
379	0.06
380	0.06
381	0.06
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.06
387	0.07
388	0.06
389	0.07
390	0.12
391	0.12
392	0.12
393	0.12
394	0.13
395	0.12
396	0.13
397	0.15
398	0.1
399	0.11
400	0.11
401	0.11
402	0.1
403	0.11
404	0.1
405	0.08
406	0.09
407	0.14
408	0.17
409	0.24
410	0.3
411	0.31
412	0.35
413	0.37
414	0.4
415	0.39
416	0.41
417	0.38
418	0.4
419	0.45
420	0.46
421	0.45
422	0.41
423	0.4
424	0.37
425	0.4
426	0.37
427	0.32
428	0.29
429	0.3
430	0.29
431	0.27
432	0.25
433	0.19
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.14
438	0.16
439	0.15
440	0.14
441	0.16
442	0.15
443	0.15
444	0.15
445	0.12
446	0.09
447	0.11
448	0.11
449	0.11
450	0.12
451	0.12
452	0.1
453	0.12
454	0.14
455	0.14
456	0.16
457	0.17
458	0.18
459	0.21
460	0.24
461	0.22
462	0.21
463	0.19
464	0.16
465	0.15
466	0.13
467	0.1
468	0.07
469	0.07
470	0.06
471	0.05
472	0.05
473	0.05
474	0.05
475	0.04
476	0.03
477	0.03
478	0.04
479	0.07
480	0.08
481	0.09
482	0.11
483	0.12
484	0.14
485	0.15
486	0.18
487	0.16
488	0.19
489	0.19
490	0.18
491	0.17
492	0.16
493	0.14
494	0.12
495	0.1
496	0.09
497	0.08
498	0.07
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.11
503	0.14
504	0.14
505	0.17
506	0.17
507	0.15
508	0.16
509	0.16
510	0.15
511	0.12
512	0.12
513	0.11
514	0.16
515	0.2
516	0.19
517	0.23
518	0.24
519	0.3
520	0.39
521	0.44
522	0.47
523	0.5
524	0.52
525	0.51
526	0.52
527	0.46
528	0.4
529	0.34
530	0.28
531	0.25
532	0.25
533	0.22
534	0.26
535	0.27
536	0.29
537	0.34
538	0.36
539	0.36
540	0.39
541	0.46
542	0.43
543	0.51
544	0.51
545	0.49
546	0.52
547	0.48
548	0.42
549	0.35
550	0.31
551	0.21
552	0.15
553	0.13
554	0.06
555	0.07
556	0.08
557	0.09
558	0.1
559	0.1
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.11
568	0.15
569	0.15
570	0.14
571	0.13
572	0.15
573	0.14
574	0.16
575	0.13
576	0.1
577	0.1
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.13
582	0.11
583	0.11
584	0.11
585	0.1
586	0.1
587	0.1
588	0.08
589	0.09
590	0.08
591	0.07
592	0.08
593	0.07
594	0.07
595	0.07
596	0.06
597	0.04
598	0.04
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.08
604	0.08
605	0.08
606	0.09
607	0.09
608	0.09
609	0.08
610	0.07
611	0.06
612	0.07
613	0.07
614	0.06
615	0.05
616	0.05
617	0.05
618	0.04
619	0.04
620	0.03
621	0.03
622	0.05
623	0.05
624	0.04
625	0.06
626	0.07
627	0.08
628	0.11
629	0.14
630	0.19
631	0.25
632	0.32
633	0.4
634	0.44
635	0.47
636	0.47
637	0.48
638	0.45
639	0.43
640	0.44
641	0.35
642	0.32
643	0.31
644	0.28
645	0.29
646	0.29
647	0.32
648	0.25
649	0.27
650	0.29
651	0.28
652	0.31
653	0.32
654	0.32
655	0.26
656	0.25
657	0.23
658	0.2
659	0.18
660	0.15
661	0.11
662	0.09
663	0.09
664	0.12
665	0.18
666	0.22
667	0.31
668	0.36
669	0.4
670	0.48
671	0.5
672	0.53
673	0.48
