FuNGI

A0A2X0NPG0

Protein Details

Accession

A0A2X0NPG0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
158-195	DPECPKYDPNAKRGRNKNHSNKKKKQHKHSKGSADSEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
168-188	AKRGRNKNHSNKKKKQHKHSK

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 9, nucl 8.5, cyto 8.5, mito 5, plas 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF14223 Retrotran_gag_2 PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MVKSKSLSAKNIWEKLKQHHEGNADPFKIRTLLYEISNASYDEDTNLGEFLQGITDKVDQLEDLGQKFKDEAIVALMLQALPPSYEMLKQAIKLSDKCSVDYAVNRLTDEYSERKLTGKYDKLLKNAGALAVREGTQVKRDPNCICRGCKGTGHYQIDPECPKYDPNAKRGRNKNHSNKKKKQHKHSKGSADSEESASFALVVKSLEESHSLHINVANRVSQNDQSEIWILDTGASQHYVGNASLLTDRQHGSLNVQTASGQVVHCDMYGTVRFKLRSGASLSLSNVYHLPGAPVNLVSTRALYRSGASCGWEDGRDVMTIKIKGLTVAKTLNGTGYTLDFTRIVEDQAHVATRATVGAPLMEWHRRYGHIAVSSLKELVKSGAVDGLVLTDEKVHDCEPCISSKSRVSKFSESVTHVTDVLQRVFMDIGFVAEDQVDFQGRKAYLAIVDQYSTAKWTFPLKTKSAEEVTRVWIAFRQGVEKMTGRKIKRVRTDNGNEFTNKLIGTDFQSQGILHETSAPYTPQQNGTVERFNGSLMAIVRAVLAASKLSWKYWSYAMEYATFVANRVLHSKLDGKTAYEVFYGKKPKVSHFRPFGSTVFAQVPKSKRSKLEPTSVRGTFIGYDNEYNYRVLVDSDSEHKVVITRDIAVLNLQPEEVRAPEVTTLLEGPDEDVGPVLEGNDAGDELQDEVAVEQIAPARPNRPCWEYGDPAVRGRNPGRFEEIDAGNEIHQRTCGQRRIAEQQGLFVTDIPELDPEPPIMSGYAMISTDRPAVPSSYEEAMNNVEADKWKEAIQDELNAMDRHQVLADSDLPHGARALGSKWVFARKENAQGEVIRYKARLVAQGFAQRSGIDYNETFAPVARSTTILFLIAIAASQGLCLEQFDYDSAFLNGTMTEMVYMKYPKGWDRPQLGQVLRLVKSMYGTKQAPREWNSAVNKLMVACGYSRSDTDSCLYVKRVEEMFIYITLYVDDGLAASNDQTFLDSEIQAFNKVYQLKRLGPVKVFLGLEFLRSSKFIFVHQSKYIRSLVATYGGDHGSKHPAKVPMEPRLNMEHSAELFDDIALYQSAVGALQYAAHRARPDIVTSVRAAASKVSAPTQAYWIAVKRIIRYLQGTIDWGRKYNLEGSTVFELYSDASWGDDMLTGKSIGAFVSIMAGAAISWQSKQQSMVATSTTEAEILAASATAKEAMWLRRLAADLKIQQPGSTLLWEDNQAVIAIAQNPAHHGRTKHYSVHHFYIRERVTTGDIRIKYCKTGAMTADLLTKLLARNLFELHLLWEISKGSAVQRDLWHWEVGAAPDGGRWRCGVLIGLRGGLHADTI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.62
2	0.66
3	0.71
4	0.67
5	0.62
6	0.61
7	0.62
8	0.61
9	0.65
10	0.64
11	0.55
12	0.5
13	0.45
14	0.41
15	0.37
16	0.31
17	0.25
18	0.22
19	0.24
20	0.25
21	0.29
22	0.28
23	0.29
24	0.3
25	0.27
26	0.23
27	0.2
28	0.18
29	0.15
30	0.15
31	0.13
32	0.12
33	0.12
34	0.09
35	0.08
36	0.08
37	0.07
38	0.09
39	0.09
40	0.09
41	0.11
42	0.13
43	0.13
44	0.14
45	0.14
46	0.11
47	0.12
48	0.18
49	0.19
50	0.2
51	0.23
52	0.23
53	0.23
54	0.24
55	0.22
56	0.2
57	0.17
58	0.16
59	0.15
60	0.15
61	0.14
62	0.14
63	0.14
64	0.11
65	0.1
66	0.1
67	0.06
68	0.06
69	0.07
70	0.08
71	0.09
72	0.11
73	0.13
74	0.18
75	0.2
76	0.22
77	0.26
78	0.3
79	0.34
80	0.36
81	0.38
82	0.41
83	0.4
84	0.4
85	0.37
86	0.33
87	0.32
88	0.33
89	0.34
90	0.31
91	0.31
92	0.3
93	0.29
94	0.27
95	0.25
96	0.26
97	0.26
98	0.25
99	0.27
100	0.27
101	0.29
102	0.3
103	0.34
104	0.39
105	0.41
106	0.42
107	0.49
108	0.54
109	0.55
110	0.59
111	0.54
112	0.47
113	0.42
114	0.39
115	0.32
116	0.27
117	0.25
118	0.21
119	0.2
120	0.18
