Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C593

Protein Details
Accession A1C593    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
775-794SSIKNLSTPQRRNKRHVPVAHydrophilic
846-868VVDAPKSYNKHKRSKSPLTAIALHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012310  DNA_ligase_ATP-dep_cent  
IPR012308  DNA_ligase_ATP-dep_N  
IPR036599  DNA_ligase_N_sf  
IPR029710  LIG4  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
Gene Ontology GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003910  F:DNA ligase (ATP) activity  
GO:0051103  P:DNA ligation involved in DNA repair  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006260  P:DNA replication  
KEGG act:ACLA_002720  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01068  DNA_ligase_A_M  
PF04675  DNA_ligase_A_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50160  DNA_LIGASE_A3  
CDD cd08039  Adenylation_DNA_ligase_Fungal  
Amino Acid Sequences MGFKFQYLCDLLSDLENNKVVKATTASRNSNPDGRVVSRWFAQHAKRIHAADTDRIALLSCLFPEKRTDRVYWLQGATLVRVIGRCLLLGSSRREELERWRVAGGIDLGQCVEDVMRQAEGDSKKGQDVTIEEIDDALNKIASRCRFSGARVRRQHTAVDVEETLSPLYRRLSSRDAKWLTRMILKSYHPVALPVHSTMKSFHFLLPHLLLFQDSFESSLKMLASEPLSHYPPNPDPKFAKDLRVQASQHLVPRIGIKIGRPEYYKARSIKHCCRMIGRRRMSIERKYDGEYCQIHIDLSQRLNPIQIFSKSGKDSTDDRSGIQNVIRDALNIGRPECKFSRQCILEGELLVWSDKNGKIADFHKLRRFIARSGTLLGIESDSPPQPYEHLMIVFFDILLLDDDVCLRKPHRDRRLLLKHVMQAIDGHADIAEQQIVDFSRHDGQSRLESIFRKGIVERWEGFVLKGCEDPYLSISPGQEHSSAGRWIKLKKDYIPGLGDTVDLTLVGARYDSRDAVALGQATKILWTHFYIGCLLNKEAVLQNQATPRFRVVDMINRHSMSPKDMLYLNLLGQFSACGVDSGHGYLLEYGTASLANMAVVFKTPFVVEMLGSGFEKPSGARYYALRFPRIQKIHSDRSLEDAASCQELQLLAEEARSVPAEDLQEEIKWAEKIRLANASSRYLVERSQSPLSTTTSCPSSIPSPAKTSSAGTTATTDSNRDSSGHNSSWGLVHQDQRNNVETHSQTDHIPIYVDDSTTSTSSLKPSKPSPRRLSSIKNLSTPQRRNKRHVPVASTGLENRRNPVGHCEEIENNSRSSCPPSPNPRQSSTAWKRRKLTEDHAARVVVDAPKSYNKHKRSKSPLTAIALCIHQNHVMQNDTNNQNRIMFVDSTCCLLPSLELFLQRLWSNQSSFRVKNTSPDMPSGHLGIGLMIATVSQGTLGPLLFELSQEIAQRLDSNSGDYPRNGKIFILEDRFLTLDAQIDDPGFNLRNTWESIGKEYLYACISWRSPKDSNMALCGISEMFGTPIEGAEAPQVCAQDLLRSKSRTKTPHISITFEGQELGILGDLDC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.21
3 0.24
4 0.23
5 0.22
6 0.23
7 0.2
8 0.2
9 0.23
10 0.25
11 0.31
12 0.39
13 0.45
14 0.48
15 0.55
16 0.57
17 0.59
18 0.53
19 0.48
20 0.45
21 0.43
22 0.44
23 0.41
24 0.4
25 0.37
26 0.38
27 0.38
28 0.41
29 0.42
30 0.44
31 0.46
32 0.49
33 0.51
34 0.51
35 0.49
36 0.48
37 0.46
38 0.45
39 0.43
40 0.39
41 0.32
42 0.31
43 0.28
44 0.22
45 0.2
46 0.15
47 0.12
48 0.17
49 0.17
50 0.18
51 0.26
52 0.29
53 0.35
54 0.38
55 0.4
56 0.41
57 0.48
58 0.53
59 0.51
60 0.49
61 0.42
62 0.41
63 0.4
64 0.33
65 0.27
66 0.22
67 0.16
68 0.16
69 0.16
70 0.15
71 0.14
72 0.13
73 0.12
74 0.12
75 0.16
76 0.21
77 0.26
78 0.28
79 0.29
80 0.31
81 0.32
82 0.33
83 0.38
84 0.43
85 0.41
86 0.38
87 0.37
88 0.36
89 0.34
90 0.36
91 0.28
92 0.22
93 0.19
94 0.18
95 0.17
96 0.16
97 0.16
98 0.12
99 0.1
100 0.06
101 0.08
102 0.09
