FuNGI

A0A2X0NV47

Protein Details

Accession

A0A2X0NV47

Localization Confidence

Low

Confidence Score

6.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
52-73	SSSSRPTRPKCLACRSPSHRVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto_nucl 8.333, cyto_mito 8.333, cyto 8, nucl 7.5, mito 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR025724 GAG-pre-integrase_dom IPR001584 Integrase_cat-core IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR013103 RVT_2
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003887 F:DNA-directed DNA polymerase activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration GO:0032196 P:transposition
Pfam	View protein in Pfam PF13976 gag_pre-integrs PF00665 rve PF07727 RVT_2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09272 RNase_HI_RT_Ty1

Amino Acid Sequences

MISTYLFDQLYYFTNEQRTQRALPAINSLADRMRVQLRSTNVPSTQLALLASSSSRPTRPKCLACRSPSHRVAECPVRAKHPPPGPCRSCKQNHWSFDCKKALENGKKADTANSTANSQHHVGCIATGLLARRRQLRTNSFVVDLGATSHMVSDKSLFTTYRHIAPTKIGGIAGGINAIGTGNIAFVAASGHPITLTGVLHTPGLFVNLLSVSRLCDTDDVRVAFTKHGIDIDKNGHNIAEGTRLDEGLYLLDADHSKCQHLALLSRSQSSVPLLTLHRCLGHLAPSSIQKMVAAGLLEGLGAGYSDEEVEKFVCNACLSAKGHRLPFPDSDSHSSERLGLVHSDVLSLPERSLTGKQYLVTFLDDYSRKLWAYAIGHKSEVFSVFKTWLAEVELETGATLKVLRTDNGGEYCSRAFTDFCKVRGTRRQYSIPRTPQQNGRAERVNCSIVEGILALLADAHLPKTFWEEAAAYFVYCKNLVQHSALDKATPNSVWQGGRTTASALHPFGCAAWLTVAPKLRSKLDPKAVRVLFTGYDLASKAFRFYDTTTKKVTLGRNATFLDTEFPGLCGDSAEPDDDTHFASAPFADPQTTVKSWTPLVSTYREPASAEELPDELDLIGRHSRDESPDKIDFLTRHHRAFIATDDDTSDTEAIEPVKSITSDPQTWREAMSGDKLPAGATIVSSKFVWKTKRNALGEITGHKARLVAQGNRQRDGIDFTETFAPVARFSSIRSLLALAATNGLHVLRLRRSIYGLKQAGRIWNRHIDALLRDLGYTATGTDHCVYSRLDDRQRPHYIALYVDDLLMISPDLAEIERVISGLEQRYGVKRLGPAEYISASRFGDSTMVQSHYHRNGTSWTCLLGSTSTLRLRNYSPDDTRPFAHRHPRSSHERIRSWYLQAIGSLLYISLGTRPDIAFAVSYLARFANNPGHRHWIAVKHIFRYLRATYRDELVYARGEARITGVVGYSDANWGACVDTSISTMGYVFYIAGSAVSWSSKRQSRVADSTTDAEYLALSHAGKEGIYLSQLLEELHVQPVAPAHIFTDNEAAAAVARDPVRVTGTRHIRLREHFVRDMVNRGDISLSHVGTSDMVADIFTKALGPKVFSTHCYALGLRTRHPRLGSASHSRGGGCKESTLSSTEAPRSSRAPASPPLAVGT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.34
3	0.38
4	0.42
5	0.44
6	0.41
7	0.45
8	0.49
9	0.45
10	0.42
11	0.46
12	0.42
13	0.39
14	0.37
15	0.33
16	0.28
17	0.27
18	0.26
19	0.23
20	0.27
21	0.27
22	0.29
23	0.33
24	0.35
25	0.42
26	0.46
27	0.48
28	0.42
29	0.44
30	0.42
31	0.4
32	0.35
33	0.27
34	0.23
35	0.17
36	0.16
37	0.13
38	0.13
39	0.11
40	0.15
41	0.16
42	0.21
43	0.29
44	0.34
45	0.42
46	0.51
47	0.59
48	0.65
49	0.73
50	0.77
51	0.76
52	0.82
53	0.8
54	0.81
55	0.78
56	0.76
57	0.69
58	0.63
59	0.64
60	0.63
61	0.62
62	0.59
63	0.55
64	0.54
65	0.56
66	0.56
67	0.58
68	0.56
69	0.59
70	0.59
71	0.67
72	0.67
73	0.69
74	0.72
75	0.73
76	0.73
77	0.73
78	0.76
79	0.74
80	0.76
81	0.76
82	0.79
83	0.74
84	0.76
85	0.74
86	0.64
87	0.58
88	0.58
89	0.61
90	0.61
91	0.63
92	0.61
93	0.59
94	0.61
95	0.58
96	0.55
97	0.48
98	0.43
99	0.41
100	0.36
101	0.33
102	0.33
103	0.34
104	0.32
105	0.3
106	0.26
107	0.21
108	0.21
109	0.19
110	0.15
111	0.15
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.13
116	0.18
117	0.21
118	0.25
119	0.32
120	0.37
121	0.43
122	0.51
123	0.56
124	0.56
125	0.59
126	0.58
127	0.52
128	0.47
129	0.41
130	0.32
131	0.24
132	0.19
133	0.14
134	0.11
135	0.09
136	0.09
137	0.1
138	0.1
139	0.1
140	0.11
141	0.11
142	0.13
143	0.16
144	0.16
145	0.16
146	0.24
147	0.26
148	0.3
149	0.32
150	0.31
151	0.3
152	0.33
153	0.36
154	0.3
155	0.28
156	0.22
157	0.18
158	0.18
159	0.17
160	0.14
161	0.08
162	0.06
163	0.05
164	0.05
165	0.05
166	0.04
167	0.03
168	0.03
169	0.03
170	0.03
171	0.03
172	0.03
173	0.03
174	0.05
175	0.05
176	0.07
177	0.07
178	0.07
179	0.07
180	0.08
181	0.09
182	0.09
183	0.09
184	0.08
185	0.1
186	0.1
187	0.11
188	0.11
189	0.11
190	0.09
191	0.1
192	0.09
193	0.07
194	0.08
195	0.09
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.11
203	0.13
204	0.14
205	0.18
206	0.23
207	0.22
208	0.23
209	0.24
210	0.25
211	0.23
212	0.23
213	0.2
214	0.15
215	0.17
216	0.18
217	0.17
218	0.21
219	0.26
220	0.27
221	0.27
222	0.26
223	0.23
224	0.21
225	0.21
226	0.17
227	0.18
228	0.14
229	0.15
230	0.16
231	0.16
232	0.15
233	0.15
234	0.14
235	0.08
236	0.08
237	0.06
238	0.05
239	0.07
240	0.08
241	0.09
242	0.13
243	0.13
244	0.14
245	0.14
246	0.15
247	0.15
248	0.16
249	0.19
250	0.2
251	0.27
252	0.27
253	0.28
254	0.29
255	0.26
256	0.26
257	0.23
258	0.2
259	0.13
260	0.15
261	0.16
262	0.17
263	0.2
264	0.2
265	0.19
266	0.18
267	0.19
268	0.17
269	0.2
270	0.2
271	0.19
272	0.21
273	0.23
274	0.25
275	0.23
276	0.22
277	0.16
278	0.14
279	0.13
280	0.12
281	0.08
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.04
288	0.03
289	0.03
290	0.03
291	0.02
292	0.03
293	0.03
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.07
301	0.09
302	0.09
303	0.09
304	0.09
305	0.15
306	0.16
307	0.21
308	0.27
309	0.29
310	0.32
311	0.36
312	0.38
313	0.35
314	0.37
315	0.36
316	0.34
317	0.34
318	0.36
319	0.36
320	0.36
321	0.33
322	0.3
323	0.26
324	0.23
325	0.19
326	0.16
327	0.12
328	0.11
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.1
337	0.09
338	0.1
339	0.11
340	0.14
341	0.14
342	0.15
343	0.16
344	0.17
345	0.18
346	0.19
347	0.18
348	0.18
349	0.15
350	0.13
351	0.17
352	0.17
353	0.17
354	0.17
355	0.17
356	0.16
357	0.15
358	0.16
359	0.15
360	0.18
361	0.25
362	0.28
363	0.28
364	0.28
365	0.28
366	0.28
367	0.24
368	0.23
369	0.16
370	0.13
371	0.13
372	0.13
373	0.15
374	0.15
375	0.13
376	0.12
377	0.12
378	0.11
379	0.1
380	0.11
381	0.1
382	0.09
383	0.09
384	0.08
385	0.07
386	0.06
387	0.06
388	0.04
389	0.08
390	0.1
391	0.1
392	0.12
393	0.14
394	0.16
395	0.18
396	0.19
397	0.14
398	0.15
399	0.15
400	0.14
401	0.12
402	0.1
403	0.09
404	0.1
405	0.2
406	0.21
407	0.22
408	0.28
409	0.29
410	0.34
411	0.43
412	0.5
413	0.47
414	0.5
415	0.58
416	0.58
417	0.66
418	0.69
419	0.69
420	0.67
421	0.65
422	0.63
423	0.62
424	0.62
425	0.62
426	0.56
427	0.51
428	0.53
429	0.48
430	0.48
431	0.44
432	0.37
433	0.28
434	0.27
435	0.23
436	0.15
437	0.14
438	0.1
439	0.07
440	0.06
441	0.06
442	0.03
443	0.03
444	0.03
445	0.03
446	0.03
447	0.04
448	0.04
449	0.04
450	0.04
451	0.09
452	0.09
453	0.09
454	0.11
455	0.11
456	0.11
457	0.14
458	0.14
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.09
464	0.09
465	0.09
466	0.11
467	0.12
468	0.13
469	0.15
470	0.16
471	0.2
472	0.19
473	0.18
474	0.17
475	0.16
476	0.16
477	0.14
478	0.12
479	0.1
480	0.13
481	0.13
482	0.12
483	0.14
484	0.14
485	0.14
486	0.14
487	0.13
488	0.12
489	0.13
490	0.14
491	0.13
492	0.12
493	0.11
494	0.11
495	0.1
496	0.09
497	0.07
498	0.06
499	0.06
500	0.06
501	0.07
502	0.09
503	0.13
504	0.13
505	0.16
506	0.18
507	0.2
508	0.24
509	0.28
510	0.33
511	0.39
512	0.44
513	0.43
514	0.51
515	0.48
516	0.45
517	0.4
518	0.34
519	0.25
520	0.2
521	0.18
522	0.09
523	0.1
524	0.09
525	0.09
526	0.08
527	0.08
528	0.08
529	0.07
530	0.08
531	0.09
532	0.11
533	0.21
534	0.23
535	0.26
536	0.28
537	0.28
538	0.3
539	0.33
540	0.34
541	0.31
542	0.34
543	0.32
544	0.34
545	0.33
546	0.32
547	0.27
548	0.24
549	0.18
550	0.12
551	0.12
552	0.08
553	0.08
554	0.07
555	0.07
556	0.07
557	0.05
558	0.05
559	0.05
560	0.06
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.06
565	0.07
566	0.07
567	0.06
568	0.06
569	0.06
570	0.06
571	0.06
572	0.06
573	0.06
574	0.05
575	0.06
576	0.06
577	0.07
578	0.11
579	0.11
580	0.14
581	0.14
582	0.15
583	0.15
584	0.16
585	0.15
586	0.14
587	0.16
588	0.16
589	0.16
590	0.17
591	0.17
592	0.16
593	0.16
594	0.14
595	0.17
596	0.15
597	0.14
598	0.13
599	0.12
600	0.12
601	0.12
602	0.11
603	0.06
604	0.06
605	0.05
606	0.07
607	0.08
608	0.08
609	0.08
610	0.1
611	0.11
612	0.14
613	0.18
614	0.19
615	0.23
616	0.24
617	0.24
618	0.23
619	0.25
620	0.21
621	0.22
622	0.29
623	0.27
624	0.27
625	0.27
626	0.27
627	0.25
628	0.25
629	0.23
630	0.18
631	0.15
632	0.15
633	0.15
634	0.15
635	0.14
636	0.14
637	0.11
638	0.06
639	0.06
640	0.07
641	0.06
642	0.06
643	0.06
644	0.05
645	0.06
646	0.06
647	0.07
648	0.09
649	0.12
650	0.16
651	0.18
652	0.22
653	0.23
654	0.23
655	0.23
656	0.21
657	0.18
658	0.15
659	0.17
660	0.14
661	0.13
662	0.13
663	0.12
664	0.12
665	0.11
666	0.11
667	0.07
668	0.06
669	0.08
670	0.08
671	0.09
672	0.09
673	0.1
674	0.12
675	0.16
676	0.23
677	0.26
678	0.32
679	0.4
680	0.49
681	0.49
682	0.5
683	0.47
684	0.45
685	0.42
686	0.37
687	0.33
688	0.25
689	0.23
690	0.2
691	0.19
692	0.15
693	0.2
694	0.23
695	0.22
696	0.3
697	0.38
698	0.41
699	0.42
700	0.4
701	0.34
702	0.3
703	0.3
704	0.23
705	0.2
706	0.17
707	0.17
708	0.19
709	0.19
710	0.18
711	0.15
712	0.14
713	0.09
714	0.1
715	0.1
716	0.08
717	0.09
718	0.15
719	0.15
720	0.15
721	0.15
722	0.15
723	0.14
724	0.15
725	0.14
726	0.08
727	0.08
728	0.08
729	0.07
730	0.06
731	0.06
732	0.06
733	0.06
734	0.09
735	0.1
736	0.15
737	0.16
738	0.16
739	0.2
740	0.24
741	0.27
742	0.34
743	0.35
744	0.33
745	0.35
746	0.37
747	0.41
748	0.4
749	0.38
750	0.33
751	0.36
752	0.36
753	0.33
754	0.31
755	0.26
756	0.24
757	0.24
758	0.22
759	0.15
760	0.14
761	0.13
762	0.13
763	0.11
764	0.09
765	0.07
766	0.06
767	0.06
768	0.08
769	0.09
770	0.09
771	0.09
772	0.11
773	0.11
774	0.13
775	0.19
776	0.23
777	0.29
778	0.34
779	0.38
780	0.45
781	0.5
782	0.49
783	0.44
784	0.41
785	0.36
786	0.31
787	0.29
788	0.23
789	0.18
790	0.16
791	0.14
792	0.1
793	0.09
794	0.08
795	0.06
796	0.03
797	0.03
798	0.03
799	0.03
800	0.03
801	0.04
802	0.04
803	0.04
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.07
809	0.09
810	0.1
811	0.1
812	0.12
813	0.15
814	0.17
815	0.18
816	0.18
817	0.19
818	0.21
819	0.22
820	0.22
821	0.2
822	0.2
823	0.21
824	0.2
825	0.17
826	0.17
827	0.14
828	0.13
829	0.12
830	0.1
831	0.1
832	0.09
833	0.11
834	0.12
835	0.15
836	0.16
837	0.18
838	0.24
839	0.27
840	0.3
841	0.27
842	0.25
843	0.29
844	0.32
845	0.33
846	0.27
847	0.23
848	0.21
849	0.2
850	0.2
851	0.14
852	0.13
853	0.11
854	0.15
855	0.19
856	0.21
857	0.21
858	0.23
859	0.24
860	0.3
861	0.35
862	0.37
863	0.37
864	0.42
865	0.46
866	0.46
867	0.46
868	0.43
869	0.42
870	0.42
871	0.49
872	0.47
873	0.5
874	0.54
875	0.59
876	0.63
877	0.68
878	0.7
879	0.68
880	0.67
881	0.64
882	0.67
883	0.62
884	0.56
885	0.5
886	0.43
887	0.35
888	0.3
889	0.26
890	0.18
891	0.15
892	0.11
893	0.08
894	0.06
895	0.05
896	0.05
897	0.06
898	0.07
899	0.07
900	0.09
901	0.09
902	0.1
903	0.11
904	0.11
905	0.09
906	0.09
907	0.12
908	0.1
909	0.1
910	0.1
911	0.1
912	0.1
913	0.1
914	0.13
915	0.19
916	0.25
917	0.27
918	0.29
919	0.37
920	0.37
921	0.39
922	0.4
923	0.38
924	0.4
925	0.47
926	0.47
927	0.42
928	0.47
929	0.46
930	0.43
931	0.42
932	0.39
933	0.38
934	0.39
935	0.41
936	0.37
937	0.4
938	0.39
939	0.34
940	0.3
941	0.24
942	0.22
943	0.19
944	0.18
945	0.15
946	0.15
947	0.14
948	0.14
949	0.13
950	0.11
951	0.1
952	0.09
953	0.08
954	0.09
955	0.09
956	0.08
957	0.08
958	0.08
959	0.08
960	0.07
961	0.08
962	0.08
963	0.07
964	0.07
965	0.07
966	0.08
967	0.09
968	0.09
969	0.09
970	0.08
971	0.09
972	0.08
973	0.07
974	0.07
975	0.06
976	0.05
977	0.05
978	0.05
979	0.05
980	0.04
981	0.05
982	0.05
983	0.07
984	0.08
985	0.1
986	0.18
987	0.23
988	0.27
989	0.31
990	0.38
991	0.44
992	0.51
993	0.52
994	0.49
995	0.47
996	0.46
997	0.42
998	0.35
999	0.27
1000	0.19
1001	0.16
1002	0.13
1003	0.1
1004	0.09
1005	0.08
1006	0.08
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.09
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.08
1013	0.09
1014	0.09
1015	0.08
1016	0.09
1017	0.1
1018	0.09
1019	0.09
1020	0.1
1021	0.11
1022	0.12
1023	0.12
1024	0.1
1025	0.11
1026	0.12
1027	0.14
1028	0.12
1029	0.11
1030	0.11
1031	0.16
1032	0.16
1033	0.17
1034	0.2
1035	0.17
1036	0.16
1037	0.16
1038	0.14
1039	0.1
1040	0.11
1041	0.1
1042	0.1
1043	0.1
1044	0.11
1045	0.11
1046	0.13
1047	0.17
1048	0.19
1049	0.23
1050	0.29
1051	0.38
1052	0.45
1053	0.5
1054	0.53
1055	0.55
1056	0.58
1057	0.63
1058	0.62
1059	0.6
1060	0.56
1061	0.53
1062	0.55
1063	0.51
1064	0.53
1065	0.45
1066	0.41
1067	0.33
1068	0.3
1069	0.29
1070	0.22
1071	0.27
1072	0.24
1073	0.22
1074	0.18
1075	0.18
1076	0.18
1077	0.18
1078	0.18
1079	0.12
1080	0.08
1081	0.07
1082	0.07
1083	0.08
1084	0.08
1085	0.08
1086	0.07
1087	0.08
1088	0.08
1089	0.13
1090	0.14
1091	0.16
1092	0.18
1093	0.24
1094	0.27
1095	0.28
1096	0.35
1097	0.33
1098	0.33
1099	0.33
1100	0.32
1101	0.32
1102	0.38
1103	0.38
1104	0.38
1105	0.45
1106	0.49
1107	0.51
1108	0.52
1109	0.51
1110	0.49
1111	0.53
1112	0.54
1113	0.54
1114	0.54
1115	0.51
1116	0.51
1117	0.47
1118	0.44
1119	0.41
1120	0.39
1121	0.31
1122	0.28
1123	0.28
1124	0.29
1125	0.3
1126	0.29
1127	0.27
1128	0.25
1129	0.29
1130	0.32
1131	0.33
1132	0.33
1133	0.35
1134	0.35
1135	0.37
1136	0.39
1137	0.37
1138	0.37
1139	0.4
1140	0.43
1141	0.41

A0A2X0NV47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer