Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CMD8

Protein Details
Accession A1CMD8    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-313EEDVKKPKPGAKRKRAAPPAKPRKKGPRVEIEYETBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
127-160KIAKEEERLGERIVPKLAPKIRRREETRERKAES
283-306KKPKPGAKRKRAAPPAKPRKKGPR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029004  L28e/Mak16  
IPR006958  Mak16  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG act:ACLA_096580  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04874  Mak16  
PF01778  Ribosomal_L28e  
Amino Acid Sequences MSSDEIVWQVINQQFCSYKLKTTKGQNFCRNEYNVSGLCNRQSCPLANSRYATVRSDPETGAMYLYMKTIERAHMPSKLWERIRLSSNYAKALEQLDERLIYWPKFLIHKCKQRLTRLTQVAIRMRKIAKEEERLGERIVPKLAPKIRRREETRERKAESAAKVERAIERELIERLRSGAYGDRPLNVEEGIWKKVLRGLERTGEGERDEDLDDGEEIEDEEEEGVGEVEYVSDLEEDEDLEDIEDWLGGDSADSSDDYDDDEEEDSDDEDSSAHSSGEEDVKKPKPGAKRKRAAPPAKPRKKGPRVEIEYETEGVGKESVFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.33
4 0.28
5 0.33
6 0.38
7 0.44
8 0.48
9 0.57
10 0.65
11 0.68
12 0.77
13 0.78
14 0.77
15 0.77
16 0.77
17 0.69
18 0.63
19 0.55
20 0.51
21 0.43
22 0.39
23 0.37
24 0.32
25 0.34
26 0.32
27 0.31
28 0.29
29 0.31
30 0.3
31 0.31
32 0.37
33 0.37
34 0.39
35 0.4
36 0.38
37 0.41
38 0.4
39 0.39
40 0.34
41 0.33
42 0.32
43 0.33
44 0.3
45 0.26
46 0.26
47 0.23
48 0.2
49 0.16
50 0.13
51 0.11
52 0.11
53 0.11
54 0.09
55 0.1
56 0.11
57 0.13
58 0.16
59 0.2
60 0.23
61 0.27
62 0.28
63 0.33
64 0.38
65 0.44
66 0.42
67 0.44
68 0.46
69 0.46
70 0.5
71 0.45
72 0.44
73 0.43
74 0.44
75 0.41
76 0.38
77 0.33
78 0.3
79 0.29
80 0.24
81 0.19
82 0.17
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.16
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.22
93 0.24
94 0.3
95 0.37
96 0.46
97 0.52
98 0.59
99 0.64
100 0.68
101 0.73
102 0.69
103 0.7
104 0.65
105 0.62
106 0.56
107 0.55
108 0.53
109 0.48
110 0.42
111 0.37
112 0.33
113 0.32
114 0.32
115 0.34
116 0.33
117 0.36
118 0.38
119 0.38
120 0.4
121 0.39
122 0.36
123 0.32
124 0.28
125 0.23
126 0.2
127 0.17
128 0.15
129 0.21
130 0.25
131 0.3
132 0.35
133 0.44
134 0.49
135 0.57
136 0.62
137 0.65
138 0.71
139 0.73
140 0.77
141 0.74
142 0.7
143 0.63
144 0.6
145 0.56
146 0.47
147 0.43
148 0.35
149 0.29
150 0.27
151 0.27
152 0.25
153 0.22
154 0.21
155 0.15
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.15
160 0.13
161 0.11
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.17
169 0.18
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.19
174 0.15
175 0.13
176 0.12
177 0.14
178 0.14
179 0.14
180 0.14
181 0.13
182 0.16
183 0.19
184 0.18
185 0.19
186 0.21
187 0.24
188 0.26
189 0.28
190 0.26
191 0.23
192 0.21
193 0.18
194 0.15
195 0.13
196 0.12
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.07
202 0.07
203 0.05
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.04
208 0.04
209 0.03
210 0.03
211 0.04
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.05
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.04
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.06
244 0.06
245 0.08
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.07
257 0.06
258 0.07
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.1
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.26
269 0.31
270 0.35
271 0.37
272 0.4
273 0.44
274 0.53
275 0.63
276 0.66
277 0.71
278 0.76
279 0.84
280 0.89
281 0.89
282 0.88
283 0.88
284 0.89
285 0.9
286 0.88
287 0.87
288 0.88
289 0.88
290 0.87
291 0.85
292 0.85
293 0.83
294 0.83
295 0.78
296 0.73
297 0.66
298 0.57
299 0.47
300 0.37
301 0.29
302 0.23
303 0.18