121	0.19
122	0.18
123	0.21
124	0.25
125	0.3
126	0.33
127	0.39
128	0.44
129	0.48
130	0.57
131	0.57
132	0.56
133	0.56
134	0.56
135	0.53
136	0.53
137	0.5
138	0.5
139	0.54
140	0.57
141	0.52
142	0.52
143	0.51
144	0.53
145	0.52
146	0.46
147	0.37
148	0.32
149	0.32
150	0.33
151	0.41
152	0.4
153	0.46
154	0.53
155	0.59
156	0.68
157	0.77
158	0.81
159	0.82
160	0.86
161	0.88
162	0.89
163	0.92
164	0.93
165	0.93
166	0.93
167	0.94
168	0.93
169	0.94
170	0.94
171	0.94
172	0.93
173	0.93
174	0.93
175	0.9
176	0.86
177	0.78
178	0.72
179	0.63
180	0.54
181	0.44
182	0.33
183	0.26
184	0.19
185	0.15
186	0.11
187	0.09
188	0.07
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.09
193	0.1
194	0.12
195	0.13
196	0.15
197	0.19
198	0.19
199	0.19
200	0.21
201	0.24
202	0.24
203	0.24
204	0.24
205	0.21
206	0.23
207	0.25
208	0.27
209	0.26
210	0.26
211	0.24
212	0.23
213	0.24
214	0.23
215	0.2
216	0.16
217	0.13
218	0.11
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.1
223	0.09
224	0.09
225	0.1
226	0.11
227	0.11
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.1
232	0.11
233	0.11
234	0.13
235	0.14
236	0.14
237	0.17
238	0.16
239	0.18
240	0.21
241	0.23
242	0.2
243	0.2
244	0.19
245	0.16
246	0.17
247	0.15
248	0.11
249	0.09
250	0.09
251	0.1
252	0.09
253	0.1
254	0.08
255	0.1
256	0.16
257	0.18
258	0.19
259	0.23
260	0.24
261	0.24
262	0.3
263	0.27
264	0.26
265	0.29
266	0.3
267	0.28
268	0.3
269	0.3
270	0.28
271	0.27
272	0.24
273	0.2
274	0.16
275	0.15
276	0.12
277	0.13
278	0.1
279	0.11
280	0.11
281	0.11
282	0.11
283	0.11
284	0.12
285	0.11
286	0.12
287	0.12
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.14
292	0.14
293	0.17
294	0.16
295	0.17
296	0.17
297	0.17
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.14
302	0.14
303	0.13
304	0.14
305	0.14
306	0.17
307	0.17
308	0.17
309	0.18
310	0.16
311	0.18
312	0.2
313	0.19
314	0.17
315	0.18
316	0.19
317	0.18
318	0.18
319	0.17
320	0.14
321	0.13
322	0.11
323	0.1
324	0.11
325	0.1
326	0.11
327	0.1
328	0.1
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.11
335	0.12
336	0.13
337	0.11
338	0.1
339	0.1
340	0.09
341	0.09
342	0.08
343	0.07
344	0.06
345	0.06
346	0.06
347	0.07
348	0.11
349	0.15
350	0.15
351	0.17
352	0.19
353	0.2
354	0.24
355	0.24
356	0.26
357	0.24
358	0.25
359	0.25
360	0.26
361	0.25
362	0.23
363	0.21
364	0.16
365	0.14
366	0.13
367	0.12
368	0.1
369	0.09
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.08
374	0.08
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.06
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.1
385	0.14
386	0.14
387	0.17
388	0.19
389	0.2
390	0.23
391	0.29
392	0.36
393	0.37
394	0.42
395	0.46
396	0.48
397	0.49
398	0.49
399	0.48
400	0.43
401	0.41
402	0.37
403	0.32
404	0.26
405	0.24
406	0.24
407	0.21
408	0.18
409	0.16
410	0.14
411	0.13
412	0.13
413	0.12
414	0.09
415	0.07
416	0.06
417	0.06
418	0.06
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.05
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.12
428	0.12
429	0.12
430	0.12
431	0.12
432	0.12
433	0.13
434	0.15
435	0.1
436	0.1
437	0.1
438	0.11
439	0.1
440	0.11
441	0.1
442	0.08
443	0.09
444	0.14
445	0.17
446	0.24
447	0.3
448	0.3
449	0.35
450	0.37
451	0.4
452	0.39
453	0.37
454	0.32
455	0.29
456	0.3
457	0.27
458	0.25
459	0.21
460	0.19
461	0.18
462	0.18
463	0.16
464	0.16
465	0.14
466	0.15
467	0.17
468	0.18
469	0.2
470	0.25
471	0.32
472	0.3
473	0.37
474	0.43
475	0.48
476	0.55
477	0.59
478	0.57
479	0.6
480	0.68
481	0.68
482	0.65
483	0.6
484	0.51
485	0.45
486	0.4
487	0.31
488	0.22
489	0.14
490	0.11
491	0.09
492	0.13
493	0.17
494	0.17
495	0.16
496	0.16
497	0.16
498	0.16
499	0.18
500	0.14
501	0.09
502	0.11
503	0.11
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.1
508	0.12
509	0.14
510	0.13
511	0.16
512	0.17
513	0.19
514	0.22
515	0.24
516	0.22
517	0.22
518	0.19
519	0.17
520	0.16
521	0.12
522	0.11
523	0.08
524	0.09
525	0.08
526	0.07
527	0.07
528	0.07
529	0.07
530	0.04
531	0.04
532	0.03
533	0.04
534	0.07
535	0.08
536	0.08
537	0.11
538	0.11
539	0.13
540	0.16
541	0.18
542	0.18
543	0.2
544	0.21
545	0.2
546	0.19
547	0.18
548	0.16
549	0.14
550	0.11
551	0.1
552	0.1
553	0.09
554	0.11
555	0.12
556	0.11
557	0.13
558	0.18
559	0.17
560	0.21
561	0.21
562	0.19
563	0.21
564	0.21
565	0.2
566	0.16
567	0.15
568	0.12
569	0.18
570	0.21
571	0.19
572	0.23
573	0.23
574	0.29
575	0.38
576	0.43
577	0.46
578	0.49
579	0.52
580	0.5
581	0.51
582	0.45
583	0.4
584	0.34
585	0.27
586	0.24
587	0.22
588	0.2
589	0.22
590	0.24
591	0.25
592	0.3
593	0.3
594	0.31
595	0.36
596	0.45
597	0.45
598	0.52
599	0.51
600	0.52
601	0.55
602	0.52
603	0.46
604	0.36
605	0.32
606	0.23
607	0.2
608	0.17
609	0.11
610	0.11
611	0.11
612	0.13
613	0.13
614	0.12
615	0.1
616	0.09
617	0.08
618	0.08
619	0.07
620	0.06
621	0.07
622	0.1
623	0.11
624	0.11
625	0.11
626	0.11
627	0.12
628	0.11
629	0.12
630	0.09
631	0.08
632	0.09
633	0.09
634	0.1
635	0.08
636	0.09
637	0.07
638	0.07
639	0.06
640	0.05
641	0.05
642	0.06
643	0.06
644	0.06
645	0.06
646	0.06
647	0.06
648	0.07
649	0.06
650	0.06
651	0.06
652	0.05
653	0.05
654	0.04
655	0.04
656	0.04
657	0.04
658	0.04
659	0.04
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.03
664	0.03
665	0.03
666	0.03
667	0.03
668	0.03
669	0.03
670	0.03
671	0.03
672	0.03
673	0.03
674	0.03
675	0.03
676	0.03
677	0.03
678	0.04
679	0.03
680	0.03
681	0.05
682	0.06
683	0.07
684	0.08
685	0.12
686	0.13
687	0.17
688	0.21
689	0.22
690	0.23
691	0.28
692	0.33
693	0.31
694	0.33
695	0.35
696	0.32
697	0.31
698	0.32
699	0.26
700	0.25
701	0.25
702	0.27
703	0.24
704	0.24
705	0.27
706	0.25
707	0.26
708	0.27
709	0.25
710	0.2
711	0.19
712	0.18
713	0.14
714	0.15
715	0.14
716	0.1
717	0.1
718	0.1
719	0.13
720	0.2
721	0.24
722	0.25