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.17
107 0.18
108 0.21
109 0.23
110 0.23
111 0.25
112 0.26
113 0.26
114 0.21
115 0.22
116 0.25
117 0.25
118 0.24
119 0.21
120 0.21
121 0.21
122 0.18
123 0.17
124 0.11
125 0.09
126 0.09
127 0.11
128 0.16
129 0.2
130 0.24
131 0.25
132 0.29
133 0.29
134 0.34
135 0.43
136 0.47
137 0.54
138 0.58
139 0.61
140 0.62
141 0.62
142 0.6
143 0.54
144 0.51
145 0.42
146 0.37
147 0.33
148 0.29
149 0.27
150 0.25
151 0.2
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.14
156 0.17
157 0.19
158 0.23
159 0.32
160 0.37
161 0.42
162 0.5
163 0.53
164 0.51
165 0.53
166 0.53
167 0.47
168 0.48
169 0.45
170 0.38
171 0.39
172 0.38
173 0.4
174 0.38
175 0.38
176 0.3
177 0.31
178 0.29
179 0.25
180 0.26
181 0.22
182 0.24
183 0.22
184 0.23
185 0.23
186 0.24
187 0.24
188 0.24
189 0.23
190 0.21
191 0.21
192 0.25
193 0.26
194 0.23
195 0.2
196 0.18
197 0.17
198 0.14
199 0.14
200 0.1
201 0.08
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.17
214 0.19
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.26
219 0.31
220 0.4
221 0.38
222 0.4
223 0.4
224 0.45
225 0.52
226 0.47
227 0.47
228 0.43
229 0.49
230 0.48
231 0.52
232 0.48
233 0.43
234 0.47
235 0.43
236 0.41
237 0.36
238 0.31
239 0.25
240 0.27
241 0.25
242 0.21
243 0.2
244 0.18
245 0.25
246 0.28
247 0.3
248 0.3
249 0.33
250 0.38
251 0.42
252 0.47
253 0.41
254 0.45
255 0.51
256 0.58
257 0.64
258 0.66
259 0.66
260 0.61
261 0.66
262 0.69
263 0.7
264 0.72
265 0.68
266 0.65
267 0.65
268 0.72
269 0.71
270 0.69
271 0.66
272 0.6
273 0.56
274 0.53
275 0.51
276 0.44
277 0.43
278 0.36
279 0.3
280 0.28
281 0.26
282 0.22
283 0.2
284 0.21
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.19
289 0.2
290 0.22
291 0.21
292 0.2
293 0.2
294 0.2
295 0.2
296 0.21
297 0.26
298 0.26
299 0.27
300 0.25
301 0.24
302 0.26
303 0.27
304 0.33
305 0.28
306 0.28
307 0.31
308 0.31
309 0.3
310 0.28
311 0.25
312 0.18
313 0.19
314 0.18
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.16
319 0.15
320 0.16
321 0.19
322 0.19
323 0.25
324 0.26
325 0.31
326 0.31
327 0.33
328 0.41
329 0.37
330 0.39
331 0.36
332 0.37
333 0.31
334 0.28
335 0.25
336 0.16
337 0.15
338 0.13
339 0.1
340 0.07
341 0.09
342 0.1
343 0.12
344 0.12
345 0.12
346 0.15
347 0.17
348 0.26
349 0.28
350 0.33
351 0.37
352 0.4
353 0.41
354 0.45
355 0.47
356 0.4
357 0.42
358 0.39
359 0.34
360 0.33
361 0.32
362 0.25
363 0.22
364 0.2
365 0.13
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.11
375 0.13
376 0.12
377 0.12
378 0.11
379 0.11
380 0.11
381 0.1
382 0.08
383 0.06
384 0.05
385 0.04
386 0.05
387 0.05
388 0.04
389 0.04
390 0.05
391 0.06
392 0.07
393 0.08
394 0.08
395 0.16
396 0.24
397 0.34
398 0.44
399 0.52
400 0.54
401 0.64
402 0.74
403 0.72
404 0.68
405 0.63
406 0.56
407 0.51
408 0.48
409 0.37
410 0.27
411 0.22
412 0.19
413 0.14
414 0.1
415 0.06
416 0.06
417 0.06
418 0.06
419 0.05
420 0.03
421 0.03
422 0.04
423 0.05
424 0.06
425 0.06
426 0.08
427 0.12
428 0.12
429 0.13
430 0.14
431 0.15
432 0.18
433 0.2
434 0.19
435 0.18
436 0.19
437 0.21
438 0.22
439 0.21
440 0.19
441 0.17
442 0.2
443 0.21
444 0.24
445 0.22
446 0.22
447 0.23
448 0.22
449 0.22
450 0.22
451 0.19
452 0.16
453 0.16
454 0.13
455 0.12
456 0.12
457 0.13
458 0.11
459 0.11
460 0.11
461 0.11
462 0.11
463 0.12
464 0.13
465 0.14
466 0.12
467 0.11
468 0.12
469 0.13
470 0.15
471 0.14
472 0.16
473 0.18
474 0.19
475 0.24
476 0.29
477 0.3
478 0.31
479 0.37
480 0.35
481 0.36
482 0.35
483 0.3
484 0.26
485 0.23
486 0.19
487 0.12
488 0.1
489 0.07
490 0.05
491 0.04
492 0.04
493 0.03
494 0.03
495 0.03
496 0.03
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.06
502 0.07
503 0.07
504 0.08
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.07
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.05
513 0.06
514 0.06
515 0.09
516 0.1
517 0.1
518 0.12
519 0.13
520 0.14
521 0.15
522 0.14
523 0.12
524 0.11
525 0.12
526 0.11
527 0.11
528 0.11
529 0.1
530 0.12
531 0.15
532 0.18
533 0.18
534 0.17
535 0.18
536 0.18
537 0.17
538 0.18
539 0.15
540 0.21
541 0.24
542 0.28
543 0.3
544 0.28
545 0.28
546 0.27
547 0.26
548 0.2
549 0.18
550 0.15
551 0.13
552 0.14
553 0.14
554 0.15
555 0.15
556 0.13
557 0.13
558 0.13
559 0.11
560 0.1
561 0.09
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.04
566 0.04
567 0.04
568 0.05
569 0.05
570 0.05
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.03
579 0.03
580 0.03
581 0.03
582 0.03
583 0.03
584 0.03
585 0.03
586 0.03
587 0.04
588 0.04
589 0.04
590 0.05
591 0.05
592 0.05
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.06
597 0.06
598 0.06
599 0.07
600 0.06
601 0.06
602 0.05
603 0.06
604 0.05
605 0.08
606 0.09
607 0.1
608 0.11
609 0.13
610 0.18
611 0.24
612 0.27
613 0.26
614 0.26
615 0.3
616 0.38
617 0.39
618 0.36
619 0.38
620 0.43
621 0.49
622 0.51
623 0.5
624 0.41
625 0.43
626 0.43
627 0.34
628 0.27
629 0.2
630 0.16
631 0.14
632 0.14
633 0.08
634 0.08
635 0.08
636 0.07
637 0.07
638 0.08
639 0.06
640 0.06
641 0.06
642 0.06
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.05
647 0.07
648 0.08
649 0.08
650 0.09
651 0.09
652 0.09
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.09
657 0.09
658 0.1
659 0.13
660 0.14
661 0.16
662 0.22
663 0.21
664 0.25
665 0.27
666 0.28
667 0.26
668 0.25
669 0.25
670 0.2
671 0.2
672 0.17
673 0.17
674 0.19
675 0.21
676 0.21
677 0.2
678 0.21
679 0.23
680 0.24
681 0.23
682 0.2
683 0.19
684 0.19
685 0.17
686 0.18
687 0.17
688 0.21
689 0.23
690 0.23
691 0.26
692 0.27
693 0.28
694 0.27
695 0.27
696 0.21
697 0.2
698 0.18
699 0.15
700 0.16
701 0.15
702 0.16
703 0.15
704 0.15
705 0.14
706 0.14
707 0.14
708 0.13
709 0.14
710 0.16
711 0.21
712 0.21
713 0.21
714 0.2
715 0.2
716 0.2
717 0.19
718 0.19
719 0.16
720 0.22
721 0.26
722 0.29
723 0.31
724 0.34
725 0.37
726 0.33
727 0.31
728 0.31
729 0.26
730 0.27
731 0.27
732 0.24
733 0.21
734 0.23
735 0.23
736 0.17
737 0.17
738 0.12
739 0.13
740 0.13
741 0.12
742 0.1
743 0.11
744 0.12
745 0.12
746 0.13
747 0.1
748 0.1
749 0.15
750 0.21
751 0.22
752 0.25
753 0.32
754 0.43
755 0.51
756 0.6
757 0.65
758 0.65
759 0.69
760 0.71
761 0.71
762 0.7
763 0.72
764 0.65
765 0.61
766 0.57
767 0.6
768 0.64
769 0.64
770 0.64
771 0.65
772 0.68
773 0.72
774 0.78
775 0.8
776 0.8
777 0.77
778 0.73
779 0.67
780 0.66
781 0.6
782 0.52
783 0.44
784 0.41
785 0.41
786 0.36
787 0.33
788 0.32
789 0.32
790 0.31
791 0.36
792 0.36
793 0.31
794 0.32
795 0.33
796 0.31
797 0.34
798 0.4
799 0.33
800 0.27
801 0.25
802 0.25
803 0.23
804 0.27
805 0.28
806 0.27
807 0.34
808 0.44
809 0.54
810 0.63
811 0.67
812 0.65
813 0.64
814 0.61
815 0.63
816 0.64
817 0.64
818 0.63
819 0.65
820 0.66
821 0.69
822 0.74
823 0.7
824 0.68
825 0.68
826 0.67
827 0.63
828 0.61
829 0.54
830 0.46
831 0.39
832 0.35
833 0.27
834 0.19
835 0.16
836 0.16
837 0.23
838 0.26
839 0.35
840 0.41
841 0.47
842 0.57
843 0.64
844 0.71
845 0.75
846 0.82
847 0.83
848 0.81
849 0.8
850 0.76
851 0.7
852 0.62
853 0.54
854 0.45
855 0.36
856 0.29
857 0.24
858 0.2
859 0.19
860 0.19
861 0.2
862 0.2
863 0.2
864 0.22
865 0.29
866 0.32
867 0.36
868 0.36
869 0.34
870 0.32
871 0.32
872 0.3
873 0.26
874 0.21
875 0.17
876 0.19
877 0.18
878 0.2
879 0.19
880 0.18
881 0.14
882 0.13
883 0.13
884 0.1
885 0.15
886 0.15
887 0.16
888 0.17
889 0.17
890 0.2
891 0.2
892 0.2
893 0.2
894 0.22
895 0.23
896 0.27
897 0.34
898 0.38
899 0.39
900 0.43
901 0.44
902 0.41
903 0.47
904 0.49
905 0.49
906 0.43
907 0.46
908 0.44
909 0.4
910 0.4
911 0.34
912 0.27
913 0.2
914 0.18
915 0.13
916 0.11
917 0.08
918 0.06
919 0.04
920 0.04
921 0.03
922 0.03
923 0.03
924 0.03
925 0.03
926 0.04
927 0.05
928 0.05
929 0.06
930 0.06
931 0.08
932 0.07
933 0.07
934 0.08
935 0.09
936 0.11
937 0.12
938 0.13
939 0.12
940 0.12
941 0.14
942 0.14
943 0.17
944 0.15
945 0.18
946 0.21
947 0.25
948 0.27
949 0.27
950 0.29
951 0.3
952 0.32
953 0.29
954 0.25
955 0.25
956 0.27
957 0.32
958 0.34
959 0.3
960 0.28
961 0.3
962 0.3
963 0.27
964 0.23
965 0.16
966 0.14
967 0.14
968 0.15
969 0.14
970 0.14
971 0.13
972 0.13
973 0.17
974 0.14
975 0.13
976 0.13
977 0.14
978 0.16
979 0.19
980 0.22
981 0.23
982 0.23
983 0.28
984 0.3
985 0.29
986 0.27
987 0.25
988 0.25
989 0.21
990 0.19
991 0.16
992 0.19
993 0.21
994 0.27
995 0.31
996 0.35
997 0.38
998 0.41
999 0.46
1000 0.48
1001 0.48
1002 0.45
1003 0.42
1004 0.35
1005 0.31
1006 0.29
1007 0.23
1008 0.16
1009 0.13
1010 0.09
1011 0.08
1012 0.08
1013 0.09
1014 0.07
1015 0.07
1016 0.09
1017 0.09
1018 0.09
1019 0.13
1020 0.14
1021 0.15
1022 0.17
1023 0.17
1024 0.16
1025 0.17
1026 0.17
1027 0.2
1028 0.25
1029 0.29
1030 0.35
1031 0.39
1032 0.44
1033 0.5
1034 0.59
1035 0.59
1036 0.62
1037 0.66
1038 0.66
1039 0.72
1040 0.71
1041 0.68
1042 0.62
1043 0.61
1044 0.55
1045 0.45
1046 0.37
1047 0.26
1048 0.23
1049 0.18
1050 0.16
1051 0.09