Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CPN5

Protein Details
Accession A1CPN5    Localization Confidence High Confidence Score 20.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
125-176EDSERVQRKREGRREKKSRRLRDMEEGGDEGDSKARRRDRKKRDPTPEDEDLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
116-167GRHKRKRTEEDSERVQRKREGRREKKSRRLRDMEEGGDEGDSKARRRDRKKR
183-186RRRA
193-205EAMKKPTKRRFRK
435-450RRMRARQIAAAKGSRR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003746  F:translation elongation factor activity  
KEGG act:ACLA_023200  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSASPESKPHSPAAAVSDHEPQVDLAEETARPPTPGADDNDDGQDEAAASATPAAQSAAGDDDDEDEDDADAVDSDEESILSEVDEAQFDDFDPENVDVEDRPQLAIDEDNLKLIGRHKRKRTEEDSERVQRKREGRREKKSRRLRDMEEGGDEGDSKARRRDRKKRDPTPEDEDLLDPATRRRRALDRAMDEAMKKPTKRRFRKADGIDLEQMADAEIEDMRKRMTHAAQLDAINRREGRPAMHKLKMLPEVVSLLNRNQYVNSLVDPEINLLEAVKFFLEPLDDGSLPAYNIQRDLMTALGKLPINKEALIASGIGKVIVFYTKSKRPEAGIKRMAERLLAEWTRPILQRSDDYSKRVYQEAEYDPRKVTARTTSAQASVAEARQRELLPPRLANRARAEITHTSYTIVPRPTMVQESKFARPLGASGEDRFRRMRARQIAAAKGSRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.28
3 0.27
4 0.31
5 0.28
6 0.27
7 0.25
8 0.21
9 0.19
10 0.18
11 0.16
12 0.1
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.16
17 0.15
18 0.15
19 0.15
20 0.16
21 0.18
22 0.23
23 0.27
24 0.3
25 0.31
26 0.32
27 0.34
28 0.33
29 0.28
30 0.23
31 0.18
32 0.12
33 0.1
34 0.08
35 0.06
36 0.05
37 0.06
38 0.06
39 0.06
40 0.06
41 0.06
42 0.06
43 0.06
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.06
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.05
62 0.05
63 0.05
64 0.05
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.05
69 0.06
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.07
77 0.1
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.12
82 0.12
83 0.12
84 0.12
85 0.09
86 0.11
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.11
91 0.12
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.13
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.18
102 0.26
103 0.33
104 0.42
105 0.5
106 0.6
107 0.68
108 0.77
109 0.78
110 0.79
111 0.78
112 0.76
113 0.77
114 0.77
115 0.76
116 0.69
117 0.64
118 0.6
119 0.6
120 0.63
121 0.64
122 0.66
123 0.69
124 0.78
125 0.86
126 0.9
127 0.92
128 0.92
129 0.92
130 0.91
131 0.88
132 0.82
133 0.81
134 0.76
135 0.67
136 0.58
137 0.48
138 0.38
139 0.3
140 0.25
141 0.15
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.18
146 0.25
147 0.34
148 0.45
149 0.55
150 0.63
151 0.73
152 0.83
153 0.87
154 0.91
155 0.89
156 0.86
157 0.83
158 0.76
159 0.66
160 0.56
161 0.46
162 0.35
163 0.28
164 0.22
165 0.14
166 0.15
167 0.21
168 0.21
169 0.22
170 0.25
171 0.3
172 0.35
173 0.44
174 0.48
175 0.44
176 0.46
177 0.47
178 0.44
179 0.39
180 0.36
181 0.33
182 0.29
183 0.26
184 0.29
185 0.37
186 0.47
187 0.55
188 0.62
189 0.66
190 0.7
191 0.79
192 0.76
193 0.77
194 0.7
195 0.64
196 0.56
197 0.46
198 0.38
199 0.28
200 0.23
201 0.13
202 0.09
203 0.05
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.06
211 0.07
212 0.1
213 0.11
214 0.16
215 0.17
216 0.19
217 0.22
218 0.22
219 0.25
220 0.26
221 0.25
222 0.22
223 0.21
224 0.2
225 0.19
226 0.19
227 0.19
228 0.22
229 0.3
230 0.33
231 0.36
232 0.37
233 0.36
234 0.4
235 0.41
236 0.34
237 0.26
238 0.21
239 0.19
240 0.18
241 0.18
242 0.14
243 0.12
244 0.14
245 0.14
246 0.14
247 0.12
248 0.13
249 0.14
250 0.13
251 0.13
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.12
256 0.11
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.05
268 0.05
269 0.05
270 0.07
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.1
275 0.1
276 0.1
277 0.12
278 0.12
279 0.09
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.09
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.08
288 0.08
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.13
293 0.15
294 0.16
295 0.16
296 0.16
297 0.13
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.08
309 0.08
310 0.1
311 0.17
312 0.24
313 0.28
314 0.3
315 0.32
316 0.34
317 0.43
318 0.48
319 0.53
320 0.54
321 0.53
322 0.54
323 0.55
324 0.51
325 0.42
326 0.34
327 0.26
328 0.26
329 0.24
330 0.21
331 0.19
332 0.21
333 0.24
334 0.24
335 0.24
336 0.19
337 0.21
338 0.25
339 0.31
340 0.38
341 0.37
342 0.4
343 0.42
344 0.43
345 0.43
346 0.41
347 0.35
348 0.28
349 0.32
350 0.35
351 0.41
352 0.39
353 0.39
354 0.38
355 0.39
356 0.4
357 0.33
358 0.3
359 0.29
360 0.32
361 0.32
362 0.35
363 0.35
364 0.34
365 0.35
366 0.32
367 0.27
368 0.24
369 0.25
370 0.25
371 0.22
372 0.22
373 0.24
374 0.24
375 0.26
376 0.3
377 0.35
378 0.37
379 0.42
380 0.44
381 0.51
382 0.52
383 0.54
384 0.52
385 0.51
386 0.47
387 0.43
388 0.46
389 0.42
390 0.46
391 0.42
392 0.37
393 0.32
394 0.32
395 0.35
396 0.34
397 0.31
398 0.25
399 0.23
400 0.26
401 0.28
402 0.34
403 0.34
404 0.32
405 0.36
406 0.41
407 0.45
408 0.47
409 0.43
410 0.36
411 0.32
412 0.31
413 0.29
414 0.3
415 0.27
416 0.26
417 0.36
418 0.37
419 0.4
420 0.41
421 0.39
422 0.41
423 0.44
424 0.51
425 0.51
426 0.56
427 0.6
428 0.66
429 0.69
430 0.68