723	0.28
724	0.31
725	0.38
726	0.42
727	0.41
728	0.34
729	0.31
730	0.29
731	0.27
732	0.23
733	0.17
734	0.13
735	0.09
736	0.09
737	0.07
738	0.07
739	0.06
740	0.07
741	0.07
742	0.06
743	0.06
744	0.06
745	0.06
746	0.06
747	0.06
748	0.05
749	0.05
750	0.06
751	0.05
752	0.05
753	0.06
754	0.06
755	0.08
756	0.08
757	0.09
758	0.09
759	0.09
760	0.1
761	0.11
762	0.13
763	0.13
764	0.13
765	0.12
766	0.13
767	0.13
768	0.12
769	0.11
770	0.08
771	0.08
772	0.08
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.11
777	0.12
778	0.13
779	0.16
780	0.16
781	0.15
782	0.15
783	0.15
784	0.16
785	0.15
786	0.14
787	0.13
788	0.12
789	0.11
790	0.11
791	0.1
792	0.08
793	0.1
794	0.12
795	0.11
796	0.11
797	0.12
798	0.12
799	0.11
800	0.11
801	0.09
802	0.07
803	0.07
804	0.07
805	0.13
806	0.13
807	0.14
808	0.16
809	0.21
810	0.22
811	0.22
812	0.27
813	0.24
814	0.33
815	0.33
816	0.33
817	0.3
818	0.3
819	0.32
820	0.29
821	0.27
822	0.19
823	0.18
824	0.16
825	0.17
826	0.18
827	0.19
828	0.18
829	0.19
830	0.21
831	0.27
832	0.28
833	0.25
834	0.24
835	0.18
836	0.18
837	0.17
838	0.14
839	0.1
840	0.09
841	0.11
842	0.11
843	0.11
844	0.1
845	0.1
846	0.11
847	0.09
848	0.1
849	0.09
850	0.09
851	0.09
852	0.11
853	0.1
854	0.09
855	0.08
856	0.07
857	0.07
858	0.06
859	0.05
860	0.04
861	0.04
862	0.03
863	0.03
864	0.03
865	0.03
866	0.03
867	0.03
868	0.04
869	0.04
870	0.04
871	0.05
872	0.06
873	0.06
874	0.07
875	0.07
876	0.07
877	0.07
878	0.07
879	0.06
880	0.06
881	0.05
882	0.04
883	0.05
884	0.05
885	0.06
886	0.08
887	0.09
888	0.09
889	0.11
890	0.13
891	0.17
892	0.24
893	0.29
894	0.34
895	0.39
896	0.43
897	0.45
898	0.5
899	0.47
900	0.41
901	0.41
902	0.38
903	0.33
904	0.3
905	0.25
906	0.19
907	0.2
908	0.21
909	0.19
910	0.2
911	0.21
912	0.24
913	0.3
914	0.34
915	0.39
916	0.4
917	0.42
918	0.38
919	0.45
920	0.44
921	0.42
922	0.39
923	0.33
924	0.29
925	0.25
926	0.23
927	0.15
928	0.12
929	0.08
930	0.1
931	0.11
932	0.11
933	0.11
934	0.15
935	0.16
936	0.16
937	0.17
938	0.18
939	0.17
940	0.19
941	0.2
942	0.18
943	0.19
944	0.21
945	0.21
946	0.19
947	0.18
948	0.18
949	0.18
950	0.15
951	0.15
952	0.11
953	0.1
954	0.09
955	0.08
956	0.06
957	0.05
958	0.04
959	0.04
960	0.04
961	0.04
962	0.04
963	0.04
964	0.04
965	0.05
966	0.05
967	0.06
968	0.06
969	0.08
970	0.1
971	0.1
972	0.11
973	0.13
974	0.14
975	0.14
976	0.14
977	0.12
978	0.15
979	0.2
980	0.2
981	0.24
982	0.28
983	0.3
984	0.37
985	0.41
986	0.41
987	0.38
988	0.39
989	0.34
990	0.34
991	0.31
992	0.24
993	0.23
994	0.19
995	0.19
996	0.18
997	0.17
998	0.13
999	0.13
1000	0.15
1001	0.13
1002	0.14
1003	0.14
1004	0.23
1005	0.26
1006	0.31
1007	0.37
1008	0.4
1009	0.38
1010	0.41
1011	0.4
1012	0.32
1013	0.29
1014	0.25
1015	0.2
1016	0.21
1017	0.2
1018	0.17
1019	0.18
1020	0.18
1021	0.18
1022	0.17
1023	0.17
1024	0.21
1025	0.22
1026	0.23
1027	0.25
1028	0.31
1029	0.33
1030	0.41
1031	0.46
1032	0.46
1033	0.51
1034	0.51
1035	0.5
1036	0.49
1037	0.49
1038	0.43
1039	0.37
1040	0.3
1041	0.24
1042	0.25
1043	0.22
1044	0.16
1045	0.14
1046	0.12
1047	0.1
1048	0.07
1049	0.08
1050	0.06
1051	0.06
1052	0.05
1053	0.05
1054	0.05
1055	0.05
1056	0.04
1057	0.04
1058	0.04
1059	0.06
1060	0.07
1061	0.11
1062	0.12
1063	0.14
1064	0.15
1065	0.15
1066	0.2
1067	0.19
1068	0.2
1069	0.22
1070	0.23
1071	0.23
1072	0.24
1073	0.25
1074	0.22
1075	0.21
1076	0.19
1077	0.15
1078	0.15
1079	0.15
1080	0.16
1081	0.15
1082	0.17
1083	0.18
1084	0.19
1085	0.21
1086	0.2
1087	0.19
1088	0.2
1089	0.2
1090	0.2
1091	0.22
1092	0.24
1093	0.23
1094	0.28
1095	0.29
1096	0.3
1097	0.31
1098	0.31
1099	0.31
1100	0.29
1101	0.3
1102	0.27
1103	0.31
1104	0.29
1105	0.28
1106	0.26
1107	0.24
1108	0.25
1109	0.28
1110	0.27
1111	0.24
1112	0.23
1113	0.26
1114	0.29
1115	0.28
1116	0.25
1117	0.19
1118	0.17
1119	0.15
1120	0.15
1121	0.11
1122	0.07
1123	0.07
1124	0.07
1125	0.07
1126	0.07
1127	0.09
1128	0.09
1129	0.09
1130	0.11
1131	0.11
1132	0.11
1133	0.11
1134	0.11
1135	0.08
1136	0.08
1137	0.07
1138	0.05
1139	0.07
1140	0.07
1141	0.06
1142	0.06
1143	0.06
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.07
1147	0.06
1148	0.06
1149	0.1
1150	0.12
1151	0.13
1152	0.15
1153	0.17
1154	0.21
1155	0.23
1156	0.25
1157	0.23
1158	0.22
1159	0.22
1160	0.22
1161	0.19
1162	0.14
1163	0.11
1164	0.09
1165	0.08
1166	0.07
1167	0.06
1168	0.05
1169	0.05
1170	0.05
1171	0.05
1172	0.06
1173	0.06
1174	0.07
1175	0.13
1176	0.16
1177	0.2
1178	0.2
1179	0.21
1180	0.23
1181	0.25
1182	0.25
1183	0.25
1184	0.29
1185	0.31
1186	0.35
1187	0.39
1188	0.36
1189	0.35
1190	0.34
1191	0.34
1192	0.28
1193	0.24
1194	0.2
1195	0.16
1196	0.18
1197	0.19
1198	0.19
1199	0.16
1200	0.14
1201	0.13
1202	0.12
1203	0.1
1204	0.11
1205	0.1
1206	0.11
1207	0.12
1208	0.12
1209	0.15
1210	0.19
1211	0.22
1212	0.24
1213	0.25
1214	0.3
1215	0.38
1216	0.43
1217	0.46
1218	0.5
1219	0.56
1220	0.59
1221	0.65
1222	0.65
1223	0.59
1224	0.56
1225	0.59
1226	0.54
1227	0.47
1228	0.4
1229	0.34
1230	0.33
1231	0.34
1232	0.37
1233	0.36
1234	0.36
1235	0.38
1236	0.43
1237	0.43
1238	0.41
1239	0.39
1240	0.38
1241	0.33
1242	0.37
1243	0.35
1244	0.34
1245	0.33
1246	0.31
1247	0.34
1248	0.29
1249	0.25
1250	0.2
1251	0.19
1252	0.15
1253	0.18
1254	0.19
1255	0.17
1256	0.19
1257	0.21
1258	0.21
1259	0.21
1260	0.2
1261	0.18
1262	0.19
1263	0.17
1264	0.15
1265	0.15
1266	0.15
1267	0.14
1268	0.14
1269	0.13
1270	0.14
1271	0.19
1272	0.21
1273	0.25
1274	0.28
1275	0.31
1276	0.37
1277	0.38
1278	0.35
1279	0.29
1280	0.28
1281	0.25
1282	0.23
1283	0.22
1284	0.17
1285	0.14
1286	0.16
1287	0.22
1288	0.22
1289	0.21
1290	0.2
1291	0.18
1292	0.18
1293	0.19
1294	0.21
1295	0.19
1296	0.24
1297	0.24
1298	0.26
1299	0.24
1300	0.24
1301	0.24

A0A2X0NPG0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer