Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2X0PJN8

Protein Details
Accession A0A2X0PJN8    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MPAPRRKNKKKYLTSGGGHYTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-10RRKNKK
133-142PRKPKKPKPS
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 8.5, cyto_mito 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MPAPRRKNKKKYLTSGGGHYTSKRQVGGPGIFITTIRGKEPRCVQEFYNVLDEVADRLYPKERLAELEKLRPVKAATTNGPDAVKNMDEDTAQAPIQAEEEPEQEPPQVEEEEEEEDQLIEAQIAREIAALNPRKPKKPKPSSSSDPTSTTKGDKSKKEKARFLSVETGTECGQFHFGRCPTRGADEGDADYLALATVCFFSIAWPYDPVELCKAIVDDLQSTRVIKTRSVRTRTRSNPISALLTRLLLPPVDTSRFCLRLTPVSTSCHAMKTETVLEKSKELIRRTFEEYAASKALSEFTFAIEPSIRSHSEPLTRTYLIEQIGLIIKDLALSTSLSLKANLSQPDLVIIPVVLMKEYALGIVEGRGWGGEGKKWNLDALGADINQKLLGGGEKEDGRVEVINRSTGGAIPTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.8
3 0.76
4 0.69
5 0.6
6 0.53
7 0.49
8 0.45
9 0.44
10 0.39
11 0.33
12 0.34
13 0.4
14 0.4
15 0.37
16 0.32
17 0.3
18 0.28
19 0.27
20 0.26
21 0.23
22 0.21
23 0.21
24 0.25
25 0.25
26 0.33
27 0.42
28 0.47
29 0.47
30 0.49
31 0.47
32 0.5
33 0.52
34 0.47
35 0.43
36 0.34
37 0.29
38 0.26
39 0.25
40 0.18
41 0.16
42 0.13
43 0.09
44 0.11
45 0.15
46 0.16
47 0.17
48 0.21
49 0.21
50 0.26
51 0.31
52 0.38
53 0.38
54 0.44
55 0.49
56 0.46
57 0.46
58 0.42
59 0.38
60 0.35
61 0.36
62 0.35
63 0.34
64 0.37
65 0.39
66 0.39
67 0.39
68 0.34
69 0.28
70 0.25
71 0.21
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.12
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.12
81 0.11
82 0.1
83 0.11
84 0.1
85 0.11
86 0.1
87 0.12
88 0.12
89 0.13
90 0.13
91 0.13
92 0.13
93 0.13
94 0.14
95 0.13
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.15
100 0.14
101 0.13
102 0.11
103 0.1
104 0.1
105 0.09
106 0.08
107 0.04
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.07
116 0.15
117 0.18
118 0.22
119 0.31
120 0.35
121 0.43
122 0.51
123 0.6
124 0.64
125 0.71
126 0.77
127 0.75
128 0.8
129 0.8
130 0.8
131 0.76
132 0.68
133 0.62
134 0.54
135 0.5
136 0.43
137 0.37
138 0.34
139 0.35
140 0.39
141 0.43
142 0.48
143 0.56
144 0.64
145 0.69
146 0.71
147 0.68
148 0.72
149 0.65
150 0.61
151 0.59
152 0.5
153 0.44
154 0.37
155 0.34
156 0.23
157 0.23
158 0.18
159 0.1
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.16
164 0.18
165 0.21
166 0.22
167 0.24
168 0.22
169 0.24
170 0.26
171 0.22
172 0.22
173 0.19
174 0.18
175 0.16
176 0.15
177 0.12
178 0.09
179 0.07
180 0.05
181 0.03
182 0.02
183 0.02
184 0.03
185 0.03
186 0.03
187 0.03
188 0.04
189 0.06
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.12
195 0.13
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.13
212 0.14
213 0.15
214 0.21
215 0.29
216 0.38
217 0.44
218 0.49
219 0.51
220 0.6
221 0.63
222 0.65
223 0.6
224 0.54
225 0.5
226 0.45
227 0.44
228 0.34
229 0.31
230 0.23
231 0.19
232 0.17
233 0.15
234 0.14
235 0.09
236 0.1
237 0.09
238 0.11
239 0.14
240 0.13
241 0.17
242 0.21
243 0.24
244 0.23
245 0.24
246 0.23
247 0.27
248 0.3
249 0.31
250 0.28
251 0.29
252 0.3
253 0.31
254 0.3
255 0.25
256 0.23
257 0.19
258 0.17
259 0.18
260 0.22
261 0.22
262 0.23
263 0.24
264 0.25
265 0.25
266 0.27
267 0.29
268 0.29
269 0.29
270 0.32
271 0.32
272 0.35
273 0.41
274 0.41
275 0.36
276 0.35
277 0.33
278 0.32
279 0.29
280 0.25
281 0.19
282 0.16
283 0.18
284 0.13
285 0.14
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.17
295 0.16
296 0.17
297 0.19
298 0.22
299 0.27
300 0.29
301 0.3
302 0.32
303 0.31
304 0.31
305 0.3
306 0.3
307 0.24
308 0.22
309 0.18
310 0.14
311 0.17
312 0.16
313 0.14
314 0.1
315 0.09
316 0.09
317 0.1
318 0.08
319 0.06
320 0.06
321 0.06
322 0.09
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.13
327 0.16
328 0.21
329 0.23
330 0.23
331 0.22
332 0.21
333 0.22
334 0.22
335 0.18
336 0.13
337 0.1
338 0.08
339 0.08
340 0.08
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.07
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.07
351 0.08
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.09
357 0.1
358 0.14
359 0.2
360 0.24
361 0.27
362 0.28
363 0.28
364 0.26
365 0.26
366 0.22
367 0.19
368 0.2
369 0.18
370 0.19
371 0.19
372 0.19
373 0.18
374 0.16
375 0.12
376 0.08
377 0.11
378 0.11
379 0.13
380 0.17
381 0.18
382 0.19
383 0.2
384 0.2
385 0.18
386 0.19
387 0.19
388 0.21
389 0.22
390 0.24
391 0.23
392 0.24
393 0.23
394 0.22