674	0.43
675	0.35
676	0.3
677	0.25
678	0.16
679	0.12
680	0.05
681	0.04
682	0.04
683	0.04
684	0.04
685	0.05
686	0.06
687	0.06
688	0.08
689	0.1
690	0.11
691	0.14
692	0.15
693	0.15
694	0.15
695	0.15
696	0.17
697	0.16
698	0.16
699	0.13
700	0.13
701	0.13
702	0.13
703	0.12
704	0.09
705	0.1
706	0.09
707	0.08
708	0.07
709	0.07
710	0.08
711	0.08
712	0.07
713	0.05
714	0.05
715	0.06
716	0.08
717	0.08
718	0.07
719	0.07
720	0.08
721	0.08
722	0.09
723	0.09
724	0.07
725	0.07
726	0.07
727	0.07
728	0.06
729	0.06
730	0.05
731	0.04
732	0.03
733	0.04
734	0.11
735	0.11
736	0.12
737	0.14
738	0.21
739	0.23
740	0.23
741	0.29
742	0.26
743	0.36
744	0.36
745	0.37
746	0.34
747	0.34
748	0.39
749	0.35
750	0.34
751	0.26
752	0.25
753	0.24
754	0.22
755	0.22
756	0.23
757	0.21
758	0.21
759	0.22
760	0.29
761	0.29
762	0.27
763	0.27
764	0.2
765	0.2
766	0.19
767	0.18
768	0.12
769	0.12
770	0.13
771	0.13
772	0.13
773	0.12
774	0.11
775	0.11
776	0.1
777	0.11
778	0.09
779	0.09
780	0.09
781	0.11
782	0.11
783	0.1
784	0.1
785	0.09
786	0.09
787	0.08
788	0.07
789	0.05
790	0.05
791	0.04
792	0.04
793	0.03
794	0.03
795	0.03
796	0.03
797	0.04
798	0.03
799	0.04
800	0.05
801	0.05
802	0.05
803	0.06
804	0.06
805	0.06
806	0.06
807	0.06
808	0.06
809	0.06
810	0.06
811	0.04
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.07
816	0.08
817	0.08
818	0.1
819	0.12
820	0.16
821	0.24
822	0.29
823	0.34
824	0.4
825	0.45
826	0.48
827	0.54
828	0.5
829	0.46
830	0.45
831	0.43
832	0.37
833	0.33
834	0.28
835	0.21
836	0.22
837	0.22
838	0.19
839	0.2
840	0.22
841	0.24
842	0.3
843	0.33
844	0.36
845	0.37
846	0.38
847	0.33
848	0.37
849	0.34
850	0.3
851	0.26
852	0.21
853	0.18
854	0.14
855	0.13
856	0.08
857	0.08
858	0.08
859	0.12
860	0.14
861	0.14
862	0.15
863	0.19
864	0.21
865	0.24
866	0.25
867	0.24
868	0.25
869	0.26
870	0.26
871	0.23
872	0.22
873	0.26
874	0.25
875	0.26
876	0.24
877	0.25
878	0.25
879	0.25
880	0.26
881	0.17
882	0.16
883	0.13
884	0.12
885	0.1
886	0.08
887	0.07
888	0.05
889	0.05
890	0.05
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.05
895	0.05
896	0.05
897	0.06
898	0.07
899	0.08
900	0.08
901	0.08
902	0.08
903	0.09
904	0.09
905	0.09
906	0.08
907	0.1
908	0.13
909	0.16
910	0.21
911	0.27
912	0.33
913	0.41
914	0.46
915	0.51
916	0.53
917	0.54
918	0.49
919	0.48
920	0.42
921	0.34
922	0.32
923	0.25
924	0.23
925	0.19
926	0.18
927	0.14
928	0.14
929	0.15
930	0.11
931	0.11
932	0.11
933	0.15
934	0.17
935	0.17
936	0.2
937	0.21
938	0.22
939	0.25
940	0.25
941	0.22
942	0.2
943	0.19
944	0.17
945	0.18
946	0.16
947	0.12
948	0.1
949	0.09
950	0.09
951	0.08
952	0.08
953	0.08
954	0.09
955	0.09
956	0.1
957	0.14
958	0.15
959	0.24
960	0.3
961	0.35
962	0.36
963	0.37
964	0.38
965	0.4
966	0.42
967	0.35
968	0.32
969	0.3
970	0.29
971	0.31
972	0.29
973	0.23
974	0.21
975	0.19
976	0.15
977	0.1
978	0.12
979	0.09
980	0.08
981	0.07
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.06
986	0.05
987	0.04
988	0.06
989	0.07
990	0.11
991	0.12
992	0.14
993	0.15
994	0.15
995	0.19
996	0.18
997	0.2
998	0.21
999	0.21
1000	0.2
1001	0.21
1002	0.2
1003	0.17
1004	0.15
1005	0.14
1006	0.1
1007	0.1
1008	0.09
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.13
1012	0.14
1013	0.15
1014	0.18
1015	0.19
1016	0.19
1017	0.18
1018	0.19
1019	0.2
1020	0.2
1021	0.2
1022	0.18
1023	0.22
1024	0.23
1025	0.25
1026	0.26
1027	0.25
1028	0.26
1029	0.26
1030	0.26
1031	0.24
1032	0.26
1033	0.23
1034	0.22
1035	0.2
1036	0.18
1037	0.18
1038	0.16
1039	0.18
1040	0.14
1041	0.15
1042	0.16
1043	0.21
1044	0.21
1045	0.2
1046	0.19
1047	0.17
1048	0.16
1049	0.16
1050	0.15
1051	0.08
1052	0.07
1053	0.07
1054	0.07
1055	0.07
1056	0.09
1057	0.09
1058	0.1
1059	0.12
1060	0.12
1061	0.12
1062	0.12
1063	0.12
1064	0.1
1065	0.1
1066	0.08
1067	0.06
1068	0.08
1069	0.07
1070	0.07
1071	0.06
1072	0.06
1073	0.04
1074	0.05
1075	0.07
1076	0.06
1077	0.06
1078	0.09
1079	0.11
1080	0.13
1081	0.15
1082	0.17
1083	0.21
1084	0.23
1085	0.25
1086	0.23
1087	0.22
1088	0.21
1089	0.22
1090	0.19
1091	0.13
1092	0.11
1093	0.09
1094	0.07
1095	0.07
1096	0.06
1097	0.04
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.05
1101	0.05
1102	0.04
1103	0.05
1104	0.07
1105	0.09
1106	0.1
1107	0.11
1108	0.11
1109	0.12
1110	0.13
1111	0.13
1112	0.12
1113	0.11
1114	0.11
1115	0.16
1116	0.18
1117	0.17
1118	0.16
1119	0.16
1120	0.15
1121	0.14
1122	0.14
1123	0.11
1124	0.11
1125	0.15
1126	0.2
1127	0.21
1128	0.2
1129	0.21
1130	0.2
1131	0.17
1132	0.14
1133	0.11
1134	0.07
1135	0.08
1136	0.08
1137	0.07
1138	0.1
1139	0.11
1140	0.13
1141	0.17
1142	0.18
1143	0.23
1144	0.33
1145	0.41
1146	0.47
1147	0.54
1148	0.62
1149	0.64
1150	0.69
1151	0.7
1152	0.61
1153	0.57
1154	0.58
1155	0.51
1156	0.43
1157	0.38
1158	0.32
1159	0.3
1160	0.33
1161	0.33
1162	0.32
1163	0.32
1164	0.34
1165	0.39
1166	0.39
1167	0.36
1168	0.32
1169	0.34
1170	0.29
1171	0.33
1172	0.32
1173	0.31
1174	0.32
1175	0.31
1176	0.36
1177	0.31
1178	0.28
1179	0.23
1180	0.24
1181	0.2
1182	0.24
1183	0.26
1184	0.22
1185	0.25
1186	0.29
1187	0.32
1188	0.32
1189	0.33
1190	0.29
1191	0.25
1192	0.24
1193	0.21
1194	0.16
1195	0.11
1196	0.09
1197	0.06
1198	0.05
1199	0.05
1200	0.05
1201	0.05
1202	0.05
1203	0.05
1204	0.05
1205	0.05
1206	0.05
1207	0.06
1208	0.06
1209	0.07
1210	0.08
1211	0.08
1212	0.08
1213	0.09
1214	0.09
1215	0.08
1216	0.08
1217	0.08
1218	0.07
1219	0.09
1220	0.14
1221	0.14
1222	0.13
1223	0.16
1224	0.16
1225	0.17
1226	0.18
1227	0.18
1228	0.2
1229	0.2
1230	0.25
1231	0.3
1232	0.32
1233	0.32

A0A2X0MSK2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer