Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CA16

Protein Details
Accession A1CA16    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
49-78ETDGTQKKTKKIIRRKRRPARPQVDPATIKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
55-69KKTKKIIRRKRRPAR
309-311KKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR034181  Cwc2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0000974  C:Prp19 complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG act:ACLA_010070  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
PS50103  ZF_C3H1  
CDD cd12360  RRM_cwf2  
Amino Acid Sequences MAETAVVDPPHATEPTPLRTESAEPEGPAPSDENALTQTSETAAVTVTETDGTQKKTKKIIRRKRRPARPQVDPATIKSEPPPQTGTIFNIWYNKWSGGDREDKYLSKHAAPSRCNIVKDSGYTRADKVPGSYFCLFFARGVCPKGHECEYLHRLPTLHDLFNPNVDCFGRDKFSDYRDDMGGVGSFTRQNRTLYVGRIHVTDDIEEVVSRHFAEWGQIDRIRVLTSRGVAFVTYTNEANAQFAKEAMAHQSLDHNEILNVRWATVDPNPLAQKREARRLEEQAAEAVRRALPAEFVAELEGRDPEARKKKKIEGSFGLDGYEAPDDVWYSRAKQLEDAGSAGQLEAPEQHLMIEAAAAASSSSAAIAPQPQSESGGIFSTSTVAALRGLTGGSVVTQKAPASSGGPLVAYGSDDDSD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.31
3 0.34
4 0.32
5 0.3
6 0.32
7 0.34
8 0.33
9 0.35
10 0.31
11 0.28
12 0.3
13 0.3
14 0.28
15 0.26
16 0.23
17 0.16
18 0.17
19 0.16
20 0.15
21 0.15
22 0.16
23 0.15
24 0.13
25 0.13
26 0.11
27 0.12
28 0.11
29 0.09
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.09
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.12
38 0.17
39 0.21
40 0.27
41 0.33
42 0.38
43 0.47
44 0.55
45 0.61
46 0.68
47 0.75
48 0.79
49 0.85
50 0.91
51 0.92
52 0.95
53 0.96
54 0.96
55 0.94
56 0.92
57 0.91
58 0.86
59 0.85
60 0.76
61 0.67
62 0.63
63 0.55
64 0.46
65 0.39
66 0.41
67 0.35
68 0.35
69 0.36
70 0.3
71 0.32
72 0.33
73 0.33
74 0.28
75 0.26
76 0.25
77 0.26
78 0.25
79 0.25
80 0.25
81 0.22
82 0.21
83 0.2
84 0.21
85 0.23
86 0.31
87 0.3
88 0.33
89 0.36
90 0.35
91 0.37
92 0.41
93 0.38
94 0.32
95 0.38
96 0.38
97 0.43
98 0.43
99 0.43
100 0.47
101 0.48
102 0.46
103 0.41
104 0.4
105 0.34
106 0.36
107 0.36
108 0.34
109 0.32
110 0.32
111 0.33
112 0.32
113 0.31
114 0.28
115 0.26
116 0.25
117 0.24
118 0.29
119 0.28
120 0.25
121 0.25
122 0.26
123 0.24
124 0.18
125 0.19
126 0.17
127 0.18
128 0.2
129 0.19
130 0.2
131 0.22
132 0.25
133 0.26
134 0.25
135 0.23
136 0.3
137 0.35
138 0.35
139 0.34
140 0.31
141 0.29
142 0.27
143 0.33
144 0.28
145 0.23
146 0.22
147 0.24
148 0.24
149 0.28
150 0.28
151 0.2
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.15
156 0.16
157 0.14
158 0.13
159 0.17
160 0.18
161 0.2
162 0.24
163 0.24
164 0.24
165 0.22
166 0.23
167 0.19
168 0.17
169 0.14
170 0.09
171 0.08
172 0.06
173 0.08
174 0.08
175 0.11
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.19
180 0.21
181 0.21
182 0.24
183 0.23
184 0.22
185 0.22
186 0.22
187 0.18
188 0.16
189 0.13
190 0.1
191 0.08
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.08
203 0.1
204 0.13
205 0.14
206 0.15
207 0.15
208 0.15
209 0.14
210 0.13
211 0.13
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.08
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.07
233 0.07
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.13
239 0.14
240 0.16
241 0.16
242 0.13
243 0.12
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.14
252 0.15
253 0.19
254 0.13
255 0.18
256 0.22
257 0.23
258 0.26
259 0.26
260 0.32
261 0.33
262 0.43
263 0.42
264 0.43
265 0.47
266 0.51
267 0.52
268 0.46
269 0.42
270 0.35
271 0.33
272 0.28
273 0.23
274 0.18
275 0.14
276 0.12
277 0.12
278 0.09
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.09
283 0.08
284 0.09
285 0.09
286 0.09
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.11
292 0.18
293 0.29
294 0.35
295 0.42
296 0.48
297 0.56
298 0.63
299 0.69
300 0.69
301 0.65
302 0.67
303 0.64
304 0.58
305 0.49
306 0.4
307 0.33
308 0.26
309 0.19
310 0.11
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.1
316 0.09
317 0.12
318 0.17
319 0.2
320 0.2
321 0.22
322 0.26
323 0.28
324 0.28
325 0.26
326 0.22
327 0.19
328 0.18
329 0.16
330 0.12
331 0.08
332 0.07
333 0.07
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.03
348 0.04
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.06
354 0.1
355 0.12
356 0.13
357 0.15
358 0.16
359 0.18
360 0.19
361 0.18
362 0.16
363 0.16
364 0.14
365 0.13
366 0.12
367 0.11
368 0.1
369 0.1
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.07
377 0.07
378 0.07
379 0.06
380 0.07
381 0.09
382 0.09
383 0.1
384 0.12
385 0.13
386 0.13
387 0.14
388 0.15
389 0.14
390 0.15
391 0.16
392 0.15
393 0.15
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.11
398 0.11